MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_008321	TCA	2	6	1181582	1181587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21002	NC_008321	TGT	2	6	1181617	1181622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21003	NC_008321	TTC	2	6	1181623	1181628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21004	NC_008321	TCA	2	6	1181639	1181644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21005	NC_008321	TG	3	6	1181716	1181721	0 %	50 %	50 %	0 %	113969358
21006	NC_008321	ATC	2	6	1181725	1181730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969358
21007	NC_008321	GTA	2	6	1181815	1181820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969358
21008	NC_008321	TCAC	2	8	1181848	1181855	25 %	25 %	0 %	50 %	113969358
21009	NC_008321	CAC	2	6	1181873	1181878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969358
21010	NC_008321	GCGA	2	8	1181902	1181909	25 %	0 %	50 %	25 %	113969358
21011	NC_008321	AGTC	2	8	1181973	1181980	25 %	25 %	25 %	25 %	113969358
21012	NC_008321	GAT	2	6	1181986	1181991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969358
21013	NC_008321	CT	3	6	1182149	1182154	0 %	50 %	0 %	50 %	113969358
21014	NC_008321	TAAC	2	8	1182273	1182280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21015	NC_008321	GT	3	6	1182386	1182391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21016	NC_008321	CAC	2	6	1182461	1182466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21017	NC_008321	GCC	2	6	1182732	1182737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969359
21018	NC_008321	AGA	2	6	1182866	1182871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969359
21019	NC_008321	ATG	2	6	1182895	1182900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969359
21020	NC_008321	GTGA	2	8	1182942	1182949	25 %	25 %	50 %	0 %	113969359
21021	NC_008321	GTTG	2	8	1182991	1182998	0 %	50 %	50 %	0 %	113969359
21022	NC_008321	GGA	2	6	1183044	1183049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969359
21023	NC_008321	CG	3	6	1183177	1183182	0 %	0 %	50 %	50 %	113969359
21024	NC_008321	ATTGCA	2	12	1183200	1183211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113969359
21025	NC_008321	CCA	2	6	1183231	1183236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969359
21026	NC_008321	GC	3	6	1183242	1183247	0 %	0 %	50 %	50 %	113969359
21027	NC_008321	CAA	2	6	1183269	1183274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969359
21028	NC_008321	GCTC	2	8	1183325	1183332	0 %	25 %	25 %	50 %	113969359
21029	NC_008321	AAG	2	6	1183333	1183338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969359
21030	NC_008321	GCA	2	6	1183367	1183372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969359
21031	NC_008321	T	6	6	1183527	1183532	0 %	100 %	0 %	0 %	113969359
21032	NC_008321	GCAC	2	8	1183602	1183609	25 %	0 %	25 %	50 %	113969359
21033	NC_008321	GCG	2	6	1183621	1183626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969359
21034	NC_008321	CGG	2	6	1183700	1183705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969359
21035	NC_008321	A	6	6	1183708	1183713	100 %	0 %	0 %	0 %	113969359
21036	NC_008321	ATC	2	6	1183812	1183817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969359
21037	NC_008321	GCA	2	6	1183889	1183894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969359
21038	NC_008321	TTG	2	6	1183902	1183907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969359
21039	NC_008321	TTG	2	6	1183942	1183947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969359
21040	NC_008321	CAC	2	6	1184312	1184317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969359
21041	NC_008321	TTAGGT	2	12	1184382	1184393	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	113969359
21042	NC_008321	GC	3	6	1184463	1184468	0 %	0 %	50 %	50 %	113969359
21043	NC_008321	GAA	2	6	1184491	1184496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969360
21044	NC_008321	CTAA	2	8	1184504	1184511	50 %	25 %	0 %	25 %	113969360
21045	NC_008321	TC	4	8	1184535	1184542	0 %	50 %	0 %	50 %	113969360
21046	NC_008321	CT	3	6	1184557	1184562	0 %	50 %	0 %	50 %	113969360
21047	NC_008321	CAT	2	6	1184566	1184571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969360
21048	NC_008321	GGT	2	6	1184609	1184614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969360
21049	NC_008321	GTG	2	6	1184615	1184620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969360
21050	NC_008321	TGG	2	6	1184877	1184882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969360
21051	NC_008321	GTT	2	6	1184944	1184949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969360
21052	NC_008321	ACG	2	6	1184961	1184966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969360
21053	NC_008321	TTTAA	2	10	1185008	1185017	40 %	60 %	0 %	0 %	113969360
21054	NC_008321	CGC	2	6	1185025	1185030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969360
21055	NC_008321	ATT	2	6	1185071	1185076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969360
21056	NC_008321	CCAAA	2	10	1185105	1185114	60 %	0 %	0 %	40 %	113969360
21057	NC_008321	AAC	2	6	1185134	1185139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969360
21058	NC_008321	CAC	2	6	1185184	1185189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969360
21059	NC_008321	GGTG	2	8	1185199	1185206	0 %	25 %	75 %	0 %	113969360
21060	NC_008321	TCGG	2	8	1185293	1185300	0 %	25 %	50 %	25 %	113969360
21061	NC_008321	TCA	2	6	1185354	1185359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969360
21062	NC_008321	AAAAC	2	10	1185380	1185389	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21063	NC_008321	TTTCA	2	10	1185455	1185464	20 %	60 %	0 %	20 %	113969361
21064	NC_008321	T	6	6	1185552	1185557	0 %	100 %	0 %	0 %	113969361
21065	NC_008321	CT	3	6	1185560	1185565	0 %	50 %	0 %	50 %	113969361
21066	NC_008321	AGC	2	6	1185660	1185665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969361
21067	NC_008321	GTT	2	6	1185717	1185722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969361
21068	NC_008321	TA	3	6	1185780	1185785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21069	NC_008321	TTG	2	6	1185805	1185810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21070	NC_008321	A	6	6	1185830	1185835	100 %	0 %	0 %	0 %	113969362
21071	NC_008321	TGA	2	6	1185874	1185879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969362
21072	NC_008321	GAG	2	6	1185938	1185943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969362
21073	NC_008321	TGG	2	6	1185984	1185989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969362
21074	NC_008321	TGG	2	6	1186006	1186011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969362
21075	NC_008321	TCG	2	6	1186089	1186094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969362
21076	NC_008321	CG	3	6	1186233	1186238	0 %	0 %	50 %	50 %	113969362
21077	NC_008321	TCA	2	6	1186273	1186278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969362
21078	NC_008321	AT	3	6	1186339	1186344	50 %	50 %	0 %	0 %	113969362
21079	NC_008321	AGT	2	6	1186369	1186374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969362
21080	NC_008321	TCG	2	6	1186394	1186399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969362
21081	NC_008321	GTA	2	6	1186447	1186452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969362
21082	NC_008321	ATC	2	6	1186464	1186469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21083	NC_008321	A	6	6	1186509	1186514	100 %	0 %	0 %	0 %	113969363
21084	NC_008321	CTT	2	6	1186577	1186582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969363
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21086	NC_008321	ATT	2	6	1186601	1186606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969363
21087	NC_008321	CAT	2	6	1186713	1186718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969363
21088	NC_008321	TAAT	2	8	1186739	1186746	50 %	50 %	0 %	0 %	113969363
21089	NC_008321	AAG	2	6	1186781	1186786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969363
21090	NC_008321	TGT	2	6	1186835	1186840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969363
21091	NC_008321	GCG	2	6	1186883	1186888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969363
21092	NC_008321	TGA	2	6	1186931	1186936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969363
21093	NC_008321	ATCAA	2	10	1186943	1186952	60 %	20 %	0 %	20 %	113969363
21094	NC_008321	GCTG	2	8	1186972	1186979	0 %	25 %	50 %	25 %	113969363
21095	NC_008321	TGA	2	6	1186980	1186985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969363
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21098	NC_008321	CAGGTA	2	12	1187090	1187101	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113969363
21099	NC_008321	CTTT	2	8	1187144	1187151	0 %	75 %	0 %	25 %	113969363
21100	NC_008321	TCG	2	6	1187171	1187176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969363
21101	NC_008321	TCG	2	6	1187183	1187188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969363
21102	NC_008321	CGTG	2	8	1187205	1187212	0 %	25 %	50 %	25 %	113969363
21103	NC_008321	A	6	6	1187230	1187235	100 %	0 %	0 %	0 %	113969363
21104	NC_008321	TAT	2	6	1187247	1187252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969363
21105	NC_008321	CGA	2	6	1187259	1187264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969363
21106	NC_008321	GGT	3	9	1187302	1187310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969363
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21108	NC_008321	GCT	2	6	1187427	1187432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969363
21109	NC_008321	AAGC	2	8	1187543	1187550	50 %	0 %	25 %	25 %	113969363
21110	NC_008321	GCG	2	6	1187623	1187628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969363
21111	NC_008321	CG	3	6	1187627	1187632	0 %	0 %	50 %	50 %	113969363
21112	NC_008321	GAA	2	6	1187656	1187661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969363
21113	NC_008321	ATG	2	6	1187686	1187691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969363
21114	NC_008321	CGC	2	6	1187701	1187706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969363
21115	NC_008321	GAAA	2	8	1187730	1187737	75 %	0 %	25 %	0 %	113969363
21116	NC_008321	CTT	3	9	1187847	1187855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969363
21117	NC_008321	CGT	2	6	1187884	1187889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969363
21118	NC_008321	GGT	2	6	1187920	1187925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969363
21119	NC_008321	GAA	2	6	1188070	1188075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969363
21120	NC_008321	CTG	2	6	1188199	1188204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969363
21121	NC_008321	TGA	2	6	1188242	1188247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969363
21122	NC_008321	TGA	2	6	1188284	1188289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969363
21123	NC_008321	GAT	2	6	1188328	1188333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969363
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21125	NC_008321	GTT	2	6	1188456	1188461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21127	NC_008321	CGT	2	6	1188659	1188664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969364
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21162	NC_008321	TAT	2	6	1191019	1191024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21190	NC_008321	T	6	6	1192569	1192574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21191	NC_008321	T	6	6	1192576	1192581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21232	NC_008321	TC	3	6	1194674	1194679	0 %	50 %	0 %	50 %	113969370
21233	NC_008321	AGC	2	6	1194728	1194733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969370
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21236	NC_008321	TGG	2	6	1194834	1194839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969370
21237	NC_008321	GAA	3	9	1194922	1194930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969370
21238	NC_008321	GCCGAA	2	12	1195015	1195026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969370
21239	NC_008321	GCTGAA	2	12	1195039	1195050	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113969370
21240	NC_008321	AGC	2	6	1195068	1195073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969370
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21248	NC_008321	GCA	2	6	1195448	1195453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969370
21249	NC_008321	ATC	2	6	1195579	1195584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969370
21250	NC_008321	ATG	2	6	1195591	1195596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969370
21251	NC_008321	GAA	2	6	1195660	1195665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969370
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21263	NC_008321	GTT	2	6	1195993	1195998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969370
21264	NC_008321	ATTG	2	8	1196067	1196074	25 %	50 %	25 %	0 %	113969370
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21320	NC_008321	GC	3	6	1198781	1198786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21321	NC_008321	GA	3	6	1198834	1198839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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21329	NC_008321	CCT	2	6	1199147	1199152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21331	NC_008321	CGAT	2	8	1199456	1199463	25 %	25 %	25 %	25 %	113969374
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21343	NC_008321	TGC	2	6	1200017	1200022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969374
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21347	NC_008321	TTCA	2	8	1200163	1200170	25 %	50 %	0 %	25 %	113969374
21348	NC_008321	CGG	2	6	1200216	1200221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969374
21349	NC_008321	CTGA	2	8	1200535	1200542	25 %	25 %	25 %	25 %	113969374
21350	NC_008321	CCAAG	2	10	1200576	1200585	40 %	0 %	20 %	40 %	113969374
21351	NC_008321	TCA	2	6	1200587	1200592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969374
21352	NC_008321	GCA	2	6	1200615	1200620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969374
21353	NC_008321	TATC	2	8	1200651	1200658	25 %	50 %	0 %	25 %	113969374
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21355	NC_008321	TAC	2	6	1200703	1200708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969374
21356	NC_008321	GC	3	6	1200732	1200737	0 %	0 %	50 %	50 %	113969374
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21360	NC_008321	TGC	2	6	1200833	1200838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969374
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21380	NC_008321	ATTA	2	8	1201427	1201434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21381	NC_008321	TAGC	2	8	1201539	1201546	25 %	25 %	25 %	25 %	113969375
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21384	NC_008321	CTT	2	6	1201609	1201614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969375
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21450	NC_008321	ACC	2	6	1204813	1204818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969377
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21452	NC_008321	TGGA	2	8	1204909	1204916	25 %	25 %	50 %	0 %	113969377
21453	NC_008321	TGG	2	6	1204971	1204976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969377
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21462	NC_008321	GAA	2	6	1205608	1205613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969377
21463	NC_008321	GC	3	6	1205793	1205798	0 %	0 %	50 %	50 %	113969377
21464	NC_008321	ATT	2	6	1205821	1205826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969377
21465	NC_008321	GAA	2	6	1205992	1205997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969377
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21469	NC_008321	CCG	2	6	1206186	1206191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969377
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