MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_008319	ACAGG	2	10	1080461	1080470	40 %	0 %	40 %	20 %	113954521
21502	NC_008319	GTA	2	6	1080570	1080575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953150
21503	NC_008319	CGTT	2	8	1080580	1080587	0 %	50 %	25 %	25 %	113953150
21504	NC_008319	CAAT	2	8	1080605	1080612	50 %	25 %	0 %	25 %	113953150
21505	NC_008319	CTT	2	6	1080653	1080658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953150
21506	NC_008319	CTT	3	9	1080680	1080688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953150
21507	NC_008319	CTTGA	2	10	1080720	1080729	20 %	40 %	20 %	20 %	113953150
21508	NC_008319	ACC	2	6	1080741	1080746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953150
21509	NC_008319	ACCA	2	8	1080754	1080761	50 %	0 %	0 %	50 %	113953150
21510	NC_008319	TCA	2	6	1080781	1080786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953150
21511	NC_008319	TCG	2	6	1080820	1080825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953150
21512	NC_008319	GATT	2	8	1080887	1080894	25 %	50 %	25 %	0 %	113952857
21513	NC_008319	CTG	3	9	1080901	1080909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952857
21514	NC_008319	CTC	2	6	1080974	1080979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952857
21515	NC_008319	CCA	2	6	1081002	1081007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952857
21516	NC_008319	TCG	2	6	1081088	1081093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952857
21517	NC_008319	CAA	2	6	1081180	1081185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952857
21518	NC_008319	AGC	2	6	1081243	1081248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952857
21519	NC_008319	AGATCA	2	12	1081346	1081357	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	113952857
21520	NC_008319	CAG	4	12	1081416	1081427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952857
21521	NC_008319	TGG	2	6	1081456	1081461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952857
21522	NC_008319	CTCA	2	8	1081486	1081493	25 %	25 %	0 %	50 %	113952857
21523	NC_008319	TGG	2	6	1081494	1081499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952857
21524	NC_008319	TGA	2	6	1081552	1081557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21525	NC_008319	CGG	2	6	1081620	1081625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953489
21526	NC_008319	TCG	2	6	1081634	1081639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953489
21527	NC_008319	TCC	2	6	1081642	1081647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953489
21528	NC_008319	GAA	2	6	1082070	1082075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953489
21529	NC_008319	AGC	2	6	1082100	1082105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953489
21530	NC_008319	ATT	2	6	1082115	1082120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953489
21531	NC_008319	GGA	2	6	1082151	1082156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953489
21532	NC_008319	GAG	2	6	1082172	1082177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953489
21533	NC_008319	TTGA	2	8	1082229	1082236	25 %	50 %	25 %	0 %	113953489
21534	NC_008319	GGAA	2	8	1082254	1082261	50 %	0 %	50 %	0 %	113953489
21535	NC_008319	GTG	2	6	1082298	1082303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953489
21536	NC_008319	GCA	2	6	1082311	1082316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953489
21537	NC_008319	ATCG	2	8	1082417	1082424	25 %	25 %	25 %	25 %	113953489
21538	NC_008319	TGG	2	6	1082453	1082458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953489
21539	NC_008319	CTG	2	6	1082485	1082490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953489
21540	NC_008319	GTG	3	9	1082499	1082507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953489
21541	NC_008319	CTC	2	6	1082534	1082539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953489
21542	NC_008319	CCA	2	6	1082662	1082667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953489
21543	NC_008319	GTT	2	6	1082779	1082784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953489
21544	NC_008319	G	9	9	1082839	1082847	0 %	0 %	100 %	0 %	113953489
21545	NC_008319	ACCG	2	8	1082848	1082855	25 %	0 %	25 %	50 %	113953489
21546	NC_008319	TGT	2	6	1082938	1082943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953489
21547	NC_008319	TGA	2	6	1083065	1083070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953489
21548	NC_008319	TTG	2	6	1083127	1083132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953489
21549	NC_008319	TGC	2	6	1083209	1083214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953489
21550	NC_008319	TCC	2	6	1083225	1083230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953489
21551	NC_008319	ACT	2	6	1083241	1083246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953489
21552	NC_008319	TCCA	2	8	1083305	1083312	25 %	25 %	0 %	50 %	113953489
21553	NC_008319	TGA	2	6	1083343	1083348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953489
21554	NC_008319	GTG	2	6	1083355	1083360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953489
21555	NC_008319	TGT	2	6	1083399	1083404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953489
21556	NC_008319	AGT	2	6	1083492	1083497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953489
21557	NC_008319	CATC	2	8	1083685	1083692	25 %	25 %	0 %	50 %	113953489
21558	NC_008319	AGA	2	6	1083701	1083706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953489
21559	NC_008319	TTC	2	6	1083727	1083732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953489
21560	NC_008319	GAAGT	2	10	1083772	1083781	40 %	20 %	40 %	0 %	113953489
21561	NC_008319	GTT	3	9	1083819	1083827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953489
21562	NC_008319	AGG	2	6	1083845	1083850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953489
21563	NC_008319	ACG	2	6	1083871	1083876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953489
21564	NC_008319	AAG	2	6	1083901	1083906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953489
21565	NC_008319	ATC	2	6	1083925	1083930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953489
21566	NC_008319	GTTGAT	2	12	1083969	1083980	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	113953489
21567	NC_008319	TGG	2	6	1084013	1084018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953489
21568	NC_008319	TTGC	2	8	1084070	1084077	0 %	50 %	25 %	25 %	113953489
21569	NC_008319	TCG	2	6	1084115	1084120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953489
21570	NC_008319	GATT	2	8	1084159	1084166	25 %	50 %	25 %	0 %	113953489
21571	NC_008319	GGTT	2	8	1084331	1084338	0 %	50 %	50 %	0 %	113953489
21572	NC_008319	CCT	2	6	1084356	1084361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953489
21573	NC_008319	GAAG	2	8	1084373	1084380	50 %	0 %	50 %	0 %	113953489
21574	NC_008319	TCTT	2	8	1084537	1084544	0 %	75 %	0 %	25 %	113953489
21575	NC_008319	GC	3	6	1084584	1084589	0 %	0 %	50 %	50 %	113953489
21576	NC_008319	TGG	2	6	1084724	1084729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953489
21577	NC_008319	AC	3	6	1084747	1084752	50 %	0 %	0 %	50 %	113953489
21578	NC_008319	ATG	2	6	1084774	1084779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953489
21579	NC_008319	ATT	2	6	1084807	1084812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953489
21580	NC_008319	CAC	2	6	1084826	1084831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953489
21581	NC_008319	CTGG	2	8	1084833	1084840	0 %	25 %	50 %	25 %	113953489
21582	NC_008319	TGC	2	6	1084847	1084852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953489
21583	NC_008319	TGC	2	6	1084951	1084956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21584	NC_008319	GACCTC	2	12	1084966	1084977	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113955517
21585	NC_008319	TGC	2	6	1085023	1085028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955517
21586	NC_008319	AT	3	6	1085256	1085261	50 %	50 %	0 %	0 %	113955517
21587	NC_008319	TCA	2	6	1085298	1085303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955517
21588	NC_008319	GAT	2	6	1085342	1085347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955517
21589	NC_008319	GGT	2	6	1085383	1085388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955517
21590	NC_008319	CGT	2	6	1085555	1085560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955517
21591	NC_008319	AC	3	6	1085638	1085643	50 %	0 %	0 %	50 %	113955517
21592	NC_008319	CATC	2	8	1085827	1085834	25 %	25 %	0 %	50 %	113953162
21593	NC_008319	GTA	2	6	1085836	1085841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953162
21594	NC_008319	GTG	2	6	1085845	1085850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953162
21595	NC_008319	GAC	2	6	1085879	1085884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953162
21596	NC_008319	CGA	2	6	1085896	1085901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953162
21597	NC_008319	TGG	2	6	1085945	1085950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953162
21598	NC_008319	TGGATG	2	12	1085967	1085978	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	113953162
21599	NC_008319	GTT	2	6	1086125	1086130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953162
21600	NC_008319	CTT	2	6	1086134	1086139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953162
21601	NC_008319	GTT	2	6	1086227	1086232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953162
21602	NC_008319	TCG	2	6	1086241	1086246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953162
21603	NC_008319	GGA	2	6	1086276	1086281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953162
21604	NC_008319	TTG	2	6	1086310	1086315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953162
21605	NC_008319	T	6	6	1086403	1086408	0 %	100 %	0 %	0 %	113953162
21606	NC_008319	GCT	3	9	1086429	1086437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953162
21607	NC_008319	GGT	2	6	1086438	1086443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953162
21608	NC_008319	GTG	2	6	1086453	1086458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953162
21609	NC_008319	GTG	2	6	1086478	1086483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953162
21610	NC_008319	GCT	2	6	1086528	1086533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953162
21611	NC_008319	GAT	2	6	1086572	1086577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953162
21612	NC_008319	ATT	2	6	1086630	1086635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113953162
21613	NC_008319	TC	3	6	1086684	1086689	0 %	50 %	0 %	50 %	113953162
21614	NC_008319	GATTG	2	10	1086726	1086735	20 %	40 %	40 %	0 %	113953162
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21616	NC_008319	ACA	2	6	1086765	1086770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953162
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