MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_008319	CTA	2	6	532760	532765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_008319	GAA	2	6	532788	532793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_008319	TGG	2	6	532835	532840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_008319	AGCT	2	8	533019	533026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10505	NC_008319	CAG	2	6	533068	533073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_008319	G	6	6	533073	533078	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_008319	CCA	2	6	533084	533089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10508	NC_008319	TG	3	6	533143	533148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_008319	AGG	2	6	533246	533251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_008319	AGG	2	6	533271	533276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_008319	AGC	2	6	533287	533292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_008319	AATG	2	8	533345	533352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_008319	TCC	2	6	533512	533517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10514	NC_008319	AGCCA	2	10	533638	533647	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10515	NC_008319	GCT	2	6	533723	533728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_008319	GGTGG	2	10	533814	533823	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_008319	CT	4	8	533851	533858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10518	NC_008319	CGG	2	6	534068	534073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_008319	GA	3	6	534164	534169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_008319	TACA	2	8	534207	534214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10521	NC_008319	CCT	2	6	534426	534431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10522	NC_008319	GC	3	6	534446	534451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10523	NC_008319	CGA	2	6	534483	534488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_008319	GAAG	2	8	534500	534507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_008319	CGT	2	6	534757	534762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_008319	AC	3	6	534841	534846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10527	NC_008319	TG	3	6	534893	534898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_008319	GAA	2	6	534982	534987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_008319	GGA	2	6	535033	535038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_008319	AAC	2	6	535085	535090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_008319	CAT	2	6	535109	535114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10532	NC_008319	TGA	2	6	535132	535137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_008319	GCA	2	6	535238	535243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_008319	GCG	2	6	535244	535249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_008319	G	6	6	535259	535264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_008319	GAA	2	6	535312	535317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_008319	T	7	7	535340	535346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_008319	CAG	2	6	535384	535389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955506
10539	NC_008319	GGTT	2	8	535420	535427	0 %	50 %	50 %	0 %	113955506
10540	NC_008319	GC	3	6	535439	535444	0 %	0 %	50 %	50 %	113955506
10541	NC_008319	TGC	2	6	535484	535489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955506
10542	NC_008319	TCATT	2	10	535531	535540	20 %	60 %	0 %	20 %	113955506
10543	NC_008319	TCCT	2	8	535562	535569	0 %	50 %	0 %	50 %	113955506
10544	NC_008319	TTAAG	2	10	535570	535579	40 %	40 %	20 %	0 %	113955506
10545	NC_008319	TTC	2	6	535621	535626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953422
10546	NC_008319	TCG	2	6	535702	535707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953422
10547	NC_008319	GCG	2	6	535812	535817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953422
10548	NC_008319	TGT	2	6	536033	536038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953422
10549	NC_008319	AATTGC	2	12	536099	536110	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113953422
10550	NC_008319	TGT	2	6	536120	536125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953422
10551	NC_008319	TGT	2	6	536149	536154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953422
10552	NC_008319	TGA	2	6	536164	536169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953422
10553	NC_008319	TTC	2	6	536298	536303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953422
10554	NC_008319	GAT	2	6	536324	536329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953422
10555	NC_008319	TAG	2	6	536330	536335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953422
10556	NC_008319	GTT	2	6	536419	536424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953422
10557	NC_008319	GAT	2	6	536543	536548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953422
10558	NC_008319	TGCT	2	8	536569	536576	0 %	50 %	25 %	25 %	113953422
10559	NC_008319	TAA	2	6	536579	536584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953422
10560	NC_008319	A	7	7	536583	536589	100 %	0 %	0 %	0 %	113953422
10561	NC_008319	TGT	2	6	536599	536604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953422
10562	NC_008319	ATC	2	6	536673	536678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953422
10563	NC_008319	GCCA	2	8	536810	536817	25 %	0 %	25 %	50 %	113953422
10564	NC_008319	T	6	6	536854	536859	0 %	100 %	0 %	0 %	113953422
10565	NC_008319	CAA	2	6	536894	536899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_008319	TGA	3	9	536909	536917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954187
10567	NC_008319	T	7	7	536940	536946	0 %	100 %	0 %	0 %	113954187
10568	NC_008319	CAT	2	6	536963	536968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954187
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10570	NC_008319	GATT	2	8	537034	537041	25 %	50 %	25 %	0 %	113954187
10571	NC_008319	TTCG	2	8	537130	537137	0 %	50 %	25 %	25 %	113954166
10572	NC_008319	GCT	2	6	537186	537191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954166
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10575	NC_008319	TTGC	2	8	537308	537315	0 %	50 %	25 %	25 %	113954166
10576	NC_008319	CTG	2	6	537328	537333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954166
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10578	NC_008319	CAAA	2	8	537358	537365	75 %	0 %	0 %	25 %	113954166
10579	NC_008319	TGCC	2	8	537391	537398	0 %	25 %	25 %	50 %	113954166
10580	NC_008319	CGAT	2	8	537400	537407	25 %	25 %	25 %	25 %	113954166
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10583	NC_008319	T	6	6	537507	537512	0 %	100 %	0 %	0 %	113954166
10584	NC_008319	TGA	2	6	537520	537525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954166
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10588	NC_008319	ACGC	2	8	537620	537627	25 %	0 %	25 %	50 %	113954166
10589	NC_008319	GT	3	6	537630	537635	0 %	50 %	50 %	0 %	113954166
10590	NC_008319	GTC	2	6	537650	537655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954166
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10598	NC_008319	GCA	2	6	538276	538281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10599	NC_008319	CAC	2	6	538287	538292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10600	NC_008319	CTC	2	6	538293	538298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10601	NC_008319	TG	3	6	538420	538425	0 %	50 %	50 %	0 %	113953041
10602	NC_008319	GTG	2	6	538512	538517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953041
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10604	NC_008319	TGGT	2	8	538605	538612	0 %	50 %	50 %	0 %	113953041
10605	NC_008319	CCTT	2	8	538659	538666	0 %	50 %	0 %	50 %	113953041
10606	NC_008319	GGC	2	6	538678	538683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953041
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10609	NC_008319	GAT	2	6	538763	538768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953041
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10615	NC_008319	CAGGCT	2	12	539096	539107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113953041
10616	NC_008319	CCT	2	6	539136	539141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953041
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10624	NC_008319	TGC	3	9	539640	539648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953888
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10980	NC_008319	CTT	2	6	556780	556785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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