MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_008319	AGC	2	6	1520644	1520649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954239
30002	NC_008319	ATCCA	2	10	1520723	1520732	40 %	20 %	0 %	40 %	113954239
30003	NC_008319	CTG	2	6	1520865	1520870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955344
30004	NC_008319	CAAAAG	2	12	1521000	1521011	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	113955344
30005	NC_008319	GTT	2	6	1521125	1521130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955344
30006	NC_008319	TGC	2	6	1521143	1521148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955344
30007	NC_008319	AAC	2	6	1521209	1521214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955344
30008	NC_008319	CAG	2	6	1521244	1521249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955344
30009	NC_008319	CTG	2	6	1521303	1521308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955344
30010	NC_008319	ATG	2	6	1521309	1521314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955344
30011	NC_008319	GAT	2	6	1521356	1521361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955344
30012	NC_008319	CTG	2	6	1521393	1521398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955344
30013	NC_008319	CTG	2	6	1521405	1521410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955344
30014	NC_008319	GCC	2	6	1521480	1521485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955344
30015	NC_008319	CTG	2	6	1521540	1521545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954054
30016	NC_008319	TGC	2	6	1521555	1521560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954054
30017	NC_008319	ATTG	2	8	1521589	1521596	25 %	50 %	25 %	0 %	113954054
30018	NC_008319	TC	3	6	1521622	1521627	0 %	50 %	0 %	50 %	113954054
30019	NC_008319	TGT	2	6	1521650	1521655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954054
30020	NC_008319	CAA	2	6	1521676	1521681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954054
30021	NC_008319	TCA	2	6	1521701	1521706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954054
30022	NC_008319	TCC	2	6	1521736	1521741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954054
30023	NC_008319	TGAT	2	8	1521775	1521782	25 %	50 %	25 %	0 %	113954054
30024	NC_008319	AG	3	6	1521784	1521789	50 %	0 %	50 %	0 %	113954054
30025	NC_008319	TGC	2	6	1521906	1521911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954054
30026	NC_008319	TGT	2	6	1522018	1522023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954054
30027	NC_008319	CCATT	2	10	1522112	1522121	20 %	40 %	0 %	40 %	113954054
30028	NC_008319	CTT	2	6	1522139	1522144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954054
30029	NC_008319	GCC	2	6	1522177	1522182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954054
30030	NC_008319	GATG	2	8	1522184	1522191	25 %	25 %	50 %	0 %	113954054
30031	NC_008319	CAT	2	6	1522229	1522234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954054
30032	NC_008319	ATT	2	6	1522314	1522319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30033	NC_008319	CTC	2	6	1522358	1522363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954710
30034	NC_008319	CA	3	6	1522526	1522531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30035	NC_008319	GAA	2	6	1522560	1522565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30036	NC_008319	GCC	2	6	1522576	1522581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30037	NC_008319	TCA	2	6	1522693	1522698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952766
30038	NC_008319	TGA	2	6	1522767	1522772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952766
30039	NC_008319	ATG	2	6	1522778	1522783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952766
30040	NC_008319	TCC	2	6	1522896	1522901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952766
30041	NC_008319	TCA	2	6	1522971	1522976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952766
30042	NC_008319	ACA	2	6	1522977	1522982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952766
30043	NC_008319	TGGC	2	8	1523008	1523015	0 %	25 %	50 %	25 %	113952766
30044	NC_008319	GCT	2	6	1523022	1523027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952766
30045	NC_008319	AGC	2	6	1523124	1523129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952766
30046	NC_008319	GCT	2	6	1523140	1523145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952766
30047	NC_008319	TTG	2	6	1523177	1523182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952766
30048	NC_008319	ACC	2	6	1523235	1523240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952766
30049	NC_008319	CCCT	2	8	1523291	1523298	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30050	NC_008319	AC	3	6	1523317	1523322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30051	NC_008319	TGT	2	6	1523357	1523362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30052	NC_008319	CAG	2	6	1523511	1523516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953429
30053	NC_008319	CAC	3	9	1523550	1523558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953429
30054	NC_008319	CAAC	2	8	1523637	1523644	50 %	0 %	0 %	50 %	113953429
30055	NC_008319	CTT	2	6	1523678	1523683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953429
30056	NC_008319	TTG	2	6	1523697	1523702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953429
30057	NC_008319	AGC	2	6	1523716	1523721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953429
30058	NC_008319	TGT	2	6	1523741	1523746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953429
30059	NC_008319	AGG	3	9	1523797	1523805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953429
30060	NC_008319	AAG	2	6	1523886	1523891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953429
30061	NC_008319	CAGC	2	8	1523927	1523934	25 %	0 %	25 %	50 %	113953429
30062	NC_008319	GGC	3	9	1523985	1523993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953429
30063	NC_008319	AAG	2	6	1524008	1524013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953429
30064	NC_008319	GGC	2	6	1524108	1524113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953429
30065	NC_008319	AAC	2	6	1524115	1524120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953429
30066	NC_008319	GCT	2	6	1524179	1524184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953429
30067	NC_008319	GCT	2	6	1524202	1524207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953429
30068	NC_008319	C	7	7	1524279	1524285	0 %	0 %	0 %	100 %	113953429
30069	NC_008319	C	6	6	1524339	1524344	0 %	0 %	0 %	100 %	113953429
30070	NC_008319	TCA	2	6	1524350	1524355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953429
30071	NC_008319	TCA	2	6	1524386	1524391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953429
30072	NC_008319	GAT	2	6	1524458	1524463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953429
30073	NC_008319	AGC	2	6	1524507	1524512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953429
30074	NC_008319	CAA	2	6	1524549	1524554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953429
30075	NC_008319	ACA	2	6	1524686	1524691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953429
30076	NC_008319	GC	3	6	1524751	1524756	0 %	0 %	50 %	50 %	113953429
30077	NC_008319	GATG	2	8	1524775	1524782	25 %	25 %	50 %	0 %	113953429
30078	NC_008319	TGC	2	6	1524802	1524807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953429
30079	NC_008319	AAGG	2	8	1524871	1524878	50 %	0 %	50 %	0 %	113953429
30080	NC_008319	TAG	2	6	1524888	1524893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953429
30081	NC_008319	CAG	2	6	1524946	1524951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954433
30082	NC_008319	GAGT	2	8	1524952	1524959	25 %	25 %	50 %	0 %	113954433
30083	NC_008319	GCC	2	6	1525078	1525083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954433
30084	NC_008319	CAG	2	6	1525100	1525105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954433
30085	NC_008319	CCT	2	6	1525221	1525226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954433
30086	NC_008319	GCAA	2	8	1525294	1525301	50 %	0 %	25 %	25 %	113954433
30087	NC_008319	AAC	2	6	1525329	1525334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954433
30088	NC_008319	CTC	2	6	1525406	1525411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954433
30089	NC_008319	AGC	2	6	1525416	1525421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954433
30090	NC_008319	T	7	7	1525450	1525456	0 %	100 %	0 %	0 %	113954433
30091	NC_008319	CGA	2	6	1525458	1525463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954433
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30094	NC_008319	TCACCT	2	12	1525911	1525922	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	113953602
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30096	NC_008319	GTC	2	6	1526109	1526114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953602
30097	NC_008319	GCT	2	6	1526354	1526359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953602
30098	NC_008319	ACG	2	6	1526434	1526439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953602
30099	NC_008319	AAC	2	6	1526545	1526550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30100	NC_008319	T	7	7	1526557	1526563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30101	NC_008319	ATG	2	6	1526599	1526604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30102	NC_008319	CGA	2	6	1526612	1526617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953909
30103	NC_008319	ATC	2	6	1526695	1526700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953909
30104	NC_008319	CAC	2	6	1526709	1526714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953909
30105	NC_008319	TCCT	2	8	1526731	1526738	0 %	50 %	0 %	50 %	113953909
30106	NC_008319	GGC	2	6	1526819	1526824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953909
30107	NC_008319	GCTCG	2	10	1526865	1526874	0 %	20 %	40 %	40 %	113953909
30108	NC_008319	TAGC	2	8	1526885	1526892	25 %	25 %	25 %	25 %	113953909
30109	NC_008319	GCC	2	6	1526930	1526935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953909
30110	NC_008319	CA	3	6	1526960	1526965	50 %	0 %	0 %	50 %	113953909
30111	NC_008319	GCTTTG	2	12	1526974	1526985	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	113953909
30112	NC_008319	CAC	2	6	1527018	1527023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953909
30113	NC_008319	CAC	2	6	1527076	1527081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953909
30114	NC_008319	CT	3	6	1527091	1527096	0 %	50 %	0 %	50 %	113953909
30115	NC_008319	GCG	2	6	1527113	1527118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953909
30116	NC_008319	TGG	2	6	1527125	1527130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953909
30117	NC_008319	TCA	2	6	1527171	1527176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953909
30118	NC_008319	ACACA	2	10	1527232	1527241	60 %	0 %	0 %	40 %	113953909
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30133	NC_008319	ACA	2	6	1527826	1527831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30134	NC_008319	CCTG	2	8	1527833	1527840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30135	NC_008319	ACA	2	6	1527855	1527860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30136	NC_008319	TGA	2	6	1527870	1527875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30152	NC_008319	GCAC	2	8	1528884	1528891	25 %	0 %	25 %	50 %	113955244
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30352	NC_008319	CGA	2	6	1539676	1539681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952875
30353	NC_008319	GAA	2	6	1539704	1539709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952875
30354	NC_008319	GAA	2	6	1539856	1539861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952875
30355	NC_008319	GCT	2	6	1539866	1539871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952875
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30363	NC_008319	GAAG	2	8	1540240	1540247	50 %	0 %	50 %	0 %	113952875
30364	NC_008319	CGCC	2	8	1540255	1540262	0 %	0 %	25 %	75 %	113952875
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30370	NC_008319	GGA	2	6	1540612	1540617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955176
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30401	NC_008319	A	6	6	1541889	1541894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30495	NC_008319	GCA	2	6	1546887	1546892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952927
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