MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008321	CAA	2	6	643660	643665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968904
11502	NC_008321	TGT	2	6	643696	643701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968904
11503	NC_008321	TTG	2	6	643724	643729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_008321	T	6	6	643749	643754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_008321	TA	3	6	643795	643800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_008321	GA	3	6	643924	643929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_008321	GCA	2	6	644067	644072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968905
11508	NC_008321	AGCAG	2	10	644079	644088	40 %	0 %	40 %	20 %	113968905
11509	NC_008321	CCG	2	6	644114	644119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968905
11510	NC_008321	CAC	2	6	644154	644159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968905
11511	NC_008321	GGT	2	6	644251	644256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968905
11512	NC_008321	TGG	2	6	644262	644267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968905
11513	NC_008321	GTG	2	6	644281	644286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968905
11514	NC_008321	GCG	3	9	644356	644364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968905
11515	NC_008321	GGT	2	6	644472	644477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968905
11516	NC_008321	GCT	2	6	644492	644497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968905
11517	NC_008321	AAT	2	6	644527	644532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968905
11518	NC_008321	GC	4	8	644619	644626	0 %	0 %	50 %	50 %	113968905
11519	NC_008321	TCG	2	6	644812	644817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968905
11520	NC_008321	CGA	2	6	644826	644831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968905
11521	NC_008321	GC	3	6	644917	644922	0 %	0 %	50 %	50 %	113968905
11522	NC_008321	CAA	2	6	645069	645074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968905
11523	NC_008321	TGG	2	6	645101	645106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968905
11524	NC_008321	TTGA	2	8	645151	645158	25 %	50 %	25 %	0 %	113968905
11525	NC_008321	GCC	2	6	645175	645180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968905
11526	NC_008321	GC	3	6	645252	645257	0 %	0 %	50 %	50 %	113968905
11527	NC_008321	AGC	2	6	645263	645268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968905
11528	NC_008321	GGC	2	6	645372	645377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968905
11529	NC_008321	TTA	2	6	645539	645544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968905
11530	NC_008321	TGG	2	6	645551	645556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968905
11531	NC_008321	TGA	2	6	645563	645568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968905
11532	NC_008321	AAT	2	6	645838	645843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968906
11533	NC_008321	GGAC	2	8	645861	645868	25 %	0 %	50 %	25 %	113968906
11534	NC_008321	T	6	6	645925	645930	0 %	100 %	0 %	0 %	113968906
11535	NC_008321	CGG	2	6	646036	646041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968906
11536	NC_008321	TTG	2	6	646071	646076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968906
11537	NC_008321	AAT	2	6	646082	646087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968906
11538	NC_008321	TGG	2	6	646117	646122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968906
11539	NC_008321	GCG	2	6	646161	646166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968906
11540	NC_008321	ATC	2	6	646206	646211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968906
11541	NC_008321	GAT	2	6	646256	646261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968906
11542	NC_008321	AAG	2	6	646371	646376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968906
11543	NC_008321	ATTTA	2	10	646397	646406	40 %	60 %	0 %	0 %	113968906
11544	NC_008321	TCT	2	6	646432	646437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968906
11545	NC_008321	AGA	2	6	646480	646485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968906
11546	NC_008321	GCG	2	6	646740	646745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968906
11547	NC_008321	GGC	2	6	646769	646774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968906
11548	NC_008321	CTG	3	9	646793	646801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968906
11549	NC_008321	CTGCG	2	10	646868	646877	0 %	20 %	40 %	40 %	113968906
11550	NC_008321	GTT	2	6	646921	646926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968906
11551	NC_008321	GTT	2	6	646931	646936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968906
11552	NC_008321	TCA	2	6	646980	646985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968906
11553	NC_008321	CCG	2	6	646987	646992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968906
11554	NC_008321	AGT	2	6	647032	647037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968906
11555	NC_008321	GCT	2	6	647062	647067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968906
11556	NC_008321	TCT	2	6	647109	647114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968906
11557	NC_008321	CAA	2	6	647170	647175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968906
11558	NC_008321	TTGGGA	2	12	647192	647203	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	113968906
11559	NC_008321	GC	3	6	647207	647212	0 %	0 %	50 %	50 %	113968906
11560	NC_008321	AATT	2	8	647243	647250	50 %	50 %	0 %	0 %	113968906
11561	NC_008321	GGC	2	6	647288	647293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968906
11562	NC_008321	TGAG	2	8	647368	647375	25 %	25 %	50 %	0 %	113968906
11563	NC_008321	TAGG	2	8	647405	647412	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_008321	ATA	2	6	647416	647421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_008321	ATT	2	6	647742	647747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968907
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11567	NC_008321	TGA	2	6	647822	647827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968907
11568	NC_008321	TCT	2	6	647828	647833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968907
11569	NC_008321	CTG	2	6	647845	647850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968907
11570	NC_008321	GAGT	2	8	648042	648049	25 %	25 %	50 %	0 %	113968908
11571	NC_008321	TAA	2	6	648058	648063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968908
11572	NC_008321	CAT	2	6	648201	648206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_008321	T	6	6	648374	648379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_008321	TGAG	2	8	648394	648401	25 %	25 %	50 %	0 %	113968909
11575	NC_008321	GCC	2	6	648442	648447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968909
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11578	NC_008321	TGA	2	6	648498	648503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968909
11579	NC_008321	TAAA	2	8	648548	648555	75 %	25 %	0 %	0 %	113968909
11580	NC_008321	CG	3	6	648664	648669	0 %	0 %	50 %	50 %	113968909
11581	NC_008321	TGA	2	6	648721	648726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11583	NC_008321	TGG	2	6	648797	648802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968910
11584	NC_008321	TAT	2	6	648889	648894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968910
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11587	NC_008321	GTT	2	6	649006	649011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968910
11588	NC_008321	ACG	2	6	649019	649024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968910
11589	NC_008321	GAA	2	6	649045	649050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968910
11590	NC_008321	GTG	2	6	649094	649099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968910
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11592	NC_008321	ATTC	2	8	649151	649158	25 %	50 %	0 %	25 %	113968910
11593	NC_008321	ACCG	2	8	649159	649166	25 %	0 %	25 %	50 %	113968910
11594	NC_008321	GAC	2	6	649207	649212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968910
11595	NC_008321	GC	3	6	649290	649295	0 %	0 %	50 %	50 %	113968910
11596	NC_008321	CGG	2	6	649359	649364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968910
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11599	NC_008321	GCG	2	6	649592	649597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968910
11600	NC_008321	TGAC	2	8	649610	649617	25 %	25 %	25 %	25 %	113968910
11601	NC_008321	ATC	2	6	649664	649669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968910
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11603	NC_008321	AACT	2	8	649863	649870	50 %	25 %	0 %	25 %	113968910
11604	NC_008321	GAC	2	6	649885	649890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968910
11605	NC_008321	TGG	2	6	650163	650168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968911
11606	NC_008321	TGC	2	6	650208	650213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968911
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11608	NC_008321	CGAG	2	8	650421	650428	25 %	0 %	50 %	25 %	113968911
11609	NC_008321	GCG	2	6	650429	650434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968911
11610	NC_008321	GGC	2	6	650476	650481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968911
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11613	NC_008321	CTG	2	6	650874	650879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968912
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11616	NC_008321	CGC	2	6	650984	650989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968912
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11619	NC_008321	GAT	2	6	651131	651136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968912
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11621	NC_008321	GGC	2	6	651164	651169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968912
11622	NC_008321	GCG	2	6	651282	651287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968912
11623	NC_008321	CTG	2	6	651342	651347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968912
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11626	NC_008321	TCG	2	6	651673	651678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11717	NC_008321	GAG	2	6	657717	657722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11979	NC_008321	GAT	2	6	672313	672318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968926
11980	NC_008321	ATGGC	2	10	672434	672443	20 %	20 %	40 %	20 %	113968926
11981	NC_008321	T	6	6	672459	672464	0 %	100 %	0 %	0 %	113968926
11982	NC_008321	TTG	2	6	672532	672537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11983	NC_008321	T	6	6	672570	672575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11984	NC_008321	GAT	2	6	672613	672618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11985	NC_008321	GGAT	2	8	672650	672657	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11986	NC_008321	GAT	2	6	672666	672671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11987	NC_008321	AAT	2	6	672674	672679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11988	NC_008321	A	6	6	672712	672717	100 %	0 %	0 %	0 %	113968927
11989	NC_008321	GGATT	2	10	672754	672763	20 %	40 %	40 %	0 %	113968927
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11991	NC_008321	CAT	2	6	672810	672815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968927
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