MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008319	ATC	2	6	583876	583881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953806
11502	NC_008319	GCC	2	6	583885	583890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953806
11503	NC_008319	ACC	2	6	583918	583923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953806
11504	NC_008319	GGA	2	6	584021	584026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953806
11505	NC_008319	ACG	2	6	584038	584043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953806
11506	NC_008319	CTT	2	6	584067	584072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953806
11507	NC_008319	GTG	2	6	584090	584095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953806
11508	NC_008319	CTG	2	6	584136	584141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953806
11509	NC_008319	GGC	2	6	584145	584150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953806
11510	NC_008319	ACC	2	6	584164	584169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953806
11511	NC_008319	GCA	2	6	584195	584200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953806
11512	NC_008319	GGT	2	6	584206	584211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953806
11513	NC_008319	ACC	3	9	584227	584235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953806
11514	NC_008319	CAG	2	6	584259	584264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953806
11515	NC_008319	TGC	2	6	584325	584330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953806
11516	NC_008319	AGA	2	6	584353	584358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953806
11517	NC_008319	GC	3	6	584372	584377	0 %	0 %	50 %	50 %	113953806
11518	NC_008319	T	6	6	584467	584472	0 %	100 %	0 %	0 %	113953806
11519	NC_008319	AG	3	6	584485	584490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_008319	TGTT	2	8	584534	584541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_008319	GTT	2	6	584628	584633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_008319	TGT	2	6	584725	584730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_008319	A	7	7	584756	584762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_008319	CTTTGA	2	12	584784	584795	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11525	NC_008319	CAGT	2	8	584843	584850	25 %	25 %	25 %	25 %	113953056
11526	NC_008319	GCT	2	6	584863	584868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953056
11527	NC_008319	CTG	2	6	584879	584884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953056
11528	NC_008319	AGC	2	6	584986	584991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953056
11529	NC_008319	ATC	2	6	585040	585045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953056
11530	NC_008319	GCC	2	6	585049	585054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953056
11531	NC_008319	ACC	2	6	585082	585087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953056
11532	NC_008319	GGA	2	6	585185	585190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953056
11533	NC_008319	ACG	2	6	585202	585207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953056
11534	NC_008319	CTT	2	6	585231	585236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953056
11535	NC_008319	GTG	2	6	585254	585259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953056
11536	NC_008319	CTG	2	6	585300	585305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953056
11537	NC_008319	GGC	2	6	585309	585314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953056
11538	NC_008319	ACC	2	6	585328	585333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953056
11539	NC_008319	GCA	2	6	585359	585364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953056
11540	NC_008319	GGT	2	6	585370	585375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953056
11541	NC_008319	ACC	3	9	585391	585399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953056
11542	NC_008319	CAG	2	6	585423	585428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953056
11543	NC_008319	AGCC	2	8	585456	585463	25 %	0 %	25 %	50 %	113953056
11544	NC_008319	GTT	2	6	585475	585480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953056
11545	NC_008319	GC	3	6	585536	585541	0 %	0 %	50 %	50 %	113953056
11546	NC_008319	T	6	6	585631	585636	0 %	100 %	0 %	0 %	113953056
11547	NC_008319	AG	3	6	585649	585654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_008319	TTG	2	6	585872	585877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_008319	TAAATG	2	12	585954	585965	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_008319	T	6	6	586050	586055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_008319	TAA	2	6	586165	586170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_008319	TGC	2	6	586174	586179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_008319	TCCAG	2	10	586214	586223	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11554	NC_008319	ATT	2	6	586228	586233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_008319	CGA	2	6	586258	586263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_008319	TCA	2	6	586308	586313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_008319	TC	3	6	586382	586387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11558	NC_008319	CAG	2	6	586403	586408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_008319	AAG	2	6	586426	586431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_008319	GTTG	3	12	586522	586533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_008319	TTG	2	6	586551	586556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_008319	AGT	2	6	586598	586603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_008319	CCA	2	6	586626	586631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11564	NC_008319	TGA	2	6	586642	586647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_008319	CTG	2	6	586725	586730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953623
11566	NC_008319	TG	3	6	586729	586734	0 %	50 %	50 %	0 %	113953623
11567	NC_008319	ATTC	2	8	586756	586763	25 %	50 %	0 %	25 %	113953623
11568	NC_008319	ATC	2	6	586785	586790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953623
11569	NC_008319	TCT	2	6	586813	586818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953623
11570	NC_008319	CT	3	6	586872	586877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11571	NC_008319	AAT	2	6	586881	586886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_008319	T	6	6	586911	586916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_008319	AGTGA	2	10	586960	586969	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_008319	CGT	2	6	586985	586990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_008319	GA	4	8	587031	587038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_008319	TCA	2	6	587080	587085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_008319	TCT	2	6	587107	587112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11578	NC_008319	GCT	2	6	587128	587133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11579	NC_008319	TAT	2	6	587335	587340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_008319	TTC	2	6	587379	587384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954177
11581	NC_008319	GTG	2	6	587419	587424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954177
11582	NC_008319	AGG	3	9	587438	587446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954177
11583	NC_008319	CGA	2	6	587474	587479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954177
11584	NC_008319	CAG	2	6	587485	587490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954177
11585	NC_008319	AGG	2	6	587516	587521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954177
11586	NC_008319	TCG	2	6	587535	587540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954177
11587	NC_008319	CAG	2	6	587593	587598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954177
11588	NC_008319	GCG	2	6	587605	587610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954177
11589	NC_008319	AGA	2	6	587625	587630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954177
11590	NC_008319	GCA	2	6	587649	587654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954177
11591	NC_008319	TCGA	2	8	587794	587801	25 %	25 %	25 %	25 %	113954177
11592	NC_008319	ATTT	2	8	587825	587832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_008319	TGCC	2	8	587878	587885	0 %	25 %	25 %	50 %	161349989
11594	NC_008319	CCA	2	6	587893	587898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161349989
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11598	NC_008319	CTT	2	6	588130	588135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161349989
11599	NC_008319	GCC	2	6	588159	588164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161349989
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11601	NC_008319	C	6	6	588183	588188	0 %	0 %	0 %	100 %	161349989
11602	NC_008319	CTG	2	6	588205	588210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161349989
11603	NC_008319	CAGCTC	2	12	588217	588228	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161349989
11604	NC_008319	CAC	2	6	588403	588408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161349989
11605	NC_008319	GTT	2	6	588438	588443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161349989
11606	NC_008319	GGC	2	6	588530	588535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161349989
11607	NC_008319	G	6	6	588850	588855	0 %	0 %	100 %	0 %	161349989
11608	NC_008319	GCG	2	6	588999	589004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161349989
11609	NC_008319	GTG	2	6	589017	589022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161349989
11610	NC_008319	TGC	2	6	589109	589114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161349989
11611	NC_008319	TGC	2	6	589187	589192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953550
11612	NC_008319	AGC	2	6	589238	589243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953550
11613	NC_008319	GTC	2	6	589283	589288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953550
11614	NC_008319	CTC	2	6	589298	589303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953550
11615	NC_008319	GGC	3	9	589455	589463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953550
11616	NC_008319	CTG	2	6	589546	589551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953550
11617	NC_008319	GTC	2	6	589583	589588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953550
11618	NC_008319	TGC	2	6	589591	589596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953550
11619	NC_008319	CTG	2	6	589632	589637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953550
11620	NC_008319	TGG	2	6	589645	589650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953550
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11622	NC_008319	CTG	2	6	589728	589733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953550
11623	NC_008319	TTG	2	6	589741	589746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953550
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11734	NC_008319	TGGA	2	8	595514	595521	25 %	25 %	50 %	0 %	113954652
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