MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_008319	CTG	2	6	2289737	2289742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953309
45003	NC_008319	AGC	2	6	2289853	2289858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953309
45004	NC_008319	TGA	2	6	2289945	2289950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953309
45005	NC_008319	CGC	2	6	2289990	2289995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953309
45006	NC_008319	TGC	2	6	2290034	2290039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953309
45007	NC_008319	ATCGCG	2	12	2290057	2290068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113953309
45008	NC_008319	T	6	6	2290076	2290081	0 %	100 %	0 %	0 %	113953309
45009	NC_008319	GGGA	2	8	2290107	2290114	25 %	0 %	75 %	0 %	113953309
45010	NC_008319	TCAC	2	8	2290125	2290132	25 %	25 %	0 %	50 %	113953309
45011	NC_008319	TGAGC	2	10	2290148	2290157	20 %	20 %	40 %	20 %	113953309
45012	NC_008319	TTG	2	6	2290236	2290241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954445
45013	NC_008319	A	6	6	2290298	2290303	100 %	0 %	0 %	0 %	113954445
45014	NC_008319	TTG	2	6	2290313	2290318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954445
45015	NC_008319	TCA	2	6	2290347	2290352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954445
45016	NC_008319	C	6	6	2290388	2290393	0 %	0 %	0 %	100 %	113954445
45017	NC_008319	TCG	2	6	2290452	2290457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954445
45018	NC_008319	GCT	2	6	2290501	2290506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954445
45019	NC_008319	TGA	2	6	2290509	2290514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954445
45020	NC_008319	CTT	2	6	2290558	2290563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954445
45021	NC_008319	CAG	2	6	2290582	2290587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954445
45022	NC_008319	TGG	2	6	2290647	2290652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954445
45023	NC_008319	CCT	2	6	2290659	2290664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954445
45024	NC_008319	TTGG	2	8	2290670	2290677	0 %	50 %	50 %	0 %	113954445
45025	NC_008319	CGC	2	6	2290708	2290713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954445
45026	NC_008319	CAG	3	9	2290827	2290835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954445
45027	NC_008319	CT	3	6	2290872	2290877	0 %	50 %	0 %	50 %	113954445
45028	NC_008319	CCA	2	6	2290989	2290994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954445
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45030	NC_008319	A	6	6	2291135	2291140	100 %	0 %	0 %	0 %	113954445
45031	NC_008319	ATG	2	6	2291177	2291182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954445
45032	NC_008319	GCG	2	6	2291196	2291201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954445
45033	NC_008319	CTT	2	6	2291239	2291244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954445
45034	NC_008319	TGT	2	6	2291253	2291258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954445
45035	NC_008319	CCATG	2	10	2291281	2291290	20 %	20 %	20 %	40 %	113954445
45036	NC_008319	TGG	2	6	2291298	2291303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954445
45037	NC_008319	T	6	6	2291380	2291385	0 %	100 %	0 %	0 %	113954445
45038	NC_008319	TG	3	6	2291393	2291398	0 %	50 %	50 %	0 %	113954445
45039	NC_008319	ACA	2	6	2291584	2291589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954445
45040	NC_008319	GGC	2	6	2291599	2291604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954445
45041	NC_008319	GAAA	2	8	2291610	2291617	75 %	0 %	25 %	0 %	113954445
45042	NC_008319	GAG	2	6	2291621	2291626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954445
45043	NC_008319	ACC	2	6	2291634	2291639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954445
45044	NC_008319	GCT	2	6	2291758	2291763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954445
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45046	NC_008319	GCA	2	6	2291777	2291782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954445
45047	NC_008319	TTCC	2	8	2291813	2291820	0 %	50 %	0 %	50 %	113954445
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45049	NC_008319	CAAA	2	8	2291949	2291956	75 %	0 %	0 %	25 %	113954445
45050	NC_008319	GTT	2	6	2291983	2291988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954445
45051	NC_008319	GCA	2	6	2291994	2291999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954445
45052	NC_008319	GTG	2	6	2292053	2292058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954445
45053	NC_008319	CGG	2	6	2292148	2292153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954445
45054	NC_008319	TG	3	6	2292232	2292237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45055	NC_008319	GTG	2	6	2292291	2292296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45056	NC_008319	CGTTC	2	10	2292432	2292441	0 %	40 %	20 %	40 %	113954548
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45058	NC_008319	GCTG	2	8	2292581	2292588	0 %	25 %	50 %	25 %	113954548
45059	NC_008319	TCA	2	6	2292659	2292664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954548
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45061	NC_008319	TTC	3	9	2292715	2292723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954548
45062	NC_008319	GATG	2	8	2292735	2292742	25 %	25 %	50 %	0 %	113954548
45063	NC_008319	TTC	2	6	2292784	2292789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954548
45064	NC_008319	GCT	2	6	2292807	2292812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954548
45065	NC_008319	CTTG	2	8	2292825	2292832	0 %	50 %	25 %	25 %	113954548
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45067	NC_008319	CT	3	6	2292897	2292902	0 %	50 %	0 %	50 %	113954548
45068	NC_008319	T	6	6	2292934	2292939	0 %	100 %	0 %	0 %	113954548
45069	NC_008319	GTT	2	6	2293023	2293028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954548
45070	NC_008319	TCCAC	2	10	2293059	2293068	20 %	20 %	0 %	60 %	113954548
45071	NC_008319	TGG	2	6	2293214	2293219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954548
45072	NC_008319	CAT	2	6	2293236	2293241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954548
45073	NC_008319	TGC	2	6	2293370	2293375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954548
45074	NC_008319	TTC	2	6	2293411	2293416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954548
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45077	NC_008319	CAT	2	6	2293491	2293496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954548
45078	NC_008319	TGC	2	6	2293516	2293521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954548
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45080	NC_008319	TGAT	2	8	2293625	2293632	25 %	50 %	25 %	0 %	113954548
45081	NC_008319	GA	4	8	2293686	2293693	50 %	0 %	50 %	0 %	113954548
45082	NC_008319	TCT	2	6	2293694	2293699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954548
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45084	NC_008319	CAT	2	6	2293767	2293772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954548
45085	NC_008319	CTG	2	6	2293780	2293785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954548
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45087	NC_008319	TGA	2	6	2293820	2293825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954548
45088	NC_008319	GCA	2	6	2293916	2293921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954548
45089	NC_008319	GCCA	3	12	2293966	2293977	25 %	0 %	25 %	50 %	113954548
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45094	NC_008319	CGA	2	6	2294424	2294429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953812
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45097	NC_008319	T	6	6	2294687	2294692	0 %	100 %	0 %	0 %	113953400
45098	NC_008319	TGC	2	6	2294732	2294737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953400
45099	NC_008319	GGA	2	6	2294754	2294759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953400
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45101	NC_008319	TGG	2	6	2294815	2294820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953400
45102	NC_008319	CCCT	2	8	2294851	2294858	0 %	25 %	0 %	75 %	113953400
45103	NC_008319	ATG	2	6	2294868	2294873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953400
45104	NC_008319	CTC	3	9	2294974	2294982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953400
45105	NC_008319	GGC	2	6	2294989	2294994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953400
45106	NC_008319	CGA	2	6	2295053	2295058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953400
45107	NC_008319	GCGTCA	2	12	2295074	2295085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113953400
45108	NC_008319	GCAC	2	8	2295347	2295354	25 %	0 %	25 %	50 %	113953400
45109	NC_008319	GCC	2	6	2295453	2295458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953400
45110	NC_008319	TGA	2	6	2295476	2295481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45111	NC_008319	GAT	2	6	2295578	2295583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954326
45112	NC_008319	CTG	2	6	2295615	2295620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954326
45113	NC_008319	GAA	2	6	2295678	2295683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954326
45114	NC_008319	GGT	2	6	2295792	2295797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954326
45115	NC_008319	A	7	7	2295801	2295807	100 %	0 %	0 %	0 %	113954326
45116	NC_008319	T	6	6	2295825	2295830	0 %	100 %	0 %	0 %	113954326
45117	NC_008319	GTG	2	6	2295843	2295848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954326
45118	NC_008319	TG	3	6	2295850	2295855	0 %	50 %	50 %	0 %	113954326
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45132	NC_008319	GC	3	6	2296891	2296896	0 %	0 %	50 %	50 %	113955076
45133	NC_008319	TCGGC	2	10	2296938	2296947	0 %	20 %	40 %	40 %	113955076
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45141	NC_008319	GCA	2	6	2297331	2297336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955076
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45145	NC_008319	GAG	2	6	2297649	2297654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45146	NC_008319	ATC	2	6	2297697	2297702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953858
45147	NC_008319	A	6	6	2297810	2297815	100 %	0 %	0 %	0 %	113953858
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45152	NC_008319	CAAA	2	8	2297973	2297980	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45153	NC_008319	GCAT	2	8	2298054	2298061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45154	NC_008319	T	7	7	2298104	2298110	0 %	100 %	0 %	0 %	113953036
45155	NC_008319	CAATC	2	10	2298131	2298140	40 %	20 %	0 %	40 %	113953036
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45189	NC_008319	CAG	2	6	2299855	2299860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953933
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45193	NC_008319	CAA	2	6	2299944	2299949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953515
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45218	NC_008319	TCA	2	6	2300927	2300932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955570
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45220	NC_008319	CA	3	6	2300970	2300975	50 %	0 %	0 %	50 %	113955570
45221	NC_008319	AATG	2	8	2301008	2301015	50 %	25 %	25 %	0 %	113955570
45222	NC_008319	ATG	2	6	2301232	2301237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45223	NC_008319	CCG	2	6	2301238	2301243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45224	NC_008319	GCC	2	6	2301267	2301272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953130
45225	NC_008319	GCT	2	6	2301301	2301306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953130
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45229	NC_008319	TAAA	2	8	2301552	2301559	75 %	25 %	0 %	0 %	113953130
45230	NC_008319	GAG	2	6	2301570	2301575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953130
45231	NC_008319	AGA	2	6	2301611	2301616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953130
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45233	NC_008319	TTG	2	6	2301786	2301791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953130
45234	NC_008319	TCA	3	9	2301824	2301832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953130
45235	NC_008319	ACC	2	6	2301897	2301902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953130
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45242	NC_008319	TTG	2	6	2302200	2302205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953130
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45245	NC_008319	GGGAA	2	10	2302285	2302294	40 %	0 %	60 %	0 %	113953130
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45270	NC_008319	TCA	2	6	2303653	2303658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45302	NC_008319	CTCTG	2	10	2305669	2305678	0 %	40 %	20 %	40 %	113953320
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45318	NC_008319	CCA	2	6	2306182	2306187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45319	NC_008319	TG	3	6	2306225	2306230	0 %	50 %	50 %	0 %	113953279
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45325	NC_008319	TGCT	2	8	2306468	2306475	0 %	50 %	25 %	25 %	113953279
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45329	NC_008319	TGA	2	6	2306598	2306603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953279
45330	NC_008319	TCAC	2	8	2306610	2306617	25 %	25 %	0 %	50 %	113953279
45331	NC_008319	CCCA	2	8	2306618	2306625	25 %	0 %	0 %	75 %	113953279
45332	NC_008319	GAG	2	6	2306666	2306671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953279
45333	NC_008319	GAA	2	6	2306692	2306697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953279
45334	NC_008319	AGCCA	2	10	2306702	2306711	40 %	0 %	20 %	40 %	113953279
45335	NC_008319	GC	3	6	2306774	2306779	0 %	0 %	50 %	50 %	113953279
45336	NC_008319	TCTCG	2	10	2306924	2306933	0 %	40 %	20 %	40 %	113953279
45337	NC_008319	GCG	2	6	2307036	2307041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953279
45338	NC_008319	TGC	2	6	2307178	2307183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953279
45339	NC_008319	TGC	2	6	2307193	2307198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953279
45340	NC_008319	GTT	2	6	2307296	2307301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954086
45341	NC_008319	G	7	7	2307310	2307316	0 %	0 %	100 %	0 %	113954086
45342	NC_008319	ACC	2	6	2307360	2307365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954086
45343	NC_008319	CGA	2	6	2307425	2307430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954086
45344	NC_008319	AAC	2	6	2307537	2307542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954086
45345	NC_008319	GAC	2	6	2307559	2307564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954086
45346	NC_008319	GAT	2	6	2307585	2307590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954086
45347	NC_008319	T	6	6	2307666	2307671	0 %	100 %	0 %	0 %	113954086
45348	NC_008319	GGC	2	6	2307689	2307694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954086
45349	NC_008319	AAG	2	6	2307708	2307713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954086
45350	NC_008319	GGA	2	6	2307806	2307811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954086
45351	NC_008319	ACC	2	6	2307829	2307834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954086
45352	NC_008319	ACG	2	6	2307841	2307846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954086
45353	NC_008319	ACG	2	6	2307877	2307882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954086
45354	NC_008319	AAC	2	6	2307980	2307985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954086
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45361	NC_008319	CA	3	6	2308178	2308183	50 %	0 %	0 %	50 %	113954086
45362	NC_008319	CAG	2	6	2308251	2308256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954086
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45412	NC_008319	CACT	2	8	2311319	2311326	25 %	25 %	0 %	50 %	113954514
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45414	NC_008319	CAGC	2	8	2311359	2311366	25 %	0 %	25 %	50 %	113954514
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45420	NC_008319	AGGA	2	8	2311689	2311696	50 %	0 %	50 %	0 %	113954514
45421	NC_008319	GCA	2	6	2311736	2311741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954514
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45427	NC_008319	G	7	7	2311948	2311954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45428	NC_008319	TGGC	2	8	2311979	2311986	0 %	25 %	50 %	25 %	113955534
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45432	NC_008319	AG	3	6	2312278	2312283	50 %	0 %	50 %	0 %	113955534
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45451	NC_008319	AACC	2	8	2313485	2313492	50 %	0 %	0 %	50 %	113953062
45452	NC_008319	A	6	6	2313521	2313526	100 %	0 %	0 %	0 %	113953062
45453	NC_008319	TGG	2	6	2313559	2313564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953062
45454	NC_008319	CTGG	2	8	2313608	2313615	0 %	25 %	50 %	25 %	113953062
45455	NC_008319	GAC	2	6	2313619	2313624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953062
45456	NC_008319	GCT	2	6	2313644	2313649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953062
45457	NC_008319	AGCC	2	8	2313729	2313736	25 %	0 %	25 %	50 %	113953062
45458	NC_008319	AGA	2	6	2313774	2313779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953062
45459	NC_008319	A	8	8	2313824	2313831	100 %	0 %	0 %	0 %	113953062
45460	NC_008319	GGGA	2	8	2313880	2313887	25 %	0 %	75 %	0 %	113953062
45461	NC_008319	GAAG	2	8	2313895	2313902	50 %	0 %	50 %	0 %	113953062
45462	NC_008319	AAC	2	6	2313924	2313929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953062
45463	NC_008319	TG	3	6	2314081	2314086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45464	NC_008319	ACC	2	6	2314155	2314160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954304
45465	NC_008319	CCA	2	6	2314290	2314295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954304
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45467	NC_008319	GTG	2	6	2314374	2314379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954304
45468	NC_008319	AGC	2	6	2314406	2314411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954304
45469	NC_008319	CCA	2	6	2314471	2314476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954304
45470	NC_008319	TTC	2	6	2314532	2314537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954304
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45481	NC_008319	CACAG	2	10	2315303	2315312	40 %	0 %	20 %	40 %	113954273
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45492	NC_008319	CAA	2	6	2315995	2316000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954931
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