MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_008319	TGC	2	6	1622951	1622956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952830
32003	NC_008319	TGG	2	6	1622968	1622973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952830
32004	NC_008319	TTG	2	6	1622997	1623002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952830
32005	NC_008319	GCC	2	6	1623020	1623025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952830
32006	NC_008319	A	8	8	1623082	1623089	100 %	0 %	0 %	0 %	113952830
32007	NC_008319	AGA	2	6	1623095	1623100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952830
32008	NC_008319	AGA	2	6	1623104	1623109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952830
32009	NC_008319	CTG	2	6	1623156	1623161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952830
32010	NC_008319	CAG	2	6	1623190	1623195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952830
32011	NC_008319	CGG	2	6	1623209	1623214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952830
32012	NC_008319	CATC	2	8	1623260	1623267	25 %	25 %	0 %	50 %	113952830
32013	NC_008319	GGC	2	6	1623380	1623385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952830
32014	NC_008319	GCC	2	6	1623390	1623395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952830
32015	NC_008319	CAG	2	6	1623482	1623487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952830
32016	NC_008319	CCG	2	6	1623488	1623493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952830
32017	NC_008319	ACC	2	6	1623588	1623593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32018	NC_008319	AATC	2	8	1623594	1623601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32019	NC_008319	ACA	2	6	1623620	1623625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32020	NC_008319	ATT	2	6	1623640	1623645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32021	NC_008319	AGA	2	6	1623649	1623654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32022	NC_008319	GAA	2	6	1623706	1623711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32023	NC_008319	TCA	2	6	1623803	1623808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32024	NC_008319	AG	3	6	1623892	1623897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32025	NC_008319	CGA	2	6	1623963	1623968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954504
32026	NC_008319	TCCT	2	8	1623973	1623980	0 %	50 %	0 %	50 %	113954504
32027	NC_008319	GAA	2	6	1624039	1624044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954504
32028	NC_008319	TCTT	2	8	1624068	1624075	0 %	75 %	0 %	25 %	113954504
32029	NC_008319	CAAC	2	8	1624090	1624097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32030	NC_008319	A	6	6	1624130	1624135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32031	NC_008319	AAC	2	6	1624166	1624171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32032	NC_008319	A	6	6	1624172	1624177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32033	NC_008319	CAT	2	6	1624205	1624210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32034	NC_008319	CAA	2	6	1624275	1624280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32035	NC_008319	AGT	2	6	1624320	1624325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32036	NC_008319	T	7	7	1624415	1624421	0 %	100 %	0 %	0 %	113955110
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32039	NC_008319	TGC	2	6	1624629	1624634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953814
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32049	NC_008319	ATG	2	6	1625296	1625301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32050	NC_008319	CGA	2	6	1625317	1625322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32052	NC_008319	GAG	2	6	1625494	1625499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954473
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32061	NC_008319	CATC	2	8	1626054	1626061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32062	NC_008319	GTC	2	6	1626126	1626131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32063	NC_008319	CCA	2	6	1626219	1626224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954713
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32070	NC_008319	ATT	2	6	1626404	1626409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32071	NC_008319	CAG	2	6	1626422	1626427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32097	NC_008319	CAAA	2	8	1627856	1627863	75 %	0 %	0 %	25 %	113954962
32098	NC_008319	TGC	2	6	1627893	1627898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954962
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32102	NC_008319	AAG	2	6	1628070	1628075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954962
32103	NC_008319	TGA	2	6	1628152	1628157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954962
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32106	NC_008319	GAA	2	6	1628289	1628294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954962
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32108	NC_008319	AATA	2	8	1628321	1628328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32109	NC_008319	CTCA	2	8	1628329	1628336	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32110	NC_008319	GAGC	2	8	1628342	1628349	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32111	NC_008319	GCA	2	6	1628429	1628434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32113	NC_008319	CAA	2	6	1628551	1628556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953394
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32115	NC_008319	AATTC	2	10	1628697	1628706	40 %	40 %	0 %	20 %	113953394
32116	NC_008319	ATC	2	6	1628786	1628791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953394
32117	NC_008319	TCA	2	6	1628800	1628805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953394
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32119	NC_008319	GCTG	2	8	1628913	1628920	0 %	25 %	50 %	25 %	113953394
32120	NC_008319	AAG	2	6	1629000	1629005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32121	NC_008319	TTG	2	6	1629035	1629040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32122	NC_008319	ACC	2	6	1629103	1629108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953651
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32128	NC_008319	TCAC	2	8	1629468	1629475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32129	NC_008319	AAC	2	6	1629485	1629490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32130	NC_008319	CAA	2	6	1629553	1629558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32132	NC_008319	ACG	2	6	1629605	1629610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954311
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32197	NC_008319	CAA	2	6	1633689	1633694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32203	NC_008319	TCCA	2	8	1633892	1633899	25 %	25 %	0 %	50 %	113953003
32204	NC_008319	CTGG	2	8	1633964	1633971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32205	NC_008319	ACC	2	6	1633981	1633986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32206	NC_008319	GGGC	2	8	1634009	1634016	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32207	NC_008319	GAT	2	6	1634048	1634053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32208	NC_008319	CCAT	2	8	1634057	1634064	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32209	NC_008319	GCA	2	6	1634069	1634074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32210	NC_008319	GCT	4	12	1634107	1634118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952759
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32213	NC_008319	A	6	6	1634342	1634347	100 %	0 %	0 %	0 %	113952759
32214	NC_008319	TGC	2	6	1634362	1634367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952759
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32220	NC_008319	GATC	2	8	1634569	1634576	25 %	25 %	25 %	25 %	113955598
32221	NC_008319	CAA	2	6	1634604	1634609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955598
32222	NC_008319	CG	3	6	1634622	1634627	0 %	0 %	50 %	50 %	113955598
32223	NC_008319	CAAC	2	8	1634628	1634635	50 %	0 %	0 %	50 %	113955598
32224	NC_008319	TCA	2	6	1634726	1634731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32225	NC_008319	CGA	2	6	1634804	1634809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952744
32226	NC_008319	ACA	2	6	1635116	1635121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954431
32227	NC_008319	CAA	2	6	1635187	1635192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954431
32228	NC_008319	ATC	2	6	1635311	1635316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954431
32229	NC_008319	CAA	2	6	1635373	1635378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953594
32230	NC_008319	AGC	2	6	1635453	1635458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953594
32231	NC_008319	CAACT	2	10	1635459	1635468	40 %	20 %	0 %	40 %	113953594
32232	NC_008319	CAG	2	6	1635487	1635492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953594
32233	NC_008319	AGCG	2	8	1635525	1635532	25 %	0 %	50 %	25 %	113953594
32234	NC_008319	AT	4	8	1635686	1635693	50 %	50 %	0 %	0 %	113953594
32235	NC_008319	GGA	2	6	1635706	1635711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953594
32236	NC_008319	GCA	2	6	1635729	1635734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953594
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32477	NC_008319	TGC	2	6	1648810	1648815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954720
32478	NC_008319	GCA	2	6	1648881	1648886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954720
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