MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 39561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_008023	ATC	2	6	1648382	1648387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993193
35003	NC_008023	ACC	2	6	1648413	1648418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94993193
35004	NC_008023	C	7	7	1648475	1648481	0 %	0 %	0 %	100 %	94993193
35005	NC_008023	AAT	2	6	1648499	1648504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94993193
35006	NC_008023	AAGC	2	8	1648637	1648644	50 %	0 %	25 %	25 %	94993193
35007	NC_008023	TCA	2	6	1648662	1648667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993193
35008	NC_008023	TTC	2	6	1648751	1648756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94993193
35009	NC_008023	ATG	2	6	1648917	1648922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993193
35010	NC_008023	CAG	2	6	1648975	1648980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94993193
35011	NC_008023	GCAC	2	8	1649001	1649008	25 %	0 %	25 %	50 %	94993193
35012	NC_008023	ATT	2	6	1649089	1649094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35013	NC_008023	ATT	2	6	1649158	1649163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35014	NC_008023	AAT	2	6	1649165	1649170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35015	NC_008023	ATC	2	6	1649324	1649329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993194
35016	NC_008023	CTTG	2	8	1649379	1649386	0 %	50 %	25 %	25 %	94993194
35017	NC_008023	CGA	2	6	1649396	1649401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94993194
35018	NC_008023	TCA	2	6	1649418	1649423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993194
35019	NC_008023	GGAATC	2	12	1649447	1649458	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94993194
35020	NC_008023	GACT	2	8	1649506	1649513	25 %	25 %	25 %	25 %	94993194
35021	NC_008023	AGC	2	6	1649527	1649532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94993194
35022	NC_008023	GCT	3	9	1649903	1649911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94993194
35023	NC_008023	CTA	2	6	1649939	1649944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993194
35024	NC_008023	TAAAA	2	10	1649998	1650007	80 %	20 %	0 %	0 %	94993194
35025	NC_008023	TCT	2	6	1650104	1650109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94993194
35026	NC_008023	CAA	2	6	1650111	1650116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94993194
35027	NC_008023	TAG	2	6	1650117	1650122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993194
35028	NC_008023	TCT	2	6	1650152	1650157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94993194
35029	NC_008023	TCT	2	6	1650185	1650190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94993194
35030	NC_008023	ACTT	2	8	1650234	1650241	25 %	50 %	0 %	25 %	94993194
35031	NC_008023	TCA	2	6	1650323	1650328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993194
35032	NC_008023	TCC	2	6	1650388	1650393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94993194
35033	NC_008023	A	6	6	1650408	1650413	100 %	0 %	0 %	0 %	94993194
35034	NC_008023	T	6	6	1650460	1650465	0 %	100 %	0 %	0 %	94993194
35035	NC_008023	ATA	3	9	1650515	1650523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94993194
35036	NC_008023	TTA	2	6	1650528	1650533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993194
35037	NC_008023	T	6	6	1650566	1650571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35038	NC_008023	GTT	2	6	1650584	1650589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35039	NC_008023	ATG	2	6	1650638	1650643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993195
35040	NC_008023	ACC	2	6	1650682	1650687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94993195
35041	NC_008023	A	6	6	1650777	1650782	100 %	0 %	0 %	0 %	94993195
35042	NC_008023	ATCA	2	8	1650835	1650842	50 %	25 %	0 %	25 %	94993195
35043	NC_008023	CCT	2	6	1650881	1650886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94993195
35044	NC_008023	TTTG	2	8	1650904	1650911	0 %	75 %	25 %	0 %	94993195
35045	NC_008023	ATAA	2	8	1650989	1650996	75 %	25 %	0 %	0 %	94993195
35046	NC_008023	CAT	2	6	1651092	1651097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993195
35047	NC_008023	A	7	7	1651142	1651148	100 %	0 %	0 %	0 %	94993195
35048	NC_008023	A	6	6	1651187	1651192	100 %	0 %	0 %	0 %	94993195
35049	NC_008023	GGC	2	6	1651228	1651233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94993195
35050	NC_008023	AAAAG	2	10	1651255	1651264	80 %	0 %	20 %	0 %	94993195
35051	NC_008023	TTTTCA	2	12	1651275	1651286	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94993195
35052	NC_008023	AAT	2	6	1651325	1651330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94993195
35053	NC_008023	TAT	2	6	1651348	1651353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94993195
35054	NC_008023	GCTACT	2	12	1651373	1651384	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	94993195
35055	NC_008023	C	7	7	1651385	1651391	0 %	0 %	0 %	100 %	94993195
35056	NC_008023	ACA	2	6	1651394	1651399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94993195
35057	NC_008023	ACG	2	6	1651438	1651443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94993196
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35059	NC_008023	TAG	2	6	1651474	1651479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993196
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35062	NC_008023	TCA	2	6	1651629	1651634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993196
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35064	NC_008023	TCC	2	6	1651735	1651740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94993196
35065	NC_008023	GTTTT	2	10	1651779	1651788	0 %	80 %	20 %	0 %	94993196
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35071	NC_008023	CCAT	2	8	1652096	1652103	25 %	25 %	0 %	50 %	94993196
35072	NC_008023	T	7	7	1652140	1652146	0 %	100 %	0 %	0 %	94993196
35073	NC_008023	T	6	6	1652174	1652179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35074	NC_008023	T	6	6	1652237	1652242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35075	NC_008023	ATCTT	2	10	1652252	1652261	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35076	NC_008023	CAAAA	2	10	1652347	1652356	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35077	NC_008023	A	6	6	1652353	1652358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35078	NC_008023	TGTCAG	2	12	1652411	1652422	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	94993197
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35090	NC_008023	A	6	6	1652885	1652890	100 %	0 %	0 %	0 %	94993198
35091	NC_008023	TAAC	2	8	1652948	1652955	50 %	25 %	0 %	25 %	94993198
35092	NC_008023	GCA	2	6	1652999	1653004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94993198
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35098	NC_008023	ACC	2	6	1653355	1653360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35099	NC_008023	TCA	2	6	1653378	1653383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94993199
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35103	NC_008023	TGA	2	6	1653542	1653547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94993199
35104	NC_008023	CTT	2	6	1653636	1653641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94993199
35105	NC_008023	TCAGCA	2	12	1653692	1653703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94993199
35106	NC_008023	TTG	2	6	1653761	1653766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94993199
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35109	NC_008023	ACGCA	2	10	1653931	1653940	40 %	0 %	20 %	40 %	94993199
35110	NC_008023	TTTG	2	8	1653962	1653969	0 %	75 %	25 %	0 %	94993199
35111	NC_008023	ATCA	2	8	1654081	1654088	50 %	25 %	0 %	25 %	94993199
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