MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35502	NC_008319	TCG	2	6	1803028	1803033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952722
35503	NC_008319	GCA	2	6	1803088	1803093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952722
35504	NC_008319	TTG	2	6	1803100	1803105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952722
35505	NC_008319	CAG	2	6	1803169	1803174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952722
35506	NC_008319	GAC	2	6	1803237	1803242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952722
35507	NC_008319	AC	3	6	1803295	1803300	50 %	0 %	0 %	50 %	113952722
35508	NC_008319	ACCT	2	8	1803375	1803382	25 %	25 %	0 %	50 %	113952722
35509	NC_008319	TGA	2	6	1803407	1803412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952722
35510	NC_008319	GCA	2	6	1803480	1803485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952722
35511	NC_008319	A	7	7	1803485	1803491	100 %	0 %	0 %	0 %	113952722
35512	NC_008319	TCA	2	6	1803496	1803501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952722
35513	NC_008319	CGG	2	6	1803502	1803507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952722
35514	NC_008319	GGA	2	6	1803528	1803533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952722
35515	NC_008319	AAATC	2	10	1803640	1803649	60 %	20 %	0 %	20 %	113952722
35516	NC_008319	CAG	2	6	1803661	1803666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952722
35517	NC_008319	TGT	2	6	1803740	1803745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952722
35518	NC_008319	CCT	2	6	1803775	1803780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952722
35519	NC_008319	CCTT	2	8	1803860	1803867	0 %	50 %	0 %	50 %	113952722
35520	NC_008319	CTCG	2	8	1803928	1803935	0 %	25 %	25 %	50 %	113952722
35521	NC_008319	CGC	2	6	1803982	1803987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35522	NC_008319	GCT	2	6	1804042	1804047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35523	NC_008319	CT	3	6	1804063	1804068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35524	NC_008319	GGT	2	6	1804082	1804087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35525	NC_008319	ACCA	2	8	1804092	1804099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35526	NC_008319	GC	3	6	1804227	1804232	0 %	0 %	50 %	50 %	113954823
35527	NC_008319	CTGC	2	8	1804260	1804267	0 %	25 %	25 %	50 %	113954823
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35532	NC_008319	GCT	2	6	1804456	1804461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954823
35533	NC_008319	CAAC	2	8	1804463	1804470	50 %	0 %	0 %	50 %	113954823
35534	NC_008319	AGT	2	6	1804492	1804497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954823
35535	NC_008319	GTC	2	6	1804499	1804504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954823
35536	NC_008319	CACT	2	8	1804910	1804917	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35537	NC_008319	GTC	2	6	1805069	1805074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953592
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35539	NC_008319	GC	3	6	1805267	1805272	0 %	0 %	50 %	50 %	113953592
35540	NC_008319	GCT	2	6	1805339	1805344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953592
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35543	NC_008319	AGC	2	6	1805475	1805480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952840
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35547	NC_008319	CTC	2	6	1805640	1805645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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35554	NC_008319	ACG	2	6	1805947	1805952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955263
35555	NC_008319	GCT	2	6	1806038	1806043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955263
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35562	NC_008319	CGG	2	6	1806361	1806366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955286
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35587	NC_008319	CAAG	2	8	1807915	1807922	50 %	0 %	25 %	25 %	113953719
35588	NC_008319	GCT	2	6	1807924	1807929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953719
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35600	NC_008319	CTGC	2	8	1808666	1808673	0 %	25 %	25 %	50 %	113954395
35601	NC_008319	CAA	3	9	1808680	1808688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954395
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35605	NC_008319	CCA	2	6	1808805	1808810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954395
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35733	NC_008319	GAAG	2	8	1815897	1815904	50 %	0 %	50 %	0 %	113955434
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35853	NC_008319	GGCT	2	8	1821719	1821726	0 %	25 %	50 %	25 %	113954851
35854	NC_008319	GCA	2	6	1821809	1821814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954851
35855	NC_008319	GCA	2	6	1821831	1821836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954851
35856	NC_008319	CTGGG	2	10	1821860	1821869	0 %	20 %	60 %	20 %	113954851
35857	NC_008319	TCT	2	6	1821910	1821915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954851
35858	NC_008319	GGT	2	6	1822063	1822068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954851
35859	NC_008319	ATC	2	6	1822187	1822192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954851
35860	NC_008319	CGT	2	6	1822226	1822231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954851
35861	NC_008319	GTC	2	6	1822236	1822241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954851
35862	NC_008319	CAC	2	6	1822353	1822358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954851
35863	NC_008319	TGC	2	6	1822416	1822421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954851
35864	NC_008319	AGC	2	6	1822471	1822476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954851
35865	NC_008319	ATC	2	6	1822595	1822600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954851
35866	NC_008319	GGC	2	6	1822601	1822606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954851
35867	NC_008319	G	6	6	1822676	1822681	0 %	0 %	100 %	0 %	113954851
35868	NC_008319	TGA	2	6	1822717	1822722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954851
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35870	NC_008319	CTG	2	6	1822781	1822786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954851
35871	NC_008319	CGCT	2	8	1822794	1822801	0 %	25 %	25 %	50 %	113954851
35872	NC_008319	TTG	2	6	1822821	1822826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954851
35873	NC_008319	CT	3	6	1822881	1822886	0 %	50 %	0 %	50 %	113954851
35874	NC_008319	GCGA	2	8	1822907	1822914	25 %	0 %	50 %	25 %	113954851
35875	NC_008319	TGA	2	6	1822947	1822952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954851
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35877	NC_008319	CA	3	6	1823003	1823008	50 %	0 %	0 %	50 %	113954851
35878	NC_008319	ACTGAA	2	12	1823009	1823020	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	113954851
35879	NC_008319	CGA	2	6	1823051	1823056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954853
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35881	NC_008319	CCA	2	6	1823070	1823075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954853
35882	NC_008319	GTC	2	6	1823101	1823106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954853
35883	NC_008319	CAAGC	2	10	1823153	1823162	40 %	0 %	20 %	40 %	113954853
35884	NC_008319	TGG	2	6	1823176	1823181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954853
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35924	NC_008319	AATC	2	8	1825146	1825153	50 %	25 %	0 %	25 %	113952851
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35940	NC_008319	AATA	2	8	1825751	1825758	75 %	25 %	0 %	0 %	113952851
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35945	NC_008319	G	8	8	1825979	1825986	0 %	0 %	100 %	0 %	113952851
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35950	NC_008319	ACA	3	9	1826138	1826146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952851
35951	NC_008319	CAAT	2	8	1826170	1826177	50 %	25 %	0 %	25 %	113952851
35952	NC_008319	GCT	2	6	1826266	1826271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953522
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35954	NC_008319	G	6	6	1826379	1826384	0 %	0 %	100 %	0 %	113953522
35955	NC_008319	CAG	2	6	1826401	1826406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953522
35956	NC_008319	GAA	2	6	1826419	1826424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953522
35957	NC_008319	ACG	2	6	1826435	1826440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953522
35958	NC_008319	CAA	2	6	1826533	1826538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953522
35959	NC_008319	TCC	2	6	1826562	1826567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953522
35960	NC_008319	CCA	2	6	1826572	1826577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953522
35961	NC_008319	TCCCA	2	10	1826657	1826666	20 %	20 %	0 %	60 %	113953522
35962	NC_008319	CGCAAC	2	12	1826780	1826791	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	113953522
35963	NC_008319	AGG	2	6	1826809	1826814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953522
35964	NC_008319	TCCC	2	8	1826869	1826876	0 %	25 %	0 %	75 %	113953722
35965	NC_008319	AAG	2	6	1826932	1826937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953722
35966	NC_008319	CAC	2	6	1827064	1827069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953722
35967	NC_008319	GAA	2	6	1827118	1827123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953722
35968	NC_008319	GTC	2	6	1827124	1827129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953722
35969	NC_008319	GCT	2	6	1827240	1827245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953722
35970	NC_008319	ACC	2	6	1827269	1827274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953722
35971	NC_008319	TCC	2	6	1827324	1827329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953722
35972	NC_008319	AATC	2	8	1827363	1827370	50 %	25 %	0 %	25 %	113953722
35973	NC_008319	TCG	2	6	1827392	1827397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953722
35974	NC_008319	CGGT	2	8	1827403	1827410	0 %	25 %	50 %	25 %	113953722
35975	NC_008319	AAC	2	6	1827421	1827426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953722
35976	NC_008319	GGCT	2	8	1827649	1827656	0 %	25 %	50 %	25 %	113953194
35977	NC_008319	TCA	2	6	1827672	1827677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953194
35978	NC_008319	GAGCA	2	10	1827691	1827700	40 %	0 %	40 %	20 %	113953194
35979	NC_008319	CAA	3	9	1827703	1827711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953194
35980	NC_008319	TCA	2	6	1827887	1827892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953194
35981	NC_008319	TGT	2	6	1827941	1827946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953194
35982	NC_008319	GCTC	2	8	1828140	1828147	0 %	25 %	25 %	50 %	113953194
35983	NC_008319	TGC	2	6	1828196	1828201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953194
35984	NC_008319	AACA	2	8	1828237	1828244	75 %	0 %	0 %	25 %	113953194
35985	NC_008319	TTCC	2	8	1828281	1828288	0 %	50 %	0 %	50 %	113953194
35986	NC_008319	TCAT	2	8	1828413	1828420	25 %	50 %	0 %	25 %	113954357
35987	NC_008319	TCA	2	6	1828444	1828449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954357
35988	NC_008319	TGG	2	6	1828462	1828467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954357
35989	NC_008319	G	6	6	1828528	1828533	0 %	0 %	100 %	0 %	113954357
35990	NC_008319	AAG	2	6	1828613	1828618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954357
35991	NC_008319	AAC	2	6	1828663	1828668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35992	NC_008319	CAT	2	6	1828701	1828706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35993	NC_008319	CTG	2	6	1828793	1828798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953146
35994	NC_008319	CAC	2	6	1828920	1828925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953146
35995	NC_008319	CTT	2	6	1828958	1828963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953146
35996	NC_008319	GAC	2	6	1828964	1828969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953146
35997	NC_008319	TCA	2	6	1829004	1829009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953146
35998	NC_008319	GCTG	2	8	1829097	1829104	0 %	25 %	50 %	25 %	113953146
35999	NC_008319	CCTG	2	8	1829106	1829113	0 %	25 %	25 %	50 %	113953146
36000	NC_008319	GA	3	6	1829191	1829196	50 %	0 %	50 %	0 %	113953146

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