MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_008319	CCAA	2	8	2417978	2417985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47502	NC_008319	A	6	6	2418018	2418023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47503	NC_008319	GGC	2	6	2418032	2418037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952813
47504	NC_008319	TTA	2	6	2418052	2418057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113952813
47505	NC_008319	CTG	4	12	2418080	2418091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952813
47506	NC_008319	GAAG	2	8	2418132	2418139	50 %	0 %	50 %	0 %	113952813
47507	NC_008319	TTA	2	6	2418143	2418148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113952813
47508	NC_008319	GCT	2	6	2418222	2418227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952813
47509	NC_008319	ATC	2	6	2418439	2418444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952813
47510	NC_008319	GCA	2	6	2418545	2418550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952813
47511	NC_008319	GGC	2	6	2418576	2418581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952813
47512	NC_008319	TCT	2	6	2418608	2418613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952813
47513	NC_008319	GCA	2	6	2418635	2418640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952813
47514	NC_008319	CTT	2	6	2418643	2418648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952813
47515	NC_008319	AGCA	2	8	2418663	2418670	50 %	0 %	25 %	25 %	113952813
47516	NC_008319	GAGC	2	8	2418692	2418699	25 %	0 %	50 %	25 %	113952813
47517	NC_008319	CTT	2	6	2418751	2418756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952813
47518	NC_008319	ACG	2	6	2418764	2418769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952813
47519	NC_008319	A	6	6	2418826	2418831	100 %	0 %	0 %	0 %	113952813
47520	NC_008319	G	6	6	2418853	2418858	0 %	0 %	100 %	0 %	113952813
47521	NC_008319	TGA	2	6	2418867	2418872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952813
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47523	NC_008319	CAT	2	6	2418918	2418923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952813
47524	NC_008319	TTC	2	6	2418944	2418949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952813
47525	NC_008319	TC	4	8	2418948	2418955	0 %	50 %	0 %	50 %	113952813
47526	NC_008319	ACG	2	6	2419061	2419066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952813
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47535	NC_008319	AGA	7	21	2419620	2419640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952813
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47538	NC_008319	AACAG	2	10	2419878	2419887	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47539	NC_008319	A	6	6	2419897	2419902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47540	NC_008319	ACA	2	6	2419967	2419972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47545	NC_008319	ACA	3	9	2420100	2420108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953450
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47552	NC_008319	CT	3	6	2420527	2420532	0 %	50 %	0 %	50 %	113953450
47553	NC_008319	ACG	2	6	2420613	2420618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953450
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47555	NC_008319	T	7	7	2420638	2420644	0 %	100 %	0 %	0 %	113953450
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47557	NC_008319	CAA	2	6	2420682	2420687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47558	NC_008319	CTG	2	6	2420743	2420748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952807
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47560	NC_008319	TCA	2	6	2420785	2420790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952807
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47562	NC_008319	CCG	2	6	2420878	2420883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47563	NC_008319	A	7	7	2420927	2420933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47564	NC_008319	A	6	6	2421049	2421054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47565	NC_008319	CAA	2	6	2421085	2421090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47569	NC_008319	CGG	2	6	2421185	2421190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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47583	NC_008319	GAT	3	9	2421901	2421909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47586	NC_008319	CAC	2	6	2421978	2421983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47587	NC_008319	A	6	6	2422105	2422110	100 %	0 %	0 %	0 %	113954229
47588	NC_008319	TCA	2	6	2422240	2422245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953800
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47606	NC_008319	CTG	2	6	2422846	2422851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47607	NC_008319	TCG	2	6	2422936	2422941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47608	NC_008319	CTTGG	2	10	2422947	2422956	0 %	40 %	40 %	20 %	113955397
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47611	NC_008319	CCAG	2	8	2423034	2423041	25 %	0 %	25 %	50 %	113955397
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47738	NC_008319	ATC	2	6	2428490	2428495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953790
47739	NC_008319	CCTC	2	8	2428505	2428512	0 %	25 %	0 %	75 %	113953790
47740	NC_008319	ACC	2	6	2428544	2428549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953790
47741	NC_008319	TGAT	2	8	2428552	2428559	25 %	50 %	25 %	0 %	113953790
47742	NC_008319	GAA	2	6	2428632	2428637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953790
47743	NC_008319	TAA	2	6	2428693	2428698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953790
47744	NC_008319	TTC	2	6	2428760	2428765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953790
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47746	NC_008319	GAA	2	6	2428812	2428817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953790
47747	NC_008319	GAT	2	6	2428878	2428883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953790
47748	NC_008319	AGCT	2	8	2428898	2428905	25 %	25 %	25 %	25 %	113953790
47749	NC_008319	AG	3	6	2428956	2428961	50 %	0 %	50 %	0 %	113953790
47750	NC_008319	TGC	2	6	2428984	2428989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953790
47751	NC_008319	GA	3	6	2429093	2429098	50 %	0 %	50 %	0 %	113953790
47752	NC_008319	AACC	2	8	2429122	2429129	50 %	0 %	0 %	50 %	113953790
47753	NC_008319	TCT	2	6	2429142	2429147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953790
47754	NC_008319	GAGTT	2	10	2429167	2429176	20 %	40 %	40 %	0 %	113953790
47755	NC_008319	AAG	2	6	2429181	2429186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953790
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47757	NC_008319	AAAG	2	8	2429339	2429346	75 %	0 %	25 %	0 %	113953790
47758	NC_008319	T	6	6	2429452	2429457	0 %	100 %	0 %	0 %	113953790
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47761	NC_008319	CTG	2	6	2429555	2429560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953790
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47764	NC_008319	CAT	2	6	2429734	2429739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953790
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47766	NC_008319	CAAA	2	8	2429800	2429807	75 %	0 %	0 %	25 %	113953790
47767	NC_008319	CAA	2	6	2429827	2429832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953790
47768	NC_008319	TCTGCA	2	12	2429977	2429988	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113953790
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47796	NC_008319	T	8	8	2431710	2431717	0 %	100 %	0 %	0 %	113953738
47797	NC_008319	AGC	2	6	2431737	2431742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953738
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47799	NC_008319	ATT	2	6	2431938	2431943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953738
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47801	NC_008319	CAC	2	6	2432042	2432047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953738
47802	NC_008319	A	6	6	2432059	2432064	100 %	0 %	0 %	0 %	113953738
47803	NC_008319	TTGT	2	8	2432097	2432104	0 %	75 %	25 %	0 %	113953738
47804	NC_008319	ATC	2	6	2432137	2432142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953738
47805	NC_008319	TCAA	2	8	2432289	2432296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47806	NC_008319	TCT	2	6	2432320	2432325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953976
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47812	NC_008319	CCA	2	6	2432632	2432637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953976
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47814	NC_008319	TGC	2	6	2432711	2432716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953976
47815	NC_008319	TTC	2	6	2432736	2432741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953976
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47824	NC_008319	CAC	2	6	2432999	2433004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953976
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47831	NC_008319	GAC	2	6	2433398	2433403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953976
47832	NC_008319	CACC	2	8	2433451	2433458	25 %	0 %	0 %	75 %	113953976
47833	NC_008319	ACC	2	6	2433461	2433466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953976
47834	NC_008319	GT	3	6	2433484	2433489	0 %	50 %	50 %	0 %	113953976
47835	NC_008319	CAC	2	6	2433497	2433502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953976
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47837	NC_008319	GCT	2	6	2433534	2433539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953976
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47841	NC_008319	CAG	2	6	2433854	2433859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953976
47842	NC_008319	CTC	2	6	2433896	2433901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953976
47843	NC_008319	CCT	2	6	2433925	2433930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953976
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47845	NC_008319	CAC	2	6	2434034	2434039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953976
47846	NC_008319	TTGC	2	8	2434080	2434087	0 %	50 %	25 %	25 %	113953976
47847	NC_008319	GA	3	6	2434145	2434150	50 %	0 %	50 %	0 %	113953976
47848	NC_008319	TCG	2	6	2434164	2434169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953976
47849	NC_008319	TGG	2	6	2434173	2434178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953976
47850	NC_008319	GCC	3	9	2434200	2434208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953976
47851	NC_008319	GCG	2	6	2434315	2434320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953976
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47853	NC_008319	TCA	2	6	2434410	2434415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953976
47854	NC_008319	GTA	2	6	2434436	2434441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953976
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47856	NC_008319	CTG	2	6	2434652	2434657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953976
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47858	NC_008319	A	6	6	2434697	2434702	100 %	0 %	0 %	0 %	113953976
47859	NC_008319	TGCCG	2	10	2434710	2434719	0 %	20 %	40 %	40 %	113953976
47860	NC_008319	CTG	2	6	2434793	2434798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953976
47861	NC_008319	AGG	2	6	2434870	2434875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953976
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47863	NC_008319	G	6	6	2434948	2434953	0 %	0 %	100 %	0 %	113953976
47864	NC_008319	GCA	2	6	2434956	2434961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953976
47865	NC_008319	CGA	2	6	2434970	2434975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953976
47866	NC_008319	CAA	2	6	2435005	2435010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47867	NC_008319	AGC	2	6	2435038	2435043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955018
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47885	NC_008319	AGA	2	6	2436043	2436048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955603
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47887	NC_008319	GC	3	6	2436151	2436156	0 %	0 %	50 %	50 %	113955603
47888	NC_008319	TGC	2	6	2436173	2436178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955603
47889	NC_008319	GAC	2	6	2436192	2436197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955603
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47893	NC_008319	TGC	2	6	2436403	2436408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955603
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47897	NC_008319	GTTT	2	8	2436688	2436695	0 %	75 %	25 %	0 %	113955603
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47905	NC_008319	CGA	2	6	2437021	2437026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955603
47906	NC_008319	GAT	2	6	2437060	2437065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955603
47907	NC_008319	ACC	2	6	2437125	2437130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955603
47908	NC_008319	AG	4	8	2437195	2437202	50 %	0 %	50 %	0 %	113955603
47909	NC_008319	GGCT	2	8	2437208	2437215	0 %	25 %	50 %	25 %	113955603
47910	NC_008319	GCT	2	6	2437285	2437290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955603
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47916	NC_008319	TCGCA	2	10	2437648	2437657	20 %	20 %	20 %	40 %	113955603
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47940	NC_008319	TCA	2	6	2438720	2438725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953125
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47943	NC_008319	GAC	2	6	2438807	2438812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953125
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47953	NC_008319	GCA	2	6	2439453	2439458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953125
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47955	NC_008319	CAT	2	6	2439537	2439542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953894
47956	NC_008319	ACC	2	6	2439550	2439555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953894
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47962	NC_008319	AAG	2	6	2439914	2439919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953894
47963	NC_008319	AAT	2	6	2439970	2439975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953894
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47997	NC_008319	AG	3	6	2441367	2441372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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47999	NC_008319	TGC	2	6	2441445	2441450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955190
48000	NC_008319	TGA	2	6	2441512	2441517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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