MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_008319	GCT	2	6	608636	608641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955055
12002	NC_008319	GAT	2	6	608665	608670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955055
12003	NC_008319	TGC	2	6	608676	608681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955055
12004	NC_008319	A	6	6	608683	608688	100 %	0 %	0 %	0 %	113955055
12005	NC_008319	T	6	6	608695	608700	0 %	100 %	0 %	0 %	113955055
12006	NC_008319	T	6	6	608849	608854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_008319	TCA	2	6	608885	608890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12008	NC_008319	TGA	2	6	608892	608897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_008319	TTC	2	6	608910	608915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12010	NC_008319	CCA	2	6	608985	608990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12011	NC_008319	GTAT	2	8	608994	609001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12012	NC_008319	GGTT	2	8	609007	609014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12013	NC_008319	AGG	2	6	609023	609028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12014	NC_008319	ATC	2	6	609039	609044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12015	NC_008319	GAT	2	6	609102	609107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_008319	TGA	2	6	609138	609143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953508
12017	NC_008319	GAA	2	6	609211	609216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953508
12018	NC_008319	CAA	2	6	609241	609246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953508
12019	NC_008319	TTGAAC	2	12	609458	609469	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12020	NC_008319	AGT	2	6	609484	609489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12021	NC_008319	ATT	2	6	609564	609569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12022	NC_008319	TGC	2	6	609578	609583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12023	NC_008319	TGT	2	6	609584	609589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12024	NC_008319	TTG	2	6	609629	609634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12025	NC_008319	CAA	2	6	609656	609661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12026	NC_008319	TGA	2	6	609662	609667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12027	NC_008319	CAT	2	6	609699	609704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12028	NC_008319	GCC	2	6	609739	609744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954815
12029	NC_008319	TCCTT	2	10	609768	609777	0 %	60 %	0 %	40 %	113954815
12030	NC_008319	CGT	2	6	609807	609812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954815
12031	NC_008319	CCAGAA	2	12	609849	609860	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	113954815
12032	NC_008319	GGT	5	15	609918	609932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954815
12033	NC_008319	CT	3	6	609943	609948	0 %	50 %	0 %	50 %	113954815
12034	NC_008319	AGG	2	6	609987	609992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954815
12035	NC_008319	TTGTG	2	10	610019	610028	0 %	60 %	40 %	0 %	113954815
12036	NC_008319	CCT	2	6	610044	610049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954815
12037	NC_008319	TGT	2	6	610223	610228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954815
12038	NC_008319	CGT	2	6	610273	610278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954815
12039	NC_008319	TTG	2	6	610309	610314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954815
12040	NC_008319	CTT	2	6	610348	610353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954815
12041	NC_008319	AG	4	8	610464	610471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12042	NC_008319	G	6	6	610536	610541	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12043	NC_008319	CT	3	6	610577	610582	0 %	50 %	0 %	50 %	113952995
12044	NC_008319	TGT	2	6	610602	610607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952995
12045	NC_008319	GTT	2	6	610619	610624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952995
12046	NC_008319	TCC	2	6	610659	610664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952995
12047	NC_008319	GTTT	2	8	610688	610695	0 %	75 %	25 %	0 %	113952995
12048	NC_008319	TGG	2	6	610701	610706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952995
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12051	NC_008319	CAC	2	6	610826	610831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952995
12052	NC_008319	TGA	2	6	610833	610838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952995
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12054	NC_008319	GTT	2	6	610860	610865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952995
12055	NC_008319	TGT	2	6	611028	611033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952995
12056	NC_008319	GAT	2	6	611047	611052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952995
12057	NC_008319	GAT	2	6	611101	611106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952995
12058	NC_008319	T	6	6	611129	611134	0 %	100 %	0 %	0 %	113952995
12059	NC_008319	GCA	2	6	611139	611144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952995
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12062	NC_008319	AGTG	2	8	611385	611392	25 %	25 %	50 %	0 %	113952995
12063	NC_008319	AAG	2	6	611407	611412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952995
12064	NC_008319	AGA	2	6	611414	611419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952995
12065	NC_008319	CAG	2	6	611503	611508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955188
12066	NC_008319	TGC	2	6	611569	611574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955188
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12068	NC_008319	AAC	2	6	611699	611704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955188
12069	NC_008319	AAG	2	6	612012	612017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12070	NC_008319	CTTG	2	8	612055	612062	0 %	50 %	25 %	25 %	113953626
12071	NC_008319	AAT	2	6	612097	612102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953626
12072	NC_008319	CTG	2	6	612120	612125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953626
12073	NC_008319	TTC	2	6	612175	612180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953626
12074	NC_008319	TGT	3	9	612182	612190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12075	NC_008319	GTT	2	6	612227	612232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12076	NC_008319	GGT	2	6	612245	612250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12077	NC_008319	TTG	2	6	612322	612327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12078	NC_008319	TGC	2	6	612392	612397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954344
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12080	NC_008319	GGTGTA	2	12	612463	612474	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	113954344
12081	NC_008319	CAA	2	6	612653	612658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954344
12082	NC_008319	GGCA	2	8	612661	612668	25 %	0 %	50 %	25 %	113954344
12083	NC_008319	CT	3	6	612743	612748	0 %	50 %	0 %	50 %	113954344
12084	NC_008319	GCA	2	6	612759	612764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954344
12085	NC_008319	TCG	2	6	612809	612814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954344
12086	NC_008319	CT	3	6	612865	612870	0 %	50 %	0 %	50 %	113954344
12087	NC_008319	GAA	2	6	612936	612941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954344
12088	NC_008319	CTCG	2	8	612990	612997	0 %	25 %	25 %	50 %	113954344
12089	NC_008319	TCCAGA	2	12	613031	613042	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113954344
12090	NC_008319	TGC	2	6	613077	613082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954344
12091	NC_008319	GATC	2	8	613089	613096	25 %	25 %	25 %	25 %	113954344
12092	NC_008319	AAATCA	2	12	613151	613162	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	113954344
12093	NC_008319	GTT	2	6	613212	613217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954344
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12095	NC_008319	AT	4	8	613291	613298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12096	NC_008319	TTA	2	6	613299	613304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12097	NC_008319	TAA	2	6	613321	613326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12098	NC_008319	TGC	2	6	613415	613420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954347
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12100	NC_008319	TCA	2	6	613525	613530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954347
12101	NC_008319	CAG	2	6	613646	613651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12102	NC_008319	ACG	2	6	613675	613680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953736
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12106	NC_008319	GCC	2	6	613830	613835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953736
12107	NC_008319	AGC	2	6	613920	613925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953736
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12113	NC_008319	TGTT	2	8	614221	614228	0 %	75 %	25 %	0 %	113953736
12114	NC_008319	CGC	2	6	614334	614339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953736
12115	NC_008319	TGA	2	6	614344	614349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953736
12116	NC_008319	TGG	3	9	614372	614380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953736
12117	NC_008319	CCT	2	6	614390	614395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953736
12118	NC_008319	CCG	2	6	614529	614534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953736
12119	NC_008319	CGG	2	6	614574	614579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953736
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12121	NC_008319	AGC	2	6	614610	614615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953736
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12123	NC_008319	AAC	2	6	614700	614705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953736
12124	NC_008319	GAG	2	6	614751	614756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953736
12125	NC_008319	TTC	2	6	614779	614784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953736
12126	NC_008319	ATC	2	6	614838	614843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953736
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12128	NC_008319	GTG	2	6	614886	614891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953736
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12154	NC_008319	GTC	2	6	616315	616320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954668
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12242	NC_008319	CGCT	2	8	621621	621628	0 %	25 %	25 %	50 %	113954781
12243	NC_008319	TCGA	2	8	621630	621637	25 %	25 %	25 %	25 %	113954781
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12298	NC_008319	TAGA	2	8	624242	624249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12302	NC_008319	TTTG	2	8	624379	624386	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12484	NC_008319	CCT	2	6	633054	633059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955483
12485	NC_008319	AGG	2	6	633063	633068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955483
12486	NC_008319	TGC	2	6	633071	633076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955483
12487	NC_008319	TGC	2	6	633078	633083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955483
12488	NC_008319	TCA	2	6	633113	633118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955483
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12490	NC_008319	CTG	2	6	633209	633214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955483
12491	NC_008319	GATG	2	8	633220	633227	25 %	25 %	50 %	0 %	113955483
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