MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_008319	TC	3	6	2316636	2316641	0 %	50 %	0 %	50 %	113955599
45502	NC_008319	AAC	2	6	2316642	2316647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955599
45503	NC_008319	GGC	2	6	2316651	2316656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955599
45504	NC_008319	CCA	2	6	2316729	2316734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955599
45505	NC_008319	GGC	2	6	2316838	2316843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955599
45506	NC_008319	TTG	2	6	2317025	2317030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955599
45507	NC_008319	CAA	2	6	2317220	2317225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955599
45508	NC_008319	GT	3	6	2317236	2317241	0 %	50 %	50 %	0 %	113955599
45509	NC_008319	GCC	2	6	2317250	2317255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955599
45510	NC_008319	CGCC	2	8	2317381	2317388	0 %	0 %	25 %	75 %	113955599
45511	NC_008319	GCT	2	6	2317450	2317455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955599
45512	NC_008319	CAGCA	2	10	2317493	2317502	40 %	0 %	20 %	40 %	113955599
45513	NC_008319	GTT	2	6	2317556	2317561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955599
45514	NC_008319	CGC	2	6	2317565	2317570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955599
45515	NC_008319	GCC	2	6	2317573	2317578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955599
45516	NC_008319	CCG	2	6	2317582	2317587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955599
45517	NC_008319	TGA	2	6	2317662	2317667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953078
45518	NC_008319	CG	3	6	2317718	2317723	0 %	0 %	50 %	50 %	113953078
45519	NC_008319	AC	3	6	2317761	2317766	50 %	0 %	0 %	50 %	113953078
45520	NC_008319	AAG	2	6	2317831	2317836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953078
45521	NC_008319	TGC	2	6	2317894	2317899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953078
45522	NC_008319	CAA	2	6	2317906	2317911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953078
45523	NC_008319	GCT	2	6	2317914	2317919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953078
45524	NC_008319	CGA	2	6	2317947	2317952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953078
45525	NC_008319	TCA	2	6	2317955	2317960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953078
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45527	NC_008319	GCA	2	6	2318091	2318096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953078
45528	NC_008319	CAT	2	6	2318119	2318124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953078
45529	NC_008319	CTG	2	6	2318155	2318160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953078
45530	NC_008319	TGA	2	6	2318166	2318171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953078
45531	NC_008319	AGC	2	6	2318267	2318272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953078
45532	NC_008319	TTGGC	2	10	2318348	2318357	0 %	40 %	40 %	20 %	113953898
45533	NC_008319	CAC	2	6	2318469	2318474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953898
45534	NC_008319	ACC	2	6	2318510	2318515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953898
45535	NC_008319	GAT	2	6	2318603	2318608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953898
45536	NC_008319	GAC	2	6	2318868	2318873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953898
45537	NC_008319	TGC	2	6	2318886	2318891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45538	NC_008319	TGG	2	6	2318990	2318995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952891
45539	NC_008319	GCC	4	12	2319047	2319058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952891
45540	NC_008319	CAA	2	6	2319142	2319147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952891
45541	NC_008319	TGCTC	2	10	2319151	2319160	0 %	40 %	20 %	40 %	113952891
45542	NC_008319	TCGC	2	8	2319177	2319184	0 %	25 %	25 %	50 %	113952891
45543	NC_008319	CAT	2	6	2319227	2319232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952891
45544	NC_008319	TC	3	6	2319286	2319291	0 %	50 %	0 %	50 %	113952891
45545	NC_008319	GCC	2	6	2319332	2319337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952891
45546	NC_008319	CAA	2	6	2319376	2319381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952891
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45548	NC_008319	TCA	2	6	2319654	2319659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952891
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45550	NC_008319	GCA	2	6	2319987	2319992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952891
45551	NC_008319	ACG	2	6	2320032	2320037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952891
45552	NC_008319	AGC	2	6	2320140	2320145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952820
45553	NC_008319	GC	3	6	2320234	2320239	0 %	0 %	50 %	50 %	113952820
45554	NC_008319	GCC	2	6	2320272	2320277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952820
45555	NC_008319	CAG	2	6	2320288	2320293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952820
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45557	NC_008319	GCA	2	6	2320345	2320350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952820
45558	NC_008319	TCA	2	6	2320471	2320476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952820
45559	NC_008319	ATCA	2	8	2320551	2320558	50 %	25 %	0 %	25 %	113952820
45560	NC_008319	TGG	2	6	2320582	2320587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952820
45561	NC_008319	TTCC	2	8	2320626	2320633	0 %	50 %	0 %	50 %	113952820
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45572	NC_008319	CCA	3	9	2321037	2321045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953469
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45575	NC_008319	CTG	3	9	2321148	2321156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953469
45576	NC_008319	AGGCC	2	10	2321184	2321193	20 %	0 %	40 %	40 %	113953469
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45578	NC_008319	CAGGC	2	10	2321253	2321262	20 %	0 %	40 %	40 %	113953469
45579	NC_008319	CCAC	2	8	2321297	2321304	25 %	0 %	0 %	75 %	113953469
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45582	NC_008319	GA	3	6	2321395	2321400	50 %	0 %	50 %	0 %	113953469
45583	NC_008319	CCTGTT	2	12	2321489	2321500	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	113954684
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45585	NC_008319	GGA	2	6	2321549	2321554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954684
45586	NC_008319	ACG	2	6	2321568	2321573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954684
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45588	NC_008319	CGT	2	6	2321728	2321733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954684
45589	NC_008319	G	7	7	2321739	2321745	0 %	0 %	100 %	0 %	113954684
45590	NC_008319	AAC	2	6	2321747	2321752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954684
45591	NC_008319	GCC	2	6	2321773	2321778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954684
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45594	NC_008319	AAGG	2	8	2322096	2322103	50 %	0 %	50 %	0 %	113954684
45595	NC_008319	AGC	4	12	2322117	2322128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954684
45596	NC_008319	CCAA	2	8	2322154	2322161	50 %	0 %	0 %	50 %	113954684
45597	NC_008319	ACGC	2	8	2322162	2322169	25 %	0 %	25 %	50 %	113954684
45598	NC_008319	ACC	3	9	2322201	2322209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954684
45599	NC_008319	GCT	2	6	2322257	2322262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954684
45600	NC_008319	AGA	2	6	2322321	2322326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954684
45601	NC_008319	TCCT	2	8	2322348	2322355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45602	NC_008319	TCA	2	6	2322385	2322390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954025
45603	NC_008319	TGG	2	6	2322421	2322426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954025
45604	NC_008319	CATG	2	8	2322452	2322459	25 %	25 %	25 %	25 %	113954025
45605	NC_008319	TCG	2	6	2322472	2322477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954025
45606	NC_008319	GTG	2	6	2322633	2322638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954025
45607	NC_008319	GCTA	2	8	2322681	2322688	25 %	25 %	25 %	25 %	113954025
45608	NC_008319	ACC	2	6	2322727	2322732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954025
45609	NC_008319	GAT	2	6	2322806	2322811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954025
45610	NC_008319	CAA	3	9	2322851	2322859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954025
45611	NC_008319	GGT	2	6	2322873	2322878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954025
45612	NC_008319	GCC	2	6	2322882	2322887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954025
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45616	NC_008319	CGC	2	6	2322993	2322998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954025
45617	NC_008319	ACG	2	6	2323117	2323122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954025
45618	NC_008319	AGG	2	6	2323150	2323155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954025
45619	NC_008319	CGG	2	6	2323241	2323246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954025
45620	NC_008319	A	6	6	2323329	2323334	100 %	0 %	0 %	0 %	113954025
45621	NC_008319	CAA	2	6	2323421	2323426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954025
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45623	NC_008319	CAA	2	6	2323469	2323474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954025
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45625	NC_008319	CAT	2	6	2323520	2323525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954025
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45627	NC_008319	TTC	2	6	2323616	2323621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953048
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45630	NC_008319	CTGG	2	8	2323677	2323684	0 %	25 %	50 %	25 %	113953048
45631	NC_008319	GGC	2	6	2323810	2323815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953048
45632	NC_008319	CAT	2	6	2323894	2323899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953048
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45636	NC_008319	GCC	2	6	2324092	2324097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955316
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45644	NC_008319	CTGG	2	8	2324448	2324455	0 %	25 %	50 %	25 %	113955316
45645	NC_008319	CGT	2	6	2324497	2324502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954629
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45647	NC_008319	GCA	2	6	2324552	2324557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954629
45648	NC_008319	CAT	2	6	2324588	2324593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954629
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45652	NC_008319	GAT	2	6	2324750	2324755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953847
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45654	NC_008319	CCGC	2	8	2324814	2324821	0 %	0 %	25 %	75 %	113953847
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45668	NC_008319	GCA	2	6	2325263	2325268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954128
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45674	NC_008319	CGC	2	6	2325463	2325468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954128
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45684	NC_008319	CGG	2	6	2325816	2325821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954128
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45715	NC_008319	CGGC	2	8	2327112	2327119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45716	NC_008319	TCC	2	6	2327124	2327129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45717	NC_008319	CAA	2	6	2327135	2327140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45718	NC_008319	TGC	2	6	2327154	2327159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45720	NC_008319	GGCT	2	8	2327184	2327191	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45721	NC_008319	AGG	2	6	2327246	2327251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955548
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45723	NC_008319	GCA	2	6	2327358	2327363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955548
45724	NC_008319	GCCGCT	2	12	2327375	2327386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	113955548
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45726	NC_008319	TGCC	2	8	2327463	2327470	0 %	25 %	25 %	50 %	113955548
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45728	NC_008319	TGA	2	6	2327558	2327563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955548
45729	NC_008319	ACA	2	6	2327577	2327582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955548
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45732	NC_008319	GCCA	2	8	2327702	2327709	25 %	0 %	25 %	50 %	113955548
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45840	NC_008319	CACC	2	8	2333625	2333632	25 %	0 %	0 %	75 %	113955462
45841	NC_008319	GT	3	6	2333646	2333651	0 %	50 %	50 %	0 %	113955462
45842	NC_008319	TCGC	2	8	2333666	2333673	0 %	25 %	25 %	50 %	113955462
45843	NC_008319	CTGG	2	8	2333851	2333858	0 %	25 %	50 %	25 %	113955462
45844	NC_008319	ACG	2	6	2333859	2333864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955462
45845	NC_008319	GCT	2	6	2333956	2333961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955462
45846	NC_008319	AAG	2	6	2334018	2334023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45967	NC_008319	AACC	2	8	2339919	2339926	50 %	0 %	0 %	50 %	113952763
45968	NC_008319	AG	4	8	2339992	2339999	50 %	0 %	50 %	0 %	113952763
45969	NC_008319	ACG	2	6	2340053	2340058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952763
45970	NC_008319	AAG	2	6	2340140	2340145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952763
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45982	NC_008319	GTTCCG	2	12	2340702	2340713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952763
45983	NC_008319	CG	3	6	2340730	2340735	0 %	0 %	50 %	50 %	113952763
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45988	NC_008319	CTC	2	6	2340994	2340999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955453
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45991	NC_008319	ATC	2	6	2341177	2341182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45999	NC_008319	GAA	2	6	2341608	2341613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954671
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