MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008319	TCCAA	2	10	633821	633830	40 %	20 %	0 %	40 %	113955105
12502	NC_008319	TGC	2	6	633850	633855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955105
12503	NC_008319	TAC	2	6	633875	633880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955105
12504	NC_008319	TGC	2	6	633887	633892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955105
12505	NC_008319	CAG	2	6	633939	633944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955105
12506	NC_008319	TCA	2	6	633955	633960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955105
12507	NC_008319	AGC	2	6	633964	633969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955105
12508	NC_008319	GTT	2	6	633983	633988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955105
12509	NC_008319	TGCT	2	8	634003	634010	0 %	50 %	25 %	25 %	113955105
12510	NC_008319	CTT	2	6	634024	634029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955105
12511	NC_008319	T	8	8	634028	634035	0 %	100 %	0 %	0 %	113955105
12512	NC_008319	C	6	6	634079	634084	0 %	0 %	0 %	100 %	113955105
12513	NC_008319	TC	3	6	634112	634117	0 %	50 %	0 %	50 %	113955105
12514	NC_008319	TTG	2	6	634141	634146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955105
12515	NC_008319	TGCA	2	8	634350	634357	25 %	25 %	25 %	25 %	113953465
12516	NC_008319	CTG	2	6	634377	634382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953465
12517	NC_008319	TGC	2	6	634411	634416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953465
12518	NC_008319	TGC	2	6	634443	634448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953465
12519	NC_008319	GTG	2	6	634518	634523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953465
12520	NC_008319	TGG	2	6	634524	634529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953465
12521	NC_008319	GTTG	2	8	634716	634723	0 %	50 %	50 %	0 %	113954290
12522	NC_008319	GTG	2	6	634726	634731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954290
12523	NC_008319	TGT	2	6	634740	634745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954290
12524	NC_008319	GCA	2	6	634757	634762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954290
12525	NC_008319	GCC	2	6	634765	634770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954290
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12527	NC_008319	CG	3	6	634848	634853	0 %	0 %	50 %	50 %	113954290
12528	NC_008319	TCAG	2	8	634875	634882	25 %	25 %	25 %	25 %	113954290
12529	NC_008319	AGC	2	6	634950	634955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954290
12530	NC_008319	TTGG	2	8	635028	635035	0 %	50 %	50 %	0 %	113954290
12531	NC_008319	AGC	2	6	635149	635154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_008319	TGG	2	6	635158	635163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954915
12533	NC_008319	GAG	2	6	635325	635330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954915
12534	NC_008319	TGA	2	6	635345	635350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954915
12535	NC_008319	GTG	2	6	635362	635367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954915
12536	NC_008319	CCT	2	6	635374	635379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954915
12537	NC_008319	AGG	2	6	635404	635409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954915
12538	NC_008319	TGGA	2	8	635485	635492	25 %	25 %	50 %	0 %	113954915
12539	NC_008319	GTT	2	6	635533	635538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954915
12540	NC_008319	TGG	2	6	635539	635544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954915
12541	NC_008319	GAGT	2	8	635560	635567	25 %	25 %	50 %	0 %	113954915
12542	NC_008319	CTTC	2	8	635592	635599	0 %	50 %	0 %	50 %	113954915
12543	NC_008319	GGGC	2	8	635603	635610	0 %	0 %	75 %	25 %	113954915
12544	NC_008319	AGT	2	6	635619	635624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954915
12545	NC_008319	TTGC	2	8	635627	635634	0 %	50 %	25 %	25 %	113954915
12546	NC_008319	GC	3	6	635646	635651	0 %	0 %	50 %	50 %	113954915
12547	NC_008319	GAT	2	6	635658	635663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953026
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12551	NC_008319	TGTT	2	8	635744	635751	0 %	75 %	25 %	0 %	113953026
12552	NC_008319	TGC	2	6	635756	635761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953026
12553	NC_008319	GCC	2	6	635828	635833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953026
12554	NC_008319	TGA	2	6	635853	635858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953026
12555	NC_008319	CTG	2	6	635891	635896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953026
12556	NC_008319	TGGC	2	8	635921	635928	0 %	25 %	50 %	25 %	113953026
12557	NC_008319	TTCAA	2	10	635976	635985	40 %	40 %	0 %	20 %	113953026
12558	NC_008319	CAGGG	2	10	636081	636090	20 %	0 %	60 %	20 %	113953026
12559	NC_008319	TGC	2	6	636176	636181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953026
12560	NC_008319	AGC	2	6	636194	636199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953026
12561	NC_008319	TGG	2	6	636207	636212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953026
12562	NC_008319	TTTC	2	8	636279	636286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12563	NC_008319	AGCC	2	8	636402	636409	25 %	0 %	25 %	50 %	113953740
12564	NC_008319	GAAT	2	8	636437	636444	50 %	25 %	25 %	0 %	113953740
12565	NC_008319	GAT	3	9	636535	636543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953740
12566	NC_008319	TAAT	2	8	636663	636670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_008319	CGC	2	6	636791	636796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12568	NC_008319	GTA	2	6	637026	637031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_008319	GTA	2	6	637076	637081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_008319	ATC	2	6	637083	637088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954785
12571	NC_008319	ATT	2	6	637127	637132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954785
12572	NC_008319	AGC	2	6	637137	637142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954785
12573	NC_008319	TCCTTC	2	12	637144	637155	0 %	50 %	0 %	50 %	113954785
12574	NC_008319	CAA	2	6	637203	637208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954785
12575	NC_008319	AATTCC	2	12	637297	637308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954785
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12578	NC_008319	GCA	2	6	637391	637396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954785
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12586	NC_008319	GAG	2	6	637606	637611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954785
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12588	NC_008319	GAG	2	6	637618	637623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954785
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12591	NC_008319	TCG	3	9	637673	637681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954785
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12599	NC_008319	ATC	2	6	638009	638014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954785
12600	NC_008319	CTCCA	2	10	638061	638070	20 %	20 %	0 %	60 %	113954785
12601	NC_008319	CCT	2	6	638123	638128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954785
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12603	NC_008319	TGG	2	6	638172	638177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954785
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12608	NC_008319	TTCC	2	8	638568	638575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12609	NC_008319	GCA	2	6	638602	638607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_008319	GC	3	6	638695	638700	0 %	0 %	50 %	50 %	113954412
12611	NC_008319	CTTC	2	8	638778	638785	0 %	50 %	0 %	50 %	113954412
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12615	NC_008319	TG	3	6	638871	638876	0 %	50 %	50 %	0 %	113954412
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12620	NC_008319	G	6	6	638982	638987	0 %	0 %	100 %	0 %	113954412
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12746	NC_008319	CTT	2	6	646201	646206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955243
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12763	NC_008319	AGA	2	6	646914	646919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953210
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12985	NC_008319	CTG	2	6	658088	658093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953789
12986	NC_008319	GTT	2	6	658104	658109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953789
12987	NC_008319	CTC	2	6	658121	658126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953789
12988	NC_008319	CTG	2	6	658147	658152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953789
12989	NC_008319	TGA	2	6	658212	658217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953789
12990	NC_008319	GTTG	2	8	658220	658227	0 %	50 %	50 %	0 %	113953789
12991	NC_008319	TGT	2	6	658234	658239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953789
12992	NC_008319	CGGTT	2	10	658287	658296	0 %	40 %	40 %	20 %	113953789
12993	NC_008319	GCT	2	6	658333	658338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953789
12994	NC_008319	CGG	2	6	658506	658511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953789
12995	NC_008319	GC	3	6	658512	658517	0 %	0 %	50 %	50 %	113953789
12996	NC_008319	CGC	2	6	658605	658610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953789
12997	NC_008319	CGGAG	2	10	658671	658680	20 %	0 %	60 %	20 %	113953789
12998	NC_008319	TGC	2	6	658698	658703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953789
12999	NC_008319	CGG	2	6	658737	658742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953789
13000	NC_008319	TGC	2	6	658754	658759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953789

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