MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_008321	TGAG	2	8	1042092	1042099	25 %	25 %	50 %	0 %	113969233
18503	NC_008321	CGG	2	6	1042278	1042283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969233
18504	NC_008321	CTGGAA	2	12	1042366	1042377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113969233
18505	NC_008321	CTT	2	6	1042495	1042500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969233
18506	NC_008321	ATA	2	6	1042536	1042541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969233
18507	NC_008321	TAC	2	6	1042559	1042564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969233
18508	NC_008321	ATG	2	6	1042577	1042582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969233
18509	NC_008321	ATC	2	6	1042635	1042640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969233
18510	NC_008321	TAT	2	6	1042667	1042672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18511	NC_008321	TTG	2	6	1042779	1042784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969234
18512	NC_008321	GGT	2	6	1042843	1042848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969234
18513	NC_008321	ATTGGT	2	12	1042885	1042896	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	113969234
18514	NC_008321	A	6	6	1042939	1042944	100 %	0 %	0 %	0 %	113969234
18515	NC_008321	GC	3	6	1042979	1042984	0 %	0 %	50 %	50 %	113969234
18516	NC_008321	ATGG	2	8	1042995	1043002	25 %	25 %	50 %	0 %	113969234
18517	NC_008321	GGT	2	6	1043026	1043031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969234
18518	NC_008321	GCG	2	6	1043047	1043052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969234
18519	NC_008321	GCG	2	6	1043077	1043082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969234
18520	NC_008321	CG	3	6	1043081	1043086	0 %	0 %	50 %	50 %	113969234
18521	NC_008321	TGT	2	6	1043123	1043128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969234
18522	NC_008321	TGG	2	6	1043159	1043164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969234
18523	NC_008321	TGT	2	6	1043246	1043251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969234
18524	NC_008321	CT	3	6	1043351	1043356	0 %	50 %	0 %	50 %	113969234
18525	NC_008321	TGA	2	6	1043376	1043381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18526	NC_008321	GAA	2	6	1043386	1043391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18527	NC_008321	A	7	7	1043408	1043414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18528	NC_008321	T	6	6	1043433	1043438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18529	NC_008321	CAT	2	6	1043474	1043479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969235
18530	NC_008321	CCG	2	6	1043508	1043513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969235
18531	NC_008321	CTT	2	6	1043520	1043525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969235
18532	NC_008321	GTC	2	6	1043554	1043559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969235
18533	NC_008321	CTG	2	6	1043719	1043724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969235
18534	NC_008321	GTG	2	6	1043774	1043779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969235
18535	NC_008321	AAT	2	6	1043810	1043815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18536	NC_008321	TGG	2	6	1043820	1043825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18537	NC_008321	AGGA	2	8	1043848	1043855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18538	NC_008321	TGC	2	6	1043986	1043991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18539	NC_008321	ATC	2	6	1044025	1044030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18540	NC_008321	AAT	2	6	1044105	1044110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18541	NC_008321	CCT	2	6	1044122	1044127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18542	NC_008321	TCT	2	6	1044139	1044144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18543	NC_008321	TAC	2	6	1044223	1044228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969236
18544	NC_008321	CTAT	2	8	1044391	1044398	25 %	50 %	0 %	25 %	113969236
18545	NC_008321	GCC	2	6	1044407	1044412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969236
18546	NC_008321	A	7	7	1044422	1044428	100 %	0 %	0 %	0 %	113969236
18547	NC_008321	GTAC	2	8	1044506	1044513	25 %	25 %	25 %	25 %	113969236
18548	NC_008321	CAC	2	6	1044546	1044551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969236
18549	NC_008321	GAC	2	6	1044591	1044596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969236
18550	NC_008321	GCA	2	6	1044716	1044721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18551	NC_008321	TTGC	2	8	1044818	1044825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18552	NC_008321	TAAG	2	8	1044907	1044914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18553	NC_008321	GGCA	2	8	1044936	1044943	25 %	0 %	50 %	25 %	113969237
18554	NC_008321	CAG	2	6	1044977	1044982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969237
18555	NC_008321	TCC	2	6	1045030	1045035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969237
18556	NC_008321	AAC	2	6	1045063	1045068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969237
18557	NC_008321	CCG	2	6	1045169	1045174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969237
18558	NC_008321	ATT	2	6	1045391	1045396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969237
18559	NC_008321	A	6	6	1045424	1045429	100 %	0 %	0 %	0 %	113969237
18560	NC_008321	CAC	2	6	1045482	1045487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969237
18561	NC_008321	CTT	2	6	1045504	1045509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969237
18562	NC_008321	CTG	2	6	1045541	1045546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969237
18563	NC_008321	TTG	2	6	1045641	1045646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_008321	TTC	2	6	1045761	1045766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969238
18565	NC_008321	GC	3	6	1045793	1045798	0 %	0 %	50 %	50 %	113969238
18566	NC_008321	TGC	2	6	1045876	1045881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969238
18567	NC_008321	TCT	3	9	1045882	1045890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969238
18568	NC_008321	ATC	2	6	1045944	1045949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969238
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18570	NC_008321	TCG	2	6	1045999	1046004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969238
18571	NC_008321	GGC	2	6	1046100	1046105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969238
18572	NC_008321	TCT	2	6	1046152	1046157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969238
18573	NC_008321	GCA	2	6	1046237	1046242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969238
18574	NC_008321	TCA	2	6	1046264	1046269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969238
18575	NC_008321	CTA	2	6	1046300	1046305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969238
18576	NC_008321	CAT	2	6	1046378	1046383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969238
18577	NC_008321	AAT	2	6	1046415	1046420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969238
18578	NC_008321	GC	4	8	1046461	1046468	0 %	0 %	50 %	50 %	113969238
18579	NC_008321	GGAC	2	8	1046474	1046481	25 %	0 %	50 %	25 %	113969238
18580	NC_008321	ACC	3	9	1046502	1046510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969238
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18582	NC_008321	ATA	2	6	1046632	1046637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969238
18583	NC_008321	TA	3	6	1046691	1046696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18584	NC_008321	GAAT	2	8	1046697	1046704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18585	NC_008321	ACT	2	6	1046739	1046744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18586	NC_008321	T	7	7	1046766	1046772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18587	NC_008321	TTC	2	6	1046806	1046811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18588	NC_008321	GTG	2	6	1046926	1046931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969239
18589	NC_008321	ACA	2	6	1046936	1046941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969239
18590	NC_008321	CA	3	6	1046958	1046963	50 %	0 %	0 %	50 %	113969239
18591	NC_008321	TAG	2	6	1047064	1047069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969239
18592	NC_008321	AGT	2	6	1047092	1047097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969239
18593	NC_008321	CGT	3	9	1047138	1047146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969239
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18597	NC_008321	A	6	6	1047242	1047247	100 %	0 %	0 %	0 %	113969240
18598	NC_008321	TCGT	2	8	1047342	1047349	0 %	50 %	25 %	25 %	113969240
18599	NC_008321	CTGA	2	8	1047416	1047423	25 %	25 %	25 %	25 %	113969240
18600	NC_008321	GTAAA	2	10	1047426	1047435	60 %	20 %	20 %	0 %	113969240
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18602	NC_008321	TTA	2	6	1047468	1047473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969240
18603	NC_008321	TGG	2	6	1047524	1047529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18604	NC_008321	T	6	6	1047539	1047544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18605	NC_008321	T	6	6	1047637	1047642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18606	NC_008321	TTCA	2	8	1047674	1047681	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18607	NC_008321	AGTA	2	8	1047693	1047700	50 %	25 %	25 %	0 %	113969241
18608	NC_008321	CGG	2	6	1047744	1047749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969241
18609	NC_008321	TG	3	6	1047757	1047762	0 %	50 %	50 %	0 %	113969241
18610	NC_008321	AT	3	6	1047780	1047785	50 %	50 %	0 %	0 %	113969241
18611	NC_008321	TGG	2	6	1047792	1047797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969241
18612	NC_008321	TGG	2	6	1047804	1047809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969241
18613	NC_008321	CGG	2	6	1047822	1047827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969241
18614	NC_008321	GGCCGT	2	12	1047916	1047927	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	113969241
18615	NC_008321	GATTT	2	10	1047952	1047961	20 %	60 %	20 %	0 %	113969241
18616	NC_008321	TGA	3	9	1047990	1047998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969241
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18618	NC_008321	GCT	2	6	1048164	1048169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969241
18619	NC_008321	GTT	2	6	1048170	1048175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969241
18620	NC_008321	CG	3	6	1048228	1048233	0 %	0 %	50 %	50 %	113969241
18621	NC_008321	ACG	2	6	1048273	1048278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969241
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18624	NC_008321	TCG	2	6	1048484	1048489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969241
18625	NC_008321	GCAA	2	8	1048519	1048526	50 %	0 %	25 %	25 %	113969241
18626	NC_008321	CTG	2	6	1048558	1048563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969241
18627	NC_008321	GCT	2	6	1048680	1048685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969241
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18631	NC_008321	TGA	3	9	1048824	1048832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969241
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18642	NC_008321	GT	3	6	1049489	1049494	0 %	50 %	50 %	0 %	113969242
18643	NC_008321	GAT	2	6	1049517	1049522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969242
18644	NC_008321	G	6	6	1049638	1049643	0 %	0 %	100 %	0 %	113969242
18645	NC_008321	GC	3	6	1049758	1049763	0 %	0 %	50 %	50 %	113969243
18646	NC_008321	CACG	2	8	1049788	1049795	25 %	0 %	25 %	50 %	113969243
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18648	NC_008321	TGC	2	6	1049837	1049842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969243
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18652	NC_008321	GTCA	2	8	1049997	1050004	25 %	25 %	25 %	25 %	113969243
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18666	NC_008321	CTT	2	6	1050733	1050738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18679	NC_008321	CGT	2	6	1051333	1051338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18853	NC_008321	TGGT	2	8	1062130	1062137	0 %	50 %	50 %	0 %	113969254
18854	NC_008321	CAT	2	6	1062245	1062250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969254
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18859	NC_008321	T	6	6	1062680	1062685	0 %	100 %	0 %	0 %	113969255
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18865	NC_008321	TGA	2	6	1063170	1063175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969255
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18868	NC_008321	AAT	2	6	1063332	1063337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18869	NC_008321	GGT	2	6	1063458	1063463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969256
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18903	NC_008321	CGTC	2	8	1065275	1065282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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18934	NC_008321	AGA	2	6	1067371	1067376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18965	NC_008321	CAA	2	6	1068657	1068662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18969	NC_008321	TTA	2	6	1068794	1068799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18970	NC_008321	A	6	6	1068888	1068893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18971	NC_008321	TAT	2	6	1068902	1068907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18972	NC_008321	T	6	6	1068916	1068921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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