MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36503	NC_008319	GAA	2	6	1856850	1856855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953629
36504	NC_008319	ATC	2	6	1856872	1856877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953629
36505	NC_008319	TTG	2	6	1856890	1856895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953629
36506	NC_008319	CTG	2	6	1856904	1856909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953629
36507	NC_008319	GGCA	2	8	1856916	1856923	25 %	0 %	50 %	25 %	113953629
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36509	NC_008319	ACAA	2	8	1856950	1856957	75 %	0 %	0 %	25 %	113953629
36510	NC_008319	TGA	2	6	1857041	1857046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953629
36511	NC_008319	AAG	2	6	1857049	1857054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953629
36512	NC_008319	TGC	2	6	1857063	1857068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953629
36513	NC_008319	TCAC	2	8	1857133	1857140	25 %	25 %	0 %	50 %	113953629
36514	NC_008319	AGGA	2	8	1857177	1857184	50 %	0 %	50 %	0 %	113953629
36515	NC_008319	CT	3	6	1857226	1857231	0 %	50 %	0 %	50 %	113953629
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36517	NC_008319	TGA	2	6	1857329	1857334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953629
36518	NC_008319	TGGC	2	8	1857343	1857350	0 %	25 %	50 %	25 %	113953629
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36521	NC_008319	CTGC	2	8	1857545	1857552	0 %	25 %	25 %	50 %	113953629
36522	NC_008319	AG	3	6	1857668	1857673	50 %	0 %	50 %	0 %	113953629
36523	NC_008319	ACC	2	6	1857685	1857690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953629
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36525	NC_008319	CAG	2	6	1857756	1857761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953629
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36527	NC_008319	TGT	2	6	1857811	1857816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36528	NC_008319	TG	3	6	1857843	1857848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36529	NC_008319	CTC	2	6	1857897	1857902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953339
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36533	NC_008319	CTGA	2	8	1858074	1858081	25 %	25 %	25 %	25 %	113953339
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36537	NC_008319	C	7	7	1858251	1858257	0 %	0 %	0 %	100 %	113953339
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36559	NC_008319	TCTG	2	8	1859631	1859638	0 %	50 %	25 %	25 %	113954031
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36586	NC_008319	ATG	2	6	1860810	1860815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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36602	NC_008319	TGCC	2	8	1861414	1861421	0 %	25 %	25 %	50 %	113955047
36603	NC_008319	G	6	6	1861465	1861470	0 %	0 %	100 %	0 %	113955047
36604	NC_008319	G	6	6	1861570	1861575	0 %	0 %	100 %	0 %	113955047
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36615	NC_008319	GCA	2	6	1862046	1862051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954256
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36618	NC_008319	TC	3	6	1862258	1862263	0 %	50 %	0 %	50 %	113954256
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36676	NC_008319	GGC	2	6	1865241	1865246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954472
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36722	NC_008319	GTCC	2	8	1867657	1867664	0 %	25 %	25 %	50 %	113952756
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36736	NC_008319	TGC	2	6	1868537	1868542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954003
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36768	NC_008319	AATT	2	8	1870238	1870245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36769	NC_008319	CTCG	2	8	1870296	1870303	0 %	25 %	25 %	50 %	113953302
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36840	NC_008319	GCA	2	6	1873552	1873557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954641
36841	NC_008319	TGCGC	2	10	1873599	1873608	0 %	20 %	40 %	40 %	113954641
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36843	NC_008319	CTCC	2	8	1873818	1873825	0 %	25 %	0 %	75 %	113954641
36844	NC_008319	GTT	2	6	1874050	1874055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954641
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36848	NC_008319	CAT	2	6	1874203	1874208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954641
36849	NC_008319	TTG	2	6	1874217	1874222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954641
36850	NC_008319	TCC	2	6	1874234	1874239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954641
36851	NC_008319	CTG	2	6	1874291	1874296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954641
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36967	NC_008319	TAC	2	6	1879783	1879788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953562
36968	NC_008319	ACGC	2	8	1879815	1879822	25 %	0 %	25 %	50 %	113953562
36969	NC_008319	ACG	2	6	1879870	1879875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953562
36970	NC_008319	TGT	2	6	1879900	1879905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955326
36971	NC_008319	GTC	3	9	1879917	1879925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955326
36972	NC_008319	GGC	2	6	1879983	1879988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955326
36973	NC_008319	TCG	2	6	1880010	1880015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955326
36974	NC_008319	TCC	2	6	1880080	1880085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955326
36975	NC_008319	TGC	3	9	1880096	1880104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955326
36976	NC_008319	TTC	2	6	1880160	1880165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955326
36977	NC_008319	TCGA	2	8	1880182	1880189	25 %	25 %	25 %	25 %	113955326
36978	NC_008319	ATCGC	2	10	1880212	1880221	20 %	20 %	20 %	40 %	113955326
36979	NC_008319	GAT	2	6	1880280	1880285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955326
36980	NC_008319	CAG	2	6	1880309	1880314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955326
36981	NC_008319	CAA	2	6	1880316	1880321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955326
36982	NC_008319	GAG	2	6	1880351	1880356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955326
36983	NC_008319	ATG	2	6	1880380	1880385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955326
36984	NC_008319	TGGGCC	2	12	1880389	1880400	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	113955326
36985	NC_008319	GATC	2	8	1880402	1880409	25 %	25 %	25 %	25 %	113955326
36986	NC_008319	GGC	2	6	1880469	1880474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955326
36987	NC_008319	CCA	2	6	1880504	1880509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955326
36988	NC_008319	CT	3	6	1880517	1880522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36989	NC_008319	AC	3	6	1880549	1880554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36990	NC_008319	GTTG	2	8	1880593	1880600	0 %	50 %	50 %	0 %	113953364
36991	NC_008319	GCT	2	6	1880636	1880641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953364
36992	NC_008319	GTCT	2	8	1880689	1880696	0 %	50 %	25 %	25 %	113953364
36993	NC_008319	GAA	2	6	1880743	1880748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953364
36994	NC_008319	GCA	2	6	1880759	1880764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953364
36995	NC_008319	AGCC	2	8	1880807	1880814	25 %	0 %	25 %	50 %	113953364
36996	NC_008319	GCC	2	6	1880935	1880940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953364
36997	NC_008319	CA	3	6	1881047	1881052	50 %	0 %	0 %	50 %	113953364
36998	NC_008319	TCT	2	6	1881114	1881119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953364
36999	NC_008319	TGGC	2	8	1881205	1881212	0 %	25 %	50 %	25 %	113953364
37000	NC_008319	ATC	2	6	1881377	1881382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953986

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