MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008319	GAA	2	6	505137	505142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955045
10002	NC_008319	TTGC	2	8	505215	505222	0 %	50 %	25 %	25 %	113955045
10003	NC_008319	AGC	2	6	505227	505232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955045
10004	NC_008319	TTG	2	6	505257	505262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955045
10005	NC_008319	CCTCG	2	10	505299	505308	0 %	20 %	20 %	60 %	113955045
10006	NC_008319	GTG	2	6	505311	505316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955045
10007	NC_008319	GAC	2	6	505329	505334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955045
10008	NC_008319	ACC	2	6	505406	505411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955045
10009	NC_008319	CGA	2	6	505445	505450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955045
10010	NC_008319	CTT	2	6	505452	505457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955045
10011	NC_008319	ATCC	2	8	505475	505482	25 %	25 %	0 %	50 %	113952888
10012	NC_008319	ATGG	2	8	505547	505554	25 %	25 %	50 %	0 %	113952888
10013	NC_008319	T	7	7	505562	505568	0 %	100 %	0 %	0 %	113952888
10014	NC_008319	ATT	2	6	505671	505676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113952888
10015	NC_008319	ATC	3	9	505686	505694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952888
10016	NC_008319	GT	3	6	505801	505806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_008319	GAA	2	6	505915	505920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_008319	TGC	2	6	505964	505969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_008319	AAT	2	6	506065	506070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_008319	CTT	2	6	506348	506353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_008319	TC	3	6	506361	506366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10022	NC_008319	GTG	2	6	506370	506375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_008319	GAT	2	6	506411	506416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_008319	CAC	2	6	506419	506424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10025	NC_008319	CCA	2	6	506438	506443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10026	NC_008319	TCA	2	6	506451	506456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_008319	AGA	2	6	506503	506508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_008319	GA	3	6	506570	506575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_008319	CT	3	6	506589	506594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10030	NC_008319	TCGGT	2	10	506601	506610	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10031	NC_008319	T	6	6	506614	506619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_008319	CT	3	6	506671	506676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10033	NC_008319	GT	3	6	506808	506813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_008319	CA	3	6	506837	506842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10035	NC_008319	AAG	2	6	506864	506869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_008319	CTC	2	6	506965	506970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_008319	TCT	2	6	507076	507081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_008319	CTT	2	6	507135	507140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_008319	CTTC	2	8	507163	507170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_008319	CGT	2	6	507228	507233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954186
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10044	NC_008319	ACA	2	6	507382	507387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954186
10045	NC_008319	CTTG	2	8	507411	507418	0 %	50 %	25 %	25 %	113954186
10046	NC_008319	CTT	3	9	507437	507445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954186
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10055	NC_008319	TGT	2	6	507798	507803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953363
10056	NC_008319	CCAAT	2	10	507824	507833	40 %	20 %	0 %	40 %	113953363
10057	NC_008319	GGTC	2	8	507901	507908	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10058	NC_008319	TGCT	2	8	507917	507924	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10059	NC_008319	GTT	2	6	507952	507957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_008319	GCT	3	9	508025	508033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10062	NC_008319	A	7	7	508227	508233	100 %	0 %	0 %	0 %	113955426
10063	NC_008319	TGA	2	6	508250	508255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955426
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10065	NC_008319	GAG	2	6	508299	508304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_008319	CCA	2	6	508318	508323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10067	NC_008319	CGT	2	6	508338	508343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10071	NC_008319	TCA	2	6	508458	508463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10083	NC_008319	TG	3	6	509312	509317	0 %	50 %	50 %	0 %	113954078
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10091	NC_008319	CGG	2	6	509749	509754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952899
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10093	NC_008319	GC	3	6	509825	509830	0 %	0 %	50 %	50 %	113952899
10094	NC_008319	TCTT	2	8	509851	509858	0 %	75 %	0 %	25 %	113952899
10095	NC_008319	TCA	2	6	509991	509996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952899
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10101	NC_008319	TCG	2	6	510252	510257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952899
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10106	NC_008319	TCC	2	6	510483	510488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952899
10107	NC_008319	AAG	2	6	510506	510511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952899
10108	NC_008319	GAAT	2	8	510674	510681	50 %	25 %	25 %	0 %	113952899
10109	NC_008319	GAGCA	2	10	510872	510881	40 %	0 %	40 %	20 %	113952899
10110	NC_008319	GCT	2	6	510975	510980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955005
10111	NC_008319	GCTT	2	8	511006	511013	0 %	50 %	25 %	25 %	113955005
10112	NC_008319	GGC	2	6	511064	511069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955005
10113	NC_008319	GAT	2	6	511149	511154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955005
10114	NC_008319	AGC	2	6	511347	511352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955005
10115	NC_008319	TGG	2	6	511367	511372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955005
10116	NC_008319	CAC	3	9	511391	511399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955005
10117	NC_008319	GCC	2	6	511413	511418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955005
10118	NC_008319	CGA	2	6	511427	511432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955005
10119	NC_008319	ACC	2	6	511470	511475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955005
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10121	NC_008319	CGG	2	6	511631	511636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955005
10122	NC_008319	ATC	2	6	511890	511895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955005
10123	NC_008319	TCA	2	6	511900	511905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955005
10124	NC_008319	TTG	2	6	511929	511934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955005
10125	NC_008319	GTG	2	6	512242	512247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_008319	G	7	7	512332	512338	0 %	0 %	100 %	0 %	113954571
10127	NC_008319	GCG	2	6	512383	512388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954571
10128	NC_008319	CAG	2	6	512395	512400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954571
10129	NC_008319	TCA	2	6	512501	512506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954571
10130	NC_008319	TGA	2	6	512523	512528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954571
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10132	NC_008319	CTTT	2	8	512669	512676	0 %	75 %	0 %	25 %	113954571
10133	NC_008319	TCT	2	6	512720	512725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954571
10134	NC_008319	CG	3	6	512857	512862	0 %	0 %	50 %	50 %	113954571
10135	NC_008319	CAT	2	6	513077	513082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955395
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10140	NC_008319	GAT	2	6	513257	513262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955395
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10154	NC_008319	ATC	2	6	513959	513964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955395
10155	NC_008319	TCCA	2	8	513980	513987	25 %	25 %	0 %	50 %	113955395
10156	NC_008319	CTG	2	6	514008	514013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10157	NC_008319	ATC	2	6	514016	514021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10158	NC_008319	TCG	2	6	514107	514112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10159	NC_008319	ATGG	3	12	514170	514181	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10160	NC_008319	CCG	2	6	514223	514228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10161	NC_008319	GCG	2	6	514283	514288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955413
10162	NC_008319	T	6	6	514521	514526	0 %	100 %	0 %	0 %	113955413
10163	NC_008319	TGC	2	6	514557	514562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955413
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10166	NC_008319	GCT	2	6	514694	514699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955413
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10169	NC_008319	AATC	2	8	514755	514762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10170	NC_008319	A	7	7	514842	514848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10171	NC_008319	CTG	2	6	514873	514878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10172	NC_008319	ACT	2	6	514884	514889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954577
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10175	NC_008319	AG	3	6	514993	514998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10176	NC_008319	GGA	2	6	515027	515032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953324
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10202	NC_008319	GT	3	6	516642	516647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10203	NC_008319	TGCC	2	8	516724	516731	0 %	25 %	25 %	50 %	113955411
10204	NC_008319	TGG	2	6	516933	516938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955411
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10219	NC_008319	ATGG	2	8	517461	517468	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10220	NC_008319	AGA	2	6	517500	517505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952749
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10228	NC_008319	TCG	2	6	517863	517868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952749
10229	NC_008319	GTC	2	6	517925	517930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952749
10230	NC_008319	CAG	2	6	517937	517942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952749
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10232	NC_008319	GAT	2	6	518096	518101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952749
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10234	NC_008319	TCT	2	6	518178	518183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952749
10235	NC_008319	CCTTG	2	10	518191	518200	0 %	40 %	20 %	40 %	113952749
10236	NC_008319	GCA	2	6	518257	518262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952749
10237	NC_008319	AGA	2	6	518307	518312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952749
10238	NC_008319	CCTT	2	8	518399	518406	0 %	50 %	0 %	50 %	113954744
10239	NC_008319	TGC	2	6	518425	518430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954744
10240	NC_008319	CA	3	6	518436	518441	50 %	0 %	0 %	50 %	113954744
10241	NC_008319	CGG	2	6	518447	518452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954744
10242	NC_008319	GGTT	2	8	518478	518485	0 %	50 %	50 %	0 %	113954744
10243	NC_008319	GAA	2	6	518487	518492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954744
10244	NC_008319	GTG	2	6	518565	518570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954744
10245	NC_008319	TCC	2	6	518639	518644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954744
10246	NC_008319	CGCTGG	2	12	518655	518666	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	113954744
10247	NC_008319	TGG	2	6	518680	518685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954744
10248	NC_008319	GTTGGT	2	12	518720	518731	0 %	50 %	50 %	0 %	113954744
10249	NC_008319	GAC	2	6	518746	518751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954744
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10251	NC_008319	GAT	2	6	518821	518826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954744
10252	NC_008319	GTA	3	9	518827	518835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_008319	TTG	2	6	518855	518860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952994
10254	NC_008319	TGG	3	9	518873	518881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952994
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10258	NC_008319	GCC	2	6	519332	519337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952994
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10261	NC_008319	CTG	2	6	519447	519452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952994
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10275	NC_008319	TGGATT	2	12	520047	520058	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	113953082
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10280	NC_008319	GCT	2	6	520285	520290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953082
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10353	NC_008319	TC	3	6	524594	524599	0 %	50 %	0 %	50 %	113955589
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10357	NC_008319	GTG	2	6	524825	524830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955589
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10362	NC_008319	GTC	2	6	525113	525118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955589
10363	NC_008319	GCC	2	6	525134	525139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955589
10364	NC_008319	TGC	2	6	525178	525183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954783
10365	NC_008319	GTT	2	6	525209	525214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954783
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10370	NC_008319	CTT	2	6	525747	525752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954783
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10372	NC_008319	GGGTGT	2	12	525804	525815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954783
10373	NC_008319	CGT	2	6	525860	525865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954783
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10392	NC_008319	TGGT	2	8	527022	527029	0 %	50 %	50 %	0 %	113953318
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10445	NC_008319	TGT	2	6	529512	529517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10476	NC_008319	GGA	3	9	531351	531359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10477	NC_008319	TGA	2	6	531375	531380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10479	NC_008319	ACAA	2	8	531447	531454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10480	NC_008319	T	6	6	531472	531477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10481	NC_008319	AG	3	6	531535	531540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10482	NC_008319	GGT	2	6	531638	531643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10483	NC_008319	ACTG	2	8	531779	531786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10484	NC_008319	GAT	2	6	531855	531860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10485	NC_008319	CTT	2	6	531866	531871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10486	NC_008319	TGATT	2	10	531900	531909	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10487	NC_008319	GA	3	6	531940	531945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10488	NC_008319	CAT	2	6	532027	532032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10489	NC_008319	TTCA	2	8	532042	532049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10490	NC_008319	AAGAGC	2	12	532071	532082	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10491	NC_008319	AGA	2	6	532156	532161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10492	NC_008319	CGG	2	6	532221	532226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10493	NC_008319	CA	3	6	532236	532241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10494	NC_008319	TAG	2	6	532389	532394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10500	NC_008319	GGGAG	2	10	532707	532716	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding

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