MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_008319	GATG	2	8	903753	903760	25 %	25 %	50 %	0 %	113952764
18002	NC_008319	CAG	2	6	903793	903798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952764
18003	NC_008319	TCA	2	6	903830	903835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953782
18004	NC_008319	ACTTC	2	10	903975	903984	20 %	40 %	0 %	40 %	113953782
18005	NC_008319	GCA	2	6	904055	904060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953782
18006	NC_008319	GTG	2	6	904205	904210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953782
18007	NC_008319	GCA	2	6	904294	904299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953782
18008	NC_008319	GAA	2	6	904338	904343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953782
18009	NC_008319	GGT	2	6	904425	904430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953782
18010	NC_008319	GTA	2	6	904465	904470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953782
18011	NC_008319	ATG	2	6	904580	904585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953782
18012	NC_008319	TTCC	2	8	904597	904604	0 %	50 %	0 %	50 %	113953782
18013	NC_008319	ACG	2	6	904868	904873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953782
18014	NC_008319	TGC	2	6	904980	904985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953782
18015	NC_008319	TCG	3	9	904991	904999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953782
18016	NC_008319	GTC	2	6	905046	905051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953782
18017	NC_008319	CGC	2	6	905103	905108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953782
18018	NC_008319	A	6	6	905288	905293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_008319	A	6	6	905311	905316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_008319	CTT	2	6	905386	905391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955010
18021	NC_008319	GCG	2	6	905438	905443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955010
18022	NC_008319	TCA	2	6	905453	905458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955010
18023	NC_008319	CA	3	6	905484	905489	50 %	0 %	0 %	50 %	113955010
18024	NC_008319	ATC	2	6	905516	905521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955010
18025	NC_008319	CGT	2	6	905661	905666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955010
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18027	NC_008319	AGGT	2	8	905768	905775	25 %	25 %	50 %	0 %	113955010
18028	NC_008319	CTT	2	6	905823	905828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955010
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18030	NC_008319	AGGT	2	8	905903	905910	25 %	25 %	50 %	0 %	113955010
18031	NC_008319	AACA	2	8	905913	905920	75 %	0 %	0 %	25 %	113955010
18032	NC_008319	TG	3	6	906036	906041	0 %	50 %	50 %	0 %	113955010
18033	NC_008319	CAC	2	6	906114	906119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955010
18034	NC_008319	TGC	2	6	906140	906145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955010
18035	NC_008319	GAG	2	6	906169	906174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955010
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18037	NC_008319	GCTTTG	2	12	906252	906263	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	113955010
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18039	NC_008319	GA	3	6	906368	906373	50 %	0 %	50 %	0 %	113955010
18040	NC_008319	CCCA	2	8	906439	906446	25 %	0 %	0 %	75 %	113955010
18041	NC_008319	TCA	2	6	906476	906481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955010
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18043	NC_008319	TTC	2	6	906584	906589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18044	NC_008319	ACG	2	6	906600	906605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18045	NC_008319	TC	3	6	906610	906615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18046	NC_008319	GCG	2	6	906671	906676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18047	NC_008319	AGG	2	6	906687	906692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18048	NC_008319	GTC	2	6	906699	906704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953215
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18052	NC_008319	TCAGC	2	10	906825	906834	20 %	20 %	20 %	40 %	113953215
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18068	NC_008319	TCT	2	6	907413	907418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18069	NC_008319	CATT	2	8	907423	907430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18070	NC_008319	A	6	6	907431	907436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18071	NC_008319	GAGAG	2	10	907445	907454	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18072	NC_008319	TGA	2	6	907455	907460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18073	NC_008319	CTTGAC	2	12	907657	907668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113955213
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18090	NC_008319	TGGTTG	2	12	908537	908548	0 %	50 %	50 %	0 %	113955213
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18104	NC_008319	T	6	6	909128	909133	0 %	100 %	0 %	0 %	113953432
18105	NC_008319	CCA	2	6	909187	909192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953432
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18107	NC_008319	ATCGCT	2	12	909330	909341	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	113953432
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18110	NC_008319	CT	3	6	909598	909603	0 %	50 %	0 %	50 %	113953850
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18122	NC_008319	CGA	2	6	910094	910099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954821
18123	NC_008319	TCCA	2	8	910137	910144	25 %	25 %	0 %	50 %	113954821
18124	NC_008319	ATCG	2	8	910266	910273	25 %	25 %	25 %	25 %	113954821
18125	NC_008319	CGAT	2	8	910274	910281	25 %	25 %	25 %	25 %	113954821
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18231	NC_008319	T	6	6	916085	916090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18232	NC_008319	GAT	2	6	916127	916132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18234	NC_008319	TAAAT	2	10	916148	916157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18235	NC_008319	TTG	2	6	916198	916203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18236	NC_008319	TGAT	2	8	916213	916220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18237	NC_008319	CTA	2	6	916233	916238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18238	NC_008319	CATT	2	8	916287	916294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18239	NC_008319	T	6	6	916293	916298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18240	NC_008319	TCT	2	6	916304	916309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18241	NC_008319	GAA	2	6	916343	916348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18242	NC_008319	TGAT	2	8	916362	916369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18244	NC_008319	AGC	2	6	916528	916533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18487	NC_008319	GAG	2	6	928761	928766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952743
18488	NC_008319	GCCA	2	8	928771	928778	25 %	0 %	25 %	50 %	113952743
18489	NC_008319	ACC	2	6	928828	928833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952743
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18491	NC_008319	TCAGC	2	10	928919	928928	20 %	20 %	20 %	40 %	113952743
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