MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_008319	TGT	2	6	880536	880541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952792
17503	NC_008319	AGA	2	6	880563	880568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952792
17504	NC_008319	CTG	2	6	880639	880644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953054
17505	NC_008319	TAG	2	6	880684	880689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953054
17506	NC_008319	TGG	2	6	880823	880828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953054
17507	NC_008319	AGA	2	6	880838	880843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953054
17508	NC_008319	GGAT	2	8	880861	880868	25 %	25 %	50 %	0 %	113953054
17509	NC_008319	CAG	2	6	880896	880901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953054
17510	NC_008319	GTG	2	6	881019	881024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953054
17511	NC_008319	CAGGC	2	10	881083	881092	20 %	0 %	40 %	40 %	113953054
17512	NC_008319	GTG	2	6	881103	881108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953054
17513	NC_008319	C	6	6	881123	881128	0 %	0 %	0 %	100 %	113953054
17514	NC_008319	ACC	2	6	881170	881175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953054
17515	NC_008319	AAC	2	6	881185	881190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953054
17516	NC_008319	C	6	6	881199	881204	0 %	0 %	0 %	100 %	113953054
17517	NC_008319	T	6	6	881241	881246	0 %	100 %	0 %	0 %	113953054
17518	NC_008319	GGA	2	6	881249	881254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953054
17519	NC_008319	CGT	2	6	881257	881262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953054
17520	NC_008319	CCT	2	6	881274	881279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953054
17521	NC_008319	AGC	2	6	881299	881304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953054
17522	NC_008319	AAC	2	6	881311	881316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953054
17523	NC_008319	GCG	2	6	881430	881435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953054
17524	NC_008319	TGG	2	6	881464	881469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953054
17525	NC_008319	TGC	2	6	881476	881481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953054
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17527	NC_008319	CAG	2	6	881545	881550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953054
17528	NC_008319	TTGG	2	8	881563	881570	0 %	50 %	50 %	0 %	113953054
17529	NC_008319	TTGGG	2	10	881620	881629	0 %	40 %	60 %	0 %	113953054
17530	NC_008319	T	7	7	881678	881684	0 %	100 %	0 %	0 %	113953054
17531	NC_008319	GAG	2	6	881697	881702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953054
17532	NC_008319	TGC	2	6	881755	881760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953054
17533	NC_008319	GTC	2	6	881822	881827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953054
17534	NC_008319	CAG	2	6	881869	881874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953257
17535	NC_008319	TCT	2	6	881898	881903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953257
17536	NC_008319	CCCG	2	8	882024	882031	0 %	0 %	25 %	75 %	113953257
17537	NC_008319	CGA	2	6	882050	882055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953257
17538	NC_008319	GAGC	2	8	882058	882065	25 %	0 %	50 %	25 %	113953257
17539	NC_008319	AGC	3	9	882063	882071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953257
17540	NC_008319	CCCCA	2	10	882113	882122	20 %	0 %	0 %	80 %	113953257
17541	NC_008319	AAT	2	6	882199	882204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953257
17542	NC_008319	C	6	6	882213	882218	0 %	0 %	0 %	100 %	113953257
17543	NC_008319	GGGA	2	8	882235	882242	25 %	0 %	75 %	0 %	113953257
17544	NC_008319	GGTTG	2	10	882256	882265	0 %	40 %	60 %	0 %	113953257
17545	NC_008319	CACGC	2	10	882275	882284	20 %	0 %	20 %	60 %	113953257
17546	NC_008319	TGC	2	6	882303	882308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953257
17547	NC_008319	ACC	2	6	882355	882360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953257
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17549	NC_008319	CCA	2	6	882391	882396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953257
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17552	NC_008319	GAGC	2	8	882490	882497	25 %	0 %	50 %	25 %	113953257
17553	NC_008319	TCAC	2	8	882540	882547	25 %	25 %	0 %	50 %	113953257
17554	NC_008319	GTTGG	2	10	882574	882583	0 %	40 %	60 %	0 %	113953257
17555	NC_008319	CCCAG	2	10	882619	882628	20 %	0 %	20 %	60 %	113953257
17556	NC_008319	CAGAC	2	10	882679	882688	40 %	0 %	20 %	40 %	113953257
17557	NC_008319	CCCG	2	8	882709	882716	0 %	0 %	25 %	75 %	113953257
17558	NC_008319	GAA	2	6	882784	882789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953257
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17560	NC_008319	GC	3	6	882939	882944	0 %	0 %	50 %	50 %	113953257
17561	NC_008319	GCA	2	6	882964	882969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953257
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17563	NC_008319	GCA	2	6	883113	883118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953257
17564	NC_008319	AGC	2	6	883149	883154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953257
17565	NC_008319	GT	3	6	883192	883197	0 %	50 %	50 %	0 %	113953257
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17568	NC_008319	GC	3	6	883244	883249	0 %	0 %	50 %	50 %	113953257
17569	NC_008319	TCGC	2	8	883263	883270	0 %	25 %	25 %	50 %	113953257
17570	NC_008319	A	6	6	883322	883327	100 %	0 %	0 %	0 %	113953257
17571	NC_008319	TCT	2	6	883332	883337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953257
17572	NC_008319	CGAG	2	8	883339	883346	25 %	0 %	50 %	25 %	113953257
17573	NC_008319	AAGG	2	8	883369	883376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17574	NC_008319	CT	4	8	883421	883428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17575	NC_008319	AGC	2	6	883464	883469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17576	NC_008319	GAG	2	6	883630	883635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954293
17577	NC_008319	GCA	2	6	883650	883655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954293
17578	NC_008319	GCT	2	6	883720	883725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954293
17579	NC_008319	CAG	2	6	883741	883746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954293
17580	NC_008319	TGG	2	6	883749	883754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954293
17581	NC_008319	ATC	2	6	883768	883773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954293
17582	NC_008319	CATA	2	8	883848	883855	50 %	25 %	0 %	25 %	113954293
17583	NC_008319	CCA	2	6	883865	883870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954293
17584	NC_008319	CATC	2	8	883875	883882	25 %	25 %	0 %	50 %	113954293
17585	NC_008319	GAC	2	6	883963	883968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954293
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17588	NC_008319	TTGA	2	8	884110	884117	25 %	50 %	25 %	0 %	113954293
17589	NC_008319	CGC	2	6	884277	884282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954293
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17591	NC_008319	TGA	2	6	884346	884351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954293
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17594	NC_008319	CATC	2	8	884490	884497	25 %	25 %	0 %	50 %	113954293
17595	NC_008319	GC	3	6	884542	884547	0 %	0 %	50 %	50 %	113954293
17596	NC_008319	GCTCG	2	10	884611	884620	0 %	20 %	40 %	40 %	113954293
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17602	NC_008319	ACCGG	2	10	884872	884881	20 %	0 %	40 %	40 %	113954293
17603	NC_008319	CAAC	2	8	884904	884911	50 %	0 %	0 %	50 %	113954293
17604	NC_008319	TGG	2	6	884933	884938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954293
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17606	NC_008319	CCG	2	6	885056	885061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954293
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17610	NC_008319	ATTA	2	8	885164	885171	50 %	50 %	0 %	0 %	113954293
17611	NC_008319	ACC	2	6	885191	885196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955349
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17615	NC_008319	CCCT	2	8	885319	885326	0 %	25 %	0 %	75 %	113955349
17616	NC_008319	CAGCC	2	10	885341	885350	20 %	0 %	20 %	60 %	113955349
17617	NC_008319	GGC	2	6	885363	885368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955349
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17984	NC_008319	CCG	2	6	903105	903110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952764
17985	NC_008319	C	6	6	903147	903152	0 %	0 %	0 %	100 %	113952764
17986	NC_008319	GGC	2	6	903173	903178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952764
17987	NC_008319	TCA	2	6	903285	903290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952764
17988	NC_008319	TGGTT	2	10	903292	903301	0 %	60 %	40 %	0 %	113952764
17989	NC_008319	GTG	2	6	903343	903348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952764
17990	NC_008319	TCG	2	6	903405	903410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952764
17991	NC_008319	ATG	2	6	903423	903428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952764
17992	NC_008319	GTT	3	9	903457	903465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952764
17993	NC_008319	GGCT	2	8	903473	903480	0 %	25 %	50 %	25 %	113952764
17994	NC_008319	TTGA	2	8	903520	903527	25 %	50 %	25 %	0 %	113952764
17995	NC_008319	GAG	2	6	903604	903609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952764
17996	NC_008319	TGC	2	6	903613	903618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952764
17997	NC_008319	GAG	2	6	903624	903629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952764
17998	NC_008319	TTG	2	6	903657	903662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952764
17999	NC_008319	AGC	2	6	903707	903712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952764
18000	NC_008319	CGGCAG	2	12	903717	903728	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	113952764

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