MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_008319	TCA	2	6	1233561	1233566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953391
24502	NC_008319	TCA	2	6	1233757	1233762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953391
24503	NC_008319	TCG	2	6	1233771	1233776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953391
24504	NC_008319	CAC	2	6	1233826	1233831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953391
24505	NC_008319	CCTG	2	8	1233865	1233872	0 %	25 %	25 %	50 %	113953391
24506	NC_008319	ACT	2	6	1233878	1233883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953391
24507	NC_008319	TGT	2	6	1233958	1233963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953391
24508	NC_008319	AAAC	2	8	1233997	1234004	75 %	0 %	0 %	25 %	113953391
24509	NC_008319	GTG	2	6	1234023	1234028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953391
24510	NC_008319	TTG	2	6	1234032	1234037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953391
24511	NC_008319	CGGTC	2	10	1234131	1234140	0 %	20 %	40 %	40 %	113953391
24512	NC_008319	ACA	2	6	1234144	1234149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953391
24513	NC_008319	GCC	2	6	1234154	1234159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953391
24514	NC_008319	TCTGGA	2	12	1234167	1234178	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113953391
24515	NC_008319	CGCA	2	8	1234181	1234188	25 %	0 %	25 %	50 %	113953391
24516	NC_008319	GCC	2	6	1234190	1234195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953391
24517	NC_008319	GGAA	2	8	1234287	1234294	50 %	0 %	50 %	0 %	113953391
24518	NC_008319	TCAC	2	8	1234331	1234338	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24519	NC_008319	CCG	2	6	1234443	1234448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954426
24520	NC_008319	CGAC	2	8	1234477	1234484	25 %	0 %	25 %	50 %	113954426
24521	NC_008319	TCA	2	6	1234508	1234513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954426
24522	NC_008319	ATT	2	6	1234591	1234596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954426
24523	NC_008319	GTG	2	6	1234629	1234634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954426
24524	NC_008319	TTG	2	6	1234638	1234643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954426
24525	NC_008319	CGT	2	6	1234683	1234688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24526	NC_008319	GTC	2	6	1234694	1234699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24527	NC_008319	ACG	2	6	1234747	1234752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24528	NC_008319	GCTC	2	8	1234796	1234803	0 %	25 %	25 %	50 %	113954426
24529	NC_008319	TGC	2	6	1234807	1234812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24530	NC_008319	TCA	2	6	1234864	1234869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954426
24531	NC_008319	GAC	2	6	1234899	1234904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24532	NC_008319	CTG	2	6	1234983	1234988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24533	NC_008319	GA	3	6	1235093	1235098	50 %	0 %	50 %	0 %	113954426
24534	NC_008319	CAC	2	6	1235162	1235167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954426
24535	NC_008319	GCT	2	6	1235246	1235251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24536	NC_008319	TC	3	6	1235312	1235317	0 %	50 %	0 %	50 %	113954426
24537	NC_008319	GTG	2	6	1235325	1235330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954426
24538	NC_008319	CAC	2	6	1235354	1235359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954426
24539	NC_008319	GGTT	2	8	1235422	1235429	0 %	50 %	50 %	0 %	113954426
24540	NC_008319	TGGC	2	8	1235451	1235458	0 %	25 %	50 %	25 %	113954426
24541	NC_008319	AC	3	6	1235578	1235583	50 %	0 %	0 %	50 %	113954426
24542	NC_008319	TGT	2	6	1235683	1235688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954426
24543	NC_008319	GCA	2	6	1235695	1235700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24544	NC_008319	AG	3	6	1235708	1235713	50 %	0 %	50 %	0 %	113954426
24545	NC_008319	ACT	2	6	1235752	1235757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954426
24546	NC_008319	TGG	2	6	1235763	1235768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954426
24547	NC_008319	AG	3	6	1235769	1235774	50 %	0 %	50 %	0 %	113954426
24548	NC_008319	GGA	2	6	1235840	1235845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954426
24549	NC_008319	CTG	3	9	1235868	1235876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24550	NC_008319	CAGCC	2	10	1235898	1235907	20 %	0 %	20 %	60 %	113954426
24551	NC_008319	GATCA	2	10	1235922	1235931	40 %	20 %	20 %	20 %	113954426
24552	NC_008319	TCC	2	6	1235954	1235959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954426
24553	NC_008319	AGG	2	6	1235995	1236000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954426
24554	NC_008319	CAAGC	2	10	1236162	1236171	40 %	0 %	20 %	40 %	113954426
24555	NC_008319	ACC	2	6	1236196	1236201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954426
24556	NC_008319	TGC	2	6	1236290	1236295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24557	NC_008319	AGC	2	6	1236316	1236321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24558	NC_008319	TCA	2	6	1236369	1236374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954426
24559	NC_008319	ATCC	2	8	1236379	1236386	25 %	25 %	0 %	50 %	113954426
24560	NC_008319	GCT	2	6	1236390	1236395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24561	NC_008319	AGG	2	6	1236460	1236465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954426
24562	NC_008319	CGAT	2	8	1236510	1236517	25 %	25 %	25 %	25 %	113954426
24563	NC_008319	CTG	2	6	1236531	1236536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24564	NC_008319	GGT	2	6	1236558	1236563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954426
24565	NC_008319	GGT	2	6	1236593	1236598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954426
24566	NC_008319	GCT	2	6	1236705	1236710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24567	NC_008319	GCA	2	6	1236791	1236796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24568	NC_008319	TGC	2	6	1236826	1236831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24569	NC_008319	TTG	2	6	1236858	1236863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954426
24570	NC_008319	CCTT	2	8	1236889	1236896	0 %	50 %	0 %	50 %	113954426
24571	NC_008319	GCT	2	6	1236897	1236902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24572	NC_008319	GAC	2	6	1236910	1236915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24573	NC_008319	GTC	2	6	1236952	1236957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24574	NC_008319	AGGA	2	8	1237078	1237085	50 %	0 %	50 %	0 %	113954426
24575	NC_008319	TGG	2	6	1237213	1237218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954426
24576	NC_008319	TGGGT	2	10	1237315	1237324	0 %	40 %	60 %	0 %	113954426
24577	NC_008319	AAC	2	6	1237495	1237500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954426
24578	NC_008319	ACG	2	6	1237537	1237542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24579	NC_008319	TCC	2	6	1237606	1237611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954426
24580	NC_008319	TGA	2	6	1237649	1237654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954426
24581	NC_008319	CTA	2	6	1237655	1237660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954426
24582	NC_008319	CATT	2	8	1237757	1237764	25 %	50 %	0 %	25 %	113954426
24583	NC_008319	GGT	2	6	1237787	1237792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954426
24584	NC_008319	ACG	2	6	1237894	1237899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24585	NC_008319	GCT	2	6	1237952	1237957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954426
24586	NC_008319	AG	3	6	1237961	1237966	50 %	0 %	50 %	0 %	113954426
24587	NC_008319	AGG	2	6	1237983	1237988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954426
24588	NC_008319	TTC	2	6	1238098	1238103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954426
24589	NC_008319	GAG	2	6	1238109	1238114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954426
24590	NC_008319	AGG	2	6	1238126	1238131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954426
24591	NC_008319	GATC	3	12	1238169	1238180	25 %	25 %	25 %	25 %	113953930
24592	NC_008319	TGA	2	6	1238188	1238193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953930
24593	NC_008319	CTT	2	6	1238253	1238258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953930
24594	NC_008319	T	7	7	1238373	1238379	0 %	100 %	0 %	0 %	113953930
24595	NC_008319	A	6	6	1238403	1238408	100 %	0 %	0 %	0 %	113953930
24596	NC_008319	CGG	2	6	1238526	1238531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953930
24597	NC_008319	GCG	2	6	1238545	1238550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953930
24598	NC_008319	AGG	3	9	1238589	1238597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953930
24599	NC_008319	CGT	2	6	1238667	1238672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953930
24600	NC_008319	CAG	2	6	1238689	1238694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953930
24601	NC_008319	T	6	6	1238801	1238806	0 %	100 %	0 %	0 %	113955217
24602	NC_008319	TCGA	2	8	1238816	1238823	25 %	25 %	25 %	25 %	113955217
24603	NC_008319	GTT	2	6	1238853	1238858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955217
24604	NC_008319	GTCGTA	2	12	1238863	1238874	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113955217
24605	NC_008319	CAC	2	6	1238883	1238888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955217
24606	NC_008319	ATCA	2	8	1238914	1238921	50 %	25 %	0 %	25 %	113955217
24607	NC_008319	GCA	2	6	1239029	1239034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955217
24608	NC_008319	CGC	2	6	1239036	1239041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955217
24609	NC_008319	CAA	2	6	1239052	1239057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955217
24610	NC_008319	AAC	2	6	1239102	1239107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955217
24611	NC_008319	GTG	2	6	1239217	1239222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955217
24612	NC_008319	GCT	2	6	1239417	1239422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952751
24613	NC_008319	TGC	2	6	1239500	1239505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952751
24614	NC_008319	ACC	2	6	1239531	1239536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952751
24615	NC_008319	CAC	2	6	1239542	1239547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952751
24616	NC_008319	CAA	2	6	1239665	1239670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952751
24617	NC_008319	TGC	2	6	1239705	1239710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952751
24618	NC_008319	GTG	2	6	1239774	1239779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952751
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24731	NC_008319	TCA	2	6	1245662	1245667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953038
24732	NC_008319	GCAT	2	8	1245670	1245677	25 %	25 %	25 %	25 %	113953038
24733	NC_008319	GCA	2	6	1245698	1245703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953038
24734	NC_008319	TCG	2	6	1245712	1245717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953038
24735	NC_008319	TGT	2	6	1245721	1245726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953038
24736	NC_008319	TTG	2	6	1245756	1245761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953038
24737	NC_008319	TGGA	2	8	1245766	1245773	25 %	25 %	50 %	0 %	113953038
24738	NC_008319	CCG	2	6	1245775	1245780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953038
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24808	NC_008319	CTG	2	6	1250228	1250233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955130
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24816	NC_008319	GCT	2	6	1250504	1250509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954305
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24829	NC_008319	TTGA	2	8	1250880	1250887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24830	NC_008319	ACA	2	6	1250959	1250964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24832	NC_008319	TGC	2	6	1251088	1251093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24833	NC_008319	CG	3	6	1251212	1251217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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24836	NC_008319	TCA	2	6	1251403	1251408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24837	NC_008319	TC	3	6	1251430	1251435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24838	NC_008319	ACG	2	6	1251507	1251512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24841	NC_008319	CTT	2	6	1251642	1251647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954138
24842	NC_008319	AT	3	6	1251659	1251664	50 %	50 %	0 %	0 %	113954138
24843	NC_008319	GTG	2	6	1251706	1251711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954138
24844	NC_008319	AATA	2	8	1251788	1251795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24845	NC_008319	TTG	3	9	1251808	1251816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24846	NC_008319	TAGT	2	8	1251841	1251848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24847	NC_008319	TTC	2	6	1251875	1251880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955282
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