MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008321	T	6	6	904552	904557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_008321	GGAACG	2	12	904601	904612	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16003	NC_008321	GAA	2	6	904622	904627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969121
16004	NC_008321	GCA	2	6	904638	904643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969121
16005	NC_008321	AGA	2	6	904841	904846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969121
16006	NC_008321	ATT	2	6	905271	905276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969121
16007	NC_008321	ACA	2	6	905284	905289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969121
16008	NC_008321	TGAT	2	8	905364	905371	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_008321	A	6	6	905378	905383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_008321	T	6	6	905398	905403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_008321	AGTT	2	8	905434	905441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_008321	TTA	2	6	905448	905453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_008321	TGT	2	6	905482	905487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_008321	TGA	2	6	905596	905601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969122
16015	NC_008321	ACA	2	6	905606	905611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969122
16016	NC_008321	AGTGG	2	10	905625	905634	20 %	20 %	60 %	0 %	113969122
16017	NC_008321	CAG	2	6	905680	905685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969122
16018	NC_008321	ATT	2	6	905841	905846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969122
16019	NC_008321	GGC	2	6	905900	905905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969122
16020	NC_008321	TTA	2	6	905937	905942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969122
16021	NC_008321	GGA	2	6	905981	905986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969122
16022	NC_008321	GGTT	2	8	906012	906019	0 %	50 %	50 %	0 %	113969122
16023	NC_008321	TTC	2	6	906075	906080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969122
16024	NC_008321	GTG	2	6	906129	906134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969122
16025	NC_008321	TTA	2	6	906163	906168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969122
16026	NC_008321	GCGG	2	8	906204	906211	0 %	0 %	75 %	25 %	113969122
16027	NC_008321	CAC	2	6	906236	906241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969122
16028	NC_008321	CTT	2	6	906281	906286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969122
16029	NC_008321	CAT	2	6	906332	906337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969122
16030	NC_008321	CTG	2	6	906426	906431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969122
16031	NC_008321	CGG	2	6	906442	906447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969122
16032	NC_008321	GC	3	6	906451	906456	0 %	0 %	50 %	50 %	113969122
16033	NC_008321	CTT	2	6	906461	906466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969122
16034	NC_008321	GCC	2	6	906473	906478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969122
16035	NC_008321	GAT	2	6	906488	906493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969122
16036	NC_008321	TTC	2	6	906516	906521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969122
16037	NC_008321	TAC	2	6	906525	906530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969122
16038	NC_008321	CG	3	6	906567	906572	0 %	0 %	50 %	50 %	113969122
16039	NC_008321	CGC	2	6	906585	906590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969122
16040	NC_008321	ACA	2	6	906605	906610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969122
16041	NC_008321	GTG	2	6	906621	906626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969122
16042	NC_008321	TTC	2	6	906678	906683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969122
16043	NC_008321	GGTGT	2	10	906687	906696	0 %	40 %	60 %	0 %	113969122
16044	NC_008321	TG	3	6	906697	906702	0 %	50 %	50 %	0 %	113969122
16045	NC_008321	CGG	2	6	906704	906709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969122
16046	NC_008321	TGT	2	6	906796	906801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969122
16047	NC_008321	ATA	2	6	906814	906819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969122
16048	NC_008321	TGG	2	6	906902	906907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969122
16049	NC_008321	TGT	2	6	906913	906918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969122
16050	NC_008321	TGC	2	6	907052	907057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969122
16051	NC_008321	AAC	2	6	907069	907074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_008321	ATT	2	6	907136	907141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_008321	TTG	2	6	907248	907253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969123
16054	NC_008321	TGC	2	6	907382	907387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969123
16055	NC_008321	GC	3	6	907419	907424	0 %	0 %	50 %	50 %	113969123
16056	NC_008321	CGC	2	6	907450	907455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969123
16057	NC_008321	GAC	2	6	907474	907479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969123
16058	NC_008321	ACGCC	2	10	907526	907535	20 %	0 %	20 %	60 %	113969123
16059	NC_008321	TGC	2	6	907598	907603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969123
16060	NC_008321	TGT	3	9	907625	907633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969123
16061	NC_008321	ATT	2	6	907709	907714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969123
16062	NC_008321	AATTC	2	10	907719	907728	40 %	40 %	0 %	20 %	113969123
16063	NC_008321	GCG	2	6	907825	907830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969123
16064	NC_008321	GAA	2	6	907869	907874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969123
16065	NC_008321	ATG	2	6	907912	907917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969123
16066	NC_008321	TGAT	2	8	907940	907947	25 %	50 %	25 %	0 %	113969123
16067	NC_008321	A	6	6	907996	908001	100 %	0 %	0 %	0 %	113969124
16068	NC_008321	CCG	2	6	908008	908013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969124
16069	NC_008321	AAGTT	2	10	908213	908222	40 %	40 %	20 %	0 %	113969124
16070	NC_008321	CGC	2	6	908251	908256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969124
16071	NC_008321	TTG	2	6	908345	908350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969124
16072	NC_008321	TGCG	2	8	908373	908380	0 %	25 %	50 %	25 %	113969124
16073	NC_008321	ATT	2	6	908526	908531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_008321	T	7	7	908563	908569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_008321	GAT	2	6	908576	908581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_008321	ATT	2	6	908619	908624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969125
16077	NC_008321	TTG	2	6	908685	908690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969125
16078	NC_008321	TTA	2	6	908839	908844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969125
16079	NC_008321	TAA	2	6	908857	908862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969125
16080	NC_008321	GGC	2	6	908877	908882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969125
16081	NC_008321	GCC	2	6	908890	908895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969125
16082	NC_008321	CTGG	2	8	908967	908974	0 %	25 %	50 %	25 %	113969125
16083	NC_008321	CGG	3	9	909003	909011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969125
16084	NC_008321	GGC	2	6	909013	909018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969125
16085	NC_008321	CCT	2	6	909029	909034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969125
16086	NC_008321	ATC	2	6	909042	909047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969125
16087	NC_008321	TCA	2	6	909107	909112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969125
16088	NC_008321	CCT	2	6	909116	909121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969126
16089	NC_008321	GTG	2	6	909146	909151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969126
16090	NC_008321	GCC	2	6	909176	909181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969126
16091	NC_008321	GGTGCT	2	12	909190	909201	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	113969126
16092	NC_008321	AGC	2	6	909333	909338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969126
16093	NC_008321	AGGC	2	8	909358	909365	25 %	0 %	50 %	25 %	113969126
16094	NC_008321	AGA	2	6	909391	909396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969126
16095	NC_008321	T	6	6	909444	909449	0 %	100 %	0 %	0 %	113969126
16096	NC_008321	CGA	2	6	909471	909476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969126
16097	NC_008321	GGT	2	6	909499	909504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969126
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16099	NC_008321	ATC	2	6	909559	909564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969126
16100	NC_008321	ATCGGC	2	12	909676	909687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113969126
16101	NC_008321	GCC	2	6	909742	909747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969126
16102	NC_008321	CGC	2	6	909847	909852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969126
16103	NC_008321	GCC	2	6	909887	909892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969126
16104	NC_008321	TCA	2	6	909939	909944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969126
16105	NC_008321	ATTA	2	8	909960	909967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_008321	ATCA	2	8	909977	909984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16107	NC_008321	CAT	2	6	910003	910008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_008321	GCA	2	6	910019	910024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16109	NC_008321	GAA	2	6	910084	910089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_008321	ATT	2	6	910159	910164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_008321	GAT	2	6	910359	910364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_008321	G	6	6	910395	910400	0 %	0 %	100 %	0 %	113969127
16113	NC_008321	TGA	2	6	910446	910451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969127
16114	NC_008321	GTTG	2	8	910494	910501	0 %	50 %	50 %	0 %	113969127
16115	NC_008321	TCC	2	6	910557	910562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969127
16116	NC_008321	GCGG	2	8	910584	910591	0 %	0 %	75 %	25 %	113969127
16117	NC_008321	TCCT	2	8	910606	910613	0 %	50 %	0 %	50 %	113969127
16118	NC_008321	CTG	2	6	910663	910668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969127
16119	NC_008321	TGG	2	6	910729	910734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969127
16120	NC_008321	GT	3	6	910736	910741	0 %	50 %	50 %	0 %	113969127
16121	NC_008321	CT	3	6	910822	910827	0 %	50 %	0 %	50 %	113969127
16122	NC_008321	CAA	2	6	910890	910895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969127
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16124	NC_008321	GAC	2	6	911072	911077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969127
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16128	NC_008321	GTT	2	6	911732	911737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16241	NC_008321	CAT	2	6	918483	918488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969132
16242	NC_008321	CAT	3	9	918567	918575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969132
16243	NC_008321	GGCA	2	8	918633	918640	25 %	0 %	50 %	25 %	113969132
16244	NC_008321	CTG	2	6	918675	918680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969132
16245	NC_008321	AAT	2	6	918723	918728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969132
16246	NC_008321	TTC	2	6	918768	918773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969132
16247	NC_008321	GAC	2	6	918837	918842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969132
16248	NC_008321	ATC	2	6	918855	918860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969132
16249	NC_008321	GCA	2	6	918887	918892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969132
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16252	NC_008321	CGG	2	6	919061	919066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969132
16253	NC_008321	ATC	2	6	919080	919085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969132
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16255	NC_008321	TCG	2	6	919240	919245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969132
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16257	NC_008321	CTTCGA	2	12	919271	919282	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113969132
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16259	NC_008321	CTT	2	6	919352	919357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969132
16260	NC_008321	TTGATG	2	12	919363	919374	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	113969132
16261	NC_008321	CTT	2	6	919376	919381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969132
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16265	NC_008321	CGTGG	2	10	919834	919843	0 %	20 %	60 %	20 %	113969133
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16270	NC_008321	TGC	2	6	920279	920284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969133
16271	NC_008321	T	6	6	920312	920317	0 %	100 %	0 %	0 %	113969133
16272	NC_008321	GGC	2	6	920346	920351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969133
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16274	NC_008321	TTC	2	6	920505	920510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969133
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16277	NC_008321	TGC	2	6	920634	920639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969133
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16282	NC_008321	TAAA	2	8	920866	920873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16283	NC_008321	T	7	7	920914	920920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16284	NC_008321	GACA	2	8	920924	920931	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16285	NC_008321	TTTG	2	8	920969	920976	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16286	NC_008321	A	6	6	921007	921012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16287	NC_008321	CTT	2	6	921049	921054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969134
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16291	NC_008321	CTT	2	6	921156	921161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969134
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16310	NC_008321	ATA	2	6	922320	922325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16311	NC_008321	TAT	2	6	922332	922337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16312	NC_008321	TTG	2	6	922544	922549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16313	NC_008321	TGA	2	6	922612	922617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16315	NC_008321	T	6	6	922744	922749	0 %	100 %	0 %	0 %	113969135
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16350	NC_008321	ATTAGA	2	12	924528	924539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	113969135
16351	NC_008321	A	6	6	924604	924609	100 %	0 %	0 %	0 %	113969135
16352	NC_008321	GGC	2	6	924648	924653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969135
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16356	NC_008321	GC	3	6	925026	925031	0 %	0 %	50 %	50 %	113969135
16357	NC_008321	CCG	2	6	925048	925053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969135
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16360	NC_008321	CCGC	2	8	925139	925146	0 %	0 %	25 %	75 %	113969135
16361	NC_008321	GCT	2	6	925161	925166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969135
16362	NC_008321	ATGG	2	8	925222	925229	25 %	25 %	50 %	0 %	113969135
16363	NC_008321	CGG	2	6	925235	925240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969135
16364	NC_008321	CGC	2	6	925332	925337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969135
16365	NC_008321	ATGG	2	8	925351	925358	25 %	25 %	50 %	0 %	113969135
16366	NC_008321	GCT	2	6	925386	925391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969135
16367	NC_008321	TAC	2	6	925412	925417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969135
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16369	NC_008321	TGA	2	6	925532	925537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969135
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16371	NC_008321	CAG	2	6	925576	925581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969135
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16377	NC_008321	TGA	2	6	925905	925910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969135
16378	NC_008321	CG	3	6	925932	925937	0 %	0 %	50 %	50 %	113969135
16379	NC_008321	TGA	2	6	925941	925946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969135
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16383	NC_008321	TTG	2	6	926097	926102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969136
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16386	NC_008321	ATC	2	6	926158	926163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969136
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16406	NC_008321	CGTT	2	8	927079	927086	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16407	NC_008321	CT	3	6	927104	927109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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16426	NC_008321	TGT	2	6	928105	928110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16451	NC_008321	CTG	2	6	929547	929552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969138
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16462	NC_008321	TGG	2	6	930332	930337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969139
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16472	NC_008321	TTG	3	9	930959	930967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969140
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16478	NC_008321	A	6	6	931480	931485	100 %	0 %	0 %	0 %	113969140
16479	NC_008321	ACC	2	6	931605	931610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969140
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16481	NC_008321	CGT	2	6	931758	931763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969141
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16484	NC_008321	TTA	2	6	931806	931811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969141
16485	NC_008321	CGCC	2	8	931823	931830	0 %	0 %	25 %	75 %	113969141
16486	NC_008321	GTG	2	6	931831	931836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969141
16487	NC_008321	AGC	2	6	931907	931912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969141
16488	NC_008321	CGATG	2	10	931925	931934	20 %	20 %	40 %	20 %	113969141
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16492	NC_008321	GAT	2	6	932018	932023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969141
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