MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39001	NC_008319	TCA	2	6	1982447	1982452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954952
39002	NC_008319	CCA	2	6	1982459	1982464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954952
39003	NC_008319	GCA	2	6	1982505	1982510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954952
39004	NC_008319	CTG	2	6	1982575	1982580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954952
39005	NC_008319	GTG	2	6	1982597	1982602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954952
39006	NC_008319	CTG	2	6	1982617	1982622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954952
39007	NC_008319	CAC	2	6	1982719	1982724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954952
39008	NC_008319	T	6	6	1982734	1982739	0 %	100 %	0 %	0 %	113954952
39009	NC_008319	T	6	6	1982761	1982766	0 %	100 %	0 %	0 %	113954952
39010	NC_008319	CAC	2	6	1982884	1982889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954952
39011	NC_008319	GAT	2	6	1982953	1982958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954952
39012	NC_008319	CAG	2	6	1982970	1982975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954952
39013	NC_008319	CGT	2	6	1983024	1983029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954952
39014	NC_008319	GCG	2	6	1983157	1983162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39015	NC_008319	GAA	2	6	1983163	1983168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39016	NC_008319	CCA	2	6	1983171	1983176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39017	NC_008319	TTC	2	6	1983202	1983207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39018	NC_008319	GA	4	8	1983267	1983274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39019	NC_008319	ATG	2	6	1983275	1983280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39020	NC_008319	GCT	2	6	1983286	1983291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39021	NC_008319	GTT	2	6	1983292	1983297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39022	NC_008319	CTG	2	6	1983334	1983339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953484
39023	NC_008319	AAC	2	6	1983436	1983441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953484
39024	NC_008319	TCTGAT	2	12	1983450	1983461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	113953484
39025	NC_008319	GC	3	6	1983510	1983515	0 %	0 %	50 %	50 %	113953484
39026	NC_008319	GC	3	6	1983537	1983542	0 %	0 %	50 %	50 %	113953484
39027	NC_008319	CAC	2	6	1983590	1983595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953484
39028	NC_008319	GGA	2	6	1983642	1983647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953484
39029	NC_008319	GCA	3	9	1983684	1983692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953484
39030	NC_008319	GCT	2	6	1983754	1983759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953484
39031	NC_008319	CAA	2	6	1983828	1983833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953484
39032	NC_008319	CG	3	6	1983864	1983869	0 %	0 %	50 %	50 %	113953560
39033	NC_008319	TC	3	6	1983970	1983975	0 %	50 %	0 %	50 %	113953560
39034	NC_008319	GGC	2	6	1984040	1984045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953560
39035	NC_008319	GCATC	2	10	1984189	1984198	20 %	20 %	20 %	40 %	113953560
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39037	NC_008319	ATC	2	6	1984319	1984324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953560
39038	NC_008319	AG	3	6	1984368	1984373	50 %	0 %	50 %	0 %	113953560
39039	NC_008319	TCGC	2	8	1984374	1984381	0 %	25 %	25 %	50 %	113953560
39040	NC_008319	AGC	2	6	1984388	1984393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953560
39041	NC_008319	GTC	2	6	1984457	1984462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953560
39042	NC_008319	GCA	2	6	1984563	1984568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953560
39043	NC_008319	TCC	2	6	1984620	1984625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953560
39044	NC_008319	AGTG	2	8	1984629	1984636	25 %	25 %	50 %	0 %	113953560
39045	NC_008319	TCA	2	6	1984690	1984695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39046	NC_008319	ACC	2	6	1984696	1984701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39047	NC_008319	GC	3	6	1984877	1984882	0 %	0 %	50 %	50 %	113955473
39048	NC_008319	CGT	2	6	1984906	1984911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955473
39049	NC_008319	GAC	2	6	1984925	1984930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955473
39050	NC_008319	CAA	2	6	1984940	1984945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955473
39051	NC_008319	CAA	2	6	1984955	1984960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955473
39052	NC_008319	GA	3	6	1984963	1984968	50 %	0 %	50 %	0 %	113955473
39053	NC_008319	TGGCA	2	10	1985133	1985142	20 %	20 %	40 %	20 %	113955473
39054	NC_008319	TTGGA	2	10	1985161	1985170	20 %	40 %	40 %	0 %	113955473
39055	NC_008319	ACC	2	6	1985192	1985197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955473
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39060	NC_008319	A	6	6	1985456	1985461	100 %	0 %	0 %	0 %	113955473
39061	NC_008319	GCT	2	6	1985464	1985469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955473
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39065	NC_008319	TGC	2	6	1985691	1985696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955473
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39067	NC_008319	ACG	2	6	1985844	1985849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955473
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39070	NC_008319	TAC	2	6	1985943	1985948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955473
39071	NC_008319	GACGT	2	10	1986032	1986041	20 %	20 %	40 %	20 %	113955473
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39073	NC_008319	TGC	2	6	1986100	1986105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955473
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39085	NC_008319	CAA	2	6	1986832	1986837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39086	NC_008319	TCA	2	6	1986850	1986855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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39089	NC_008319	GAA	2	6	1986965	1986970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955134
39090	NC_008319	ATC	2	6	1987026	1987031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955134
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39097	NC_008319	AG	3	6	1987192	1987197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39098	NC_008319	ATT	2	6	1987200	1987205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39099	NC_008319	CCAC	2	8	1987316	1987323	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39100	NC_008319	ATG	2	6	1987441	1987446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953459
39101	NC_008319	CCT	3	9	1987451	1987459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953459
39102	NC_008319	T	6	6	1987593	1987598	0 %	100 %	0 %	0 %	113953459
39103	NC_008319	TCG	2	6	1987661	1987666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953459
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39105	NC_008319	AACT	2	8	1987817	1987824	50 %	25 %	0 %	25 %	113953459
39106	NC_008319	GTT	2	6	1987825	1987830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953459
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39109	NC_008319	CTG	2	6	1987932	1987937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952978
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39113	NC_008319	TTCG	2	8	1988087	1988094	0 %	50 %	25 %	25 %	113952978
39114	NC_008319	GCA	2	6	1988123	1988128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952978
39115	NC_008319	C	6	6	1988142	1988147	0 %	0 %	0 %	100 %	113952978
39116	NC_008319	CTG	2	6	1988156	1988161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952978
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39353	NC_008319	GCT	2	6	1998235	1998240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953165
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39470	NC_008319	TGC	2	6	2004281	2004286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954243
39471	NC_008319	TTG	2	6	2004337	2004342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954243
39472	NC_008319	GCCA	2	8	2004358	2004365	25 %	0 %	25 %	50 %	113954243
39473	NC_008319	ATC	2	6	2004371	2004376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954243
39474	NC_008319	TGA	2	6	2004518	2004523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954243
39475	NC_008319	AGA	2	6	2004606	2004611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954243
39476	NC_008319	ACG	2	6	2004661	2004666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954243
39477	NC_008319	ACA	2	6	2004893	2004898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954243
39478	NC_008319	TTGGTC	2	12	2004940	2004951	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	113954243
39479	NC_008319	GTG	2	6	2005022	2005027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954243
39480	NC_008319	TGG	2	6	2005031	2005036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954243
39481	NC_008319	TCG	2	6	2005043	2005048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954243
39482	NC_008319	GAG	2	6	2005088	2005093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954243
39483	NC_008319	TC	3	6	2005105	2005110	0 %	50 %	0 %	50 %	113954243
39484	NC_008319	CAG	2	6	2005157	2005162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954243
39485	NC_008319	GTG	2	6	2005333	2005338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954243
39486	NC_008319	CAT	2	6	2005425	2005430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955489
39487	NC_008319	TCA	2	6	2005463	2005468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955489
39488	NC_008319	CGGTG	2	10	2005617	2005626	0 %	20 %	60 %	20 %	113955489
39489	NC_008319	GAT	2	6	2005657	2005662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955489
39490	NC_008319	CAG	2	6	2005696	2005701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955489
39491	NC_008319	CCT	2	6	2005737	2005742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955489
39492	NC_008319	CCG	2	6	2005743	2005748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955489
39493	NC_008319	AG	3	6	2005806	2005811	50 %	0 %	50 %	0 %	113955489
39494	NC_008319	GTA	2	6	2005870	2005875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955489
39495	NC_008319	ATCA	2	8	2005897	2005904	50 %	25 %	0 %	25 %	113955489
39496	NC_008319	CCT	2	6	2005970	2005975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955489
39497	NC_008319	AGGC	2	8	2005992	2005999	25 %	0 %	50 %	25 %	113955489
39498	NC_008319	CTCA	2	8	2006053	2006060	25 %	25 %	0 %	50 %	113955489
39499	NC_008319	CTG	2	6	2006073	2006078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955489
39500	NC_008319	CCA	2	6	2006187	2006192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955489

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