MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_008319	TGG	2	6	2135932	2135937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954090
42003	NC_008319	TGG	2	6	2136219	2136224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42004	NC_008319	CAAC	2	8	2136305	2136312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42005	NC_008319	AG	3	6	2136372	2136377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42006	NC_008319	CAT	2	6	2136422	2136427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42007	NC_008319	ACA	2	6	2136434	2136439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42008	NC_008319	TTA	2	6	2136459	2136464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42009	NC_008319	CAA	2	6	2136491	2136496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42010	NC_008319	CAT	2	6	2136694	2136699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42011	NC_008319	TTC	2	6	2136717	2136722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42012	NC_008319	GACA	2	8	2136749	2136756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42013	NC_008319	AC	3	6	2136789	2136794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42014	NC_008319	TCA	2	6	2136831	2136836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42015	NC_008319	TCA	2	6	2136944	2136949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42016	NC_008319	A	8	8	2136949	2136956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42017	NC_008319	A	6	6	2137031	2137036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42018	NC_008319	CAAC	2	8	2137045	2137052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42019	NC_008319	TCA	3	9	2137063	2137071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42020	NC_008319	ACG	2	6	2137118	2137123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42021	NC_008319	AC	3	6	2137191	2137196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42022	NC_008319	GT	3	6	2137209	2137214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42023	NC_008319	AGC	2	6	2137248	2137253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954618
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42025	NC_008319	AAG	2	6	2137303	2137308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954618
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42029	NC_008319	TTGA	2	8	2137634	2137641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42030	NC_008319	TGG	2	6	2137697	2137702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42031	NC_008319	AAGG	2	8	2137728	2137735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42032	NC_008319	TGT	2	6	2137750	2137755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42037	NC_008319	CT	3	6	2138175	2138180	0 %	50 %	0 %	50 %	113954284
42038	NC_008319	AATG	2	8	2138221	2138228	50 %	25 %	25 %	0 %	113954284
42039	NC_008319	GTC	2	6	2138250	2138255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954284
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42042	NC_008319	TCT	2	6	2138330	2138335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954284
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42044	NC_008319	T	6	6	2138348	2138353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42045	NC_008319	ACT	2	6	2138385	2138390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42047	NC_008319	TAT	2	6	2138446	2138451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954930
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42057	NC_008319	CTG	2	6	2138900	2138905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952999
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42062	NC_008319	GAC	2	6	2139159	2139164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952999
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42072	NC_008319	AGA	2	6	2139828	2139833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42073	NC_008319	AAAG	2	8	2139847	2139854	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42074	NC_008319	CTT	2	6	2139868	2139873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42078	NC_008319	TTCA	2	8	2140167	2140174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42079	NC_008319	ATC	2	6	2140213	2140218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42089	NC_008319	TGCC	2	8	2140547	2140554	0 %	25 %	25 %	50 %	113953620
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42094	NC_008319	TTGG	2	8	2140744	2140751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42095	NC_008319	TCGAA	2	10	2140769	2140778	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42096	NC_008319	TTC	2	6	2140849	2140854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954414
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42105	NC_008319	TGC	2	6	2141209	2141214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954414
42106	NC_008319	TCTT	2	8	2141360	2141367	0 %	75 %	0 %	25 %	113954414
42107	NC_008319	TTC	2	6	2141374	2141379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954414
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42109	NC_008319	GGCT	2	8	2141428	2141435	0 %	25 %	50 %	25 %	113954414
42110	NC_008319	GAC	2	6	2141440	2141445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954414
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42112	NC_008319	CTG	2	6	2141516	2141521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954414
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42114	NC_008319	T	7	7	2141589	2141595	0 %	100 %	0 %	0 %	113954414
42115	NC_008319	CTG	2	6	2141682	2141687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954414
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42117	NC_008319	ATTT	2	8	2141814	2141821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42118	NC_008319	A	6	6	2141852	2141857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42119	NC_008319	T	6	6	2141870	2141875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42120	NC_008319	AG	3	6	2141882	2141887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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42122	NC_008319	CCA	2	6	2141962	2141967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955179
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42332	NC_008319	AG	3	6	2152220	2152225	50 %	0 %	50 %	0 %	113954133
42333	NC_008319	TGA	2	6	2152235	2152240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954133
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42337	NC_008319	GC	4	8	2152385	2152392	0 %	0 %	50 %	50 %	113952818
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42339	NC_008319	TGGG	2	8	2152623	2152630	0 %	25 %	75 %	0 %	113952818
42340	NC_008319	ATC	2	6	2152817	2152822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955036
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42343	NC_008319	CGC	2	6	2153001	2153006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955036
42344	NC_008319	GGT	2	6	2153135	2153140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955036
42345	NC_008319	GGA	2	6	2153178	2153183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955036
42346	NC_008319	AGG	2	6	2153281	2153286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955036
42347	NC_008319	GGT	3	9	2153333	2153341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955036
42348	NC_008319	CAA	2	6	2153354	2153359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955036
42349	NC_008319	AGC	2	6	2153381	2153386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955036
42350	NC_008319	CCAC	2	8	2153461	2153468	25 %	0 %	0 %	75 %	113955036
42351	NC_008319	CTT	2	6	2153491	2153496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955036
42352	NC_008319	GA	3	6	2153508	2153513	50 %	0 %	50 %	0 %	113955036
42353	NC_008319	CACC	2	8	2153527	2153534	25 %	0 %	0 %	75 %	113955036
42354	NC_008319	GCG	2	6	2153592	2153597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955036
42355	NC_008319	CCAC	2	8	2153626	2153633	25 %	0 %	0 %	75 %	113955036
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42474	NC_008319	AAT	2	6	2159869	2159874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954695
42475	NC_008319	TAAA	2	8	2160008	2160015	75 %	25 %	0 %	0 %	113954695
42476	NC_008319	AGCA	2	8	2160043	2160050	50 %	0 %	25 %	25 %	113954695
42477	NC_008319	CAG	2	6	2160070	2160075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954695
42478	NC_008319	ACCA	2	8	2160136	2160143	50 %	0 %	0 %	50 %	113954695
42479	NC_008319	CCA	2	6	2160169	2160174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954695
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42482	NC_008319	CACATG	2	12	2160512	2160523	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113954063
42483	NC_008319	TCC	2	6	2160571	2160576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954063
42484	NC_008319	CTT	2	6	2160589	2160594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954063
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42489	NC_008319	AGA	2	6	2160696	2160701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954063
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42497	NC_008319	CAA	3	9	2161440	2161448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953395
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42499	NC_008319	TGC	2	6	2161528	2161533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953395
42500	NC_008319	ACC	2	6	2161545	2161550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953395

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