MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_008319	CGT	2	6	1180281	1180286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955293
23503	NC_008319	TCCCCT	2	12	1180427	1180438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954719
23504	NC_008319	GCT	2	6	1180492	1180497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954719
23505	NC_008319	GCT	2	6	1180586	1180591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954719
23506	NC_008319	AACAGG	2	12	1180597	1180608	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	113954719
23507	NC_008319	TGG	2	6	1180783	1180788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954719
23508	NC_008319	GTTG	2	8	1180837	1180844	0 %	50 %	50 %	0 %	113954719
23509	NC_008319	TGA	2	6	1180918	1180923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954719
23510	NC_008319	CGG	2	6	1180964	1180969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954719
23511	NC_008319	TCG	2	6	1180990	1180995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954719
23512	NC_008319	CCAA	2	8	1181091	1181098	50 %	0 %	0 %	50 %	113954719
23513	NC_008319	GTT	2	6	1181120	1181125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954719
23514	NC_008319	GGTGTT	2	12	1181194	1181205	0 %	50 %	50 %	0 %	113954719
23515	NC_008319	CGT	2	6	1181233	1181238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954719
23516	NC_008319	CAGC	2	8	1181248	1181255	25 %	0 %	25 %	50 %	113954719
23517	NC_008319	GCA	2	6	1181270	1181275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954719
23518	NC_008319	GGAT	2	8	1181329	1181336	25 %	25 %	50 %	0 %	113954719
23519	NC_008319	TTG	2	6	1181349	1181354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954719
23520	NC_008319	TGC	2	6	1181365	1181370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954719
23521	NC_008319	CAG	2	6	1181387	1181392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954719
23522	NC_008319	GCATC	2	10	1181443	1181452	20 %	20 %	20 %	40 %	113954719
23523	NC_008319	GCCAT	2	10	1181481	1181490	20 %	20 %	20 %	40 %	113954719
23524	NC_008319	CT	3	6	1181491	1181496	0 %	50 %	0 %	50 %	113954719
23525	NC_008319	TGC	2	6	1181500	1181505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954719
23526	NC_008319	CTC	2	6	1181601	1181606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954719
23527	NC_008319	CGC	2	6	1181633	1181638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954719
23528	NC_008319	GGT	2	6	1181642	1181647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954719
23529	NC_008319	TCG	2	6	1181648	1181653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954719
23530	NC_008319	TCG	2	6	1181689	1181694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954719
23531	NC_008319	GCA	2	6	1181737	1181742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955332
23532	NC_008319	GTT	2	6	1181750	1181755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955332
23533	NC_008319	ACG	2	6	1181836	1181841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955332
23534	NC_008319	GGA	2	6	1181878	1181883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955332
23535	NC_008319	CCT	2	6	1181887	1181892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955332
23536	NC_008319	CGG	2	6	1181924	1181929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955332
23537	NC_008319	CTC	2	6	1181934	1181939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955332
23538	NC_008319	TCGA	2	8	1181946	1181953	25 %	25 %	25 %	25 %	113955332
23539	NC_008319	GGA	2	6	1181969	1181974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955332
23540	NC_008319	TGG	2	6	1182070	1182075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955332
23541	NC_008319	TGCG	2	8	1182092	1182099	0 %	25 %	50 %	25 %	113955332
23542	NC_008319	TCA	2	6	1182131	1182136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955332
23543	NC_008319	CTG	2	6	1182176	1182181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955332
23544	NC_008319	TCAA	2	8	1182184	1182191	50 %	25 %	0 %	25 %	113955332
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23548	NC_008319	T	6	6	1182454	1182459	0 %	100 %	0 %	0 %	113955332
23549	NC_008319	CCA	3	9	1182479	1182487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955332
23550	NC_008319	CAGGT	2	10	1182492	1182501	20 %	20 %	40 %	20 %	113955332
23551	NC_008319	GTT	3	9	1182515	1182523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955332
23552	NC_008319	CTTG	2	8	1182536	1182543	0 %	50 %	25 %	25 %	113955332
23553	NC_008319	TGGCTT	2	12	1182581	1182592	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	113955332
23554	NC_008319	GAG	2	6	1182741	1182746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23555	NC_008319	CAC	2	6	1182811	1182816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955164
23556	NC_008319	GCT	2	6	1182878	1182883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955164
23557	NC_008319	AGCC	2	8	1182914	1182921	25 %	0 %	25 %	50 %	113955164
23558	NC_008319	TGGC	2	8	1182947	1182954	0 %	25 %	50 %	25 %	113955164
23559	NC_008319	GGT	2	6	1183017	1183022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955164
23560	NC_008319	GAC	2	6	1183038	1183043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955164
23561	NC_008319	TGGT	2	8	1183203	1183210	0 %	50 %	50 %	0 %	113955164
23562	NC_008319	GCT	2	6	1183232	1183237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955164
23563	NC_008319	AACGG	2	10	1183280	1183289	40 %	0 %	40 %	20 %	113955164
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23566	NC_008319	ATCG	2	8	1183426	1183433	25 %	25 %	25 %	25 %	113955164
23567	NC_008319	GCT	2	6	1183466	1183471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955164
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23569	NC_008319	TTC	2	6	1183545	1183550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955164
23570	NC_008319	CGCT	2	8	1183637	1183644	0 %	25 %	25 %	50 %	113955164
23571	NC_008319	AGC	2	6	1183700	1183705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955164
23572	NC_008319	TCT	2	6	1183820	1183825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955164
23573	NC_008319	GA	3	6	1183886	1183891	50 %	0 %	50 %	0 %	113955164
23574	NC_008319	ACCA	2	8	1183909	1183916	50 %	0 %	0 %	50 %	113955164
23575	NC_008319	CATT	2	8	1184007	1184014	25 %	50 %	0 %	25 %	113955164
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23579	NC_008319	AATTG	2	10	1184342	1184351	40 %	40 %	20 %	0 %	113952902
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23583	NC_008319	GGT	2	6	1184736	1184741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952902
23584	NC_008319	ACC	2	6	1184778	1184783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952902
23585	NC_008319	TCC	2	6	1184814	1184819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952902
23586	NC_008319	GCA	2	6	1184848	1184853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952902
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23588	NC_008319	ATC	2	6	1184901	1184906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952902
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23594	NC_008319	TG	3	6	1185130	1185135	0 %	50 %	50 %	0 %	113952902
23595	NC_008319	GAGC	2	8	1185158	1185165	25 %	0 %	50 %	25 %	113952902
23596	NC_008319	TCGT	2	8	1185304	1185311	0 %	50 %	25 %	25 %	113952902
23597	NC_008319	AC	3	6	1185377	1185382	50 %	0 %	0 %	50 %	113952902
23598	NC_008319	GAA	2	6	1185476	1185481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952902
23599	NC_008319	GT	3	6	1185506	1185511	0 %	50 %	50 %	0 %	113952902
23600	NC_008319	GGT	2	6	1185602	1185607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23601	NC_008319	AACG	2	8	1185645	1185652	50 %	0 %	25 %	25 %	113954921
23602	NC_008319	GGT	2	6	1185657	1185662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954921
23603	NC_008319	GCA	2	6	1185741	1185746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954921
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23606	NC_008319	GAA	2	6	1185993	1185998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954921
23607	NC_008319	CTGG	2	8	1186041	1186048	0 %	25 %	50 %	25 %	113954921
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23610	NC_008319	T	6	6	1186191	1186196	0 %	100 %	0 %	0 %	113954921
23611	NC_008319	CAGA	2	8	1186197	1186204	50 %	0 %	25 %	25 %	113954921
23612	NC_008319	A	6	6	1186215	1186220	100 %	0 %	0 %	0 %	113954921
23613	NC_008319	AAG	2	6	1186262	1186267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954921
23614	NC_008319	TTG	2	6	1186304	1186309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954921
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23616	NC_008319	CTG	2	6	1186491	1186496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954921
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