MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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80002	NC_008321	GCCGAA	2	12	4516284	4516295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972110
80003	NC_008321	GC	3	6	4516304	4516309	0 %	0 %	50 %	50 %	113972110
80004	NC_008321	TTG	2	6	4516383	4516388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113972110
80005	NC_008321	CCGT	2	8	4516405	4516412	0 %	25 %	25 %	50 %	113972110
80006	NC_008321	GGCGAA	2	12	4516452	4516463	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	113972110
80007	NC_008321	GAA	2	6	4516644	4516649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113972110
80008	NC_008321	GT	3	6	4516668	4516673	0 %	50 %	50 %	0 %	113972110
80009	NC_008321	CTG	2	6	4516674	4516679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113972110
80010	NC_008321	TGC	2	6	4516684	4516689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113972110
80011	NC_008321	GC	3	6	4516692	4516697	0 %	0 %	50 %	50 %	113972110
80012	NC_008321	TGA	2	6	4516753	4516758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113972110
80013	NC_008321	CAT	2	6	4516781	4516786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113972110
80014	NC_008321	ATC	2	6	4516977	4516982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113972110
80015	NC_008321	AGGA	2	8	4517020	4517027	50 %	0 %	50 %	0 %	113972110
80016	NC_008321	GGC	3	9	4517069	4517077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113972110
80017	NC_008321	AGCG	2	8	4517142	4517149	25 %	0 %	50 %	25 %	113972110
80018	NC_008321	GCCC	2	8	4517297	4517304	0 %	0 %	25 %	75 %	113972110
80019	NC_008321	GCC	2	6	4517364	4517369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113972110
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80021	NC_008321	GACC	2	8	4517384	4517391	25 %	0 %	25 %	50 %	113972110
80022	NC_008321	CGC	2	6	4517467	4517472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113972110
80023	NC_008321	CAT	2	6	4517543	4517548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113972110
80024	NC_008321	GCA	2	6	4517558	4517563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972110
80025	NC_008321	GTG	2	6	4517764	4517769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113972110
80026	NC_008321	GCC	2	6	4517808	4517813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113972110
80027	NC_008321	GTA	2	6	4517847	4517852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113972110
80028	NC_008321	ATT	2	6	4517992	4517997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113972110
80029	NC_008321	GC	3	6	4518037	4518042	0 %	0 %	50 %	50 %	113972110
80030	NC_008321	TATCGA	2	12	4518086	4518097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113972110
80031	NC_008321	AT	3	6	4518116	4518121	50 %	50 %	0 %	0 %	113972110
80032	NC_008321	TACAGC	2	12	4518171	4518182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113972110
80033	NC_008321	CAAG	2	8	4518227	4518234	50 %	0 %	25 %	25 %	113972110
80034	NC_008321	CTG	2	6	4518267	4518272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113972110
80035	NC_008321	ATG	2	6	4518273	4518278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113972110
80036	NC_008321	ATT	2	6	4518306	4518311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113972110
80037	NC_008321	GTT	2	6	4518350	4518355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113972110
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80039	NC_008321	GAT	2	6	4518398	4518403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113972110
80040	NC_008321	CGC	2	6	4518419	4518424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113972110
80041	NC_008321	GTG	2	6	4518435	4518440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113972110
80042	NC_008321	CA	3	6	4518495	4518500	50 %	0 %	0 %	50 %	113972110
80043	NC_008321	TTGA	2	8	4518522	4518529	25 %	50 %	25 %	0 %	113972110
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80045	NC_008321	CAT	2	6	4518596	4518601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113972110
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80049	NC_008321	TGTT	2	8	4518688	4518695	0 %	75 %	25 %	0 %	113972110
80050	NC_008321	CTGC	2	8	4518696	4518703	0 %	25 %	25 %	50 %	113972110
80051	NC_008321	T	6	6	4518803	4518808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80052	NC_008321	AGT	2	6	4518817	4518822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80053	NC_008321	AGC	2	6	4518871	4518876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80054	NC_008321	GGC	2	6	4519035	4519040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113972111
80055	NC_008321	AAAC	2	8	4519099	4519106	75 %	0 %	0 %	25 %	113972111
80056	NC_008321	ACAAT	2	10	4519248	4519257	60 %	20 %	0 %	20 %	113972111
80057	NC_008321	CCG	2	6	4519274	4519279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113972111
80058	NC_008321	TG	3	6	4519407	4519412	0 %	50 %	50 %	0 %	113972111
80059	NC_008321	GCA	2	6	4519604	4519609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972111
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80061	NC_008321	A	7	7	4519673	4519679	100 %	0 %	0 %	0 %	113972111
80062	NC_008321	TGG	2	6	4519735	4519740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113972111
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80065	NC_008321	TCA	2	6	4519985	4519990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113972111
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80067	NC_008321	ATCA	2	8	4520321	4520328	50 %	25 %	0 %	25 %	113972112
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80069	NC_008321	GAAC	2	8	4520630	4520637	50 %	0 %	25 %	25 %	113972112
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80074	NC_008321	CAAG	2	8	4521004	4521011	50 %	0 %	25 %	25 %	113972112
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80105	NC_008321	TC	3	6	4522371	4522376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80106	NC_008321	TGA	2	6	4522406	4522411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113972113
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80112	NC_008321	T	6	6	4522783	4522788	0 %	100 %	0 %	0 %	113972113
80113	NC_008321	GC	3	6	4522806	4522811	0 %	0 %	50 %	50 %	113972113
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80115	NC_008321	GGC	2	6	4522899	4522904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113972113
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80329	NC_008321	TTA	2	6	4534060	4534065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113972123
80330	NC_008321	CAC	2	6	4534077	4534082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113972123
80331	NC_008321	CATCC	2	10	4534147	4534156	20 %	20 %	0 %	60 %	113972123
80332	NC_008321	GCAA	2	8	4534314	4534321	50 %	0 %	25 %	25 %	113972123
80333	NC_008321	A	6	6	4534333	4534338	100 %	0 %	0 %	0 %	113972123
80334	NC_008321	TAA	2	6	4534405	4534410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80335	NC_008321	A	6	6	4534409	4534414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80336	NC_008321	CAA	2	6	4534463	4534468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113972124
80337	NC_008321	GCAT	2	8	4534545	4534552	25 %	25 %	25 %	25 %	113972124
80338	NC_008321	GGC	2	6	4534562	4534567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113972124
80339	NC_008321	CCA	2	6	4534569	4534574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113972124
80340	NC_008321	TCA	2	6	4534587	4534592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113972124
80341	NC_008321	TGT	2	6	4534653	4534658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113972124
80342	NC_008321	AGC	2	6	4534799	4534804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113972124
80343	NC_008321	GCCA	2	8	4534826	4534833	25 %	0 %	25 %	50 %	113972124
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80345	NC_008321	ATT	2	6	4534868	4534873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113972124
80346	NC_008321	TGC	2	6	4534896	4534901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113972124
80347	NC_008321	GCAAG	2	10	4534915	4534924	40 %	0 %	40 %	20 %	113972124
80348	NC_008321	CA	3	6	4535136	4535141	50 %	0 %	0 %	50 %	113972125
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80350	NC_008321	TCA	2	6	4535327	4535332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113972125
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80467	NC_008321	GCG	2	6	4541735	4541740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113972130
80468	NC_008321	GTT	2	6	4541837	4541842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113972130
80469	NC_008321	GAT	2	6	4541858	4541863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113972130
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80475	NC_008321	GC	3	6	4542205	4542210	0 %	0 %	50 %	50 %	113972131
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