MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_008321	TGGCG	2	10	847658	847667	0 %	20 %	60 %	20 %	113969070
15002	NC_008321	CAG	2	6	847694	847699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969070
15003	NC_008321	CA	3	6	847721	847726	50 %	0 %	0 %	50 %	113969070
15004	NC_008321	ATC	2	6	847769	847774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969070
15005	NC_008321	CAT	2	6	847858	847863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969070
15006	NC_008321	GTG	2	6	847963	847968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_008321	AGT	2	6	848009	848014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969071
15008	NC_008321	GCG	2	6	848055	848060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969071
15009	NC_008321	GCC	2	6	848093	848098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969071
15010	NC_008321	AG	3	6	848288	848293	50 %	0 %	50 %	0 %	113969071
15011	NC_008321	ATT	2	6	848480	848485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969071
15012	NC_008321	GGCTTT	2	12	848490	848501	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	113969072
15013	NC_008321	GCG	3	9	848514	848522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969072
15014	NC_008321	GTTACG	2	12	848538	848549	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113969072
15015	NC_008321	CAA	2	6	848609	848614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969072
15016	NC_008321	CCA	2	6	848622	848627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969072
15017	NC_008321	CGC	2	6	848663	848668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969072
15018	NC_008321	CAGTAA	2	12	848670	848681	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	113969072
15019	NC_008321	GGC	2	6	848688	848693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969072
15020	NC_008321	GC	3	6	848725	848730	0 %	0 %	50 %	50 %	113969072
15021	NC_008321	TGC	2	6	848821	848826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969072
15022	NC_008321	ATCAC	2	10	848830	848839	40 %	20 %	0 %	40 %	113969072
15023	NC_008321	GGC	2	6	848844	848849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969072
15024	NC_008321	A	6	6	848850	848855	100 %	0 %	0 %	0 %	113969072
15025	NC_008321	CGC	2	6	848928	848933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969072
15026	NC_008321	AGA	2	6	848936	848941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969072
15027	NC_008321	CG	3	6	848972	848977	0 %	0 %	50 %	50 %	113969072
15028	NC_008321	CTT	2	6	849032	849037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969072
15029	NC_008321	CAT	2	6	849090	849095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969072
15030	NC_008321	GAA	2	6	849123	849128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969072
15031	NC_008321	CTT	2	6	849140	849145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969072
15032	NC_008321	GCGG	2	8	849153	849160	0 %	0 %	75 %	25 %	113969072
15033	NC_008321	AGC	2	6	849175	849180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969072
15034	NC_008321	ATC	2	6	849330	849335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969072
15035	NC_008321	CCG	2	6	849340	849345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113969072
15036	NC_008321	AGT	2	6	849362	849367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969072
15037	NC_008321	GTA	2	6	849378	849383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969072
15038	NC_008321	T	6	6	849482	849487	0 %	100 %	0 %	0 %	113969072
15039	NC_008321	GTG	2	6	849501	849506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969072
15040	NC_008321	CGG	2	6	849568	849573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969072
15041	NC_008321	CAC	2	6	849576	849581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969072
15042	NC_008321	TTC	2	6	849609	849614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969072
15043	NC_008321	GAG	2	6	849660	849665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969072
15044	NC_008321	GCC	2	6	849804	849809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15045	NC_008321	GCT	2	6	849884	849889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_008321	GGC	2	6	849958	849963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15047	NC_008321	ATG	2	6	850036	850041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_008321	GCG	2	6	850148	850153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969073
15049	NC_008321	CGT	2	6	850155	850160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969073
15050	NC_008321	GCA	2	6	850195	850200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969073
15051	NC_008321	GCG	2	6	850304	850309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969073
15052	NC_008321	GGC	2	6	850343	850348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969073
15053	NC_008321	CAC	2	6	850377	850382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969073
15054	NC_008321	CAC	2	6	850413	850418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969073
15055	NC_008321	ATA	2	6	850456	850461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969073
15056	NC_008321	CGG	2	6	850469	850474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969073
15057	NC_008321	GCTTG	2	10	850679	850688	0 %	40 %	40 %	20 %	113969073
15058	NC_008321	ACA	2	6	850715	850720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969073
15059	NC_008321	ATC	2	6	850767	850772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969073
15060	NC_008321	GGA	2	6	850795	850800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113969073
15061	NC_008321	TCT	2	6	850807	850812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969073
15062	NC_008321	GC	3	6	850842	850847	0 %	0 %	50 %	50 %	113969073
15063	NC_008321	GC	3	6	850892	850897	0 %	0 %	50 %	50 %	113969073
15064	NC_008321	CAT	2	6	850965	850970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969073
15065	NC_008321	A	6	6	851025	851030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_008321	CCCG	2	8	851087	851094	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15067	NC_008321	TCT	2	6	851236	851241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969074
15068	NC_008321	T	6	6	851246	851251	0 %	100 %	0 %	0 %	113969074
15069	NC_008321	T	6	6	851258	851263	0 %	100 %	0 %	0 %	113969074
15070	NC_008321	TCT	2	6	851267	851272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969074
15071	NC_008321	CG	3	6	851294	851299	0 %	0 %	50 %	50 %	113969074
15072	NC_008321	CTT	2	6	851321	851326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969074
15073	NC_008321	TGC	2	6	851331	851336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969074
15074	NC_008321	TGC	2	6	851361	851366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969074
15075	NC_008321	CTC	2	6	851472	851477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113969074
15076	NC_008321	T	6	6	851529	851534	0 %	100 %	0 %	0 %	113969074
15077	NC_008321	TCA	2	6	851563	851568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15078	NC_008321	CTAT	2	8	851602	851609	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15079	NC_008321	TTTCA	2	10	851637	851646	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15080	NC_008321	T	6	6	851658	851663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_008321	TGAAA	2	10	851680	851689	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_008321	CAT	2	6	851711	851716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969075
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15084	NC_008321	TG	3	6	851869	851874	0 %	50 %	50 %	0 %	113969075
15085	NC_008321	CAC	2	6	851878	851883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969075
15086	NC_008321	TA	3	6	852016	852021	50 %	50 %	0 %	0 %	113969075
15087	NC_008321	TCAGT	2	10	852114	852123	20 %	40 %	20 %	20 %	113969075
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15089	NC_008321	TTA	2	6	852134	852139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969075
15090	NC_008321	GAAT	2	8	852173	852180	50 %	25 %	25 %	0 %	113969075
15091	NC_008321	TG	3	6	852220	852225	0 %	50 %	50 %	0 %	113969075
15092	NC_008321	ATT	2	6	852244	852249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969075
15093	NC_008321	ACAG	2	8	852282	852289	50 %	0 %	25 %	25 %	113969075
15094	NC_008321	GCC	2	6	852538	852543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15095	NC_008321	TGA	2	6	852674	852679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969076
15096	NC_008321	GAGTT	2	10	852680	852689	20 %	40 %	40 %	0 %	113969076
15097	NC_008321	GGC	2	6	852769	852774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969076
15098	NC_008321	GGC	2	6	852798	852803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969076
15099	NC_008321	TGA	2	6	852933	852938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969076
15100	NC_008321	GCA	2	6	853038	853043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969076
15101	NC_008321	AGC	2	6	853044	853049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969076
15102	NC_008321	ATT	2	6	853110	853115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969076
15103	NC_008321	AGA	2	6	853116	853121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969076
15104	NC_008321	AGCG	2	8	853156	853163	25 %	0 %	50 %	25 %	113969076
15105	NC_008321	CCA	2	6	853165	853170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969076
15106	NC_008321	GCG	2	6	853313	853318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969076
15107	NC_008321	GCA	2	6	853333	853338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969076
15108	NC_008321	CTG	2	6	853389	853394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969076
15109	NC_008321	TAT	2	6	853548	853553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969076
15110	NC_008321	GCA	2	6	853647	853652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969076
15111	NC_008321	GCCATT	2	12	853683	853694	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113969076
15112	NC_008321	GGT	3	9	853762	853770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969076
15113	NC_008321	GGT	2	6	853774	853779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969076
15114	NC_008321	GCG	2	6	853789	853794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969076
15115	NC_008321	CGTTT	2	10	853807	853816	0 %	60 %	20 %	20 %	113969076
15116	NC_008321	GCG	2	6	853849	853854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969076
15117	NC_008321	ACC	2	6	853897	853902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969076
15118	NC_008321	T	6	6	853979	853984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_008321	T	6	6	854008	854013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_008321	CAG	2	6	854072	854077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_008321	GAT	2	6	854219	854224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969077
15122	NC_008321	TGA	2	6	854305	854310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969077
15123	NC_008321	AAG	2	6	854319	854324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113969077
15124	NC_008321	TTGG	2	8	854330	854337	0 %	50 %	50 %	0 %	113969077
15125	NC_008321	ACT	2	6	854422	854427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969077
15126	NC_008321	CGG	2	6	854524	854529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969077
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15128	NC_008321	TAA	2	6	854627	854632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113969077
15129	NC_008321	GTT	2	6	854673	854678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_008321	GTT	2	6	854757	854762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15131	NC_008321	GTT	2	6	854834	854839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15132	NC_008321	GCAT	2	8	854864	854871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15133	NC_008321	GTT	2	6	854985	854990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15134	NC_008321	CAC	2	6	855270	855275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113969078
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15143	NC_008321	GTT	2	6	855831	855836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969078
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15150	NC_008321	CTAG	2	8	856065	856072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15151	NC_008321	TGG	2	6	856138	856143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15152	NC_008321	TTG	2	6	856240	856245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113969079
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15159	NC_008321	GTA	2	6	856657	856662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969080
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15177	NC_008321	AAT	2	6	857459	857464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15178	NC_008321	CGG	2	6	857534	857539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969081
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15187	NC_008321	AAT	2	6	858021	858026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15189	NC_008321	GGC	2	6	858167	858172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969082
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15222	NC_008321	TCG	2	6	859419	859424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969082
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15224	NC_008321	GTCA	2	8	859494	859501	25 %	25 %	25 %	25 %	113969082
15225	NC_008321	CG	3	6	859591	859596	0 %	0 %	50 %	50 %	113969082
15226	NC_008321	TGCA	2	8	859658	859665	25 %	25 %	25 %	25 %	113969083
15227	NC_008321	GGC	2	6	859685	859690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969083
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15229	NC_008321	A	6	6	859767	859772	100 %	0 %	0 %	0 %	113969083
15230	NC_008321	TGGA	2	8	859796	859803	25 %	25 %	50 %	0 %	113969083
15231	NC_008321	GT	3	6	859864	859869	0 %	50 %	50 %	0 %	113969083
15232	NC_008321	GCT	2	6	859896	859901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969083
15233	NC_008321	GAT	2	6	859961	859966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969083
15234	NC_008321	TAAG	2	8	860065	860072	50 %	25 %	25 %	0 %	113969083
15235	NC_008321	TGCGC	2	10	860210	860219	0 %	20 %	40 %	40 %	113969084
15236	NC_008321	CAT	2	6	860229	860234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969084
15237	NC_008321	CTG	2	6	860253	860258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969084
15238	NC_008321	GGC	2	6	860291	860296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969084
15239	NC_008321	ATCCCA	2	12	860328	860339	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113969084
15240	NC_008321	CAG	2	6	860424	860429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969084
15241	NC_008321	ATTCAC	2	12	860436	860447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969084
15242	NC_008321	GCT	2	6	860477	860482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969084
15243	NC_008321	TCT	2	6	860622	860627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969085
15244	NC_008321	TTC	2	6	860654	860659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969085
15245	NC_008321	CGG	2	6	860878	860883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969085
15246	NC_008321	GGC	2	6	860921	860926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969085
15247	NC_008321	TGG	2	6	860949	860954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969085
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15255	NC_008321	GCTT	2	8	861672	861679	0 %	50 %	25 %	25 %	113969085
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15262	NC_008321	TGGT	2	8	861963	861970	0 %	50 %	50 %	0 %	113969085
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15274	NC_008321	TGA	2	6	862538	862543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15280	NC_008321	CTG	2	6	862962	862967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969086
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15283	NC_008321	AT	3	6	863186	863191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15284	NC_008321	CGG	2	6	863206	863211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15285	NC_008321	GCC	2	6	863219	863224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15330	NC_008321	CT	4	8	865381	865388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15331	NC_008321	AAGT	2	8	865391	865398	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15332	NC_008321	GAA	2	6	865403	865408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15333	NC_008321	AT	4	8	865422	865429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15335	NC_008321	GATG	2	8	865644	865651	25 %	25 %	50 %	0 %	113969088
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15349	NC_008321	TGA	2	6	866393	866398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113969088
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15352	NC_008321	TATC	2	8	866587	866594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15353	NC_008321	GC	3	6	866658	866663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15354	NC_008321	GTTAA	2	10	866792	866801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15355	NC_008321	CAC	2	6	866938	866943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15356	NC_008321	GCCA	2	8	867078	867085	25 %	0 %	25 %	50 %	113969089
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15363	NC_008321	ATT	2	6	867678	867683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969089
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15365	NC_008321	GGT	2	6	867711	867716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969089
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15484	NC_008321	ATC	2	6	874297	874302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113969095
15485	NC_008321	CGG	2	6	874373	874378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969095
15486	NC_008321	TTTG	2	8	874437	874444	0 %	75 %	25 %	0 %	113969095
15487	NC_008321	CGG	2	6	874473	874478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969095
15488	NC_008321	CTT	2	6	874521	874526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969095
15489	NC_008321	CTG	2	6	874537	874542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113969095
15490	NC_008321	ACA	2	6	874634	874639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113969096
15491	NC_008321	TTC	2	6	874651	874656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969096
15492	NC_008321	CTT	2	6	874671	874676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113969096
15493	NC_008321	GTG	2	6	874729	874734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969096
15494	NC_008321	GGGC	2	8	874802	874809	0 %	0 %	75 %	25 %	113969096
15495	NC_008321	CGG	2	6	875018	875023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969096
15496	NC_008321	TTA	2	6	875141	875146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113969096
15497	NC_008321	ATAGGC	2	12	875263	875274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113969097
15498	NC_008321	GTG	2	6	875287	875292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113969097
15499	NC_008321	ACG	2	6	875366	875371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113969097
15500	NC_008321	GGC	3	9	875458	875466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113969097

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