MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_008321	GTG	2	6	1098394	1098399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969284
19502	NC_008321	TTA	2	6	1098515	1098520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969284
19503	NC_008321	GT	3	6	1098560	1098565	0 %	50 %	50 %	0 %	113969284
19504	NC_008321	CTT	2	6	1098588	1098593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19505	NC_008321	TTAGTG	2	12	1098701	1098712	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	113969285
19506	NC_008321	ACG	2	6	1098768	1098773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969285
19507	NC_008321	TGG	2	6	1098802	1098807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969285
19508	NC_008321	TGG	2	6	1098859	1098864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969285
19509	NC_008321	GGT	2	6	1098866	1098871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969285
19510	NC_008321	GGC	2	6	1098905	1098910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969285
19511	NC_008321	GTCT	2	8	1098972	1098979	0 %	50 %	25 %	25 %	113969285
19512	NC_008321	GAA	2	6	1099022	1099027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969285
19513	NC_008321	AAG	2	6	1099040	1099045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969285
19514	NC_008321	ATA	2	6	1099071	1099076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969285
19515	NC_008321	GTTCC	2	10	1099127	1099136	0 %	40 %	20 %	40 %	113969285
19516	NC_008321	GGT	2	6	1099142	1099147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969285
19517	NC_008321	GTG	2	6	1099215	1099220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969285
19518	NC_008321	CTT	2	6	1099237	1099242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969285
19519	NC_008321	GAA	2	6	1099265	1099270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969285
19520	NC_008321	AGA	2	6	1099303	1099308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969285
19521	NC_008321	CAT	3	9	1099315	1099323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969285
19522	NC_008321	TTC	2	6	1099448	1099453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969285
19523	NC_008321	GGT	3	9	1099487	1099495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969285
19524	NC_008321	CA	3	6	1099518	1099523	50 %	0 %	0 %	50 %	113969285
19525	NC_008321	AGA	2	6	1099759	1099764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969285
19526	NC_008321	TG	3	6	1099779	1099784	0 %	50 %	50 %	0 %	113969285
19527	NC_008321	ATG	2	6	1099793	1099798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969285
19528	NC_008321	CGG	2	6	1099867	1099872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969285
19529	NC_008321	GTT	2	6	1099962	1099967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969286
19530	NC_008321	CTGG	2	8	1100040	1100047	0 %	25 %	50 %	25 %	113969286
19531	NC_008321	T	6	6	1100065	1100070	0 %	100 %	0 %	0 %	113969286
19532	NC_008321	GCA	2	6	1100114	1100119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969286
19533	NC_008321	AAG	2	6	1100324	1100329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969286
19534	NC_008321	CCAA	2	8	1100419	1100426	50 %	0 %	0 %	50 %	113969286
19535	NC_008321	AAGC	2	8	1100505	1100512	50 %	0 %	25 %	25 %	113969286
19536	NC_008321	TGG	2	6	1100622	1100627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969286
19537	NC_008321	ACCG	2	8	1100688	1100695	25 %	0 %	25 %	50 %	113969286
19538	NC_008321	ATG	2	6	1100696	1100701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969286
19539	NC_008321	ATT	2	6	1100768	1100773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969286
19540	NC_008321	GAA	2	6	1100779	1100784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969286
19541	NC_008321	GAT	2	6	1100901	1100906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969286
19542	NC_008321	AAGA	2	8	1100941	1100948	75 %	0 %	25 %	0 %	113969286
19543	NC_008321	CTA	2	6	1100997	1101002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969286
19544	NC_008321	AGT	2	6	1101029	1101034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969286
19545	NC_008321	TTA	2	6	1101075	1101080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969287
19546	NC_008321	TCA	2	6	1101112	1101117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969287
19547	NC_008321	GAAG	2	8	1101132	1101139	50 %	0 %	50 %	0 %	113969287
19548	NC_008321	TGA	2	6	1101185	1101190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969287
19549	NC_008321	AAGCGT	2	12	1101201	1101212	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113969287
19550	NC_008321	AGA	2	6	1101224	1101229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969287
19551	NC_008321	GC	3	6	1101231	1101236	0 %	0 %	50 %	50 %	113969287
19552	NC_008321	CCT	2	6	1101292	1101297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19553	NC_008321	T	7	7	1101308	1101314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19554	NC_008321	AAGA	2	8	1101435	1101442	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19555	NC_008321	CTG	2	6	1101455	1101460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19556	NC_008321	AT	3	6	1101486	1101491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19557	NC_008321	GAG	2	6	1101492	1101497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19558	NC_008321	GTG	2	6	1101662	1101667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969288
19559	NC_008321	ATCC	2	8	1101784	1101791	25 %	25 %	0 %	50 %	113969288
19560	NC_008321	TAT	2	6	1101828	1101833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969288
19561	NC_008321	AAC	2	6	1101930	1101935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969288
19562	NC_008321	TGAAGA	2	12	1102015	1102026	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	113969288
19563	NC_008321	CAG	2	6	1102052	1102057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969288
19564	NC_008321	GAAC	2	8	1102237	1102244	50 %	0 %	25 %	25 %	113969289
19565	NC_008321	GAT	2	6	1102271	1102276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969289
19566	NC_008321	TGC	2	6	1102383	1102388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969289
19567	NC_008321	GAT	2	6	1102421	1102426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969289
19568	NC_008321	TG	3	6	1102446	1102451	0 %	50 %	50 %	0 %	113969289
19569	NC_008321	A	6	6	1102457	1102462	100 %	0 %	0 %	0 %	113969289
19570	NC_008321	CGA	2	6	1102498	1102503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969289
19571	NC_008321	TTGA	2	8	1102547	1102554	25 %	50 %	25 %	0 %	113969289
19572	NC_008321	A	6	6	1102687	1102692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19573	NC_008321	TCT	2	6	1102710	1102715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19574	NC_008321	GATG	2	8	1102716	1102723	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19575	NC_008321	T	6	6	1102786	1102791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19576	NC_008321	TCA	2	6	1102793	1102798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19577	NC_008321	TGT	2	6	1102806	1102811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19578	NC_008321	T	6	6	1102855	1102860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19579	NC_008321	TGGT	2	8	1102867	1102874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19580	NC_008321	GATG	2	8	1102889	1102896	25 %	25 %	50 %	0 %	113969290
19581	NC_008321	AT	3	6	1102899	1102904	50 %	50 %	0 %	0 %	113969290
19582	NC_008321	TCG	2	6	1102940	1102945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969290
19583	NC_008321	CTT	2	6	1102960	1102965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969290
19584	NC_008321	AAAG	2	8	1102993	1103000	75 %	0 %	25 %	0 %	113969290
19585	NC_008321	TAA	2	6	1103001	1103006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969290
19586	NC_008321	GGT	2	6	1103068	1103073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969290
19587	NC_008321	TTG	2	6	1103078	1103083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969290
19588	NC_008321	ATT	2	6	1103194	1103199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969290
19589	NC_008321	TGG	2	6	1103335	1103340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969290
19590	NC_008321	AGG	2	6	1103342	1103347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969290
19591	NC_008321	TTGT	2	8	1103365	1103372	0 %	75 %	25 %	0 %	113969290
19592	NC_008321	TGG	2	6	1103463	1103468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969290
19593	NC_008321	CTT	2	6	1103541	1103546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969290
19594	NC_008321	CCG	2	6	1103599	1103604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969290
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19596	NC_008321	TTG	2	6	1103846	1103851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969290
19597	NC_008321	TGT	2	6	1103864	1103869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969290
19598	NC_008321	CGATG	2	10	1103931	1103940	20 %	20 %	40 %	20 %	113969290
19599	NC_008321	GCA	2	6	1104048	1104053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969290
19600	NC_008321	GATG	2	8	1104102	1104109	25 %	25 %	50 %	0 %	113969290
19601	NC_008321	GT	3	6	1104118	1104123	0 %	50 %	50 %	0 %	113969290
19602	NC_008321	ACA	2	6	1104156	1104161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969290
19603	NC_008321	GCC	2	6	1104181	1104186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969290
19604	NC_008321	AGCG	2	8	1104230	1104237	25 %	0 %	50 %	25 %	113969290
19605	NC_008321	TCA	2	6	1104350	1104355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969290
19606	NC_008321	AGC	2	6	1104367	1104372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969290
19607	NC_008321	ACCAA	2	10	1104419	1104428	60 %	0 %	0 %	40 %	113969290
19608	NC_008321	GGC	2	6	1104456	1104461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969290
19609	NC_008321	GCGG	2	8	1104462	1104469	0 %	0 %	75 %	25 %	113969290
19610	NC_008321	GTG	2	6	1104493	1104498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969290
19611	NC_008321	CA	3	6	1104648	1104653	50 %	0 %	0 %	50 %	113969290
19612	NC_008321	CAG	2	6	1104700	1104705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969290
19613	NC_008321	CAG	2	6	1104736	1104741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969290
19614	NC_008321	AGA	2	6	1104753	1104758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969290
19615	NC_008321	GCGT	2	8	1104779	1104786	0 %	25 %	50 %	25 %	113969290
19616	NC_008321	T	6	6	1104940	1104945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19617	NC_008321	TA	3	6	1105013	1105018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19618	NC_008321	GGA	2	6	1105035	1105040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19619	NC_008321	TCAT	2	8	1105058	1105065	25 %	50 %	0 %	25 %	113969291
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19622	NC_008321	TCA	2	6	1105166	1105171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969291
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19971	NC_008321	TGC	2	6	1123436	1123441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19972	NC_008321	CAT	2	6	1123535	1123540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19973	NC_008321	GAT	2	6	1123542	1123547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19974	NC_008321	ACTA	2	8	1123616	1123623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19975	NC_008321	AGG	2	6	1123662	1123667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19976	NC_008321	TCC	2	6	1123681	1123686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19977	NC_008321	G	7	7	1123712	1123718	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19978	NC_008321	TTTGAT	2	12	1123731	1123742	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19979	NC_008321	ATT	2	6	1123773	1123778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19980	NC_008321	AG	3	6	1123789	1123794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19981	NC_008321	AAT	2	6	1123815	1123820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19982	NC_008321	AAC	2	6	1123825	1123830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19983	NC_008321	AGC	2	6	1123872	1123877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19984	NC_008321	TTC	2	6	1123943	1123948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969304
19985	NC_008321	GCG	2	6	1123998	1124003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969304
19986	NC_008321	TGCC	2	8	1124017	1124024	0 %	25 %	25 %	50 %	113969304
19987	NC_008321	CCAT	2	8	1124152	1124159	25 %	25 %	0 %	50 %	113969304
19988	NC_008321	CAA	2	6	1124160	1124165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969304
19989	NC_008321	CAG	2	6	1124169	1124174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969304
19990	NC_008321	TGGTGC	2	12	1124233	1124244	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	113969304
19991	NC_008321	GCA	2	6	1124261	1124266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969304
19992	NC_008321	TCT	2	6	1124307	1124312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969304
19993	NC_008321	CTC	2	6	1124325	1124330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969304
19994	NC_008321	GGC	2	6	1124334	1124339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969304
19995	NC_008321	GAA	2	6	1124349	1124354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969304
19996	NC_008321	ATG	2	6	1124529	1124534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969304
19997	NC_008321	CAA	2	6	1124612	1124617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969304
19998	NC_008321	CGC	2	6	1124654	1124659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969304
19999	NC_008321	ATTG	2	8	1124711	1124718	25 %	50 %	25 %	0 %	113969304
20000	NC_008321	GAT	2	6	1124772	1124777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969304

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