MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_008319	CAC	2	6	2210033	2210038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952796
43502	NC_008319	ACA	2	6	2210066	2210071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952796
43503	NC_008319	GA	3	6	2210125	2210130	50 %	0 %	50 %	0 %	113952796
43504	NC_008319	GATCG	2	10	2210134	2210143	20 %	20 %	40 %	20 %	113952796
43505	NC_008319	TTG	2	6	2210147	2210152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952796
43506	NC_008319	TGA	2	6	2210211	2210216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952796
43507	NC_008319	CAT	2	6	2210244	2210249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952796
43508	NC_008319	CAA	2	6	2210292	2210297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952796
43509	NC_008319	ACT	2	6	2210358	2210363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952796
43510	NC_008319	CCTTGC	2	12	2210436	2210447	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	113952796
43511	NC_008319	GCT	2	6	2210557	2210562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952796
43512	NC_008319	CAAA	2	8	2210603	2210610	75 %	0 %	0 %	25 %	113952796
43513	NC_008319	TAC	2	6	2210662	2210667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952796
43514	NC_008319	AAG	2	6	2210726	2210731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952796
43515	NC_008319	GCAAA	2	10	2210752	2210761	60 %	0 %	20 %	20 %	113952796
43516	NC_008319	TGC	2	6	2210769	2210774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952796
43517	NC_008319	ACTT	2	8	2211010	2211017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43518	NC_008319	GAT	2	6	2211043	2211048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43519	NC_008319	TAAT	2	8	2211097	2211104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43520	NC_008319	GAC	2	6	2211113	2211118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43521	NC_008319	TCA	2	6	2211180	2211185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953916
43522	NC_008319	TCGA	2	8	2211217	2211224	25 %	25 %	25 %	25 %	113953916
43523	NC_008319	AAC	2	6	2211232	2211237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953916
43524	NC_008319	CAT	2	6	2211282	2211287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953916
43525	NC_008319	CGG	2	6	2211309	2211314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953916
43526	NC_008319	AGG	2	6	2211349	2211354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953916
43527	NC_008319	CACC	2	8	2211399	2211406	25 %	0 %	0 %	75 %	113953916
43528	NC_008319	CCT	2	6	2211426	2211431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953916
43529	NC_008319	ATCAC	2	10	2211527	2211536	40 %	20 %	0 %	40 %	113953916
43530	NC_008319	CAA	2	6	2211547	2211552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953916
43531	NC_008319	GTCT	2	8	2211586	2211593	0 %	50 %	25 %	25 %	113953916
43532	NC_008319	TCA	2	6	2211914	2211919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953916
43533	NC_008319	A	6	6	2211985	2211990	100 %	0 %	0 %	0 %	113953916
43534	NC_008319	GCG	2	6	2211991	2211996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953916
43535	NC_008319	ACA	2	6	2212076	2212081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953916
43536	NC_008319	TGCG	2	8	2212092	2212099	0 %	25 %	50 %	25 %	113953916
43537	NC_008319	AACG	2	8	2212111	2212118	50 %	0 %	25 %	25 %	113953916
43538	NC_008319	TCA	2	6	2212250	2212255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953916
43539	NC_008319	TGA	2	6	2212259	2212264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953916
43540	NC_008319	AGA	2	6	2212294	2212299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43541	NC_008319	GAT	2	6	2212378	2212383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43542	NC_008319	ATGG	2	8	2212387	2212394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43543	NC_008319	CAG	2	6	2212433	2212438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954424
43544	NC_008319	TGT	2	6	2212477	2212482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954424
43545	NC_008319	TGC	2	6	2212517	2212522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954424
43546	NC_008319	CTT	2	6	2212584	2212589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954424
43547	NC_008319	GGA	3	9	2212610	2212618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954424
43548	NC_008319	GCC	2	6	2212793	2212798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955091
43549	NC_008319	CCGCTT	2	12	2212799	2212810	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	113955091
43550	NC_008319	AGA	2	6	2212823	2212828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955091
43551	NC_008319	GC	3	6	2212914	2212919	0 %	0 %	50 %	50 %	113955091
43552	NC_008319	AGG	2	6	2212997	2213002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955091
43553	NC_008319	AGG	2	6	2213020	2213025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955091
43554	NC_008319	ACC	2	6	2213092	2213097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955091
43555	NC_008319	TCC	2	6	2213174	2213179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43556	NC_008319	TTC	2	6	2213221	2213226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43557	NC_008319	GGC	2	6	2213271	2213276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952864
43558	NC_008319	CAG	2	6	2213289	2213294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952864
43559	NC_008319	GAT	2	6	2213310	2213315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952864
43560	NC_008319	CCG	2	6	2213425	2213430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953052
43561	NC_008319	AAC	2	6	2213442	2213447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953052
43562	NC_008319	CTT	2	6	2213464	2213469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953052
43563	NC_008319	GCA	2	6	2213545	2213550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953052
43564	NC_008319	CAGC	2	8	2213561	2213568	25 %	0 %	25 %	50 %	113953052
43565	NC_008319	GAAC	2	8	2213571	2213578	50 %	0 %	25 %	25 %	113953052
43566	NC_008319	CTC	2	6	2213625	2213630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953052
43567	NC_008319	GACG	2	8	2213652	2213659	25 %	0 %	50 %	25 %	113953052
43568	NC_008319	TCC	2	6	2213666	2213671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953052
43569	NC_008319	TGA	2	6	2213721	2213726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953052
43570	NC_008319	CTC	2	6	2213788	2213793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953052
43571	NC_008319	TCTG	2	8	2213804	2213811	0 %	50 %	25 %	25 %	113953052
43572	NC_008319	CTG	3	9	2213809	2213817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953052
43573	NC_008319	GC	3	6	2213847	2213852	0 %	0 %	50 %	50 %	113953052
43574	NC_008319	GAAGG	2	10	2213884	2213893	40 %	0 %	60 %	0 %	113953052
43575	NC_008319	TGAA	2	8	2213930	2213937	50 %	25 %	25 %	0 %	113953052
43576	NC_008319	GTG	2	6	2214005	2214010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953052
43577	NC_008319	CCAC	2	8	2214016	2214023	25 %	0 %	0 %	75 %	113953052
43578	NC_008319	T	7	7	2214032	2214038	0 %	100 %	0 %	0 %	113953052
43579	NC_008319	GGGC	2	8	2214148	2214155	0 %	0 %	75 %	25 %	113953052
43580	NC_008319	AGA	2	6	2214173	2214178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953052
43581	NC_008319	AGG	2	6	2214179	2214184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953052
43582	NC_008319	CT	3	6	2214219	2214224	0 %	50 %	0 %	50 %	113953052
43583	NC_008319	ACTC	2	8	2214261	2214268	25 %	25 %	0 %	50 %	113953052
43584	NC_008319	GCG	2	6	2214345	2214350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953052
43585	NC_008319	CAAC	2	8	2214460	2214467	50 %	0 %	0 %	50 %	113953052
43586	NC_008319	G	6	6	2214488	2214493	0 %	0 %	100 %	0 %	113953052
43587	NC_008319	CCTTG	2	10	2214509	2214518	0 %	40 %	20 %	40 %	113953052
43588	NC_008319	TTGC	2	8	2214565	2214572	0 %	50 %	25 %	25 %	113953052
43589	NC_008319	CGC	2	6	2214708	2214713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953052
43590	NC_008319	AAC	2	6	2214790	2214795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953052
43591	NC_008319	GCA	2	6	2214826	2214831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953052
43592	NC_008319	CAA	2	6	2214877	2214882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953052
43593	NC_008319	CAGCT	2	10	2214944	2214953	20 %	20 %	20 %	40 %	113953052
43594	NC_008319	GCT	2	6	2215072	2215077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953052
43595	NC_008319	CA	3	6	2215140	2215145	50 %	0 %	0 %	50 %	113953052
43596	NC_008319	GACA	2	8	2215268	2215275	50 %	0 %	25 %	25 %	113953052
43597	NC_008319	CAA	2	6	2215276	2215281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953052
43598	NC_008319	GAACA	2	10	2215364	2215373	60 %	0 %	20 %	20 %	113953052
43599	NC_008319	GTC	2	6	2215382	2215387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953052
43600	NC_008319	CCA	2	6	2215398	2215403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953052
43601	NC_008319	GAC	2	6	2215501	2215506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953052
43602	NC_008319	GCA	2	6	2215618	2215623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953052
43603	NC_008319	GAC	2	6	2215639	2215644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953052
43604	NC_008319	CTG	2	6	2215694	2215699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953052
43605	NC_008319	AAGG	2	8	2215884	2215891	50 %	0 %	50 %	0 %	113953052
43606	NC_008319	GCTTCG	2	12	2216010	2216021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954603
43607	NC_008319	GTC	2	6	2216046	2216051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954603
43608	NC_008319	GCCA	2	8	2216173	2216180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43609	NC_008319	T	7	7	2216191	2216197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43610	NC_008319	CACT	2	8	2216206	2216213	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43611	NC_008319	CTT	2	6	2216254	2216259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955410
43612	NC_008319	GCT	2	6	2216287	2216292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955410
43613	NC_008319	AGC	2	6	2216294	2216299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955410
43614	NC_008319	ATC	2	6	2216351	2216356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955410
43615	NC_008319	TCCG	2	8	2216439	2216446	0 %	25 %	25 %	50 %	113953310
43616	NC_008319	CAA	2	6	2216453	2216458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953310
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43618	NC_008319	CTG	2	6	2216584	2216589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953310
43619	NC_008319	CGAG	2	8	2216682	2216689	25 %	0 %	50 %	25 %	113953310
43620	NC_008319	ACC	2	6	2216727	2216732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953310
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43631	NC_008319	GCA	2	6	2217377	2217382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953310
43632	NC_008319	TTG	2	6	2217384	2217389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953310
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43660	NC_008319	T	7	7	2218619	2218625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43728	NC_008319	TCGC	2	8	2222516	2222523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43729	NC_008319	CTTTC	2	10	2222547	2222556	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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43738	NC_008319	ATCA	2	8	2223045	2223052	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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43978	NC_008319	GCT	2	6	2236605	2236610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954079
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