MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008319	CAG	2	6	349712	349717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955113
7002	NC_008319	TGC	2	6	349739	349744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955113
7003	NC_008319	CGA	2	6	349808	349813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955113
7004	NC_008319	CCGC	2	8	349816	349823	0 %	0 %	25 %	75 %	113955113
7005	NC_008319	ACC	2	6	349897	349902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955113
7006	NC_008319	CAA	2	6	349940	349945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955113
7007	NC_008319	ATCG	2	8	349974	349981	25 %	25 %	25 %	25 %	113955113
7008	NC_008319	TTGT	2	8	350051	350058	0 %	75 %	25 %	0 %	113955113
7009	NC_008319	ATCG	2	8	350195	350202	25 %	25 %	25 %	25 %	113955113
7010	NC_008319	GAT	2	6	350217	350222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955113
7011	NC_008319	ATC	2	6	350229	350234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955113
7012	NC_008319	C	6	6	350316	350321	0 %	0 %	0 %	100 %	113955113
7013	NC_008319	CAC	2	6	350331	350336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955113
7014	NC_008319	GCG	2	6	350403	350408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955113
7015	NC_008319	TTC	2	6	350463	350468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955113
7016	NC_008319	TGC	2	6	350483	350488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955113
7017	NC_008319	T	6	6	350528	350533	0 %	100 %	0 %	0 %	113955113
7018	NC_008319	CTT	2	6	350553	350558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955113
7019	NC_008319	CAG	2	6	350583	350588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955113
7020	NC_008319	GCT	2	6	350603	350608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955113
7021	NC_008319	CTA	2	6	350651	350656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955113
7022	NC_008319	AAG	2	6	350676	350681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955113
7023	NC_008319	ATCA	2	8	350709	350716	50 %	25 %	0 %	25 %	113955113
7024	NC_008319	CTGC	2	8	350732	350739	0 %	25 %	25 %	50 %	113955113
7025	NC_008319	CAC	2	6	350787	350792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955113
7026	NC_008319	TTC	2	6	350814	350819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955113
7027	NC_008319	GAAA	2	8	350837	350844	75 %	0 %	25 %	0 %	113955113
7028	NC_008319	CAG	2	6	350849	350854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955113
7029	NC_008319	CAG	2	6	350870	350875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_008319	AAG	2	6	351171	351176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954749
7031	NC_008319	CCA	2	6	351307	351312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7032	NC_008319	CGGC	2	8	351329	351336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7033	NC_008319	GAT	2	6	351483	351488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955576
7034	NC_008319	TAG	2	6	351497	351502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955576
7035	NC_008319	CTC	2	6	351532	351537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955576
7036	NC_008319	GTC	2	6	351693	351698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_008319	GTC	2	6	351705	351710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954734
7038	NC_008319	GCCCA	2	10	351718	351727	20 %	0 %	20 %	60 %	113954734
7039	NC_008319	TGA	2	6	351753	351758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954734
7040	NC_008319	AGTG	2	8	351834	351841	25 %	25 %	50 %	0 %	113954734
7041	NC_008319	GCT	2	6	351917	351922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_008319	TTGAAA	2	12	351950	351961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_008319	GAC	2	6	351987	351992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_008319	TTGGCC	2	12	352004	352015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_008319	GAAA	2	8	352024	352031	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_008319	CGC	2	6	352110	352115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953935
7047	NC_008319	CGG	2	6	352156	352161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953935
7048	NC_008319	GT	3	6	352163	352168	0 %	50 %	50 %	0 %	113953935
7049	NC_008319	GTT	2	6	352183	352188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953935
7050	NC_008319	GAG	2	6	352205	352210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953935
7051	NC_008319	GGA	2	6	352261	352266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953935
7052	NC_008319	ATTG	2	8	352270	352277	25 %	50 %	25 %	0 %	113953935
7053	NC_008319	TCC	2	6	352295	352300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953935
7054	NC_008319	CGAT	2	8	352306	352313	25 %	25 %	25 %	25 %	113953935
7055	NC_008319	ACA	2	6	352372	352377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953935
7056	NC_008319	TATCAA	2	12	352380	352391	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7057	NC_008319	CTAA	2	8	352435	352442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7058	NC_008319	GGT	2	6	352464	352469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_008319	T	6	6	352481	352486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_008319	GCA	2	6	352622	352627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_008319	TAA	2	6	352628	352633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_008319	GTC	2	6	352653	352658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_008319	GTTGA	2	10	352754	352763	20 %	40 %	40 %	0 %	113953154
7064	NC_008319	TGC	2	6	352816	352821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953154
7065	NC_008319	TTC	2	6	352847	352852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953154
7066	NC_008319	CTG	3	9	352860	352868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953154
7067	NC_008319	TTG	2	6	352907	352912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953154
7068	NC_008319	ATCC	2	8	352949	352956	25 %	25 %	0 %	50 %	113953154
7069	NC_008319	CTC	3	9	352998	353006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953154
7070	NC_008319	GTT	2	6	353031	353036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953154
7071	NC_008319	T	7	7	353180	353186	0 %	100 %	0 %	0 %	113953154
7072	NC_008319	T	6	6	353275	353280	0 %	100 %	0 %	0 %	113953154
7073	NC_008319	TTG	2	6	353291	353296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953154
7074	NC_008319	GTTG	2	8	353359	353366	0 %	50 %	50 %	0 %	113953154
7075	NC_008319	GTC	2	6	353380	353385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953154
7076	NC_008319	TTTC	2	8	353436	353443	0 %	75 %	0 %	25 %	113953154
7077	NC_008319	TGT	2	6	353607	353612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953154
7078	NC_008319	CTTTC	2	10	353634	353643	0 %	60 %	0 %	40 %	113953154
7079	NC_008319	TTGC	2	8	353660	353667	0 %	50 %	25 %	25 %	113953154
7080	NC_008319	TTGG	2	8	353786	353793	0 %	50 %	50 %	0 %	113953154
7081	NC_008319	ATA	2	6	353812	353817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953154
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7083	NC_008319	CA	3	6	353837	353842	50 %	0 %	0 %	50 %	113953154
7084	NC_008319	GCA	2	6	353843	353848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953154
7085	NC_008319	ACT	2	6	353882	353887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953154
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7087	NC_008319	TTCT	2	8	353923	353930	0 %	75 %	0 %	25 %	113953154
7088	NC_008319	GT	3	6	353941	353946	0 %	50 %	50 %	0 %	113953154
7089	NC_008319	GCCGT	2	10	354100	354109	0 %	20 %	40 %	40 %	113953154
7090	NC_008319	T	6	6	354132	354137	0 %	100 %	0 %	0 %	113953154
7091	NC_008319	ATGT	2	8	354185	354192	25 %	50 %	25 %	0 %	113953154
7092	NC_008319	T	6	6	354205	354210	0 %	100 %	0 %	0 %	113953154
7093	NC_008319	TTG	2	6	354322	354327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953154
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7095	NC_008319	CTG	2	6	354382	354387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953154
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7098	NC_008319	T	6	6	354496	354501	0 %	100 %	0 %	0 %	113953154
7099	NC_008319	TGT	2	6	354540	354545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953154
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7101	NC_008319	TTG	2	6	354570	354575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953154
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7103	NC_008319	GAT	2	6	354702	354707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_008319	AATT	2	8	354794	354801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_008319	TTC	2	6	354978	354983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954209
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7107	NC_008319	TGCT	2	8	355052	355059	0 %	50 %	25 %	25 %	113954209
7108	NC_008319	GAC	3	9	355072	355080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954209
7109	NC_008319	ACCCC	2	10	355082	355091	20 %	0 %	0 %	80 %	113954209
7110	NC_008319	TCG	2	6	355233	355238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953644
7111	NC_008319	GGC	2	6	355240	355245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953644
7112	NC_008319	AGGC	2	8	355299	355306	25 %	0 %	50 %	25 %	113953644
7113	NC_008319	TCA	2	6	355323	355328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953644
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7116	NC_008319	TTGTGG	2	12	355464	355475	0 %	50 %	50 %	0 %	113953644
7117	NC_008319	CCT	2	6	355536	355541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953644
7118	NC_008319	TGT	2	6	355542	355547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953644
7119	NC_008319	TGG	2	6	355566	355571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953644
7120	NC_008319	CGT	2	6	355616	355621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953644
7121	NC_008319	TTG	2	6	355679	355684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953644
7122	NC_008319	TTC	2	6	355743	355748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953644
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7124	NC_008319	G	6	6	355917	355922	0 %	0 %	100 %	0 %	113953644
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7242	NC_008319	TGC	2	6	361191	361196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953441
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7245	NC_008319	TCG	2	6	361434	361439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955542
7246	NC_008319	GTT	2	6	361465	361470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955542
7247	NC_008319	GTG	2	6	361487	361492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955542
7248	NC_008319	AGA	2	6	361542	361547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955542
7249	NC_008319	GCA	2	6	361583	361588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955542
7250	NC_008319	CTG	3	9	361712	361720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955542
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7256	NC_008319	GCTC	2	8	361885	361892	0 %	25 %	25 %	50 %	113955542
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7288	NC_008319	TCC	2	6	363612	363617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7360	NC_008319	GTC	2	6	366909	366914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953264
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7367	NC_008319	TC	3	6	367532	367537	0 %	50 %	0 %	50 %	113953264
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7489	NC_008319	CTC	2	6	373722	373727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953183
7490	NC_008319	GGT	2	6	373829	373834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953183
7491	NC_008319	TGT	2	6	373880	373885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953183
7492	NC_008319	GCAA	2	8	373911	373918	50 %	0 %	25 %	25 %	113953183
7493	NC_008319	TGCG	2	8	374052	374059	0 %	25 %	50 %	25 %	113953183
7494	NC_008319	GGC	2	6	374092	374097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953183
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7496	NC_008319	ACT	2	6	374295	374300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953183
7497	NC_008319	TGAT	2	8	374310	374317	25 %	50 %	25 %	0 %	113953183
7498	NC_008319	T	8	8	374403	374410	0 %	100 %	0 %	0 %	113953183
7499	NC_008319	ATG	2	6	374492	374497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953183
7500	NC_008319	CTC	2	6	374516	374521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953183

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