MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 39561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23503	NC_008023	TCA	2	6	1099185	1099190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94992642
23504	NC_008023	GGA	2	6	1099273	1099278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94992642
23505	NC_008023	TTCCTG	2	12	1099281	1099292	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	94992642
23506	NC_008023	TGT	2	6	1099344	1099349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94992642
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23509	NC_008023	A	6	6	1099458	1099463	100 %	0 %	0 %	0 %	94992642
23510	NC_008023	TGAG	2	8	1099464	1099471	25 %	25 %	50 %	0 %	94992642
23511	NC_008023	CTT	2	6	1099542	1099547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94992643
23512	NC_008023	GTC	2	6	1099582	1099587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94992643
23513	NC_008023	CAG	2	6	1099635	1099640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94992643
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23515	NC_008023	CGC	2	6	1099868	1099873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94992643
23516	NC_008023	GCA	2	6	1099880	1099885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94992643
23517	NC_008023	TCC	2	6	1099891	1099896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94992643
23518	NC_008023	CTT	2	6	1099898	1099903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94992643
23519	NC_008023	TCC	2	6	1099924	1099929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94992643
23520	NC_008023	TCC	2	6	1099957	1099962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23521	NC_008023	ATTG	2	8	1099970	1099977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23522	NC_008023	A	6	6	1100014	1100019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23526	NC_008023	GGC	2	6	1100206	1100211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94992644
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23530	NC_008023	ATCC	2	8	1100310	1100317	25 %	25 %	0 %	50 %	94992644
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23534	NC_008023	CTTT	2	8	1100516	1100523	0 %	75 %	0 %	25 %	94992644
23535	NC_008023	AT	3	6	1100525	1100530	50 %	50 %	0 %	0 %	94992644
23536	NC_008023	A	6	6	1100587	1100592	100 %	0 %	0 %	0 %	94992644
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23538	NC_008023	T	7	7	1100780	1100786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23540	NC_008023	A	7	7	1100876	1100882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23541	NC_008023	ACCC	2	8	1100936	1100943	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23542	NC_008023	T	8	8	1100952	1100959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23543	NC_008023	GAT	2	6	1101002	1101007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23546	NC_008023	TTA	2	6	1101162	1101167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94992645
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23553	NC_008023	AGC	2	6	1101633	1101638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94992646
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23622	NC_008023	T	6	6	1105719	1105724	0 %	100 %	0 %	0 %	94992648
23623	NC_008023	TCA	2	6	1105735	1105740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94992648
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23636	NC_008023	TCA	2	6	1106743	1106748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94992648
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23640	NC_008023	AT	3	6	1107094	1107099	50 %	50 %	0 %	0 %	94992648
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23649	NC_008023	TCA	2	6	1107634	1107639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94992648
23650	NC_008023	GA	3	6	1107676	1107681	50 %	0 %	50 %	0 %	94992648
23651	NC_008023	TGT	2	6	1107752	1107757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94992648
23652	NC_008023	CAT	2	6	1107794	1107799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94992648
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23655	NC_008023	GGT	2	6	1107862	1107867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94992648
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23705	NC_008023	CAG	2	6	1110722	1110727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94992648
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23707	NC_008023	CCTTT	2	10	1110786	1110795	0 %	60 %	0 %	40 %	94992648
23708	NC_008023	CTGC	2	8	1110797	1110804	0 %	25 %	25 %	50 %	94992648
23709	NC_008023	CATC	2	8	1110815	1110822	25 %	25 %	0 %	50 %	94992648
23710	NC_008023	GAC	2	6	1110839	1110844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94992648
23711	NC_008023	ATA	2	6	1110849	1110854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94992648
23712	NC_008023	AT	3	6	1110872	1110877	50 %	50 %	0 %	0 %	94992648
23713	NC_008023	AGT	2	6	1110881	1110886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94992648
23714	NC_008023	TTTA	2	8	1110942	1110949	25 %	75 %	0 %	0 %	94992648
23715	NC_008023	GGCA	2	8	1111058	1111065	25 %	0 %	50 %	25 %	94992648
23716	NC_008023	CCT	2	6	1111171	1111176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23717	NC_008023	CAGG	2	8	1111196	1111203	25 %	0 %	50 %	25 %	94992649
23718	NC_008023	TG	3	6	1111276	1111281	0 %	50 %	50 %	0 %	94992649
23719	NC_008023	TTC	2	6	1111381	1111386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94992649
23720	NC_008023	T	6	6	1111407	1111412	0 %	100 %	0 %	0 %	94992649
23721	NC_008023	TCAT	2	8	1111416	1111423	25 %	50 %	0 %	25 %	94992649
23722	NC_008023	ACC	3	9	1111424	1111432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23723	NC_008023	CCT	2	6	1111631	1111636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94992650
23724	NC_008023	TTG	2	6	1111667	1111672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94992650
23725	NC_008023	GTT	2	6	1111752	1111757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94992650
23726	NC_008023	TGG	2	6	1111970	1111975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94992650
23727	NC_008023	AAT	2	6	1112036	1112041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94992650
23728	NC_008023	TCC	2	6	1112116	1112121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94992650
23729	NC_008023	TGA	2	6	1112132	1112137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94992650
23730	NC_008023	TGT	2	6	1112217	1112222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94992650
23731	NC_008023	TCTGT	2	10	1112297	1112306	0 %	60 %	20 %	20 %	94992650
23732	NC_008023	TCC	2	6	1112339	1112344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94992651
23733	NC_008023	T	7	7	1112355	1112361	0 %	100 %	0 %	0 %	94992651
23734	NC_008023	CTG	2	6	1112368	1112373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94992651
23735	NC_008023	T	6	6	1112415	1112420	0 %	100 %	0 %	0 %	94992651
23736	NC_008023	CAT	2	6	1112442	1112447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94992651
23737	NC_008023	GGCAA	2	10	1112476	1112485	40 %	0 %	40 %	20 %	94992651
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