MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 39561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_008023	ACCGTT	2	12	611270	611281	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	94992132
13003	NC_008023	TAT	2	6	611287	611292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94992132
13004	NC_008023	GCA	2	6	611400	611405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94992132
13005	NC_008023	GAG	2	6	611488	611493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94992132
13006	NC_008023	CTT	2	6	611598	611603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94992132
13007	NC_008023	A	7	7	611662	611668	100 %	0 %	0 %	0 %	94992132
13008	NC_008023	TGAG	2	8	611690	611697	25 %	25 %	50 %	0 %	94992132
13009	NC_008023	GAG	2	6	611717	611722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94992132
13010	NC_008023	TGC	2	6	611808	611813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94992132
13011	NC_008023	T	6	6	611871	611876	0 %	100 %	0 %	0 %	94992132
13012	NC_008023	AAG	2	6	611882	611887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94992132
13013	NC_008023	CAA	2	6	611908	611913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94992132
13014	NC_008023	TAT	2	6	611962	611967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94992132
13015	NC_008023	GTT	2	6	612055	612060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94992132
13016	NC_008023	TAGCC	2	10	612072	612081	20 %	20 %	20 %	40 %	94992132
13017	NC_008023	AAG	2	6	612086	612091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94992132
13018	NC_008023	CAG	2	6	612143	612148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94992132
13019	NC_008023	TA	3	6	612326	612331	50 %	50 %	0 %	0 %	94992132
13020	NC_008023	ATT	2	6	612343	612348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94992132
13021	NC_008023	CTG	2	6	612350	612355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94992132
13022	NC_008023	AAG	2	6	612389	612394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94992132
13023	NC_008023	CTGGG	2	10	612545	612554	0 %	20 %	60 %	20 %	94992132
13024	NC_008023	ATG	2	6	612596	612601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94992132
13025	NC_008023	AGA	2	6	612816	612821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94992132
13026	NC_008023	A	6	6	612887	612892	100 %	0 %	0 %	0 %	94992132
13027	NC_008023	TAG	2	6	612905	612910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94992132
13028	NC_008023	CAG	2	6	612923	612928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94992132
13029	NC_008023	TGT	2	6	612990	612995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94992132
13030	NC_008023	TGAAGA	2	12	613161	613172	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	94992132
13031	NC_008023	A	6	6	613208	613213	100 %	0 %	0 %	0 %	94992133
13032	NC_008023	ACA	2	6	613331	613336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94992133
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13034	NC_008023	ATTG	2	8	613396	613403	25 %	50 %	25 %	0 %	94992133
13035	NC_008023	CTG	2	6	613404	613409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94992133
13036	NC_008023	ATT	2	6	613478	613483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94992133
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13039	NC_008023	AAGA	2	8	613601	613608	75 %	0 %	25 %	0 %	94992133
13040	NC_008023	TCA	2	6	613617	613622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94992133
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13043	NC_008023	TGG	2	6	613942	613947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94992133
13044	NC_008023	ATG	2	6	614024	614029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94992133
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13049	NC_008023	TGA	2	6	614125	614130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94992133
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13051	NC_008023	AGA	2	6	614218	614223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94992133
13052	NC_008023	ATA	2	6	614224	614229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94992133
13053	NC_008023	TTA	2	6	614236	614241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_008023	ACT	2	6	614266	614271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_008023	T	6	6	614309	614314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_008023	TC	3	6	614362	614367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13057	NC_008023	T	6	6	614368	614373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_008023	TTA	2	6	614409	614414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_008023	TTG	2	6	614431	614436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_008023	TAA	2	6	614448	614453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_008023	AGAC	2	8	614488	614495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13062	NC_008023	GAATA	2	10	614575	614584	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_008023	A	8	8	614592	614599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_008023	CTA	2	6	614614	614619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94992134
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13066	NC_008023	CTTT	2	8	614776	614783	0 %	75 %	0 %	25 %	94992134
13067	NC_008023	ATA	2	6	614828	614833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_008023	AGG	2	6	614838	614843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_008023	GAA	2	6	614854	614859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94992135
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13095	NC_008023	TTA	2	6	616271	616276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94992137
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13099	NC_008023	ATG	2	6	616401	616406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94992137
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13102	NC_008023	A	6	6	616443	616448	100 %	0 %	0 %	0 %	94992137
13103	NC_008023	GTT	2	6	616463	616468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94992137
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13106	NC_008023	AAT	2	6	616550	616555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94992137
13107	NC_008023	TCG	2	6	616576	616581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94992137
13108	NC_008023	GTG	2	6	616619	616624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_008023	TTAA	2	8	616661	616668	50 %	50 %	0 %	0 %	94992138
13110	NC_008023	GTG	2	6	616776	616781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94992138
13111	NC_008023	CTT	2	6	616784	616789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94992138
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13119	NC_008023	TCG	2	6	617461	617466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94992138
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13123	NC_008023	TCT	2	6	617655	617660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94992138
13124	NC_008023	ATC	2	6	617710	617715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94992138
13125	NC_008023	GGT	2	6	617729	617734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94992138
13126	NC_008023	TGC	2	6	617839	617844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94992138
13127	NC_008023	GAT	2	6	617966	617971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94992138
13128	NC_008023	GAT	2	6	617981	617986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94992138
13129	NC_008023	GAA	2	6	617999	618004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94992138
13130	NC_008023	ACT	2	6	618015	618020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94992138
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13132	NC_008023	GAA	2	6	618077	618082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94992138
13133	NC_008023	GGA	2	6	618142	618147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13134	NC_008023	CT	3	6	618163	618168	0 %	50 %	0 %	50 %	94992139
13135	NC_008023	ATT	2	6	618188	618193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94992139
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13144	NC_008023	TGA	2	6	618748	618753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94992139
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13151	NC_008023	AAG	2	6	619139	619144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13152	NC_008023	ACTA	2	8	619153	619160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13153	NC_008023	ATGA	2	8	619188	619195	50 %	25 %	25 %	0 %	94992140
13154	NC_008023	GTT	2	6	619216	619221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94992140
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13161	NC_008023	A	6	6	619540	619545	100 %	0 %	0 %	0 %	94992140
13162	NC_008023	TGA	2	6	619557	619562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94992140
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13167	NC_008023	A	6	6	619808	619813	100 %	0 %	0 %	0 %	94992140
13168	NC_008023	ATGA	2	8	619834	619841	50 %	25 %	25 %	0 %	94992140
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13172	NC_008023	CTG	2	6	620000	620005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94992140
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13174	NC_008023	CAG	2	6	620108	620113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94992140
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13180	NC_008023	TTGG	2	8	620377	620384	0 %	50 %	50 %	0 %	94992140
13181	NC_008023	CGT	2	6	620392	620397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94992140
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13195	NC_008023	TAAG	2	8	621051	621058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13196	NC_008023	TAT	2	6	621073	621078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13197	NC_008023	TTTG	2	8	621079	621086	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13198	NC_008023	TAC	2	6	621125	621130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13200	NC_008023	TTG	2	6	621151	621156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13201	NC_008023	T	6	6	621180	621185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13202	NC_008023	GTT	2	6	621194	621199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13204	NC_008023	TAA	2	6	621304	621309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94992142
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13208	NC_008023	ATT	2	6	621379	621384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94992142
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13213	NC_008023	TAC	2	6	621581	621586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13215	NC_008023	AAT	2	6	621623	621628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94992143
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13230	NC_008023	TGG	2	6	622691	622696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94992143
13231	NC_008023	TGC	2	6	622745	622750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94992143
13232	NC_008023	TTG	2	6	622768	622773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94992143
13233	NC_008023	TAA	2	6	622793	622798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94992143
13234	NC_008023	CTA	2	6	622820	622825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94992143
13235	NC_008023	CTA	2	6	622858	622863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94992143
13236	NC_008023	TTA	2	6	622926	622931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94992144
13237	NC_008023	TGC	2	6	622943	622948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94992144
13238	NC_008023	T	7	7	622960	622966	0 %	100 %	0 %	0 %	94992144
13239	NC_008023	A	6	6	623126	623131	100 %	0 %	0 %	0 %	94992145
13240	NC_008023	CTTA	2	8	623176	623183	25 %	50 %	0 %	25 %	94992145
13241	NC_008023	CAG	2	6	623247	623252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94992145
13242	NC_008023	CAC	2	6	623267	623272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94992145
13243	NC_008023	TGG	2	6	623332	623337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94992145
13244	NC_008023	ATA	2	6	623373	623378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94992145
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13371	NC_008023	CCT	2	6	631107	631112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94992153
13372	NC_008023	CCT	2	6	631131	631136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94992153
13373	NC_008023	AGGAGA	2	12	631146	631157	50 %	0 %	50 %	0 %	94992153
13374	NC_008023	CCT	2	6	631182	631187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94992153
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13377	NC_008023	ATC	2	6	631292	631297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94992153
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13485	NC_008023	GCT	2	6	637012	637017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94992155
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13488	NC_008023	GCA	2	6	637146	637151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94992155
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13492	NC_008023	AACA	2	8	637251	637258	75 %	0 %	0 %	25 %	94992156
13493	NC_008023	A	8	8	637324	637331	100 %	0 %	0 %	0 %	94992156
13494	NC_008023	TTTAT	2	10	637333	637342	20 %	80 %	0 %	0 %	94992156
13495	NC_008023	AGTC	2	8	637531	637538	25 %	25 %	25 %	25 %	94992156
13496	NC_008023	GAC	2	6	637540	637545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94992156
13497	NC_008023	TTA	2	6	637560	637565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94992156
13498	NC_008023	GAT	2	6	637572	637577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94992156
13499	NC_008023	AGC	2	6	637661	637666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94992156
13500	NC_008023	TTA	2	6	637722	637727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94992156

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