MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_008319	CTG	2	6	1364221	1364226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954515
27002	NC_008319	GCC	2	6	1364300	1364305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954515
27003	NC_008319	CATC	2	8	1364324	1364331	25 %	25 %	0 %	50 %	113954515
27004	NC_008319	CA	3	6	1364346	1364351	50 %	0 %	0 %	50 %	113954515
27005	NC_008319	ATG	2	6	1364356	1364361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27006	NC_008319	CAG	2	6	1364365	1364370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27007	NC_008319	CGG	2	6	1364403	1364408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27008	NC_008319	G	13	13	1364407	1364419	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27009	NC_008319	CTG	2	6	1364437	1364442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27010	NC_008319	CAA	2	6	1364488	1364493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954011
27011	NC_008319	GAAT	2	8	1364497	1364504	50 %	25 %	25 %	0 %	113954011
27012	NC_008319	AGG	2	6	1364583	1364588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954011
27013	NC_008319	TGCC	2	8	1364613	1364620	0 %	25 %	25 %	50 %	113954011
27014	NC_008319	ATTG	2	8	1364681	1364688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27015	NC_008319	T	6	6	1364776	1364781	0 %	100 %	0 %	0 %	113954644
27016	NC_008319	TGC	2	6	1364792	1364797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954644
27017	NC_008319	CCT	2	6	1364820	1364825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954644
27018	NC_008319	CCA	2	6	1364834	1364839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954644
27019	NC_008319	AC	3	6	1364950	1364955	50 %	0 %	0 %	50 %	113954644
27020	NC_008319	AGGTC	2	10	1364962	1364971	20 %	20 %	40 %	20 %	113954644
27021	NC_008319	TTTG	2	8	1365124	1365131	0 %	75 %	25 %	0 %	113954644
27022	NC_008319	ATC	2	6	1365157	1365162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954644
27023	NC_008319	GCC	2	6	1365246	1365251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954644
27024	NC_008319	AAT	2	6	1365253	1365258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954644
27025	NC_008319	TGAA	2	8	1365291	1365298	50 %	25 %	25 %	0 %	113954644
27026	NC_008319	CAG	2	6	1365352	1365357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954644
27027	NC_008319	CAAT	2	8	1365375	1365382	50 %	25 %	0 %	25 %	113954644
27028	NC_008319	T	6	6	1365388	1365393	0 %	100 %	0 %	0 %	113954644
27029	NC_008319	AT	3	6	1365457	1365462	50 %	50 %	0 %	0 %	113954644
27030	NC_008319	CAA	2	6	1365480	1365485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954644
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27034	NC_008319	AGC	2	6	1365751	1365756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954644
27035	NC_008319	TGA	2	6	1365805	1365810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954644
27036	NC_008319	TGA	2	6	1365837	1365842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954644
27037	NC_008319	T	6	6	1365902	1365907	0 %	100 %	0 %	0 %	113954644
27038	NC_008319	TGC	2	6	1366053	1366058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954644
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27040	NC_008319	ATTT	2	8	1366149	1366156	25 %	75 %	0 %	0 %	113954644
27041	NC_008319	TCA	2	6	1366230	1366235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954644
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27043	NC_008319	GTA	2	6	1366316	1366321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954644
27044	NC_008319	GAT	2	6	1366360	1366365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954644
27045	NC_008319	CAGAT	2	10	1366416	1366425	40 %	20 %	20 %	20 %	113954644
27046	NC_008319	TGCTGT	2	12	1366434	1366445	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	113954644
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27051	NC_008319	CAT	2	6	1366705	1366710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954644
27052	NC_008319	GAC	2	6	1366712	1366717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954644
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27054	NC_008319	TTCCC	2	10	1366887	1366896	0 %	40 %	0 %	60 %	113954644
27055	NC_008319	A	6	6	1366977	1366982	100 %	0 %	0 %	0 %	113954644
27056	NC_008319	GA	3	6	1367015	1367020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27057	NC_008319	CAG	2	6	1367026	1367031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27058	NC_008319	TGA	2	6	1367076	1367081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27059	NC_008319	TC	3	6	1367160	1367165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27060	NC_008319	CAA	2	6	1367232	1367237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27061	NC_008319	A	6	6	1367343	1367348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27062	NC_008319	GAAG	2	8	1367351	1367358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27063	NC_008319	TCA	2	6	1367453	1367458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955573
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27065	NC_008319	AT	3	6	1367483	1367488	50 %	50 %	0 %	0 %	113955573
27066	NC_008319	GCTTG	2	10	1367512	1367521	0 %	40 %	40 %	20 %	113955573
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27079	NC_008319	CAT	2	6	1368099	1368104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955573
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27091	NC_008319	CTG	2	6	1368950	1368955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953424
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27101	NC_008319	TAA	2	6	1369130	1369135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27102	NC_008319	TGA	2	6	1369167	1369172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953639
27103	NC_008319	GCA	2	6	1369175	1369180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953639
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27108	NC_008319	TCC	2	6	1369643	1369648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27109	NC_008319	AGC	2	6	1369658	1369663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27110	NC_008319	TGG	2	6	1369699	1369704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954883
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27116	NC_008319	CAA	2	6	1369940	1369945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27117	NC_008319	CT	3	6	1369948	1369953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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27119	NC_008319	AACCA	2	10	1370025	1370034	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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27123	NC_008319	GAGC	2	8	1370185	1370192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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