MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10270 chromosome

Total Repeats: 41330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_008022	TTTGT	2	10	1260379	1260388	0 %	80 %	20 %	0 %	94990814
27002	NC_008022	TCA	2	6	1260425	1260430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990815
27003	NC_008022	CAT	2	6	1260449	1260454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990815
27004	NC_008022	GCC	2	6	1260521	1260526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94990815
27005	NC_008022	CAA	2	6	1260573	1260578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94990815
27006	NC_008022	CCA	2	6	1260652	1260657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94990815
27007	NC_008022	ACC	2	6	1260686	1260691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27008	NC_008022	CTC	2	6	1260753	1260758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94990816
27009	NC_008022	GTTT	2	8	1260763	1260770	0 %	75 %	25 %	0 %	94990816
27010	NC_008022	ACC	2	6	1260853	1260858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94990816
27011	NC_008022	CAT	2	6	1260866	1260871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990816
27012	NC_008022	T	6	6	1260888	1260893	0 %	100 %	0 %	0 %	94990816
27013	NC_008022	GGCT	2	8	1260894	1260901	0 %	25 %	50 %	25 %	94990816
27014	NC_008022	AATC	2	8	1260935	1260942	50 %	25 %	0 %	25 %	94990816
27015	NC_008022	GCC	2	6	1260945	1260950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94990816
27016	NC_008022	ATC	2	6	1260982	1260987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990816
27017	NC_008022	TGCG	2	8	1260991	1260998	0 %	25 %	50 %	25 %	94990816
27018	NC_008022	CAG	2	6	1261022	1261027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990816
27019	NC_008022	T	6	6	1261070	1261075	0 %	100 %	0 %	0 %	94990816
27020	NC_008022	GTC	2	6	1261080	1261085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990816
27021	NC_008022	T	6	6	1261131	1261136	0 %	100 %	0 %	0 %	94990816
27022	NC_008022	TTC	2	6	1261140	1261145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990816
27023	NC_008022	GA	3	6	1261205	1261210	50 %	0 %	50 %	0 %	94990816
27024	NC_008022	CAG	2	6	1261226	1261231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990816
27025	NC_008022	ATA	3	9	1261234	1261242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990816
27026	NC_008022	TG	3	6	1261243	1261248	0 %	50 %	50 %	0 %	94990816
27027	NC_008022	T	6	6	1261322	1261327	0 %	100 %	0 %	0 %	94990817
27028	NC_008022	TTC	2	6	1261331	1261336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990817
27029	NC_008022	TGT	2	6	1261351	1261356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990817
27030	NC_008022	GAT	2	6	1261374	1261379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990817
27031	NC_008022	TTC	2	6	1261460	1261465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990817
27032	NC_008022	TCG	2	6	1261497	1261502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990817
27033	NC_008022	TCA	2	6	1261539	1261544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990817
27034	NC_008022	CATA	2	8	1261576	1261583	50 %	25 %	0 %	25 %	94990817
27035	NC_008022	ACT	2	6	1261629	1261634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990817
27036	NC_008022	AGC	2	6	1261641	1261646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990817
27037	NC_008022	TGATTT	2	12	1261678	1261689	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	94990817
27038	NC_008022	T	6	6	1261725	1261730	0 %	100 %	0 %	0 %	94990817
27039	NC_008022	TTG	2	6	1261763	1261768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990818
27040	NC_008022	ATT	2	6	1261774	1261779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990818
27041	NC_008022	CAA	2	6	1261850	1261855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94990818
27042	NC_008022	CTA	2	6	1261866	1261871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990818
27043	NC_008022	TCAT	2	8	1261886	1261893	25 %	50 %	0 %	25 %	94990818
27044	NC_008022	GT	5	10	1262168	1262177	0 %	50 %	50 %	0 %	94990818
27045	NC_008022	TGA	2	6	1262289	1262294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990818
27046	NC_008022	ATAGC	2	10	1262318	1262327	40 %	20 %	20 %	20 %	94990818
27047	NC_008022	TAC	2	6	1262367	1262372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990818
27048	NC_008022	AGC	2	6	1262401	1262406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990818
27049	NC_008022	AAT	2	6	1262422	1262427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990818
27050	NC_008022	GCC	2	6	1262590	1262595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94990818
27051	NC_008022	TAA	2	6	1262637	1262642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990818
27052	NC_008022	GCT	2	6	1262670	1262675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990818
27053	NC_008022	ACG	2	6	1262797	1262802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990818
27054	NC_008022	CT	3	6	1262810	1262815	0 %	50 %	0 %	50 %	94990818
27055	NC_008022	TGC	2	6	1262822	1262827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990818
27056	NC_008022	CCTGT	2	10	1262843	1262852	0 %	40 %	20 %	40 %	94990818
27057	NC_008022	CTG	2	6	1262887	1262892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990818
27058	NC_008022	TAC	2	6	1262946	1262951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990818
27059	NC_008022	GTT	2	6	1263014	1263019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990818
27060	NC_008022	TGA	2	6	1263219	1263224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990818
27061	NC_008022	CGT	2	6	1263306	1263311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990818
27062	NC_008022	ACT	3	9	1263443	1263451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990818
27063	NC_008022	TAG	2	6	1263465	1263470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990818
27064	NC_008022	GCTA	2	8	1263526	1263533	25 %	25 %	25 %	25 %	94990818
27065	NC_008022	GTC	2	6	1263550	1263555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990818
27066	NC_008022	TCC	2	6	1263646	1263651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27067	NC_008022	T	6	6	1263688	1263693	0 %	100 %	0 %	0 %	94990819
27068	NC_008022	ATC	2	6	1263730	1263735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990819
27069	NC_008022	ACC	2	6	1263796	1263801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94990819
27070	NC_008022	ATC	2	6	1263823	1263828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990819
27071	NC_008022	AGC	2	6	1263895	1263900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990819
27072	NC_008022	T	6	6	1263922	1263927	0 %	100 %	0 %	0 %	94990819
27073	NC_008022	GT	3	6	1263991	1263996	0 %	50 %	50 %	0 %	94990819
27074	NC_008022	GGT	2	6	1264096	1264101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94990819
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27079	NC_008022	CGC	2	6	1264350	1264355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94990819
27080	NC_008022	TGCTT	2	10	1264423	1264432	0 %	60 %	20 %	20 %	94990819
27081	NC_008022	TCT	2	6	1264463	1264468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990819
27082	NC_008022	TTA	2	6	1264496	1264501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990819
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27085	NC_008022	TAACT	2	10	1264929	1264938	40 %	40 %	0 %	20 %	94990820
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27090	NC_008022	GTT	2	6	1265133	1265138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990820
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27092	NC_008022	TCA	2	6	1265230	1265235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990820
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27101	NC_008022	GATT	2	8	1265676	1265683	25 %	50 %	25 %	0 %	94990820
27102	NC_008022	TG	3	6	1265706	1265711	0 %	50 %	50 %	0 %	94990820
27103	NC_008022	ACT	2	6	1265746	1265751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990820
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27108	NC_008022	T	6	6	1265961	1265966	0 %	100 %	0 %	0 %	94990820
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27111	NC_008022	GATA	2	8	1266164	1266171	50 %	25 %	25 %	0 %	94990820
27112	NC_008022	CTC	3	9	1266198	1266206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94990820
27113	NC_008022	TTGC	2	8	1266261	1266268	0 %	50 %	25 %	25 %	94990820
27114	NC_008022	GAT	2	6	1266273	1266278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990820
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27119	NC_008022	TG	3	6	1266517	1266522	0 %	50 %	50 %	0 %	94990820
27120	NC_008022	GTA	2	6	1266572	1266577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990820
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27197	NC_008022	T	6	6	1271039	1271044	0 %	100 %	0 %	0 %	94990823
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27201	NC_008022	A	6	6	1271232	1271237	100 %	0 %	0 %	0 %	94990823
27202	NC_008022	TCA	3	9	1271238	1271246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990823
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27207	NC_008022	CGA	2	6	1271655	1271660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990824
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27209	NC_008022	TCAA	2	8	1271688	1271695	50 %	25 %	0 %	25 %	94990824
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27212	NC_008022	T	8	8	1271846	1271853	0 %	100 %	0 %	0 %	94990825
27213	NC_008022	AG	3	6	1271882	1271887	50 %	0 %	50 %	0 %	94990825
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27227	NC_008022	TTG	2	6	1272754	1272759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990827
27228	NC_008022	ACTTGT	2	12	1272829	1272840	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94990827
27229	NC_008022	CAC	2	6	1272847	1272852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94990827
27230	NC_008022	CAT	2	6	1272962	1272967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990827
27231	NC_008022	GTT	2	6	1272974	1272979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990827
27232	NC_008022	ATG	2	6	1272981	1272986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990827
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27234	NC_008022	A	6	6	1273083	1273088	100 %	0 %	0 %	0 %	94990828
27235	NC_008022	TGTT	2	8	1273092	1273099	0 %	75 %	25 %	0 %	94990828
27236	NC_008022	GTGG	2	8	1273101	1273108	0 %	25 %	75 %	0 %	94990828
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27480	NC_008022	T	7	7	1284293	1284299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27484	NC_008022	TAG	2	6	1284530	1284535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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