MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_008319	GGT	2	6	1261048	1261053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954662
25002	NC_008319	TGAA	2	8	1261104	1261111	50 %	25 %	25 %	0 %	113954662
25003	NC_008319	CGA	2	6	1261136	1261141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954662
25004	NC_008319	CGGT	2	8	1261208	1261215	0 %	25 %	50 %	25 %	113954662
25005	NC_008319	GGCA	2	8	1261276	1261283	25 %	0 %	50 %	25 %	113954662
25006	NC_008319	TCT	2	6	1261372	1261377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954662
25007	NC_008319	TTG	2	6	1261434	1261439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954662
25008	NC_008319	TGA	2	6	1261519	1261524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954662
25009	NC_008319	GATC	2	8	1261583	1261590	25 %	25 %	25 %	25 %	113954662
25010	NC_008319	CAA	2	6	1261611	1261616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954002
25011	NC_008319	GCTC	2	8	1261620	1261627	0 %	25 %	25 %	50 %	113954002
25012	NC_008319	CTG	2	6	1261634	1261639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954002
25013	NC_008319	CTA	2	6	1261840	1261845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954002
25014	NC_008319	AATA	2	8	1261855	1261862	75 %	25 %	0 %	0 %	113954002
25015	NC_008319	AAG	2	6	1261931	1261936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954002
25016	NC_008319	TGA	2	6	1261948	1261953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954002
25017	NC_008319	ATG	2	6	1261988	1261993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954368
25018	NC_008319	CG	3	6	1261996	1262001	0 %	0 %	50 %	50 %	113954368
25019	NC_008319	TGA	2	6	1262023	1262028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954368
25020	NC_008319	TC	3	6	1262030	1262035	0 %	50 %	0 %	50 %	113954368
25021	NC_008319	ACC	2	6	1262089	1262094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954368
25022	NC_008319	CCT	2	6	1262188	1262193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954368
25023	NC_008319	CAA	2	6	1262200	1262205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954368
25024	NC_008319	AG	4	8	1262224	1262231	50 %	0 %	50 %	0 %	113954368
25025	NC_008319	ATT	2	6	1262257	1262262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954368
25026	NC_008319	ATC	2	6	1262265	1262270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954368
25027	NC_008319	GA	3	6	1262284	1262289	50 %	0 %	50 %	0 %	113954368
25028	NC_008319	TGGC	2	8	1262349	1262356	0 %	25 %	50 %	25 %	113954368
25029	NC_008319	TTGA	2	8	1262381	1262388	25 %	50 %	25 %	0 %	113954368
25030	NC_008319	ACCGG	2	10	1262528	1262537	20 %	0 %	40 %	40 %	113954368
25031	NC_008319	GAC	2	6	1262570	1262575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954368
25032	NC_008319	GCC	2	6	1262666	1262671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954368
25033	NC_008319	TCA	2	6	1262784	1262789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954630
25034	NC_008319	TCA	2	6	1262805	1262810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954630
25035	NC_008319	CGGTT	2	10	1262823	1262832	0 %	40 %	40 %	20 %	113954630
25036	NC_008319	GT	3	6	1262864	1262869	0 %	50 %	50 %	0 %	113954630
25037	NC_008319	GTG	2	6	1262951	1262956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954630
25038	NC_008319	CAG	2	6	1263007	1263012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954630
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25040	NC_008319	CCA	2	6	1263182	1263187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954630
25041	NC_008319	GAT	2	6	1263211	1263216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954630
25042	NC_008319	CTTG	2	8	1263240	1263247	0 %	50 %	25 %	25 %	113954630
25043	NC_008319	CAA	2	6	1263256	1263261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954630
25044	NC_008319	GCA	2	6	1263264	1263269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954630
25045	NC_008319	AG	4	8	1263391	1263398	50 %	0 %	50 %	0 %	113954630
25046	NC_008319	CGAG	2	8	1263429	1263436	25 %	0 %	50 %	25 %	113954630
25047	NC_008319	GA	3	6	1263455	1263460	50 %	0 %	50 %	0 %	113954630
25048	NC_008319	AAG	2	6	1263484	1263489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954630
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25050	NC_008319	ATC	2	6	1263589	1263594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954630
25051	NC_008319	CCG	2	6	1263650	1263655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954630
25052	NC_008319	ATG	2	6	1263798	1263803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953378
25053	NC_008319	TTG	2	6	1263809	1263814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953378
25054	NC_008319	GTT	2	6	1263918	1263923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953378
25055	NC_008319	GTC	2	6	1263924	1263929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953378
25056	NC_008319	GATTT	2	10	1263957	1263966	20 %	60 %	20 %	0 %	113953378
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25059	NC_008319	ACT	2	6	1264408	1264413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953378
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25061	NC_008319	TCA	2	6	1264453	1264458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953378
25062	NC_008319	GAAC	2	8	1264472	1264479	50 %	0 %	25 %	25 %	113953378
25063	NC_008319	TCG	2	6	1264487	1264492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953378
25064	NC_008319	GT	3	6	1264502	1264507	0 %	50 %	50 %	0 %	113953378
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25073	NC_008319	AACA	2	8	1265194	1265201	75 %	0 %	0 %	25 %	113953378
25074	NC_008319	TG	3	6	1265237	1265242	0 %	50 %	50 %	0 %	113953378
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25085	NC_008319	T	6	6	1265974	1265979	0 %	100 %	0 %	0 %	113955288
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25088	NC_008319	GGA	2	6	1266033	1266038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953543
25089	NC_008319	GAG	2	6	1266075	1266080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953543
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25094	NC_008319	GA	3	6	1266408	1266413	50 %	0 %	50 %	0 %	113953543
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25097	NC_008319	ACG	2	6	1266664	1266669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953543
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25100	NC_008319	TGA	2	6	1266805	1266810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953543
25101	NC_008319	CAG	2	6	1266968	1266973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954756
25102	NC_008319	GCC	2	6	1267005	1267010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954756
25103	NC_008319	TTGCTG	2	12	1267122	1267133	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	113954756
25104	NC_008319	AGT	2	6	1267254	1267259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954756
25105	NC_008319	CAC	2	6	1267372	1267377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954756
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25107	NC_008319	CCA	2	6	1267395	1267400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954756
25108	NC_008319	CCAA	2	8	1267410	1267417	50 %	0 %	0 %	50 %	113954756
25109	NC_008319	GTC	2	6	1267451	1267456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954756
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25111	NC_008319	CAG	2	6	1267573	1267578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954756
25112	NC_008319	A	6	6	1267621	1267626	100 %	0 %	0 %	0 %	113954756
25113	NC_008319	TGT	2	6	1267796	1267801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954756
25114	NC_008319	CGG	2	6	1267850	1267855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952795
25115	NC_008319	CAT	2	6	1267857	1267862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952795
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25352	NC_008319	GCA	2	6	1279435	1279440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953218
25353	NC_008319	TGG	2	6	1279451	1279456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953218
25354	NC_008319	AAAG	2	8	1279516	1279523	75 %	0 %	25 %	0 %	113953218
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25361	NC_008319	G	6	6	1280182	1280187	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25362	NC_008319	AG	3	6	1280215	1280220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25363	NC_008319	TTC	2	6	1280259	1280264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954592
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25366	NC_008319	ATTT	2	8	1280364	1280371	25 %	75 %	0 %	0 %	113954592
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25391	NC_008319	AGTG	2	8	1281667	1281674	25 %	25 %	50 %	0 %	113954592
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25393	NC_008319	A	7	7	1281730	1281736	100 %	0 %	0 %	0 %	113955427
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25421	NC_008319	TTGG	2	8	1283435	1283442	0 %	50 %	50 %	0 %	113953089
25422	NC_008319	AAC	2	6	1283468	1283473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953089
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25435	NC_008319	TAG	2	6	1284319	1284324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954116
25436	NC_008319	ATA	2	6	1284333	1284338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954116
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25450	NC_008319	GGCGAT	2	12	1285266	1285277	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	113954736
25451	NC_008319	CTG	2	6	1285331	1285336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954736
25452	NC_008319	ATC	2	6	1285343	1285348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954736
25453	NC_008319	AAT	2	6	1285411	1285416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954736
25454	NC_008319	TC	3	6	1285444	1285449	0 %	50 %	0 %	50 %	113954736
25455	NC_008319	CTT	2	6	1285513	1285518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954736
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25457	NC_008319	TC	3	6	1285582	1285587	0 %	50 %	0 %	50 %	113954736
25458	NC_008319	TGA	2	6	1285608	1285613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954736
25459	NC_008319	CAT	2	6	1285615	1285620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954736
25460	NC_008319	GCA	2	6	1285627	1285632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954736
25461	NC_008319	CGTT	2	8	1285656	1285663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25462	NC_008319	GCTC	2	8	1285752	1285759	0 %	25 %	25 %	50 %	113955116
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25464	NC_008319	CACT	2	8	1285821	1285828	25 %	25 %	0 %	50 %	113955116
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25466	NC_008319	TGC	3	9	1285898	1285906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955116
25467	NC_008319	TGAC	2	8	1285947	1285954	25 %	25 %	25 %	25 %	113955116
25468	NC_008319	CTT	2	6	1286002	1286007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955116
25469	NC_008319	ATGT	2	8	1286098	1286105	25 %	50 %	25 %	0 %	113955116
25470	NC_008319	CTTG	2	8	1286149	1286156	0 %	50 %	25 %	25 %	113955116
25471	NC_008319	T	7	7	1286161	1286167	0 %	100 %	0 %	0 %	113955116
25472	NC_008319	GTA	2	6	1286188	1286193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955116
25473	NC_008319	GTT	2	6	1286211	1286216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955116
25474	NC_008319	GTTG	2	8	1286222	1286229	0 %	50 %	50 %	0 %	113955116
25475	NC_008319	CAACA	2	10	1286235	1286244	60 %	0 %	0 %	40 %	113955116
25476	NC_008319	TCC	3	9	1286252	1286260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955116
25477	NC_008319	CTCA	2	8	1286267	1286274	25 %	25 %	0 %	50 %	113955116
25478	NC_008319	TGA	2	6	1286277	1286282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955116
25479	NC_008319	CTA	2	6	1286302	1286307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955116
25480	NC_008319	TC	3	6	1286358	1286363	0 %	50 %	0 %	50 %	113955116
25481	NC_008319	TAA	2	6	1286499	1286504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955116
25482	NC_008319	ACC	2	6	1286556	1286561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955116
25483	NC_008319	CCT	2	6	1286603	1286608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955116
25484	NC_008319	CAC	2	6	1286612	1286617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955116
25485	NC_008319	CTG	2	6	1286644	1286649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955116
25486	NC_008319	TGTT	2	8	1286694	1286701	0 %	75 %	25 %	0 %	113955116
25487	NC_008319	AAG	2	6	1286711	1286716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955116
25488	NC_008319	GCCAG	2	10	1286787	1286796	20 %	0 %	40 %	40 %	113955116
25489	NC_008319	CATT	2	8	1286818	1286825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25490	NC_008319	GCAT	2	8	1286871	1286878	25 %	25 %	25 %	25 %	113952846
25491	NC_008319	TGG	2	6	1286897	1286902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952846
25492	NC_008319	GTT	2	6	1286929	1286934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952846
25493	NC_008319	CT	3	6	1286993	1286998	0 %	50 %	0 %	50 %	113952846
25494	NC_008319	CTGC	2	8	1287033	1287040	0 %	25 %	25 %	50 %	113952846
25495	NC_008319	ACA	2	6	1287057	1287062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952846
25496	NC_008319	ACC	2	6	1287101	1287106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952846
25497	NC_008319	TGC	2	6	1287133	1287138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952846
25498	NC_008319	TTGT	2	8	1287301	1287308	0 %	75 %	25 %	0 %	113953103
25499	NC_008319	TGC	2	6	1287321	1287326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953103
25500	NC_008319	ACG	2	6	1287350	1287355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953103

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