MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_008321	ATA	2	6	1071415	1071420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969262
19003	NC_008321	GGC	2	6	1071447	1071452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969262
19004	NC_008321	TCCAG	2	10	1071503	1071512	20 %	20 %	20 %	40 %	113969262
19005	NC_008321	TAA	2	6	1071546	1071551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969262
19006	NC_008321	AAC	2	6	1071562	1071567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969262
19007	NC_008321	AAT	2	6	1071603	1071608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969262
19008	NC_008321	AT	3	6	1071739	1071744	50 %	50 %	0 %	0 %	113969262
19009	NC_008321	TAAG	2	8	1071764	1071771	50 %	25 %	25 %	0 %	113969262
19010	NC_008321	TAA	2	6	1071813	1071818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969262
19011	NC_008321	CGA	2	6	1071899	1071904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969262
19012	NC_008321	GAT	2	6	1071927	1071932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969262
19013	NC_008321	AGC	2	6	1071949	1071954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969262
19014	NC_008321	TGC	2	6	1072012	1072017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969262
19015	NC_008321	CAATCG	2	12	1072235	1072246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113969263
19016	NC_008321	GCT	2	6	1072252	1072257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969263
19017	NC_008321	GCC	2	6	1072288	1072293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969263
19018	NC_008321	CAG	2	6	1072323	1072328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969263
19019	NC_008321	AAT	2	6	1072359	1072364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969263
19020	NC_008321	CG	3	6	1072392	1072397	0 %	0 %	50 %	50 %	113969263
19021	NC_008321	TGT	2	6	1072466	1072471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969263
19022	NC_008321	CG	3	6	1072524	1072529	0 %	0 %	50 %	50 %	113969263
19023	NC_008321	TGA	2	6	1072565	1072570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969263
19024	NC_008321	TGCT	2	8	1072582	1072589	0 %	50 %	25 %	25 %	113969263
19025	NC_008321	ACC	2	6	1072602	1072607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969263
19026	NC_008321	TTG	2	6	1072608	1072613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969263
19027	NC_008321	ACC	2	6	1072632	1072637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969263
19028	NC_008321	CCG	2	6	1072736	1072741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969263
19029	NC_008321	CAG	2	6	1072749	1072754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969263
19030	NC_008321	GAC	2	6	1072770	1072775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969263
19031	NC_008321	TAA	2	6	1072832	1072837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969263
19032	NC_008321	CTTGGC	2	12	1072865	1072876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969263
19033	NC_008321	AGT	2	6	1072903	1072908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969263
19034	NC_008321	GCA	2	6	1072978	1072983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969263
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19036	NC_008321	GGC	2	6	1073151	1073156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969263
19037	NC_008321	A	6	6	1073163	1073168	100 %	0 %	0 %	0 %	113969263
19038	NC_008321	GCA	2	6	1073251	1073256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969263
19039	NC_008321	GCCA	2	8	1073262	1073269	25 %	0 %	25 %	50 %	113969263
19040	NC_008321	AAT	2	6	1073292	1073297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969263
19041	NC_008321	CCG	2	6	1073314	1073319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969263
19042	NC_008321	TTGA	2	8	1073337	1073344	25 %	50 %	25 %	0 %	113969263
19043	NC_008321	ATA	2	6	1073357	1073362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969263
19044	NC_008321	AAT	2	6	1073373	1073378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969263
19045	NC_008321	CGG	2	6	1073568	1073573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19046	NC_008321	CAT	2	6	1073628	1073633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19047	NC_008321	TTAT	2	8	1073767	1073774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19048	NC_008321	TGT	2	6	1073798	1073803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19049	NC_008321	TG	3	6	1073831	1073836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19050	NC_008321	A	7	7	1073928	1073934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19051	NC_008321	CAT	2	6	1073959	1073964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19052	NC_008321	TTA	2	6	1073983	1073988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19053	NC_008321	TAATGA	2	12	1074014	1074025	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_008321	GTT	2	6	1074031	1074036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19055	NC_008321	CTA	2	6	1074046	1074051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19056	NC_008321	TAA	2	6	1074072	1074077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19057	NC_008321	TCT	2	6	1074107	1074112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969264
19058	NC_008321	GTC	2	6	1074128	1074133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969264
19059	NC_008321	CACTGC	2	12	1074166	1074177	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113969264
19060	NC_008321	ATTT	2	8	1074186	1074193	25 %	75 %	0 %	0 %	113969264
19061	NC_008321	AAG	2	6	1074225	1074230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969264
19062	NC_008321	ATTA	2	8	1074293	1074300	50 %	50 %	0 %	0 %	113969264
19063	NC_008321	ATC	2	6	1074386	1074391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969264
19064	NC_008321	GAT	2	6	1074482	1074487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969264
19065	NC_008321	GTCT	2	8	1074492	1074499	0 %	50 %	25 %	25 %	113969264
19066	NC_008321	AAGACA	2	12	1074546	1074557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	113969264
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19071	NC_008321	AAG	2	6	1074972	1074977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969264
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19074	NC_008321	CATA	2	8	1075092	1075099	50 %	25 %	0 %	25 %	113969265
19075	NC_008321	GTC	2	6	1075128	1075133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969265
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19086	NC_008321	GTGG	2	8	1075934	1075941	0 %	25 %	75 %	0 %	113969266
19087	NC_008321	GAT	2	6	1075945	1075950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969266
19088	NC_008321	GCT	2	6	1075987	1075992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969266
19089	NC_008321	TGTGC	2	10	1076191	1076200	0 %	40 %	40 %	20 %	113969266
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19091	NC_008321	GC	3	6	1076365	1076370	0 %	0 %	50 %	50 %	113969266
19092	NC_008321	GC	3	6	1076383	1076388	0 %	0 %	50 %	50 %	113969266
19093	NC_008321	GCC	2	6	1076432	1076437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969266
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19097	NC_008321	A	6	6	1076544	1076549	100 %	0 %	0 %	0 %	113969267
19098	NC_008321	ATC	2	6	1076583	1076588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969267
19099	NC_008321	TGC	2	6	1076626	1076631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969267
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19101	NC_008321	GGCT	2	8	1076724	1076731	0 %	25 %	50 %	25 %	113969267
19102	NC_008321	A	6	6	1076787	1076792	100 %	0 %	0 %	0 %	113969267
19103	NC_008321	AC	3	6	1076906	1076911	50 %	0 %	0 %	50 %	113969267
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19107	NC_008321	GCA	2	6	1076975	1076980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969267
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19109	NC_008321	T	6	6	1077025	1077030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19116	NC_008321	GCC	2	6	1077521	1077526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969268
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19118	NC_008321	TGAG	2	8	1077686	1077693	25 %	25 %	50 %	0 %	113969268
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19238	NC_008321	CGG	2	6	1083802	1083807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969273
19239	NC_008321	ACG	2	6	1083870	1083875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
19240	NC_008321	GTG	2	6	1083892	1083897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969273
19241	NC_008321	AAT	2	6	1083902	1083907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969273
19242	NC_008321	AAG	2	6	1083987	1083992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969273
19243	NC_008321	CGC	2	6	1084015	1084020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969273
19244	NC_008321	TAA	2	6	1084073	1084078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969273
19245	NC_008321	GCA	2	6	1084117	1084122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
19246	NC_008321	ATA	2	6	1084361	1084366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969273
19247	NC_008321	GCA	2	6	1084429	1084434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
19248	NC_008321	GGT	2	6	1084511	1084516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969273
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19250	NC_008321	TTTCAA	2	12	1084546	1084557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	113969273
19251	NC_008321	CTG	2	6	1084602	1084607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969273
19252	NC_008321	GGC	2	6	1084706	1084711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969273
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19254	NC_008321	GCA	3	9	1084873	1084881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969273
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19257	NC_008321	GCT	2	6	1084979	1084984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969273
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19262	NC_008321	TAAGGC	2	12	1085132	1085143	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113969273
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19266	NC_008321	GC	3	6	1085265	1085270	0 %	0 %	50 %	50 %	113969273
19267	NC_008321	GGC	2	6	1085366	1085371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969273
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19277	NC_008321	T	6	6	1086070	1086075	0 %	100 %	0 %	0 %	113969273
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19285	NC_008321	ATC	2	6	1086410	1086415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969273
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19342	NC_008321	T	6	6	1089460	1089465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19343	NC_008321	ATT	2	6	1089487	1089492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19344	NC_008321	TCCC	2	8	1089498	1089505	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19345	NC_008321	CAG	2	6	1089537	1089542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19346	NC_008321	TCG	2	6	1089553	1089558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19352	NC_008321	T	7	7	1089985	1089991	0 %	100 %	0 %	0 %	113969277
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19472	NC_008321	TTTA	2	8	1096920	1096927	25 %	75 %	0 %	0 %	113969282
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