MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_008319	CGTCAG	2	12	2084457	2084468	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113955476
41003	NC_008319	CGT	2	6	2084469	2084474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955476
41004	NC_008319	CG	3	6	2084475	2084480	0 %	0 %	50 %	50 %	113955476
41005	NC_008319	GAT	2	6	2084525	2084530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955476
41006	NC_008319	ATC	2	6	2084598	2084603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955476
41007	NC_008319	TTC	2	6	2084613	2084618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955476
41008	NC_008319	GAT	2	6	2084706	2084711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955476
41009	NC_008319	GGC	2	6	2084720	2084725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955476
41010	NC_008319	AAG	2	6	2084727	2084732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955476
41011	NC_008319	GAT	2	6	2084741	2084746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955476
41012	NC_008319	GAG	2	6	2084748	2084753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955476
41013	NC_008319	CTCAT	2	10	2084764	2084773	20 %	40 %	0 %	40 %	113955476
41014	NC_008319	CTT	2	6	2084829	2084834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955476
41015	NC_008319	CGC	2	6	2084858	2084863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955476
41016	NC_008319	TGG	2	6	2085022	2085027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955476
41017	NC_008319	GGC	2	6	2085083	2085088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955476
41018	NC_008319	CAA	2	6	2085113	2085118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955476
41019	NC_008319	CT	3	6	2085162	2085167	0 %	50 %	0 %	50 %	113955476
41020	NC_008319	CTG	2	6	2085177	2085182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955476
41021	NC_008319	CGC	2	6	2085413	2085418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955476
41022	NC_008319	GC	3	6	2085440	2085445	0 %	0 %	50 %	50 %	113955476
41023	NC_008319	TGG	2	6	2085448	2085453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955476
41024	NC_008319	CGG	3	9	2085458	2085466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955476
41025	NC_008319	AAG	2	6	2085475	2085480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955476
41026	NC_008319	TCCT	2	8	2085485	2085492	0 %	50 %	0 %	50 %	113955476
41027	NC_008319	CGA	2	6	2085536	2085541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955476
41028	NC_008319	GTC	2	6	2085579	2085584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955476
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41030	NC_008319	TCAC	2	8	2085648	2085655	25 %	25 %	0 %	50 %	113955476
41031	NC_008319	GGCCA	2	10	2085666	2085675	20 %	0 %	40 %	40 %	113955476
41032	NC_008319	CTG	2	6	2085792	2085797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955476
41033	NC_008319	ACG	2	6	2085934	2085939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955476
41034	NC_008319	GCT	2	6	2085950	2085955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955476
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41038	NC_008319	CGC	2	6	2086164	2086169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955476
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41041	NC_008319	GCT	2	6	2086375	2086380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953053
41042	NC_008319	TGGC	2	8	2086392	2086399	0 %	25 %	50 %	25 %	113953053
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41054	NC_008319	AAG	2	6	2087019	2087024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953053
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41056	NC_008319	CAG	2	6	2087146	2087151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953053
41057	NC_008319	GCC	2	6	2087183	2087188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953053
41058	NC_008319	AG	3	6	2087197	2087202	50 %	0 %	50 %	0 %	113953053
41059	NC_008319	GTGC	2	8	2087238	2087245	0 %	25 %	50 %	25 %	113953199
41060	NC_008319	AG	3	6	2087425	2087430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41061	NC_008319	CA	3	6	2087545	2087550	50 %	0 %	0 %	50 %	113954262
41062	NC_008319	CGA	2	6	2087551	2087556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954262
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41064	NC_008319	A	7	7	2087652	2087658	100 %	0 %	0 %	0 %	113954262
41065	NC_008319	GCC	2	6	2087682	2087687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954262
41066	NC_008319	GCC	2	6	2087732	2087737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954262
41067	NC_008319	AAC	2	6	2087786	2087791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954262
41068	NC_008319	ATC	2	6	2087792	2087797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954262
41069	NC_008319	AAT	2	6	2087822	2087827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954262
41070	NC_008319	TCA	2	6	2087829	2087834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954262
41071	NC_008319	TTC	2	6	2087999	2088004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954262
41072	NC_008319	TGA	2	6	2088024	2088029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954262
41073	NC_008319	TAA	2	6	2088049	2088054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954262
41074	NC_008319	CGA	2	6	2088181	2088186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954262
41075	NC_008319	CAAG	2	8	2088302	2088309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41076	NC_008319	TTC	2	6	2088423	2088428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952835
41077	NC_008319	CAC	2	6	2088446	2088451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952835
41078	NC_008319	TGC	2	6	2088464	2088469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952835
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41080	NC_008319	AAC	2	6	2088634	2088639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41081	NC_008319	CAG	2	6	2088650	2088655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953666
41082	NC_008319	GCA	2	6	2088670	2088675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953666
41083	NC_008319	TAG	2	6	2088798	2088803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953666
41084	NC_008319	CGTCCA	2	12	2088848	2088859	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41085	NC_008319	AAT	2	6	2088891	2088896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41086	NC_008319	CTC	2	6	2088912	2088917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41087	NC_008319	GCA	2	6	2089024	2089029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955482
41088	NC_008319	CGT	2	6	2089107	2089112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955482
41089	NC_008319	TGG	2	6	2089220	2089225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955482
41090	NC_008319	ACC	2	6	2089431	2089436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955482
41091	NC_008319	CTT	2	6	2089453	2089458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955482
41092	NC_008319	GC	3	6	2089468	2089473	0 %	0 %	50 %	50 %	113955482
41093	NC_008319	GGA	2	6	2089476	2089481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955482
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41097	NC_008319	CGTG	2	8	2089824	2089831	0 %	25 %	50 %	25 %	113955482
41098	NC_008319	AAG	2	6	2089877	2089882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955482
41099	NC_008319	CAA	2	6	2089887	2089892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955482
41100	NC_008319	TCG	2	6	2089943	2089948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955482
41101	NC_008319	AAC	2	6	2089988	2089993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955482
41102	NC_008319	TAA	2	6	2090025	2090030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955482
41103	NC_008319	AAG	2	6	2090063	2090068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955482
41104	NC_008319	A	6	6	2090116	2090121	100 %	0 %	0 %	0 %	113955482
41105	NC_008319	AAC	2	6	2090128	2090133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955482
41106	NC_008319	TCAAC	2	10	2090138	2090147	40 %	20 %	0 %	40 %	113955482
41107	NC_008319	AAT	2	6	2090230	2090235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113952869
41108	NC_008319	TCC	2	6	2090366	2090371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952869
41109	NC_008319	GAC	2	6	2090541	2090546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952869
41110	NC_008319	AGCA	2	8	2090555	2090562	50 %	0 %	25 %	25 %	113952869
41111	NC_008319	GAT	2	6	2090589	2090594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952869
41112	NC_008319	AG	3	6	2090607	2090612	50 %	0 %	50 %	0 %	113952869
41113	NC_008319	ATC	2	6	2090698	2090703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952869
41114	NC_008319	GCT	2	6	2090708	2090713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952869
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41116	NC_008319	TCA	2	6	2090755	2090760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41233	NC_008319	GCG	2	6	2096020	2096025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955467
41234	NC_008319	C	6	6	2096116	2096121	0 %	0 %	0 %	100 %	113955467
41235	NC_008319	GCA	2	6	2096127	2096132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955467
41236	NC_008319	CAG	2	6	2096146	2096151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955467
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41239	NC_008319	GGA	2	6	2096312	2096317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955467
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41244	NC_008319	CAAC	2	8	2096649	2096656	50 %	0 %	0 %	50 %	113955151
41245	NC_008319	CAG	2	6	2096667	2096672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955151
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41249	NC_008319	ATTT	2	8	2096888	2096895	25 %	75 %	0 %	0 %	113955151
41250	NC_008319	GGCT	2	8	2096945	2096952	0 %	25 %	50 %	25 %	113955151
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41295	NC_008319	CT	3	6	2099513	2099518	0 %	50 %	0 %	50 %	113954526
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41300	NC_008319	CTG	2	6	2099641	2099646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41334	NC_008319	ACC	3	9	2101354	2101362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952826
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41340	NC_008319	GAAC	2	8	2101722	2101729	50 %	0 %	25 %	25 %	113952826
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41349	NC_008319	GCC	2	6	2102191	2102196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953514
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41351	NC_008319	CCA	2	6	2102283	2102288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953514
41352	NC_008319	TGC	2	6	2102289	2102294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953514
41353	NC_008319	GCT	2	6	2102319	2102324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953514
41354	NC_008319	GCC	2	6	2102400	2102405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953514
41355	NC_008319	CTT	2	6	2102535	2102540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953514
41356	NC_008319	CTG	3	9	2102587	2102595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953514
41357	NC_008319	TGC	2	6	2102612	2102617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953514
41358	NC_008319	CTC	2	6	2102635	2102640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953514
41359	NC_008319	GCA	2	6	2102643	2102648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953514
41360	NC_008319	GCT	2	6	2102706	2102711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953514
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41362	NC_008319	TGC	2	6	2102829	2102834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953514
41363	NC_008319	AGC	2	6	2102852	2102857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953514
41364	NC_008319	GCA	2	6	2102994	2102999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953514
41365	NC_008319	AGC	2	6	2103056	2103061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953514
41366	NC_008319	CGCCGG	2	12	2103067	2103078	0 %	0 %	50 %	50 %	113953514
41367	NC_008319	CTG	2	6	2103145	2103150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953514
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41372	NC_008319	CAC	2	6	2103352	2103357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953514
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41374	NC_008319	GCT	2	6	2103378	2103383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953514
41375	NC_008319	AGT	2	6	2103392	2103397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953514
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41377	NC_008319	GTG	2	6	2103450	2103455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953514
41378	NC_008319	CGAT	2	8	2103530	2103537	25 %	25 %	25 %	25 %	113953514
41379	NC_008319	GCA	2	6	2103560	2103565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953514
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41381	NC_008319	GCC	2	6	2103617	2103622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953514
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41387	NC_008319	CTCG	2	8	2103875	2103882	0 %	25 %	25 %	50 %	113953514
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41393	NC_008319	CTC	2	6	2104051	2104056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953514
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41400	NC_008319	GGT	2	6	2104523	2104528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952928
41401	NC_008319	GCT	2	6	2104585	2104590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952928
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41404	NC_008319	GT	3	6	2104793	2104798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41405	NC_008319	CGG	2	6	2104875	2104880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954033
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41413	NC_008319	CAT	2	6	2105095	2105100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954033
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41420	NC_008319	CCAT	2	8	2105345	2105352	25 %	25 %	0 %	50 %	113954033
41421	NC_008319	ATCAG	2	10	2105369	2105378	40 %	20 %	20 %	20 %	113954033
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41428	NC_008319	AACA	2	8	2105749	2105756	75 %	0 %	0 %	25 %	113954033
41429	NC_008319	GATA	2	8	2105760	2105767	50 %	25 %	25 %	0 %	113954033
41430	NC_008319	CGG	2	6	2105831	2105836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954033
41431	NC_008319	TAA	2	6	2105857	2105862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41432	NC_008319	CTGA	2	8	2105866	2105873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41433	NC_008319	GCT	2	6	2105947	2105952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954464
41434	NC_008319	AGC	2	6	2105966	2105971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954464
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41437	NC_008319	TCG	2	6	2106164	2106169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954464
41438	NC_008319	CGA	2	6	2106260	2106265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954464
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41440	NC_008319	GCT	2	6	2106416	2106421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954464
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41443	NC_008319	GTC	2	6	2106571	2106576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954464
41444	NC_008319	ACC	2	6	2106625	2106630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954464
41445	NC_008319	CCTG	2	8	2106641	2106648	0 %	25 %	25 %	50 %	113954464
41446	NC_008319	CGG	2	6	2106677	2106682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954464
41447	NC_008319	CTT	2	6	2106723	2106728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954464
41448	NC_008319	TCA	2	6	2106885	2106890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41449	NC_008319	GGC	2	6	2107036	2107041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955097
41450	NC_008319	GCA	3	9	2107061	2107069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955097
41451	NC_008319	CAG	2	6	2107080	2107085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955097
41452	NC_008319	CAAG	2	8	2107107	2107114	50 %	0 %	25 %	25 %	113955097
41453	NC_008319	TAC	2	6	2107121	2107126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955097
41454	NC_008319	CCTG	2	8	2107142	2107149	0 %	25 %	25 %	50 %	113955097
41455	NC_008319	CAA	2	6	2107183	2107188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955097
41456	NC_008319	GGC	2	6	2107234	2107239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955097
41457	NC_008319	ACG	2	6	2107297	2107302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955097
41458	NC_008319	GGC	2	6	2107433	2107438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955315
41459	NC_008319	GTG	2	6	2107451	2107456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955315
41460	NC_008319	GCA	2	6	2107487	2107492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955315
41461	NC_008319	CT	3	6	2107554	2107559	0 %	50 %	0 %	50 %	113955315
41462	NC_008319	CGG	2	6	2107708	2107713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955315
41463	NC_008319	ATT	2	6	2107811	2107816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955315
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