MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_008319	GCA	2	6	1466584	1466589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955253
29003	NC_008319	CCA	2	6	1466674	1466679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955253
29004	NC_008319	ACC	2	6	1466742	1466747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955253
29005	NC_008319	GGCC	2	8	1466797	1466804	0 %	0 %	50 %	50 %	113955253
29006	NC_008319	C	6	6	1466872	1466877	0 %	0 %	0 %	100 %	113955253
29007	NC_008319	GCT	2	6	1466907	1466912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955253
29008	NC_008319	TGC	2	6	1466920	1466925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955253
29009	NC_008319	CTG	2	6	1466936	1466941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955253
29010	NC_008319	GCC	2	6	1466965	1466970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955253
29011	NC_008319	TTC	2	6	1466991	1466996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955253
29012	NC_008319	CGAG	2	8	1467004	1467011	25 %	0 %	50 %	25 %	113955253
29013	NC_008319	CAG	2	6	1467041	1467046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955253
29014	NC_008319	CAA	2	6	1467231	1467236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955253
29015	NC_008319	TGC	2	6	1467242	1467247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955253
29016	NC_008319	CGA	2	6	1467358	1467363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955253
29017	NC_008319	GCT	2	6	1467389	1467394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955253
29018	NC_008319	ACC	2	6	1467536	1467541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955253
29019	NC_008319	AAT	2	6	1467615	1467620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113952938
29020	NC_008319	ATC	2	6	1467696	1467701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952938
29021	NC_008319	GCC	2	6	1467744	1467749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952938
29022	NC_008319	TTC	2	6	1467762	1467767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952938
29023	NC_008319	GATC	2	8	1467842	1467849	25 %	25 %	25 %	25 %	113952938
29024	NC_008319	CTT	2	6	1467944	1467949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952938
29025	NC_008319	TTC	2	6	1467999	1468004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952938
29026	NC_008319	A	6	6	1468032	1468037	100 %	0 %	0 %	0 %	113952938
29027	NC_008319	GTT	2	6	1468047	1468052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952938
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29029	NC_008319	TGC	2	6	1468097	1468102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952938
29030	NC_008319	CCT	2	6	1468186	1468191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952938
29031	NC_008319	CAC	2	6	1468200	1468205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952938
29032	NC_008319	TGT	2	6	1468253	1468258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952938
29033	NC_008319	GCC	2	6	1468437	1468442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952938
29034	NC_008319	TCG	2	6	1468498	1468503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952938
29035	NC_008319	GAAGA	2	10	1468524	1468533	60 %	0 %	40 %	0 %	113952938
29036	NC_008319	TGC	2	6	1468550	1468555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29037	NC_008319	AAT	2	6	1468602	1468607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953510
29038	NC_008319	GCA	2	6	1468617	1468622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953510
29039	NC_008319	CGT	2	6	1468625	1468630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953510
29040	NC_008319	GA	3	6	1468644	1468649	50 %	0 %	50 %	0 %	113953510
29041	NC_008319	GA	3	6	1468660	1468665	50 %	0 %	50 %	0 %	113953510
29042	NC_008319	GCA	2	6	1468666	1468671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953510
29043	NC_008319	TCA	2	6	1468699	1468704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953510
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29046	NC_008319	CAA	2	6	1468810	1468815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954978
29047	NC_008319	CAA	2	6	1468853	1468858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954978
29048	NC_008319	TGGA	2	8	1468906	1468913	25 %	25 %	50 %	0 %	113954978
29049	NC_008319	TCA	2	6	1468966	1468971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954978
29050	NC_008319	CTT	2	6	1469012	1469017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954978
29051	NC_008319	TGC	2	6	1469053	1469058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954978
29052	NC_008319	AAC	2	6	1469094	1469099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955450
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29055	NC_008319	AAT	2	6	1469400	1469405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955450
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29057	NC_008319	ACC	2	6	1469480	1469485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955450
29058	NC_008319	GCC	2	6	1469501	1469506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955450
29059	NC_008319	CAG	2	6	1469589	1469594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955450
29060	NC_008319	GT	3	6	1469618	1469623	0 %	50 %	50 %	0 %	113955450
29061	NC_008319	GCA	2	6	1469660	1469665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955450
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29063	NC_008319	AATC	2	8	1469833	1469840	50 %	25 %	0 %	25 %	113955450
29064	NC_008319	GATT	2	8	1469949	1469956	25 %	50 %	25 %	0 %	113955450
29065	NC_008319	GCA	2	6	1470148	1470153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953175
29066	NC_008319	GCG	2	6	1470158	1470163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953175
29067	NC_008319	AAG	2	6	1470168	1470173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953175
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29071	NC_008319	CAA	2	6	1470326	1470331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953175
29072	NC_008319	GACGG	2	10	1470440	1470449	20 %	0 %	60 %	20 %	113953175
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29075	NC_008319	AACGG	2	10	1470546	1470555	40 %	0 %	40 %	20 %	113953175
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29077	NC_008319	CTG	2	6	1470605	1470610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953175
29078	NC_008319	CGA	2	6	1470619	1470624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953175
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29082	NC_008319	CTGGCA	2	12	1470955	1470966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113955321
29083	NC_008319	CTG	2	6	1471005	1471010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955321
29084	NC_008319	CGA	2	6	1471011	1471016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955321
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29087	NC_008319	GAGCT	2	10	1471094	1471103	20 %	20 %	40 %	20 %	113955321
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29089	NC_008319	AGCA	2	8	1471125	1471132	50 %	0 %	25 %	25 %	113955321
29090	NC_008319	GTCG	2	8	1471165	1471172	0 %	25 %	50 %	25 %	113955321
29091	NC_008319	CTTG	2	8	1471203	1471210	0 %	50 %	25 %	25 %	113955321
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29099	NC_008319	CCAC	2	8	1471398	1471405	25 %	0 %	0 %	75 %	113955321
29100	NC_008319	GCT	2	6	1471456	1471461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955321
29101	NC_008319	GCT	2	6	1471622	1471627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953831
29102	NC_008319	GCTTG	2	10	1471662	1471671	0 %	40 %	40 %	20 %	113953831
29103	NC_008319	GCA	2	6	1471679	1471684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953831
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29105	NC_008319	TC	3	6	1471782	1471787	0 %	50 %	0 %	50 %	113953831
29106	NC_008319	CAA	2	6	1471813	1471818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953831
29107	NC_008319	CCAT	2	8	1471822	1471829	25 %	25 %	0 %	50 %	113953831
29108	NC_008319	GCA	2	6	1471833	1471838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953831
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29111	NC_008319	TGA	2	6	1471933	1471938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29112	NC_008319	GAA	3	9	1472081	1472089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953058
29113	NC_008319	TAC	2	6	1472171	1472176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953058
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29115	NC_008319	CT	3	6	1472335	1472340	0 %	50 %	0 %	50 %	113953058
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29227	NC_008319	CAAA	2	8	1478482	1478489	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29228	NC_008319	GTCA	2	8	1478529	1478536	25 %	25 %	25 %	25 %	113953511
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