MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_008319	TTC	2	6	1206708	1206713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953987
24003	NC_008319	AAG	2	6	1206823	1206828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953987
24004	NC_008319	CAG	2	6	1206854	1206859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953987
24005	NC_008319	ATG	2	6	1206865	1206870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953987
24006	NC_008319	CAG	2	6	1206912	1206917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953987
24007	NC_008319	AG	3	6	1207254	1207259	50 %	0 %	50 %	0 %	113953987
24008	NC_008319	GTCG	2	8	1207280	1207287	0 %	25 %	50 %	25 %	113953987
24009	NC_008319	GTA	2	6	1207290	1207295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953987
24010	NC_008319	TAA	2	6	1207317	1207322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953987
24011	NC_008319	GCC	2	6	1207324	1207329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953987
24012	NC_008319	CCA	2	6	1207431	1207436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953284
24013	NC_008319	AGC	2	6	1207468	1207473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953284
24014	NC_008319	CG	3	6	1207502	1207507	0 %	0 %	50 %	50 %	113953284
24015	NC_008319	GTG	2	6	1207540	1207545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953284
24016	NC_008319	GGA	2	6	1207561	1207566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953284
24017	NC_008319	TCCA	2	8	1207611	1207618	25 %	25 %	0 %	50 %	113953284
24018	NC_008319	TC	4	8	1207635	1207642	0 %	50 %	0 %	50 %	113953284
24019	NC_008319	CCGG	2	8	1207671	1207678	0 %	0 %	50 %	50 %	113953284
24020	NC_008319	TGC	2	6	1207679	1207684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953284
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24026	NC_008319	TTTC	3	12	1207925	1207936	0 %	75 %	0 %	25 %	113953284
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24032	NC_008319	CAT	2	6	1208091	1208096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953284
24033	NC_008319	TTGAG	2	10	1208308	1208317	20 %	40 %	40 %	0 %	113955385
24034	NC_008319	TTGAT	2	10	1208337	1208346	20 %	60 %	20 %	0 %	113955385
24035	NC_008319	ACA	2	6	1208381	1208386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955385
24036	NC_008319	TCA	2	6	1208528	1208533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955385
24037	NC_008319	G	6	6	1208539	1208544	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24038	NC_008319	TCC	2	6	1208608	1208613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954717
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24040	NC_008319	GGCG	2	8	1208724	1208731	0 %	0 %	75 %	25 %	113954717
24041	NC_008319	CT	3	6	1208821	1208826	0 %	50 %	0 %	50 %	113954717
24042	NC_008319	CGA	2	6	1208986	1208991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954717
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24052	NC_008319	GCT	2	6	1209709	1209714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954552
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24055	NC_008319	ACG	2	6	1209737	1209742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954552
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24059	NC_008319	ATTT	2	8	1210034	1210041	25 %	75 %	0 %	0 %	113954552
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24062	NC_008319	GTTT	2	8	1210126	1210133	0 %	75 %	25 %	0 %	113954552
24063	NC_008319	TTG	2	6	1210134	1210139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954552
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24072	NC_008319	TTG	2	6	1210913	1210918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953658
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24075	NC_008319	T	6	6	1211101	1211106	0 %	100 %	0 %	0 %	113953658
24076	NC_008319	CTG	2	6	1211121	1211126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953658
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24078	NC_008319	CGT	2	6	1211241	1211246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953658
24079	NC_008319	CGA	2	6	1211399	1211404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953658
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24089	NC_008319	GCTG	2	8	1211728	1211735	0 %	25 %	50 %	25 %	113953658
24090	NC_008319	CAG	2	6	1211775	1211780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953658
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24100	NC_008319	AT	3	6	1212314	1212319	50 %	50 %	0 %	0 %	113954696
24101	NC_008319	CAG	2	6	1212354	1212359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954696
24102	NC_008319	TGA	2	6	1212426	1212431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954696
24103	NC_008319	TTCC	2	8	1212479	1212486	0 %	50 %	0 %	50 %	113954696
24104	NC_008319	CAT	2	6	1212507	1212512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954696
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24106	NC_008319	AGC	2	6	1212572	1212577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954696
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24115	NC_008319	G	6	6	1213183	1213188	0 %	0 %	100 %	0 %	113955060
24116	NC_008319	AGC	2	6	1213207	1213212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955060
24117	NC_008319	AGA	2	6	1213223	1213228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955060
24118	NC_008319	T	6	6	1213230	1213235	0 %	100 %	0 %	0 %	113955060
24119	NC_008319	GTG	2	6	1213266	1213271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955060
24120	NC_008319	TTG	3	9	1213341	1213349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955060
24121	NC_008319	G	6	6	1213418	1213423	0 %	0 %	100 %	0 %	113955060
24122	NC_008319	CAGC	2	8	1213538	1213545	25 %	0 %	25 %	50 %	113955060
24123	NC_008319	CG	3	6	1213588	1213593	0 %	0 %	50 %	50 %	113955060
24124	NC_008319	GAT	2	6	1213670	1213675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955060
24125	NC_008319	TTGA	2	8	1213689	1213696	25 %	50 %	25 %	0 %	113955060
24126	NC_008319	GCT	2	6	1213703	1213708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955060
24127	NC_008319	GAC	2	6	1213715	1213720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955060
24128	NC_008319	ATG	2	6	1213750	1213755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955060
24129	NC_008319	GCT	2	6	1213926	1213931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955060
24130	NC_008319	GCT	2	6	1214007	1214012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955060
24131	NC_008319	GCG	2	6	1214019	1214024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955060
24132	NC_008319	CTT	2	6	1214073	1214078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955060
24133	NC_008319	AC	3	6	1214134	1214139	50 %	0 %	0 %	50 %	113955060
24134	NC_008319	CAA	2	6	1214160	1214165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955060
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24137	NC_008319	TTG	2	6	1214289	1214294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955060
24138	NC_008319	TGG	2	6	1214306	1214311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955060
24139	NC_008319	GAACTG	2	12	1214316	1214327	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113955060
24140	NC_008319	GTGG	2	8	1214328	1214335	0 %	25 %	75 %	0 %	113955060
24141	NC_008319	CCG	2	6	1214336	1214341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955060
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24144	NC_008319	GCC	2	6	1214586	1214591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952971
24145	NC_008319	GTC	2	6	1214606	1214611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952971
24146	NC_008319	AGC	2	6	1214663	1214668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952971
24147	NC_008319	CAAAC	2	10	1214692	1214701	60 %	0 %	0 %	40 %	113952971
24148	NC_008319	CTG	2	6	1214702	1214707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952971
24149	NC_008319	TCT	2	6	1214721	1214726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952971
24150	NC_008319	TCT	2	6	1214805	1214810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952971
24151	NC_008319	ACA	2	6	1214841	1214846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952971
24152	NC_008319	GCG	2	6	1214858	1214863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952971
24153	NC_008319	AGG	2	6	1214887	1214892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952971
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24172	NC_008319	GCT	2	6	1215937	1215942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952971
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24175	NC_008319	GCCA	2	8	1216143	1216150	25 %	0 %	25 %	50 %	113952971
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24178	NC_008319	AGCTC	2	10	1216335	1216344	20 %	20 %	20 %	40 %	113952971
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24180	NC_008319	GC	3	6	1216421	1216426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24181	NC_008319	TGC	2	6	1216429	1216434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24182	NC_008319	CGA	2	6	1216447	1216452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24183	NC_008319	GA	3	6	1216505	1216510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24184	NC_008319	GCA	2	6	1216550	1216555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953413
24185	NC_008319	GCT	3	9	1216598	1216606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953413
24186	NC_008319	GAC	2	6	1216625	1216630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953413
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24188	NC_008319	CTCG	2	8	1216646	1216653	0 %	25 %	25 %	50 %	113953413
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24194	NC_008319	TTG	2	6	1216815	1216820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954048
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24202	NC_008319	TGT	2	6	1217310	1217315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954961
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24207	NC_008319	GCCT	2	8	1217546	1217553	0 %	25 %	25 %	50 %	113954961
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24216	NC_008319	CTCC	2	8	1217822	1217829	0 %	25 %	0 %	75 %	113954961
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24226	NC_008319	GGAT	2	8	1218539	1218546	25 %	25 %	50 %	0 %	113954961
24227	NC_008319	CTT	2	6	1218547	1218552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954961
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24229	NC_008319	AGG	2	6	1218636	1218641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954961
24230	NC_008319	GCA	2	6	1218654	1218659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954961
24231	NC_008319	CGT	2	6	1218676	1218681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954961
24232	NC_008319	GAT	2	6	1218742	1218747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954961
24233	NC_008319	GTT	2	6	1218863	1218868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954961
24234	NC_008319	GA	3	6	1218908	1218913	50 %	0 %	50 %	0 %	113954961
24235	NC_008319	CCA	2	6	1218974	1218979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954961
24236	NC_008319	GACC	2	8	1219063	1219070	25 %	0 %	25 %	50 %	113954961
24237	NC_008319	GAC	2	6	1219078	1219083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954961
24238	NC_008319	GTG	3	9	1219114	1219122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954961
24239	NC_008319	TGT	2	6	1219163	1219168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954961
24240	NC_008319	CCTT	2	8	1219261	1219268	0 %	50 %	0 %	50 %	113954961
24241	NC_008319	GA	4	8	1219297	1219304	50 %	0 %	50 %	0 %	113954961
24242	NC_008319	CTG	2	6	1219337	1219342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954961
24243	NC_008319	GTTGA	2	10	1219390	1219399	20 %	40 %	40 %	0 %	113954961
24244	NC_008319	AGG	2	6	1219413	1219418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954961
24245	NC_008319	TGA	2	6	1219428	1219433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954961
24246	NC_008319	TGA	2	6	1219488	1219493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954961
24247	NC_008319	GTT	2	6	1219599	1219604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954400
24248	NC_008319	A	6	6	1219610	1219615	100 %	0 %	0 %	0 %	113954400
24249	NC_008319	GGGC	2	8	1219724	1219731	0 %	0 %	75 %	25 %	113954400
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24253	NC_008319	GCA	2	6	1219944	1219949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954400
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24259	NC_008319	CGATG	2	10	1220458	1220467	20 %	20 %	40 %	20 %	113954400
24260	NC_008319	GTA	2	6	1220480	1220485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954400
24261	NC_008319	GCA	2	6	1220512	1220517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954400
24262	NC_008319	GTT	2	6	1220561	1220566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954400
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24265	NC_008319	CCT	2	6	1220797	1220802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954400
24266	NC_008319	TGA	2	6	1220893	1220898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954400
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24268	NC_008319	CGAT	2	8	1220979	1220986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24269	NC_008319	GTT	2	6	1221025	1221030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953091
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24280	NC_008319	ATCTC	2	10	1221548	1221557	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24281	NC_008319	TGA	2	6	1221570	1221575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24283	NC_008319	GCA	2	6	1221666	1221671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24284	NC_008319	GCAA	2	8	1221685	1221692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24285	NC_008319	TTGA	2	8	1221770	1221777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24286	NC_008319	CAG	2	6	1221904	1221909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24287	NC_008319	T	6	6	1222009	1222014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24288	NC_008319	CTTC	2	8	1222036	1222043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24289	NC_008319	TTG	2	6	1222063	1222068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24290	NC_008319	GAC	2	6	1222074	1222079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24293	NC_008319	GCA	2	6	1222291	1222296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953929
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24312	NC_008319	TCG	2	6	1223271	1223276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953929
24313	NC_008319	GAT	2	6	1223290	1223295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953929
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24315	NC_008319	AAATG	2	10	1223351	1223360	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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24338	NC_008319	TTGG	2	8	1224772	1224779	0 %	50 %	50 %	0 %	113953717
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24341	NC_008319	GT	3	6	1225147	1225152	0 %	50 %	50 %	0 %	113955016
24342	NC_008319	TGC	2	6	1225160	1225165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955016
24343	NC_008319	TGC	2	6	1225275	1225280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955016
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24346	NC_008319	GC	3	6	1225375	1225380	0 %	0 %	50 %	50 %	113954672
24347	NC_008319	CTG	2	6	1225562	1225567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954672
24348	NC_008319	TGTC	2	8	1225596	1225603	0 %	50 %	25 %	25 %	113954672
24349	NC_008319	CAGCTC	2	12	1225626	1225637	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113954672
24350	NC_008319	GTC	2	6	1225709	1225714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954672
24351	NC_008319	CTC	2	6	1225763	1225768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954672
24352	NC_008319	GCA	2	6	1225828	1225833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954672
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24354	NC_008319	ATC	2	6	1225866	1225871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954672
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24357	NC_008319	GAA	2	6	1225984	1225989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24358	NC_008319	TCCT	2	8	1226011	1226018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24359	NC_008319	GCA	2	6	1226184	1226189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953442
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24362	NC_008319	TGCT	2	8	1226330	1226337	0 %	50 %	25 %	25 %	113953442
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24388	NC_008319	GGA	2	6	1227681	1227686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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24449	NC_008319	CCTT	2	8	1231277	1231284	0 %	50 %	0 %	50 %	113955505
24450	NC_008319	ATG	2	6	1231319	1231324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955505
24451	NC_008319	TTC	2	6	1231339	1231344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955505
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24453	NC_008319	TGA	2	6	1231515	1231520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955505
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24456	NC_008319	GCA	2	6	1231610	1231615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955505
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24458	NC_008319	TCT	2	6	1231724	1231729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955505
24459	NC_008319	AAGTGC	2	12	1231750	1231761	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113955505
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24461	NC_008319	TCGCAA	2	12	1231821	1231832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113955505
24462	NC_008319	GCCAT	2	10	1231853	1231862	20 %	20 %	20 %	40 %	113955505
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24464	NC_008319	A	6	6	1231925	1231930	100 %	0 %	0 %	0 %	113955505
24465	NC_008319	TCA	2	6	1231934	1231939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955505
24466	NC_008319	GTTG	2	8	1231951	1231958	0 %	50 %	50 %	0 %	113955505
24467	NC_008319	ACC	2	6	1231975	1231980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955505
24468	NC_008319	GCCT	2	8	1231993	1232000	0 %	25 %	25 %	50 %	113955505
24469	NC_008319	T	6	6	1232004	1232009	0 %	100 %	0 %	0 %	113955505
24470	NC_008319	TG	3	6	1232127	1232132	0 %	50 %	50 %	0 %	113955505
24471	NC_008319	AAT	2	6	1232192	1232197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955505
24472	NC_008319	T	6	6	1232206	1232211	0 %	100 %	0 %	0 %	113955505
24473	NC_008319	ATG	2	6	1232240	1232245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955505
24474	NC_008319	GAAT	2	8	1232248	1232255	50 %	25 %	25 %	0 %	113955505
24475	NC_008319	GAC	2	6	1232288	1232293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955505
24476	NC_008319	GCG	2	6	1232294	1232299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955505
24477	NC_008319	TC	3	6	1232320	1232325	0 %	50 %	0 %	50 %	113955505
24478	NC_008319	TGA	2	6	1232330	1232335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955505
24479	NC_008319	GAG	2	6	1232369	1232374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955505
24480	NC_008319	AG	3	6	1232380	1232385	50 %	0 %	50 %	0 %	113955505
24481	NC_008319	TGC	2	6	1232386	1232391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955505
24482	NC_008319	GTT	2	6	1232405	1232410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955505
24483	NC_008319	CCA	2	6	1232420	1232425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955505
24484	NC_008319	CCACC	2	10	1232502	1232511	20 %	0 %	0 %	80 %	113955505
24485	NC_008319	CAA	2	6	1232658	1232663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955505
24486	NC_008319	CCA	2	6	1232682	1232687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955505
24487	NC_008319	GCG	2	6	1232731	1232736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955505
24488	NC_008319	CGC	2	6	1232739	1232744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955505
24489	NC_008319	GAA	2	6	1232790	1232795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955505
24490	NC_008319	ATG	2	6	1232813	1232818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955505
24491	NC_008319	TGG	2	6	1232916	1232921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955505
24492	NC_008319	CAG	2	6	1232994	1232999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955505
24493	NC_008319	TTG	2	6	1233005	1233010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955505
24494	NC_008319	GAC	2	6	1233049	1233054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955505
24495	NC_008319	ACC	2	6	1233146	1233151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955505
24496	NC_008319	CTG	2	6	1233211	1233216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955505
24497	NC_008319	CATTC	2	10	1233345	1233354	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24498	NC_008319	CTTC	2	8	1233435	1233442	0 %	50 %	0 %	50 %	113953391
24499	NC_008319	CATC	2	8	1233472	1233479	25 %	25 %	0 %	50 %	113953391
24500	NC_008319	CGC	2	6	1233536	1233541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953391

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