MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_008321	GTG	3	9	1124898	1124906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969304
20003	NC_008321	TGCCT	2	10	1124942	1124951	0 %	40 %	20 %	40 %	113969304
20004	NC_008321	GTG	2	6	1124952	1124957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969304
20005	NC_008321	CCA	2	6	1124974	1124979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969304
20006	NC_008321	CCGCA	2	10	1125008	1125017	20 %	0 %	20 %	60 %	113969304
20007	NC_008321	GGGC	2	8	1125019	1125026	0 %	0 %	75 %	25 %	113969304
20008	NC_008321	CAT	2	6	1125118	1125123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969304
20009	NC_008321	AG	3	6	1125165	1125170	50 %	0 %	50 %	0 %	113969304
20010	NC_008321	TCG	2	6	1125227	1125232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969304
20011	NC_008321	TAA	2	6	1125239	1125244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969304
20012	NC_008321	GCT	2	6	1125291	1125296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20013	NC_008321	TA	3	6	1125342	1125347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20014	NC_008321	CAC	2	6	1125435	1125440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969305
20015	NC_008321	ACC	2	6	1125459	1125464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969305
20016	NC_008321	CGAGC	2	10	1125522	1125531	20 %	0 %	40 %	40 %	113969305
20017	NC_008321	CAG	2	6	1125765	1125770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969305
20018	NC_008321	CTG	2	6	1125866	1125871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969305
20019	NC_008321	CTT	2	6	1125926	1125931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969305
20020	NC_008321	GAA	2	6	1125975	1125980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969305
20021	NC_008321	TGCT	2	8	1126049	1126056	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20022	NC_008321	GCA	2	6	1126255	1126260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969306
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20027	NC_008321	TGC	2	6	1126365	1126370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969306
20028	NC_008321	GTC	2	6	1126394	1126399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969306
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20033	NC_008321	TA	3	6	1126638	1126643	50 %	50 %	0 %	0 %	113969306
20034	NC_008321	GTG	2	6	1126769	1126774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969306
20035	NC_008321	GCGG	2	8	1126796	1126803	0 %	0 %	75 %	25 %	113969306
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20037	NC_008321	CGC	2	6	1127038	1127043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20038	NC_008321	CAGT	2	8	1127058	1127065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20039	NC_008321	GC	3	6	1127100	1127105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20040	NC_008321	AGCA	2	8	1127166	1127173	50 %	0 %	25 %	25 %	113969307
20041	NC_008321	GTC	2	6	1127187	1127192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969307
20042	NC_008321	GCT	2	6	1127210	1127215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969307
20043	NC_008321	TGC	2	6	1127239	1127244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969307
20044	NC_008321	CGT	2	6	1127333	1127338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969307
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20049	NC_008321	TCA	2	6	1127526	1127531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969307
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20051	NC_008321	GCTG	2	8	1127600	1127607	0 %	25 %	50 %	25 %	113969307
20052	NC_008321	ATT	2	6	1127650	1127655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969307
20053	NC_008321	GTG	2	6	1127685	1127690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969307
20054	NC_008321	TCC	2	6	1127704	1127709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969307
20055	NC_008321	TTA	2	6	1127738	1127743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969307
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20057	NC_008321	GAG	2	6	1127816	1127821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20058	NC_008321	GGAC	2	8	1127876	1127883	25 %	0 %	50 %	25 %	113969308
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20072	NC_008321	TGGCT	2	10	1128794	1128803	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20073	NC_008321	TACTCG	2	12	1128836	1128847	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113969309
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20116	NC_008321	GGT	2	6	1130833	1130838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969310
20117	NC_008321	ATC	2	6	1130884	1130889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969310
20118	NC_008321	CGC	2	6	1130961	1130966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969310
20119	NC_008321	CGGT	2	8	1130975	1130982	0 %	25 %	50 %	25 %	113969310
20120	NC_008321	TGA	2	6	1130999	1131004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969310
20121	NC_008321	TGG	2	6	1131015	1131020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969310
20122	NC_008321	AGCC	2	8	1131041	1131048	25 %	0 %	25 %	50 %	113969310
20123	NC_008321	CGT	2	6	1131057	1131062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969310
20124	NC_008321	GC	3	6	1131259	1131264	0 %	0 %	50 %	50 %	113969310
20125	NC_008321	TGCG	2	8	1131323	1131330	0 %	25 %	50 %	25 %	113969310
20126	NC_008321	GCT	2	6	1131456	1131461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969310
20127	NC_008321	GGT	3	9	1131688	1131696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969310
20128	NC_008321	CTG	2	6	1131732	1131737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969310
20129	NC_008321	TG	3	6	1131736	1131741	0 %	50 %	50 %	0 %	113969310
20130	NC_008321	CAT	2	6	1131780	1131785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969310
20131	NC_008321	AGA	2	6	1131861	1131866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969310
20132	NC_008321	GGT	2	6	1131919	1131924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969310
20133	NC_008321	GGC	2	6	1131957	1131962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969310
20134	NC_008321	ATT	2	6	1131973	1131978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969310
20135	NC_008321	AGC	2	6	1132055	1132060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969310
20136	NC_008321	CAC	2	6	1132077	1132082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969310
20137	NC_008321	GCC	2	6	1132102	1132107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969310
20138	NC_008321	GTT	2	6	1132129	1132134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969310
20139	NC_008321	CG	3	6	1132159	1132164	0 %	0 %	50 %	50 %	113969310
20140	NC_008321	CCT	2	6	1132381	1132386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969310
20141	NC_008321	TGA	2	6	1132466	1132471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969310
20142	NC_008321	GAA	2	6	1132488	1132493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969310
20143	NC_008321	GCC	2	6	1132585	1132590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969310
20144	NC_008321	GAA	2	6	1132633	1132638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969310
20145	NC_008321	AAG	2	6	1132664	1132669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969310
20146	NC_008321	AGGTG	2	10	1132734	1132743	20 %	20 %	60 %	0 %	113969310
20147	NC_008321	TGGGCG	2	12	1132745	1132756	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	113969310
20148	NC_008321	CT	3	6	1132826	1132831	0 %	50 %	0 %	50 %	113969310
20149	NC_008321	TTGA	2	8	1132882	1132889	25 %	50 %	25 %	0 %	113969310
20150	NC_008321	CCAC	2	8	1132910	1132917	25 %	0 %	0 %	75 %	113969310
20151	NC_008321	CA	3	6	1132988	1132993	50 %	0 %	0 %	50 %	113969310
20152	NC_008321	ACC	2	6	1133038	1133043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969310
20153	NC_008321	GCA	2	6	1133128	1133133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969310
20154	NC_008321	GAC	2	6	1133161	1133166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969310
20155	NC_008321	TCA	2	6	1133234	1133239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20156	NC_008321	GGC	2	6	1133330	1133335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969311
20157	NC_008321	CAGC	2	8	1133347	1133354	25 %	0 %	25 %	50 %	113969311
20158	NC_008321	TCC	2	6	1133423	1133428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969311
20159	NC_008321	GAT	2	6	1133460	1133465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969311
20160	NC_008321	CGGTG	2	10	1133530	1133539	0 %	20 %	60 %	20 %	113969311
20161	NC_008321	GCG	2	6	1133598	1133603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969311
20162	NC_008321	TGA	2	6	1133630	1133635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969311
20163	NC_008321	TAA	2	6	1133641	1133646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969311
20164	NC_008321	CAT	2	6	1133697	1133702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969311
20165	NC_008321	GTT	2	6	1133787	1133792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969311
20166	NC_008321	ATT	2	6	1133893	1133898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969311
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20172	NC_008321	TAA	2	6	1134070	1134075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20173	NC_008321	AGG	2	6	1134154	1134159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20174	NC_008321	ATAG	2	8	1134214	1134221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20175	NC_008321	TAC	2	6	1134233	1134238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20176	NC_008321	GGGAA	2	10	1134251	1134260	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20177	NC_008321	GA	3	6	1134261	1134266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20178	NC_008321	CTG	2	6	1134303	1134308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20179	NC_008321	CAGC	2	8	1134436	1134443	25 %	0 %	25 %	50 %	113969312
20180	NC_008321	TTC	2	6	1134594	1134599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969312
20181	NC_008321	AATT	2	8	1134602	1134609	50 %	50 %	0 %	0 %	113969312
20182	NC_008321	A	6	6	1134657	1134662	100 %	0 %	0 %	0 %	113969312
20183	NC_008321	CGC	2	6	1134671	1134676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969312
20184	NC_008321	CTG	2	6	1134689	1134694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969312
20185	NC_008321	GAA	2	6	1134747	1134752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969312
20186	NC_008321	TCG	2	6	1134888	1134893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969312
20187	NC_008321	GGC	2	6	1134944	1134949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969312
20188	NC_008321	GGTT	2	8	1134964	1134971	0 %	50 %	50 %	0 %	113969312
20189	NC_008321	TGG	2	6	1135057	1135062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969312
20190	NC_008321	CG	3	6	1135082	1135087	0 %	0 %	50 %	50 %	113969312
20191	NC_008321	TTC	2	6	1135157	1135162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969312
20192	NC_008321	GCT	2	6	1135178	1135183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969312
20193	NC_008321	TC	3	6	1135194	1135199	0 %	50 %	0 %	50 %	113969312
20194	NC_008321	CGC	2	6	1135216	1135221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969312
20195	NC_008321	TGC	2	6	1135278	1135283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969312
20196	NC_008321	T	6	6	1135308	1135313	0 %	100 %	0 %	0 %	113969312
20197	NC_008321	TGT	2	6	1135341	1135346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969312
20198	NC_008321	GCA	2	6	1135442	1135447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20199	NC_008321	TAA	2	6	1135506	1135511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20200	NC_008321	TAA	2	6	1135552	1135557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20201	NC_008321	ACA	2	6	1135558	1135563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20202	NC_008321	TGCCT	2	10	1135630	1135639	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20203	NC_008321	CCA	2	6	1135678	1135683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20204	NC_008321	GCG	2	6	1135811	1135816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20205	NC_008321	TGAT	2	8	1135844	1135851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20206	NC_008321	GT	3	6	1135896	1135901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20207	NC_008321	GAT	2	6	1135969	1135974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20208	NC_008321	GCA	2	6	1136002	1136007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969313
20209	NC_008321	ACA	2	6	1136036	1136041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969313
20210	NC_008321	GCC	2	6	1136089	1136094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969313
20211	NC_008321	CAT	2	6	1136180	1136185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969313
20212	NC_008321	AGG	2	6	1136205	1136210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969313
20213	NC_008321	GCA	2	6	1136245	1136250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969313
20214	NC_008321	ACTC	2	8	1136254	1136261	25 %	25 %	0 %	50 %	113969313
20215	NC_008321	GGT	2	6	1136269	1136274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969313
20216	NC_008321	TGG	2	6	1136319	1136324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969313
20217	NC_008321	GGC	2	6	1136386	1136391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969313
20218	NC_008321	TTTAGC	2	12	1136411	1136422	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	113969313
20219	NC_008321	GGC	2	6	1136641	1136646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969313
20220	NC_008321	AGA	2	6	1136672	1136677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969313
20221	NC_008321	GC	3	6	1136736	1136741	0 %	0 %	50 %	50 %	113969313
20222	NC_008321	GCG	2	6	1136819	1136824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969313
20223	NC_008321	CCCA	2	8	1136927	1136934	25 %	0 %	0 %	75 %	113969313
20224	NC_008321	GGT	2	6	1137019	1137024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969313
20225	NC_008321	GCG	2	6	1137121	1137126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969313
20226	NC_008321	GCT	2	6	1137236	1137241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969314
20227	NC_008321	A	6	6	1137261	1137266	100 %	0 %	0 %	0 %	113969314
20228	NC_008321	CGC	2	6	1137374	1137379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969314
20229	NC_008321	TTG	2	6	1137429	1137434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969314
20230	NC_008321	CGG	2	6	1137530	1137535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969314
20231	NC_008321	GC	3	6	1137562	1137567	0 %	0 %	50 %	50 %	113969314
20232	NC_008321	GGC	2	6	1137599	1137604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969314
20233	NC_008321	A	7	7	1137645	1137651	100 %	0 %	0 %	0 %	113969314
20234	NC_008321	GGGCA	2	10	1137672	1137681	20 %	0 %	60 %	20 %	113969314
20235	NC_008321	TGG	2	6	1137718	1137723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969314
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20351	NC_008321	A	7	7	1143832	1143838	100 %	0 %	0 %	0 %	113969320
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20355	NC_008321	GCC	2	6	1143993	1143998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969320
20356	NC_008321	TCG	2	6	1144136	1144141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969321
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20375	NC_008321	AG	3	6	1145153	1145158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20376	NC_008321	TTAA	2	8	1145290	1145297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20378	NC_008321	GC	3	6	1145480	1145485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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20384	NC_008321	CG	3	6	1145860	1145865	0 %	0 %	50 %	50 %	113969322
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20461	NC_008321	T	6	6	1151301	1151306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20462	NC_008321	TAA	2	6	1151314	1151319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20463	NC_008321	ACTTC	2	10	1151330	1151339	20 %	40 %	0 %	40 %	113969328
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20468	NC_008321	GGC	2	6	1151731	1151736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969328
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20472	NC_008321	AAG	2	6	1152077	1152082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969328
20473	NC_008321	CTT	2	6	1152083	1152088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969328
20474	NC_008321	TGCT	2	8	1152120	1152127	0 %	50 %	25 %	25 %	113969328
20475	NC_008321	GCT	2	6	1152297	1152302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969329
20476	NC_008321	TGA	3	9	1152309	1152317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969329
20477	NC_008321	GTT	2	6	1152322	1152327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969329
20478	NC_008321	TAA	2	6	1152352	1152357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969329
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20480	NC_008321	TTGCA	2	10	1152405	1152414	20 %	40 %	20 %	20 %	113969329
20481	NC_008321	AGC	2	6	1152502	1152507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969329
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20483	NC_008321	TGC	2	6	1152661	1152666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969329
20484	NC_008321	GAG	2	6	1152677	1152682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969329
20485	NC_008321	GCC	2	6	1152725	1152730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969329
20486	NC_008321	GT	3	6	1152856	1152861	0 %	50 %	50 %	0 %	113969329
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20488	NC_008321	CA	3	6	1152885	1152890	50 %	0 %	0 %	50 %	113969329
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20492	NC_008321	CCT	2	6	1152984	1152989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20493	NC_008321	AGT	2	6	1153131	1153136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969330
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20497	NC_008321	AAC	2	6	1153380	1153385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20498	NC_008321	ACCA	2	8	1153432	1153439	50 %	0 %	0 %	50 %	113969331
20499	NC_008321	CTT	2	6	1153495	1153500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969331
20500	NC_008321	T	6	6	1153574	1153579	0 %	100 %	0 %	0 %	113969331

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