MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_008319	GGA	2	6	758322	758327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953483
15002	NC_008319	TAC	2	6	758433	758438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953483
15003	NC_008319	CAG	2	6	758461	758466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953483
15004	NC_008319	GGT	2	6	758483	758488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953483
15005	NC_008319	CGG	2	6	758539	758544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953483
15006	NC_008319	CTAC	2	8	758567	758574	25 %	25 %	0 %	50 %	113953483
15007	NC_008319	GGCGAT	2	12	758576	758587	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	113953483
15008	NC_008319	ATC	2	6	758674	758679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_008319	A	6	6	758829	758834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_008319	AGC	2	6	758838	758843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_008319	CTT	2	6	758861	758866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952882
15012	NC_008319	CTT	2	6	758872	758877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952882
15013	NC_008319	TTG	2	6	758899	758904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952882
15014	NC_008319	GGC	2	6	758922	758927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952882
15015	NC_008319	TCC	2	6	759104	759109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15016	NC_008319	GGA	2	6	759119	759124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_008319	TTG	2	6	759147	759152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_008319	GAT	2	6	759227	759232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955574
15019	NC_008319	GGAA	2	8	759237	759244	50 %	0 %	50 %	0 %	113955574
15020	NC_008319	CTG	2	6	759263	759268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955574
15021	NC_008319	CTT	2	6	759286	759291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955574
15022	NC_008319	TGC	2	6	759375	759380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955574
15023	NC_008319	CAGG	2	8	759527	759534	25 %	0 %	50 %	25 %	113955574
15024	NC_008319	GAC	2	6	759554	759559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955574
15025	NC_008319	CAA	2	6	759646	759651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955574
15026	NC_008319	TCC	2	6	759700	759705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955574
15027	NC_008319	TGG	2	6	759711	759716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955574
15028	NC_008319	GCTGA	2	10	759745	759754	20 %	20 %	40 %	20 %	113955574
15029	NC_008319	AGC	2	6	759807	759812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954800
15030	NC_008319	TGG	2	6	759845	759850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954800
15031	NC_008319	GGT	2	6	759855	759860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954800
15032	NC_008319	TGG	2	6	759881	759886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954800
15033	NC_008319	GC	3	6	759954	759959	0 %	0 %	50 %	50 %	113954800
15034	NC_008319	GGC	2	6	759964	759969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954800
15035	NC_008319	ATC	2	6	759973	759978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954800
15036	NC_008319	TCA	2	6	759999	760004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954800
15037	NC_008319	C	6	6	760015	760020	0 %	0 %	0 %	100 %	113954800
15038	NC_008319	TGG	3	9	760095	760103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954800
15039	NC_008319	AGC	2	6	760161	760166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954800
15040	NC_008319	CATC	2	8	760185	760192	25 %	25 %	0 %	50 %	113954800
15041	NC_008319	GTC	2	6	760205	760210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954800
15042	NC_008319	CTC	2	6	760289	760294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954800
15043	NC_008319	GCTG	2	8	760324	760331	0 %	25 %	50 %	25 %	113954800
15044	NC_008319	GGC	2	6	760351	760356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954800
15045	NC_008319	GC	3	6	760362	760367	0 %	0 %	50 %	50 %	113954800
15046	NC_008319	GAG	2	6	760391	760396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954800
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15048	NC_008319	GTG	2	6	760420	760425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954800
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15050	NC_008319	CCTG	2	8	760524	760531	0 %	25 %	25 %	50 %	113954800
15051	NC_008319	TCT	2	6	760575	760580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954800
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15053	NC_008319	GGT	2	6	760680	760685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954800
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15055	NC_008319	CT	3	6	760769	760774	0 %	50 %	0 %	50 %	113954800
15056	NC_008319	ACC	2	6	760884	760889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954948
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15058	NC_008319	CAG	2	6	760979	760984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954948
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15069	NC_008319	TGGT	2	8	761804	761811	0 %	50 %	50 %	0 %	113954948
15070	NC_008319	TGT	2	6	761825	761830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954948
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15085	NC_008319	TGG	2	6	762567	762572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954318
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15087	NC_008319	GGT	2	6	762657	762662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_008319	GCA	2	6	762734	762739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_008319	CTTG	2	8	762754	762761	0 %	50 %	25 %	25 %	113952924
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15092	NC_008319	TCC	2	6	762949	762954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15093	NC_008319	CAG	2	6	762955	762960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15094	NC_008319	AAC	2	6	762977	762982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15095	NC_008319	GAC	2	6	763033	763038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955040
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15100	NC_008319	GCA	2	6	763134	763139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955040
15101	NC_008319	ATG	2	6	763181	763186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955040
15102	NC_008319	GC	3	6	763197	763202	0 %	0 %	50 %	50 %	113955040
15103	NC_008319	TCA	2	6	763205	763210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955040
15104	NC_008319	GAGTT	2	10	763322	763331	20 %	40 %	40 %	0 %	113955040
15105	NC_008319	TGC	2	6	763332	763337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955040
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15108	NC_008319	TGC	2	6	763412	763417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955040
15109	NC_008319	GC	3	6	763426	763431	0 %	0 %	50 %	50 %	113955040
15110	NC_008319	GCG	4	12	763442	763453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955040
15111	NC_008319	TGA	2	6	763503	763508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955040
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15115	NC_008319	CAGGTA	2	12	763655	763666	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	113955040
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15125	NC_008319	AACC	2	8	763975	763982	50 %	0 %	0 %	50 %	113955040
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15230	NC_008319	AAAT	2	8	769039	769046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15231	NC_008319	TTG	2	6	769092	769097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15232	NC_008319	AATG	2	8	769110	769117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15233	NC_008319	GTGTT	2	10	769151	769160	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
15234	NC_008319	TGC	2	6	769162	769167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15237	NC_008319	AGA	2	6	769274	769279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15238	NC_008319	AGT	2	6	769322	769327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15259	NC_008319	TTG	2	6	770284	770289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15354	NC_008319	TA	3	6	775241	775246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15355	NC_008319	TAA	2	6	775297	775302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15356	NC_008319	AT	3	6	775335	775340	50 %	50 %	0 %	0 %	113954343
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15492	NC_008319	CAG	2	6	781612	781617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15493	NC_008319	TCA	2	6	781644	781649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15494	NC_008319	GTT	2	6	781754	781759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954364
15495	NC_008319	CTC	2	6	781811	781816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954364
15496	NC_008319	CAC	2	6	781889	781894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954364
15497	NC_008319	ACA	2	6	781896	781901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954364
15498	NC_008319	TTA	2	6	781903	781908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954364
15499	NC_008319	AGCA	2	8	781910	781917	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15500	NC_008319	TCT	2	6	781948	781953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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