MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_008319	CTG	2	6	1414819	1414824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953810
28002	NC_008319	GTG	2	6	1414870	1414875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953810
28003	NC_008319	ACG	3	9	1414961	1414969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953810
28004	NC_008319	GCAG	2	8	1414990	1414997	25 %	0 %	50 %	25 %	113953810
28005	NC_008319	AGGT	2	8	1415087	1415094	25 %	25 %	50 %	0 %	113953810
28006	NC_008319	CCAGC	2	10	1415125	1415134	20 %	0 %	20 %	60 %	113953810
28007	NC_008319	CTT	2	6	1415178	1415183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953810
28008	NC_008319	GCT	2	6	1415347	1415352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953810
28009	NC_008319	CCT	2	6	1415387	1415392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953810
28010	NC_008319	ACA	2	6	1415403	1415408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953810
28011	NC_008319	CCT	2	6	1415425	1415430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953810
28012	NC_008319	TGC	2	6	1415512	1415517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28013	NC_008319	AACA	2	8	1415560	1415567	75 %	0 %	0 %	25 %	113953251
28014	NC_008319	ACA	2	6	1415588	1415593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953251
28015	NC_008319	TGC	2	6	1415741	1415746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953251
28016	NC_008319	GTG	2	6	1415830	1415835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953251
28017	NC_008319	CAC	2	6	1415847	1415852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953251
28018	NC_008319	CAC	2	6	1415883	1415888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953251
28019	NC_008319	ACC	2	6	1415909	1415914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953251
28020	NC_008319	CGG	2	6	1415921	1415926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953251
28021	NC_008319	ATC	2	6	1415960	1415965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953251
28022	NC_008319	AGG	2	6	1416011	1416016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953251
28023	NC_008319	TCT	2	6	1416075	1416080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953251
28024	NC_008319	GGA	2	6	1416084	1416089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953251
28025	NC_008319	CAACCG	2	12	1416136	1416147	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	113953251
28026	NC_008319	TGC	2	6	1416177	1416182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953251
28027	NC_008319	CAA	2	6	1416214	1416219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953251
28028	NC_008319	TGG	2	6	1416232	1416237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953251
28029	NC_008319	TGG	2	6	1416275	1416280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953251
28030	NC_008319	CAA	2	6	1416286	1416291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953251
28031	NC_008319	TGG	2	6	1416318	1416323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953251
28032	NC_008319	CAA	2	6	1416432	1416437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952815
28033	NC_008319	CTGT	2	8	1416448	1416455	0 %	50 %	25 %	25 %	113952815
28034	NC_008319	T	6	6	1416486	1416491	0 %	100 %	0 %	0 %	113952815
28035	NC_008319	TGC	2	6	1416607	1416612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952815
28036	NC_008319	GAC	2	6	1416624	1416629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952815
28037	NC_008319	TGT	2	6	1416686	1416691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952815
28038	NC_008319	AG	3	6	1416726	1416731	50 %	0 %	50 %	0 %	113952815
28039	NC_008319	CAA	4	12	1416782	1416793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952815
28040	NC_008319	AGC	2	6	1416832	1416837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952815
28041	NC_008319	TGC	2	6	1416839	1416844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952815
28042	NC_008319	TGG	3	9	1416847	1416855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952815
28043	NC_008319	GCACA	2	10	1416937	1416946	40 %	0 %	20 %	40 %	113952815
28044	NC_008319	CAG	2	6	1417000	1417005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952815
28045	NC_008319	TTG	2	6	1417024	1417029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952815
28046	NC_008319	CT	3	6	1417048	1417053	0 %	50 %	0 %	50 %	113952815
28047	NC_008319	CGA	2	6	1417109	1417114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952815
28048	NC_008319	TGA	2	6	1417139	1417144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952815
28049	NC_008319	TCGC	2	8	1417255	1417262	0 %	25 %	25 %	50 %	113952815
28050	NC_008319	AGG	2	6	1417313	1417318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952815
28051	NC_008319	GCG	2	6	1417395	1417400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952815
28052	NC_008319	ACAG	2	8	1417467	1417474	50 %	0 %	25 %	25 %	113952815
28053	NC_008319	TGG	2	6	1417531	1417536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952815
28054	NC_008319	AGGCCA	2	12	1417555	1417566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952815
28055	NC_008319	TGC	2	6	1417705	1417710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952815
28056	NC_008319	ATCG	2	8	1417777	1417784	25 %	25 %	25 %	25 %	113954682
28057	NC_008319	GAT	2	6	1417791	1417796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954682
28058	NC_008319	TTC	2	6	1417864	1417869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954682
28059	NC_008319	ACT	2	6	1417879	1417884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954682
28060	NC_008319	AAC	2	6	1417933	1417938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28061	NC_008319	GCAA	2	8	1417969	1417976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28062	NC_008319	A	6	6	1417989	1417994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28063	NC_008319	CAA	2	6	1418018	1418023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28064	NC_008319	AGC	2	6	1418041	1418046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952721
28065	NC_008319	TCCT	2	8	1418065	1418072	0 %	50 %	0 %	50 %	113952721
28066	NC_008319	T	6	6	1418156	1418161	0 %	100 %	0 %	0 %	113952721
28067	NC_008319	CACATT	2	12	1418275	1418286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952721
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28070	NC_008319	CAC	2	6	1418464	1418469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952721
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28072	NC_008319	CATC	2	8	1418658	1418665	25 %	25 %	0 %	50 %	113952721
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28081	NC_008319	GAGCT	3	15	1419206	1419220	20 %	20 %	40 %	20 %	113952721
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28087	NC_008319	CCG	2	6	1419527	1419532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28088	NC_008319	CAA	2	6	1419669	1419674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28089	NC_008319	CGG	2	6	1419700	1419705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28090	NC_008319	CCA	2	6	1419713	1419718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28091	NC_008319	ACA	2	6	1419751	1419756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28092	NC_008319	ACAAG	2	10	1419780	1419789	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28093	NC_008319	GCG	2	6	1419856	1419861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955089
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28099	NC_008319	ATG	2	6	1420237	1420242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955089
28100	NC_008319	GCC	2	6	1420246	1420251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955089
28101	NC_008319	ATTC	2	8	1420282	1420289	25 %	50 %	0 %	25 %	113955089
28102	NC_008319	TAT	2	6	1420386	1420391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955089
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28104	NC_008319	T	6	6	1420517	1420522	0 %	100 %	0 %	0 %	113955089
28105	NC_008319	TGA	2	6	1420624	1420629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955089
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28107	NC_008319	ACA	2	6	1420814	1420819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28108	NC_008319	CAA	2	6	1420925	1420930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28109	NC_008319	CATC	2	8	1420944	1420951	25 %	25 %	0 %	50 %	113952832
28110	NC_008319	CCAA	2	8	1421095	1421102	50 %	0 %	0 %	50 %	113952832
28111	NC_008319	CAAC	2	8	1421128	1421135	50 %	0 %	0 %	50 %	113952832
28112	NC_008319	GATG	2	8	1421188	1421195	25 %	25 %	50 %	0 %	113952832
28113	NC_008319	AGC	2	6	1421218	1421223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952832
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28115	NC_008319	CAC	2	6	1421287	1421292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952832
28116	NC_008319	AGC	2	6	1421372	1421377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953407
28117	NC_008319	CAG	2	6	1421423	1421428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953407
28118	NC_008319	TCC	2	6	1421436	1421441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953407
28119	NC_008319	AAC	2	6	1421452	1421457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953407
28120	NC_008319	AGGA	2	8	1421555	1421562	50 %	0 %	50 %	0 %	113953407
28121	NC_008319	CTG	3	9	1421605	1421613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953407
28122	NC_008319	CAA	2	6	1421627	1421632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953407
28123	NC_008319	C	6	6	1421637	1421642	0 %	0 %	0 %	100 %	113953407
28124	NC_008319	AGCA	2	8	1421645	1421652	50 %	0 %	25 %	25 %	113953407
28125	NC_008319	CTC	2	6	1421675	1421680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953407
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28129	NC_008319	ACC	2	6	1421957	1421962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953407
28130	NC_008319	AAAC	2	8	1422012	1422019	75 %	0 %	0 %	25 %	113953407
28131	NC_008319	AAC	2	6	1422034	1422039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953407
28132	NC_008319	GCA	2	6	1422070	1422075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953407
28133	NC_008319	CCT	2	6	1422091	1422096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953407
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28136	NC_008319	TC	3	6	1422207	1422212	0 %	50 %	0 %	50 %	113953407
28137	NC_008319	GCT	2	6	1422247	1422252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954103
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28148	NC_008319	CAC	2	6	1422854	1422859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954103
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28153	NC_008319	GA	3	6	1423134	1423139	50 %	0 %	50 %	0 %	113954103
28154	NC_008319	CAAAA	2	10	1423152	1423161	80 %	0 %	0 %	20 %	113954103
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28163	NC_008319	A	8	8	1423612	1423619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28164	NC_008319	CAG	2	6	1423637	1423642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28166	NC_008319	ACT	2	6	1423695	1423700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28168	NC_008319	CCTC	2	8	1423799	1423806	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28169	NC_008319	ATG	2	6	1423843	1423848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28171	NC_008319	ATTGC	2	10	1423903	1423912	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28172	NC_008319	TGA	2	6	1423954	1423959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955313
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28188	NC_008319	T	7	7	1424597	1424603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28189	NC_008319	GACT	2	8	1424668	1424675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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28195	NC_008319	AGTC	2	8	1425050	1425057	25 %	25 %	25 %	25 %	113953047
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28206	NC_008319	TC	3	6	1425483	1425488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28207	NC_008319	GA	3	6	1425500	1425505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28208	NC_008319	TCAA	2	8	1425647	1425654	50 %	25 %	0 %	25 %	113953652
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28211	NC_008319	CGTG	2	8	1425777	1425784	0 %	25 %	50 %	25 %	113953652
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28224	NC_008319	T	6	6	1426612	1426617	0 %	100 %	0 %	0 %	113953443
28225	NC_008319	TG	3	6	1426675	1426680	0 %	50 %	50 %	0 %	113953443
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28228	NC_008319	GT	3	6	1426781	1426786	0 %	50 %	50 %	0 %	113953443
28229	NC_008319	CGC	2	6	1426794	1426799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953443
28230	NC_008319	GCT	2	6	1426960	1426965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953443
28231	NC_008319	CGA	2	6	1427004	1427009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953443
28232	NC_008319	TGA	2	6	1427021	1427026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953443
28233	NC_008319	CCA	2	6	1427114	1427119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953443
28234	NC_008319	CTA	2	6	1427120	1427125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953443
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28354	NC_008319	CTA	2	6	1433761	1433766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954650
28355	NC_008319	TGC	2	6	1433769	1433774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954650
28356	NC_008319	GCT	2	6	1433793	1433798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954650
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28359	NC_008319	GCCT	2	8	1433978	1433985	0 %	25 %	25 %	50 %	113954650
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28364	NC_008319	GCG	2	6	1434247	1434252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954650
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28419	NC_008319	CGT	2	6	1437588	1437593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955177
28420	NC_008319	GAGG	2	8	1437663	1437670	25 %	0 %	75 %	0 %	113955177
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28422	NC_008319	TGC	2	6	1437809	1437814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955177
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28432	NC_008319	TGG	2	6	1438138	1438143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955177
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28434	NC_008319	GCGA	2	8	1438212	1438219	25 %	0 %	50 %	25 %	113955177
28435	NC_008319	TTGT	2	8	1438227	1438234	0 %	75 %	25 %	0 %	113955177
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28454	NC_008319	GAT	2	6	1439121	1439126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955177
28455	NC_008319	TTG	2	6	1439143	1439148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955177
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28457	NC_008319	CGA	2	6	1439246	1439251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955177
28458	NC_008319	TGC	2	6	1439321	1439326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955177
28459	NC_008319	GAA	2	6	1439331	1439336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955177
28460	NC_008319	GCA	3	9	1439412	1439420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28461	NC_008319	CCAT	2	8	1439491	1439498	25 %	25 %	0 %	50 %	113954182
28462	NC_008319	CTC	2	6	1439554	1439559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954182
28463	NC_008319	TCC	3	9	1439588	1439596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954182
28464	NC_008319	ATC	2	6	1439659	1439664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954182
28465	NC_008319	AC	3	6	1439679	1439684	50 %	0 %	0 %	50 %	113954182
28466	NC_008319	GGT	2	6	1439791	1439796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954182
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