MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_008319	GGT	2	6	1339572	1339577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953002
26503	NC_008319	GGTT	2	8	1339602	1339609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26504	NC_008319	GAT	2	6	1339651	1339656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26505	NC_008319	AAGC	2	8	1339665	1339672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26506	NC_008319	CAA	2	6	1339711	1339716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26507	NC_008319	TTG	2	6	1339775	1339780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26508	NC_008319	TGA	2	6	1339798	1339803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954272
26509	NC_008319	CAA	2	6	1339820	1339825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954272
26510	NC_008319	GCT	2	6	1339924	1339929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954272
26511	NC_008319	T	7	7	1340150	1340156	0 %	100 %	0 %	0 %	113954272
26512	NC_008319	TGT	2	6	1340201	1340206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954272
26513	NC_008319	TGA	2	6	1340234	1340239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954272
26514	NC_008319	GCGAT	2	10	1340271	1340280	20 %	20 %	40 %	20 %	113954272
26515	NC_008319	GGT	2	6	1340372	1340377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954272
26516	NC_008319	CTGT	2	8	1340394	1340401	0 %	50 %	25 %	25 %	113954272
26517	NC_008319	CAAG	2	8	1340441	1340448	50 %	0 %	25 %	25 %	113954272
26518	NC_008319	GGA	2	6	1340551	1340556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954623
26519	NC_008319	TGC	2	6	1340574	1340579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954623
26520	NC_008319	AAC	2	6	1340621	1340626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954623
26521	NC_008319	AAC	2	6	1340704	1340709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954623
26522	NC_008319	GCA	2	6	1340839	1340844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954623
26523	NC_008319	TGG	2	6	1340975	1340980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954623
26524	NC_008319	AGC	2	6	1341028	1341033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954623
26525	NC_008319	CGT	2	6	1341066	1341071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954623
26526	NC_008319	GAT	2	6	1341073	1341078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954623
26527	NC_008319	CCAAGG	2	12	1341204	1341215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954623
26528	NC_008319	CAGG	2	8	1341247	1341254	25 %	0 %	50 %	25 %	113954623
26529	NC_008319	CAA	2	6	1341277	1341282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954623
26530	NC_008319	TGG	2	6	1341329	1341334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954623
26531	NC_008319	CGC	2	6	1341363	1341368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954623
26532	NC_008319	CGG	2	6	1341416	1341421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954623
26533	NC_008319	TGC	4	12	1341423	1341434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954623
26534	NC_008319	ACA	2	6	1341493	1341498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954623
26535	NC_008319	ATC	2	6	1341622	1341627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954623
26536	NC_008319	TCAA	2	8	1341721	1341728	50 %	25 %	0 %	25 %	113955276
26537	NC_008319	CGC	2	6	1341792	1341797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955276
26538	NC_008319	TTA	2	6	1341837	1341842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955276
26539	NC_008319	AGCA	2	8	1341856	1341863	50 %	0 %	25 %	25 %	113955276
26540	NC_008319	TCA	2	6	1341866	1341871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955276
26541	NC_008319	AGCA	2	8	1341959	1341966	50 %	0 %	25 %	25 %	113955276
26542	NC_008319	TGAT	2	8	1342066	1342073	25 %	50 %	25 %	0 %	113955276
26543	NC_008319	CA	3	6	1342103	1342108	50 %	0 %	0 %	50 %	113955276
26544	NC_008319	GCG	2	6	1342131	1342136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955276
26545	NC_008319	TGT	2	6	1342187	1342192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955276
26546	NC_008319	AGT	2	6	1342253	1342258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955276
26547	NC_008319	GTT	2	6	1342268	1342273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955276
26548	NC_008319	TGC	3	9	1342283	1342291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955276
26549	NC_008319	ACA	2	6	1342318	1342323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955276
26550	NC_008319	GTC	2	6	1342646	1342651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955276
26551	NC_008319	TGTT	2	8	1342663	1342670	0 %	75 %	25 %	0 %	113955276
26552	NC_008319	ATTG	2	8	1342793	1342800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26553	NC_008319	GTTT	2	8	1342888	1342895	0 %	75 %	25 %	0 %	113952997
26554	NC_008319	CT	4	8	1342927	1342934	0 %	50 %	0 %	50 %	113952997
26555	NC_008319	CAG	2	6	1342948	1342953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952997
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26557	NC_008319	CTCC	2	8	1342991	1342998	0 %	25 %	0 %	75 %	113952997
26558	NC_008319	TGC	2	6	1343032	1343037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952997
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26560	NC_008319	GGT	2	6	1343088	1343093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952997
26561	NC_008319	GCA	2	6	1343197	1343202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952997
26562	NC_008319	CAA	2	6	1343208	1343213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952997
26563	NC_008319	AAT	2	6	1343518	1343523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26564	NC_008319	CAT	2	6	1343540	1343545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26565	NC_008319	ATG	2	6	1343576	1343581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953619
26566	NC_008319	CGAT	2	8	1343592	1343599	25 %	25 %	25 %	25 %	113953619
26567	NC_008319	CGA	2	6	1343608	1343613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953619
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26571	NC_008319	GCA	2	6	1343676	1343681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953619
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26574	NC_008319	TCT	2	6	1343772	1343777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953619
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26577	NC_008319	TGAT	2	8	1343906	1343913	25 %	50 %	25 %	0 %	113953619
26578	NC_008319	C	6	6	1343955	1343960	0 %	0 %	0 %	100 %	113953619
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26582	NC_008319	CAG	2	6	1344196	1344201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953619
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26584	NC_008319	CAGGTA	2	12	1344274	1344285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113953619
26585	NC_008319	TGC	3	9	1344331	1344339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953619
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26589	NC_008319	AAT	2	6	1344422	1344427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26590	NC_008319	AAC	2	6	1344442	1344447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955558
26591	NC_008319	GCAT	2	8	1344467	1344474	25 %	25 %	25 %	25 %	113955558
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26604	NC_008319	TGG	2	6	1345142	1345147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955558
26605	NC_008319	ATC	2	6	1345148	1345153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955558
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26607	NC_008319	CGAA	2	8	1345210	1345217	50 %	0 %	25 %	25 %	113955558
26608	NC_008319	GA	3	6	1345244	1345249	50 %	0 %	50 %	0 %	113955558
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26610	NC_008319	CAACA	2	10	1345363	1345372	60 %	0 %	0 %	40 %	113955558
26611	NC_008319	GAA	2	6	1345446	1345451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955558
26612	NC_008319	TGAG	2	8	1345545	1345552	25 %	25 %	50 %	0 %	113955558
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26615	NC_008319	AAAC	2	8	1345633	1345640	75 %	0 %	0 %	25 %	113955558
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26980	NC_008319	ATG	2	6	1362794	1362799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953889
26981	NC_008319	TTGC	2	8	1362815	1362822	0 %	50 %	25 %	25 %	113953889
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