MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 90652

< Previous12...3233343536373839404142...181182Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_008048	GCGG	2	8	675102	675109	0 %	0 %	75 %	25 %	103486156
18003	NC_008048	CAA	2	6	675205	675210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	103486156
18004	NC_008048	TCG	2	6	675216	675221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486156
18005	NC_008048	GCC	2	6	675252	675257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486156
18006	NC_008048	GCGCG	2	10	675280	675289	0 %	0 %	60 %	40 %	103486156
18007	NC_008048	TCG	2	6	675306	675311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486156
18008	NC_008048	ATT	2	6	675312	675317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	103486156
18009	NC_008048	CGC	2	6	675338	675343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486156
18010	NC_008048	CGA	2	6	675388	675393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486156
18011	NC_008048	TCG	2	6	675423	675428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486156
18012	NC_008048	TGA	2	6	675444	675449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486156
18013	NC_008048	GGC	2	6	675451	675456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486156
18014	NC_008048	CACGA	2	10	675458	675467	40 %	0 %	20 %	40 %	103486156
18015	NC_008048	CAC	2	6	675481	675486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103486156
18016	NC_008048	GC	3	6	675503	675508	0 %	0 %	50 %	50 %	103486156
18017	NC_008048	GAG	2	6	675536	675541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103486156
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18019	NC_008048	CGCGC	2	10	675660	675669	0 %	0 %	40 %	60 %	103486156
18020	NC_008048	CGG	2	6	675688	675693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486156
18021	NC_008048	TCGG	2	8	675716	675723	0 %	25 %	50 %	25 %	103486156
18022	NC_008048	ATG	2	6	675746	675751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486156
18023	NC_008048	GAG	2	6	675752	675757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103486156
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18026	NC_008048	CGG	3	9	675844	675852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486156
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18032	NC_008048	GCC	2	6	676051	676056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18033	NC_008048	GAC	2	6	676163	676168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486157
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18037	NC_008048	TGG	2	6	676321	676326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103486157
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18043	NC_008048	GAT	2	6	676433	676438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486157
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18046	NC_008048	GTC	2	6	676572	676577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486157
18047	NC_008048	GCGCG	2	10	676624	676633	0 %	0 %	60 %	40 %	103486157
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18052	NC_008048	TCG	2	6	676923	676928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486158
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18086	NC_008048	GAAGG	2	10	678070	678079	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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18121	NC_008048	CGC	2	6	679523	679528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486162
18122	NC_008048	CGC	2	6	679567	679572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486162
18123	NC_008048	CGG	2	6	679648	679653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486162
18124	NC_008048	GCGT	2	8	679739	679746	0 %	25 %	50 %	25 %	103486162
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18151	NC_008048	CG	3	6	680619	680624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18152	NC_008048	GC	3	6	680721	680726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18221	NC_008048	ATCG	2	8	683719	683726	25 %	25 %	25 %	25 %	103486167
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18227	NC_008048	ACG	2	6	684141	684146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486168
18228	NC_008048	GCAAC	2	10	684204	684213	40 %	0 %	20 %	40 %	103486168
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18230	NC_008048	CGC	2	6	684266	684271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486168
18231	NC_008048	CG	3	6	684279	684284	0 %	0 %	50 %	50 %	103486168
18232	NC_008048	CGC	3	9	684295	684303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486168
18233	NC_008048	CG	3	6	684307	684312	0 %	0 %	50 %	50 %	103486168
18234	NC_008048	CGA	2	6	684316	684321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486168
18235	NC_008048	GC	4	8	684330	684337	0 %	0 %	50 %	50 %	103486168
18236	NC_008048	CGGT	2	8	684361	684368	0 %	25 %	50 %	25 %	103486168
18237	NC_008048	GGCG	2	8	684427	684434	0 %	0 %	75 %	25 %	103486168
18238	NC_008048	GCG	3	9	684432	684440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486168
18239	NC_008048	TCA	2	6	684442	684447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486168
18240	NC_008048	TA	3	6	684538	684543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18348	NC_008048	GCC	2	6	688491	688496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18349	NC_008048	GC	3	6	688499	688504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18350	NC_008048	TCGCT	2	10	688526	688535	0 %	40 %	20 %	40 %	103486173
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18482	NC_008048	CGA	2	6	692827	692832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486175
18483	NC_008048	TCA	2	6	692847	692852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103486175
18484	NC_008048	AAG	2	6	692861	692866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	103486175
18485	NC_008048	CGC	2	6	692901	692906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486175
18486	NC_008048	TCG	2	6	692982	692987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486175
18487	NC_008048	GGC	2	6	693013	693018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486175
18488	NC_008048	GCT	2	6	693058	693063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486175
18489	NC_008048	GCG	2	6	693086	693091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103486175
18490	NC_008048	CCGCG	2	10	693094	693103	0 %	0 %	40 %	60 %	103486175
18491	NC_008048	CGA	2	6	693163	693168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103486175
18492	NC_008048	CCG	2	6	693214	693219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486175
18493	NC_008048	TGC	2	6	693225	693230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103486175
18494	NC_008048	TCG	2	6	693275	693280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18495	NC_008048	CCCG	2	8	693349	693356	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18496	NC_008048	GAAC	2	8	693407	693414	50 %	0 %	25 %	25 %	103486176
18497	NC_008048	GAAA	2	8	693467	693474	75 %	0 %	25 %	0 %	103486176
18498	NC_008048	CGC	2	6	693476	693481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103486176
18499	NC_008048	GAT	2	6	693490	693495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486176
18500	NC_008048	ATG	2	6	693514	693519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103486176

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