MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10750 chromosome

Total Repeats: 41534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008024	ATTT	2	8	91	98	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008024	ACTA	2	8	117	124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008024	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008024	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	94993397
5	NC_008024	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	94993397
6	NC_008024	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993397
7	NC_008024	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	94993397
8	NC_008024	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94993397
9	NC_008024	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94993397
10	NC_008024	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	94993397
11	NC_008024	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94993397
12	NC_008024	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94993397
13	NC_008024	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993397
14	NC_008024	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	94993397
15	NC_008024	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993397
16	NC_008024	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	94993397
17	NC_008024	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993397
18	NC_008024	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	94993397
19	NC_008024	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	94993397
20	NC_008024	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94993397
21	NC_008024	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94993397
22	NC_008024	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	94993397
23	NC_008024	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993397
24	NC_008024	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94993397
25	NC_008024	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94993397
26	NC_008024	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	94993397
27	NC_008024	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94993397
28	NC_008024	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94993397
29	NC_008024	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993397
30	NC_008024	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94993397
31	NC_008024	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94993397
32	NC_008024	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	94993397
33	NC_008024	TGT	2	6	1598	1603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008024	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008024	TC	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008024	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008024	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008024	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008024	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008024	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008024	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993398
42	NC_008024	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993398
43	NC_008024	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	94993398
44	NC_008024	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993398
45	NC_008024	T	7	7	1951	1957	0 %	100 %	0 %	0 %	94993398
46	NC_008024	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993398
47	NC_008024	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94993398
48	NC_008024	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94993398
49	NC_008024	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94993398
50	NC_008024	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993398
51	NC_008024	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993398
52	NC_008024	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94993398
53	NC_008024	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	94993398
54	NC_008024	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94993398
55	NC_008024	GA	3	6	2335	2340	50 %	0 %	50 %	0 %	94993398
56	NC_008024	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94993398
57	NC_008024	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993398
58	NC_008024	TTTC	2	8	2424	2431	0 %	75 %	0 %	25 %	94993398
59	NC_008024	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993398
60	NC_008024	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94993398
61	NC_008024	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94993398
62	NC_008024	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	94993398
63	NC_008024	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	94993398
64	NC_008024	TGA	2	6	2797	2802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993398
65	NC_008024	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94993398
66	NC_008024	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	94993398
67	NC_008024	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	94993398
68	NC_008024	T	7	7	2874	2880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008024	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008024	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008024	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	94993399
72	NC_008024	A	6	6	2953	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	94993399
73	NC_008024	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993399
74	NC_008024	A	7	7	3099	3105	100 %	0 %	0 %	0 %	94993399
75	NC_008024	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008024	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008024	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008024	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008024	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008024	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008024	T	6	6	3402	3407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008024	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008024	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008024	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94993400
85	NC_008024	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94993400
86	NC_008024	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	94993400
87	NC_008024	A	7	7	3630	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	94993400
88	NC_008024	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	94993400
89	NC_008024	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993400
90	NC_008024	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	94993400
91	NC_008024	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	94993400
92	NC_008024	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94993400
93	NC_008024	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94993400
94	NC_008024	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94993400
95	NC_008024	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	94993400
96	NC_008024	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993400
97	NC_008024	AGA	3	9	4193	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94993400
98	NC_008024	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94993400
99	NC_008024	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94993400
100	NC_008024	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993400
101	NC_008024	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94993400
102	NC_008024	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94993400
103	NC_008024	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993400
104	NC_008024	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993400
105	NC_008024	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94993400
106	NC_008024	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94993400
107	NC_008024	GTT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94993400
108	NC_008024	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993400
109	NC_008024	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94993401
110	NC_008024	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94993401
111	NC_008024	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	94993401
112	NC_008024	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993401
113	NC_008024	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993401
114	NC_008024	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993401
115	NC_008024	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94993401
116	NC_008024	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993401
117	NC_008024	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993401
118	NC_008024	TTACGT	2	12	4938	4949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94993401
119	NC_008024	AGG	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94993401
120	NC_008024	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94993401
121	NC_008024	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993401
122	NC_008024	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94993401
123	NC_008024	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	94993401
124	NC_008024	A	6	6	5176	5181	100 %	0 %	0 %	0 %	94993401
125	NC_008024	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993402
126	NC_008024	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94993402
127	NC_008024	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993402
128	NC_008024	A	9	9	5349	5357	100 %	0 %	0 %	0 %	94993402
129	NC_008024	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993402
130	NC_008024	T	6	6	5444	5449	0 %	100 %	0 %	0 %	94993402
131	NC_008024	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993402
132	NC_008024	TTA	2	6	5706	5711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993402
133	NC_008024	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	94993402
134	NC_008024	GAT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993402
135	NC_008024	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94993402
136	NC_008024	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993402
137	NC_008024	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993402
138	NC_008024	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	94993402
139	NC_008024	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94993402
140	NC_008024	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	94993402
141	NC_008024	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993402
142	NC_008024	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993402
143	NC_008024	T	6	6	6098	6103	0 %	100 %	0 %	0 %	94993402
144	NC_008024	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993402
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147	NC_008024	ACT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993402
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151	NC_008024	A	7	7	6384	6390	100 %	0 %	0 %	0 %	94993402
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154	NC_008024	CCTT	2	8	6472	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	94993402
155	NC_008024	AGTG	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	94993402
156	NC_008024	TGA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993402
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167	NC_008024	TGA	3	9	7018	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993402
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171	NC_008024	GTA	2	6	7299	7304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993402
172	NC_008024	A	6	6	7304	7309	100 %	0 %	0 %	0 %	94993402
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182	NC_008024	TTGA	2	8	7799	7806	25 %	50 %	25 %	0 %	94993402
183	NC_008024	ATG	2	6	7824	7829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993402
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199	NC_008024	A	6	6	8686	8691	100 %	0 %	0 %	0 %	94993402
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201	NC_008024	AAC	2	6	8719	8724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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266	NC_008024	ATCAGA	2	12	11102	11113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94993407
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268	NC_008024	A	6	6	11145	11150	100 %	0 %	0 %	0 %	94993407
269	NC_008024	AGC	2	6	11201	11206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94993407
270	NC_008024	T	7	7	11225	11231	0 %	100 %	0 %	0 %	94993407
271	NC_008024	TAT	2	6	11237	11242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993407
272	NC_008024	A	6	6	11246	11251	100 %	0 %	0 %	0 %	94993407
273	NC_008024	GAT	2	6	11286	11291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993407
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408	NC_008024	A	6	6	16680	16685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_008024	A	6	6	16763	16768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_008024	TAA	2	6	16801	16806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_008024	AG	3	6	16814	16819	50 %	0 %	50 %	0 %	94993411
412	NC_008024	AC	3	6	16829	16834	50 %	0 %	0 %	50 %	94993411
413	NC_008024	A	6	6	16841	16846	100 %	0 %	0 %	0 %	94993411
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417	NC_008024	AG	3	6	17041	17046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_008024	T	6	6	17631	17636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_008024	AT	3	6	17745	17750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_008024	GGA	2	6	17751	17756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_008024	GGA	2	6	18215	18220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_008024	TGGT	2	8	18281	18288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
446	NC_008024	CGC	2	6	18405	18410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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448	NC_008024	CAC	2	6	18450	18455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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451	NC_008024	CCT	2	6	18577	18582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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454	NC_008024	TG	3	6	18790	18795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
455	NC_008024	AGCG	2	8	18844	18851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
456	NC_008024	TA	3	6	18865	18870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_008024	TAA	2	6	18970	18975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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