MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008319	AAT	2	6	558486	558491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_008319	AGTGG	2	10	558721	558730	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_008319	TCTG	2	8	558746	558753	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11004	NC_008319	A	6	6	558766	558771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_008319	GCT	2	6	558772	558777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_008319	AG	3	6	558784	558789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_008319	TTG	2	6	558898	558903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955099
11008	NC_008319	ATG	2	6	558920	558925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955099
11009	NC_008319	GGC	2	6	558936	558941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955099
11010	NC_008319	CCATT	2	10	558955	558964	20 %	40 %	0 %	40 %	113955099
11011	NC_008319	TGAAC	2	10	558980	558989	40 %	20 %	20 %	20 %	113955099
11012	NC_008319	A	6	6	559021	559026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_008319	TGA	2	6	559030	559035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_008319	GTCA	2	8	559049	559056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11015	NC_008319	GCAAC	2	10	559083	559092	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11016	NC_008319	TTTG	2	8	559119	559126	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_008319	CAT	2	6	559137	559142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_008319	CTG	2	6	559158	559163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_008319	CTTG	2	8	559218	559225	0 %	50 %	25 %	25 %	113954894
11020	NC_008319	CGC	2	6	559271	559276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954894
11021	NC_008319	TCC	2	6	559280	559285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954894
11022	NC_008319	A	7	7	559295	559301	100 %	0 %	0 %	0 %	113954894
11023	NC_008319	A	6	6	559445	559450	100 %	0 %	0 %	0 %	113954894
11024	NC_008319	CTGAT	2	10	559512	559521	20 %	40 %	20 %	20 %	113954894
11025	NC_008319	T	7	7	559563	559569	0 %	100 %	0 %	0 %	113954894
11026	NC_008319	GCTT	2	8	559639	559646	0 %	50 %	25 %	25 %	113954894
11027	NC_008319	TGC	2	6	559730	559735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954894
11028	NC_008319	TCA	2	6	559801	559806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954894
11029	NC_008319	GTT	2	6	559814	559819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_008319	ACTTC	2	10	559823	559832	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11031	NC_008319	CCA	2	6	559868	559873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11032	NC_008319	TTG	2	6	559884	559889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_008319	TGC	2	6	559969	559974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953871
11034	NC_008319	CG	3	6	559979	559984	0 %	0 %	50 %	50 %	113953871
11035	NC_008319	TGCCGA	2	12	560023	560034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113953871
11036	NC_008319	GCG	2	6	560080	560085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953871
11037	NC_008319	TGG	2	6	560106	560111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953871
11038	NC_008319	GGC	2	6	560139	560144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953871
11039	NC_008319	CGA	2	6	560174	560179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953871
11040	NC_008319	GGT	2	6	560188	560193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953871
11041	NC_008319	TTTGC	2	10	560194	560203	0 %	60 %	20 %	20 %	113953871
11042	NC_008319	AGC	2	6	560259	560264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953871
11043	NC_008319	GCT	2	6	560321	560326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953871
11044	NC_008319	GCT	2	6	560515	560520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953871
11045	NC_008319	GGGTG	2	10	560544	560553	0 %	20 %	80 %	0 %	113953871
11046	NC_008319	CCT	2	6	560678	560683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952956
11047	NC_008319	TGA	2	6	560714	560719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952956
11048	NC_008319	TTTG	2	8	560721	560728	0 %	75 %	25 %	0 %	113952956
11049	NC_008319	GGT	2	6	560736	560741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952956
11050	NC_008319	GCG	2	6	560778	560783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952956
11051	NC_008319	G	6	6	560851	560856	0 %	0 %	100 %	0 %	113952956
11052	NC_008319	TGG	2	6	560873	560878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952956
11053	NC_008319	GTT	2	6	560880	560885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952956
11054	NC_008319	T	6	6	560931	560936	0 %	100 %	0 %	0 %	113952956
11055	NC_008319	TGC	2	6	560952	560957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952956
11056	NC_008319	GTT	2	6	560973	560978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952956
11057	NC_008319	TGT	2	6	561005	561010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952956
11058	NC_008319	GCA	2	6	561013	561018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952956
11059	NC_008319	GCCT	2	8	561054	561061	0 %	25 %	25 %	50 %	113952956
11060	NC_008319	GGT	2	6	561115	561120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952956
11061	NC_008319	GCC	2	6	561145	561150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952956
11062	NC_008319	GTG	2	6	561151	561156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952956
11063	NC_008319	TGT	3	9	561213	561221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952956
11064	NC_008319	TTG	2	6	561226	561231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952956
11065	NC_008319	TGC	2	6	561299	561304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11066	NC_008319	TGG	2	6	561337	561342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952861
11067	NC_008319	GCAA	2	8	561365	561372	50 %	0 %	25 %	25 %	113952861
11068	NC_008319	TGCC	2	8	561391	561398	0 %	25 %	25 %	50 %	113952861
11069	NC_008319	CGGC	2	8	561415	561422	0 %	0 %	50 %	50 %	113952861
11070	NC_008319	CAGC	2	8	561427	561434	25 %	0 %	25 %	50 %	113952861
11071	NC_008319	GCA	2	6	561625	561630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11072	NC_008319	C	6	6	561643	561648	0 %	0 %	0 %	100 %	113952861
11073	NC_008319	GTC	2	6	561649	561654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11074	NC_008319	GA	3	6	561692	561697	50 %	0 %	50 %	0 %	113952861
11075	NC_008319	CAG	2	6	561716	561721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11076	NC_008319	CTG	2	6	561798	561803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11077	NC_008319	CAG	2	6	561823	561828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11078	NC_008319	AAC	2	6	561851	561856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952861
11079	NC_008319	GCA	3	9	561873	561881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11080	NC_008319	CCAG	2	8	561997	562004	25 %	0 %	25 %	50 %	113952861
11081	NC_008319	A	6	6	562016	562021	100 %	0 %	0 %	0 %	113952861
11082	NC_008319	GCATCA	2	12	562152	562163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113952861
11083	NC_008319	GTT	2	6	562180	562185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952861
11084	NC_008319	GCT	2	6	562258	562263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11085	NC_008319	GCT	2	6	562334	562339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11086	NC_008319	CAC	2	6	562471	562476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113952861
11087	NC_008319	ACG	2	6	562479	562484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11088	NC_008319	CA	3	6	562491	562496	50 %	0 %	0 %	50 %	113952861
11089	NC_008319	C	6	6	562503	562508	0 %	0 %	0 %	100 %	113952861
11090	NC_008319	TCA	2	6	562550	562555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952861
11091	NC_008319	TGA	2	6	562605	562610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952861
11092	NC_008319	TGC	2	6	562662	562667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11093	NC_008319	CTC	2	6	562722	562727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952861
11094	NC_008319	CGGT	2	8	562780	562787	0 %	25 %	50 %	25 %	113952861
11095	NC_008319	AGCG	2	8	562813	562820	25 %	0 %	50 %	25 %	113952861
11096	NC_008319	GAC	2	6	562833	562838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11097	NC_008319	GTC	2	6	562843	562848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11098	NC_008319	TTG	2	6	562987	562992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952861
11099	NC_008319	GCG	2	6	563008	563013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952861
11100	NC_008319	CCT	2	6	563023	563028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952861
11101	NC_008319	AGC	2	6	563087	563092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11102	NC_008319	CAG	2	6	563179	563184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952861
11103	NC_008319	GCG	2	6	563194	563199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952861
11104	NC_008319	CAA	2	6	563266	563271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952861
11105	NC_008319	CATT	2	8	563274	563281	25 %	50 %	0 %	25 %	113952861
11106	NC_008319	GCA	2	6	563288	563293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954689
11107	NC_008319	GTT	2	6	563453	563458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954689
11108	NC_008319	GC	3	6	563475	563480	0 %	0 %	50 %	50 %	113954689
11109	NC_008319	CCA	2	6	563570	563575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954689
11110	NC_008319	GCT	2	6	563665	563670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954689
11111	NC_008319	CAG	2	6	563675	563680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954689
11112	NC_008319	CG	3	6	563720	563725	0 %	0 %	50 %	50 %	113954689
11113	NC_008319	CCT	2	6	563759	563764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954689
11114	NC_008319	CGG	2	6	563786	563791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954689
11115	NC_008319	CAC	2	6	563816	563821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954689
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11117	NC_008319	ACG	2	6	564000	564005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954689
11118	NC_008319	AAC	2	6	564040	564045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954689
11119	NC_008319	TTC	2	6	564066	564071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954689
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11121	NC_008319	GCG	2	6	564162	564167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954689
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11234	NC_008319	CACT	2	8	570304	570311	25 %	25 %	0 %	50 %	113954520
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11488	NC_008319	CTC	2	6	583330	583335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11489	NC_008319	ATTC	2	8	583367	583374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11490	NC_008319	GA	3	6	583378	583383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11491	NC_008319	GTT	2	6	583425	583430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11492	NC_008319	GTT	2	6	583445	583450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11493	NC_008319	T	6	6	583482	583487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11494	NC_008319	TGAT	2	8	583578	583585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11495	NC_008319	A	7	7	583592	583598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11496	NC_008319	CTTTGA	2	12	583620	583631	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11497	NC_008319	CAGT	2	8	583679	583686	25 %	25 %	25 %	25 %	113953806
11498	NC_008319	GCT	2	6	583699	583704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953806
11499	NC_008319	CTG	2	6	583715	583720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953806
11500	NC_008319	AGC	2	6	583822	583827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953806

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