MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 plasmid1

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008320	CA	3	6	20	25	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008320	ATGT	2	8	107	114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008320	GCG	2	6	144	149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008320	CGT	2	6	196	201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008320	A	7	7	219	225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008320	GGGTG	2	10	226	235	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008320	CTGTCA	2	12	263	274	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008320	T	6	6	308	313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008320	CTC	2	6	315	320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008320	AGCGA	2	10	410	419	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008320	GGC	2	6	449	454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008320	GCG	2	6	486	491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008320	TCTT	2	8	661	668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008320	TCTT	2	8	680	687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008320	CTC	2	6	697	702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008320	GGT	2	6	739	744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008320	GGT	2	6	772	777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008320	GGT	2	6	805	810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008320	TGG	2	6	876	881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008320	CAC	2	6	899	904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_008320	TCT	2	6	944	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951723
22	NC_008320	A	6	6	1041	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	113951723
23	NC_008320	A	6	6	1097	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	113951723
24	NC_008320	TTA	2	6	1155	1160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113951723
25	NC_008320	GAA	2	6	1173	1178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951723
26	NC_008320	A	6	6	1209	1214	100 %	0 %	0 %	0 %	113951723
27	NC_008320	CCT	2	6	1294	1299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113951723
28	NC_008320	CTA	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951723
29	NC_008320	TAAA	2	8	1456	1463	75 %	25 %	0 %	0 %	113951723
30	NC_008320	CAAA	2	8	1571	1578	75 %	0 %	0 %	25 %	113951723
31	NC_008320	GCC	2	6	1686	1691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951724
32	NC_008320	GGC	2	6	1723	1728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113951724
33	NC_008320	CTG	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951724
34	NC_008320	GA	3	6	1813	1818	50 %	0 %	50 %	0 %	113951724
35	NC_008320	AAC	2	6	1822	1827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951724
36	NC_008320	ACA	2	6	1863	1868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951724
37	NC_008320	CTT	2	6	1870	1875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951724
38	NC_008320	TAC	2	6	1888	1893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951724
39	NC_008320	TAA	2	6	1894	1899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113951724
40	NC_008320	GAAA	2	8	1928	1935	75 %	0 %	25 %	0 %	113951724
41	NC_008320	GAA	2	6	1949	1954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951724
42	NC_008320	AGA	2	6	2018	2023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951724
43	NC_008320	AAG	2	6	2041	2046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951724
44	NC_008320	TAT	2	6	2147	2152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113951725
45	NC_008320	ATC	2	6	2163	2168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951725
46	NC_008320	CAA	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951725
47	NC_008320	TTCT	2	8	2204	2211	0 %	75 %	0 %	25 %	113951725
48	NC_008320	TAG	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113951725
49	NC_008320	ACT	2	6	2238	2243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951725
50	NC_008320	ATTA	2	8	2289	2296	50 %	50 %	0 %	0 %	113951725
51	NC_008320	TTG	2	6	2353	2358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113951725
52	NC_008320	T	6	6	2371	2376	0 %	100 %	0 %	0 %	113951725
53	NC_008320	T	6	6	2438	2443	0 %	100 %	0 %	0 %	113951725
54	NC_008320	T	6	6	2473	2478	0 %	100 %	0 %	0 %	113951725
55	NC_008320	TGT	2	6	2528	2533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113951725
56	NC_008320	CT	3	6	2628	2633	0 %	50 %	0 %	50 %	113951726
57	NC_008320	TCT	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951726
58	NC_008320	T	8	8	2663	2670	0 %	100 %	0 %	0 %	113951726
59	NC_008320	TTC	2	6	2695	2700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951726
60	NC_008320	CAAT	2	8	2724	2731	50 %	25 %	0 %	25 %	113951726
61	NC_008320	AAC	2	6	2828	2833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951726
62	NC_008320	TAT	2	6	2850	2855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113951726
63	NC_008320	ACT	2	6	2890	2895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008320	A	6	6	2921	2926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008320	A	6	6	2952	2957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008320	GT	3	6	3000	3005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008320	AAG	2	6	3035	3040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008320	AAT	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008320	CTT	2	6	3051	3056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008320	TCC	2	6	3058	3063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008320	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008320	A	8	8	3101	3108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008320	AGAC	2	8	3112	3119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008320	CGC	2	6	3153	3158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_008320	A	6	6	3168	3173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008320	CAC	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008320	ACG	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008320	CTC	2	6	3408	3413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_008320	TCA	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008320	TATT	2	8	3571	3578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008320	TAG	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008320	A	7	7	3634	3640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008320	CAC	2	6	3641	3646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_008320	TAC	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008320	TGT	2	6	3677	3682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008320	ATT	2	6	3720	3725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008320	ACTC	2	8	3913	3920	25 %	25 %	0 %	50 %	113951727
88	NC_008320	CT	3	6	3975	3980	0 %	50 %	0 %	50 %	113951727
89	NC_008320	TAAC	2	8	4039	4046	50 %	25 %	0 %	25 %	113951727
90	NC_008320	ACA	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008320	ATC	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951728
92	NC_008320	CAA	2	6	4131	4136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951728
93	NC_008320	CAT	2	6	4145	4150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951728
94	NC_008320	CTT	2	6	4218	4223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951728
95	NC_008320	GATA	2	8	4241	4248	50 %	25 %	25 %	0 %	113951728
96	NC_008320	TC	3	6	4258	4263	0 %	50 %	0 %	50 %	113951728
97	NC_008320	GAT	2	6	4265	4270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113951728
98	NC_008320	CTT	2	6	4356	4361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951728
99	NC_008320	CCAC	2	8	4417	4424	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_008320	GGT	2	6	4432	4437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008320	AAT	2	6	4449	4454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008320	GCTC	2	8	4460	4467	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008320	TTA	2	6	4488	4493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008320	AAT	2	6	4495	4500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008320	TGC	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008320	GCA	2	6	4614	4619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008320	ATA	2	6	4622	4627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008320	CAT	2	6	4755	4760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008320	AGA	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008320	T	6	6	4827	4832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008320	CAT	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008320	TTC	2	6	4918	4923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008320	GTG	2	6	4978	4983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113951729
114	NC_008320	TGC	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951729
115	NC_008320	GA	3	6	5010	5015	50 %	0 %	50 %	0 %	113951729
116	NC_008320	ACT	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951729
117	NC_008320	GCC	2	6	5184	5189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951729
118	NC_008320	TTGT	2	8	5228	5235	0 %	75 %	25 %	0 %	113951729
119	NC_008320	CAA	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008320	GGT	2	6	5281	5286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008320	ATC	2	6	5321	5326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008320	GT	3	6	5489	5494	0 %	50 %	50 %	0 %	113951730
123	NC_008320	TTC	2	6	5502	5507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951730
124	NC_008320	CCA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113951730
125	NC_008320	GCT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951730
126	NC_008320	GCT	2	6	5696	5701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951730
127	NC_008320	GTT	2	6	5774	5779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113951730
128	NC_008320	CCGGA	2	10	5787	5796	20 %	0 %	40 %	40 %	113951730
129	NC_008320	CGC	2	6	5843	5848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951730
130	NC_008320	CGC	2	6	5887	5892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951730
131	NC_008320	TGC	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951730
132	NC_008320	CTT	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951730
133	NC_008320	CAA	2	6	6138	6143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951730
134	NC_008320	CTT	2	6	6183	6188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951730
135	NC_008320	A	6	6	6339	6344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008320	AGA	2	6	6398	6403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008320	GATT	2	8	6413	6420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.