MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_008319	TCTT	2	8	1881450	1881457	0 %	75 %	0 %	25 %	113953986
37002	NC_008319	GGA	2	6	1881461	1881466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953986
37003	NC_008319	GTC	2	6	1881536	1881541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953986
37004	NC_008319	GAT	2	6	1881571	1881576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953986
37005	NC_008319	TTG	2	6	1881651	1881656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953986
37006	NC_008319	GTG	2	6	1881662	1881667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953986
37007	NC_008319	GCT	2	6	1881751	1881756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953986
37008	NC_008319	GCTT	2	8	1881780	1881787	0 %	50 %	25 %	25 %	113953986
37009	NC_008319	TCC	2	6	1881877	1881882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953986
37010	NC_008319	GCT	2	6	1881884	1881889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953986
37011	NC_008319	TGT	2	6	1881960	1881965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953169
37012	NC_008319	GAA	3	9	1882022	1882030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953169
37013	NC_008319	CAG	2	6	1882116	1882121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953169
37014	NC_008319	CCA	4	12	1882174	1882185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953169
37015	NC_008319	CAA	2	6	1882404	1882409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37016	NC_008319	GCTC	2	8	1882446	1882453	0 %	25 %	25 %	50 %	113953816
37017	NC_008319	CTG	2	6	1882544	1882549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953816
37018	NC_008319	CCA	2	6	1882578	1882583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953816
37019	NC_008319	ATC	2	6	1882594	1882599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953816
37020	NC_008319	GTCA	2	8	1882668	1882675	25 %	25 %	25 %	25 %	113953816
37021	NC_008319	CCA	2	6	1882700	1882705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953816
37022	NC_008319	ACT	2	6	1882815	1882820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953816
37023	NC_008319	TGGAAG	2	12	1882848	1882859	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	113953816
37024	NC_008319	AGC	2	6	1882917	1882922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953816
37025	NC_008319	CCA	2	6	1882952	1882957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953816
37026	NC_008319	GGT	2	6	1882982	1882987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953816
37027	NC_008319	TTC	2	6	1882998	1883003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953816
37028	NC_008319	GTGA	2	8	1883132	1883139	25 %	25 %	50 %	0 %	113952936
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37031	NC_008319	CAG	2	6	1883294	1883299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952936
37032	NC_008319	GCT	2	6	1883309	1883314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952936
37033	NC_008319	G	6	6	1883392	1883397	0 %	0 %	100 %	0 %	113952936
37034	NC_008319	CAAAG	2	10	1883398	1883407	60 %	0 %	20 %	20 %	113952936
37035	NC_008319	CAA	2	6	1883426	1883431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952936
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37038	NC_008319	TCCC	2	8	1883683	1883690	0 %	25 %	0 %	75 %	113952936
37039	NC_008319	A	6	6	1883759	1883764	100 %	0 %	0 %	0 %	113952936
37040	NC_008319	TGA	2	6	1883802	1883807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952936
37041	NC_008319	ACA	2	6	1883814	1883819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952936
37042	NC_008319	AAC	2	6	1883828	1883833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952936
37043	NC_008319	GTG	2	6	1883859	1883864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952936
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37053	NC_008319	CTGA	2	8	1884292	1884299	25 %	25 %	25 %	25 %	113952936
37054	NC_008319	GGA	2	6	1884345	1884350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952936
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37058	NC_008319	CA	4	8	1884598	1884605	50 %	0 %	0 %	50 %	113952936
37059	NC_008319	G	6	6	1884680	1884685	0 %	0 %	100 %	0 %	113952936
37060	NC_008319	TTGCT	2	10	1884687	1884696	0 %	60 %	20 %	20 %	113952936
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37067	NC_008319	TTGCA	2	10	1885096	1885105	20 %	40 %	20 %	20 %	113953478
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37074	NC_008319	GAACA	2	10	1885390	1885399	60 %	0 %	20 %	20 %	113953478
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37088	NC_008319	TGC	2	6	1885923	1885928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954902
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37100	NC_008319	GGC	2	6	1886332	1886337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954902
37101	NC_008319	AGG	2	6	1886352	1886357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954902
37102	NC_008319	CAG	2	6	1886403	1886408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954902
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37104	NC_008319	CGG	2	6	1886449	1886454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954902
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37107	NC_008319	GT	3	6	1886567	1886572	0 %	50 %	50 %	0 %	113954902
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37115	NC_008319	ACC	2	6	1886826	1886831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955528
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37341	NC_008319	CCAC	2	8	1898451	1898458	25 %	0 %	0 %	75 %	113954074
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37467	NC_008319	CGA	2	6	1904588	1904593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954161
37468	NC_008319	AACCA	2	10	1904748	1904757	60 %	0 %	0 %	40 %	113954161
37469	NC_008319	AAC	2	6	1904758	1904763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954161
37470	NC_008319	CAA	2	6	1904769	1904774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954161
37471	NC_008319	CCAGT	2	10	1904798	1904807	20 %	20 %	20 %	40 %	113954161
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37475	NC_008319	GCA	2	6	1904902	1904907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954161
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37480	NC_008319	GAGC	2	8	1905110	1905117	25 %	0 %	50 %	25 %	113954161
37481	NC_008319	GATC	2	8	1905129	1905136	25 %	25 %	25 %	25 %	113954161
37482	NC_008319	TCC	2	6	1905145	1905150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954161
37483	NC_008319	AGGC	2	8	1905181	1905188	25 %	0 %	50 %	25 %	113954161
37484	NC_008319	CTC	2	6	1905240	1905245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954161
37485	NC_008319	CCA	2	6	1905254	1905259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954161
37486	NC_008319	CAT	2	6	1905272	1905277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954161
37487	NC_008319	GCT	2	6	1905287	1905292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954161
37488	NC_008319	GGGA	2	8	1905354	1905361	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37489	NC_008319	CTG	2	6	1905371	1905376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37490	NC_008319	ACC	2	6	1905445	1905450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953445
37491	NC_008319	GAC	2	6	1905522	1905527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953445
37492	NC_008319	CG	4	8	1905547	1905554	0 %	0 %	50 %	50 %	113953445
37493	NC_008319	CAG	2	6	1905575	1905580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953445
37494	NC_008319	CAT	2	6	1905590	1905595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953445
37495	NC_008319	CCG	2	6	1905684	1905689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953445
37496	NC_008319	GAT	2	6	1905713	1905718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953445
37497	NC_008319	CAA	2	6	1905735	1905740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953445
37498	NC_008319	CCG	2	6	1905743	1905748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953445
37499	NC_008319	GAC	2	6	1905794	1905799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953445
37500	NC_008319	GGC	2	6	1905800	1905805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953445

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