MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008319	GAA	2	6	658826	658831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_008319	GAT	2	6	658928	658933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954028
13003	NC_008319	TTC	2	6	658963	658968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954028
13004	NC_008319	TTGG	2	8	659117	659124	0 %	50 %	50 %	0 %	113954028
13005	NC_008319	TCGC	2	8	659153	659160	0 %	25 %	25 %	50 %	113954028
13006	NC_008319	TCA	2	6	659162	659167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954028
13007	NC_008319	GCT	2	6	659191	659196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954028
13008	NC_008319	GTT	2	6	659225	659230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_008319	GAC	2	6	659242	659247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_008319	ATTGA	2	10	659306	659315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_008319	TGT	2	6	659322	659327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_008319	TTGC	2	8	659379	659386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13013	NC_008319	ATTG	2	8	659392	659399	25 %	50 %	25 %	0 %	113955061
13014	NC_008319	TTGG	2	8	659448	659455	0 %	50 %	50 %	0 %	113955061
13015	NC_008319	GAG	2	6	659547	659552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955061
13016	NC_008319	GCG	2	6	659562	659567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955061
13017	NC_008319	AATG	2	8	659568	659575	50 %	25 %	25 %	0 %	113955061
13018	NC_008319	CGG	2	6	659585	659590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955061
13019	NC_008319	GCG	2	6	659621	659626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955061
13020	NC_008319	A	7	7	659650	659656	100 %	0 %	0 %	0 %	113955061
13021	NC_008319	TGA	2	6	659870	659875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955061
13022	NC_008319	TGA	2	6	659921	659926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955061
13023	NC_008319	AGA	2	6	659942	659947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955061
13024	NC_008319	CAG	2	6	659976	659981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955061
13025	NC_008319	CTA	2	6	659987	659992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955061
13026	NC_008319	AGTT	2	8	660003	660010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_008319	TTGT	2	8	660033	660040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_008319	TCAG	2	8	660251	660258	25 %	25 %	25 %	25 %	113953576
13029	NC_008319	CTA	2	6	660289	660294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_008319	TTG	2	6	660333	660338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_008319	GTG	2	6	660344	660349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_008319	CTT	2	6	660363	660368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_008319	ACCA	2	8	660461	660468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13034	NC_008319	AGA	2	6	660513	660518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_008319	TAAG	2	8	660535	660542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_008319	CATACG	2	12	660549	660560	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_008319	AGTG	2	8	660593	660600	25 %	25 %	50 %	0 %	113954418
13038	NC_008319	AGG	2	6	660610	660615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954418
13039	NC_008319	CAAT	2	8	660727	660734	50 %	25 %	0 %	25 %	113954418
13040	NC_008319	CTG	2	6	660845	660850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955597
13041	NC_008319	TGA	2	6	660886	660891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955597
13042	NC_008319	TGC	2	6	660945	660950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955597
13043	NC_008319	AAG	2	6	660951	660956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955597
13044	NC_008319	GAT	2	6	661016	661021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955597
13045	NC_008319	AGCA	2	8	661041	661048	50 %	0 %	25 %	25 %	113955597
13046	NC_008319	AAT	2	6	661098	661103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_008319	GTT	2	6	661125	661130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_008319	AAT	2	6	661131	661136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_008319	TACG	2	8	661159	661166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13050	NC_008319	GAT	2	6	661187	661192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_008319	GTT	2	6	661244	661249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_008319	AGT	2	6	661250	661255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_008319	TAG	2	6	661316	661321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_008319	CAG	2	6	661326	661331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_008319	AG	3	6	661414	661419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_008319	T	7	7	661469	661475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_008319	GAG	2	6	661486	661491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_008319	GTA	2	6	661494	661499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_008319	TTCG	2	8	661510	661517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13060	NC_008319	TGC	2	6	661569	661574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953374
13061	NC_008319	TGC	2	6	661656	661661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953374
13062	NC_008319	CGC	2	6	661665	661670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953374
13063	NC_008319	ACA	2	6	661679	661684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953374
13064	NC_008319	TGT	2	6	661713	661718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953374
13065	NC_008319	ATC	2	6	661777	661782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953374
13066	NC_008319	TGCAC	2	10	661854	661863	20 %	20 %	20 %	40 %	113953374
13067	NC_008319	GTCT	2	8	661866	661873	0 %	50 %	25 %	25 %	113953374
13068	NC_008319	ACC	2	6	661883	661888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953374
13069	NC_008319	GATTG	2	10	661921	661930	20 %	40 %	40 %	0 %	113953374
13070	NC_008319	GGC	2	6	661936	661941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953374
13071	NC_008319	GCT	2	6	662007	662012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953374
13072	NC_008319	CCT	2	6	662070	662075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953374
13073	NC_008319	T	8	8	662095	662102	0 %	100 %	0 %	0 %	113953374
13074	NC_008319	TCT	2	6	662120	662125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953374
13075	NC_008319	GAG	3	9	662219	662227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953374
13076	NC_008319	CCA	2	6	662241	662246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953374
13077	NC_008319	AGC	2	6	662273	662278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953374
13078	NC_008319	GCACC	2	10	662388	662397	20 %	0 %	20 %	60 %	113953374
13079	NC_008319	TCA	2	6	662433	662438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953374
13080	NC_008319	CCT	2	6	662523	662528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953374
13081	NC_008319	ATTC	2	8	662541	662548	25 %	50 %	0 %	25 %	113953374
13082	NC_008319	CAT	2	6	662574	662579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953374
13083	NC_008319	T	7	7	662615	662621	0 %	100 %	0 %	0 %	113953374
13084	NC_008319	AAT	2	6	662627	662632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953374
13085	NC_008319	TGCCA	2	10	662653	662662	20 %	20 %	20 %	40 %	113953374
13086	NC_008319	AGC	2	6	662739	662744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953374
13087	NC_008319	T	6	6	662749	662754	0 %	100 %	0 %	0 %	113953374
13088	NC_008319	CAT	2	6	662838	662843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953374
13089	NC_008319	CAC	2	6	662902	662907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953374
13090	NC_008319	GGC	3	9	662928	662936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953374
13091	NC_008319	TGA	2	6	663111	663116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_008319	AAT	2	6	663121	663126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_008319	ACT	2	6	663169	663174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952823
13094	NC_008319	CGA	2	6	663192	663197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952823
13095	NC_008319	GAA	2	6	663285	663290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952823
13096	NC_008319	CTC	2	6	663325	663330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952823
13097	NC_008319	CGT	2	6	663370	663375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952823
13098	NC_008319	ATC	2	6	663406	663411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952823
13099	NC_008319	GAT	2	6	663433	663438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952823
13100	NC_008319	GCACT	2	10	663638	663647	20 %	20 %	20 %	40 %	113952823
13101	NC_008319	TCT	2	6	663672	663677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952823
13102	NC_008319	CT	3	6	663709	663714	0 %	50 %	0 %	50 %	113952823
13103	NC_008319	GAC	2	6	663745	663750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952823
13104	NC_008319	AAG	2	6	663799	663804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952823
13105	NC_008319	AGGC	2	8	663809	663816	25 %	0 %	50 %	25 %	113952823
13106	NC_008319	GAG	2	6	663845	663850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952823
13107	NC_008319	ACT	2	6	663916	663921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953844
13108	NC_008319	CTT	2	6	663962	663967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953844
13109	NC_008319	GT	3	6	664084	664089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_008319	TCC	2	6	664136	664141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954869
13111	NC_008319	CTA	2	6	664182	664187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954869
13112	NC_008319	TGACA	2	10	664367	664376	40 %	20 %	20 %	20 %	113954869
13113	NC_008319	CGC	2	6	664420	664425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954869
13114	NC_008319	GCCA	2	8	664451	664458	25 %	0 %	25 %	50 %	113954869
13115	NC_008319	GCC	2	6	664475	664480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954869
13116	NC_008319	CGC	2	6	664501	664506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954869
13117	NC_008319	AAT	2	6	664540	664545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954869
13118	NC_008319	CGC	2	6	664582	664587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954869
13119	NC_008319	AAT	2	6	664594	664599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954869
13120	NC_008319	CAT	2	6	664660	664665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954869
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13122	NC_008319	TCA	2	6	664761	664766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954869
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13489	NC_008319	ACC	2	6	683964	683969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953246
13490	NC_008319	GAC	2	6	683993	683998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953246
13491	NC_008319	CTT	2	6	684010	684015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953246
13492	NC_008319	CCA	2	6	684016	684021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953246
13493	NC_008319	GCA	2	6	684024	684029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953246
13494	NC_008319	ATTCG	2	10	684146	684155	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13495	NC_008319	AGC	2	6	684201	684206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13496	NC_008319	GTT	2	6	684269	684274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954583
13497	NC_008319	CAC	2	6	684305	684310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954583
13498	NC_008319	TGTTGG	2	12	684323	684334	0 %	50 %	50 %	0 %	113954583
13499	NC_008319	CGG	2	6	684356	684361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954583
13500	NC_008319	GTG	2	6	684367	684372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954583

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