MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10270 chromosome

Total Repeats: 41330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008022	ATTG	2	8	611301	611308	25 %	50 %	25 %	0 %	94990145
13002	NC_008022	A	6	6	611333	611338	100 %	0 %	0 %	0 %	94990145
13003	NC_008022	GAA	2	6	611518	611523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94990145
13004	NC_008022	AGA	2	6	611532	611537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94990145
13005	NC_008022	A	6	6	611560	611565	100 %	0 %	0 %	0 %	94990145
13006	NC_008022	TGA	2	6	611577	611582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990145
13007	NC_008022	CAT	2	6	611591	611596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990145
13008	NC_008022	CTT	2	6	611632	611637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990145
13009	NC_008022	GGT	2	6	611653	611658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94990145
13010	NC_008022	GGT	2	6	611674	611679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94990145
13011	NC_008022	ATGA	2	8	611854	611861	50 %	25 %	25 %	0 %	94990145
13012	NC_008022	GCC	2	6	611862	611867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94990145
13013	NC_008022	ATA	2	6	611957	611962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990145
13014	NC_008022	CAGG	2	8	611977	611984	25 %	0 %	50 %	25 %	94990145
13015	NC_008022	CTG	2	6	612020	612025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990145
13016	NC_008022	ACCA	2	8	612032	612039	50 %	0 %	0 %	50 %	94990145
13017	NC_008022	CAA	2	6	612182	612187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94990145
13018	NC_008022	TTG	2	6	612275	612280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990145
13019	NC_008022	CAT	2	6	612348	612353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990145
13020	NC_008022	GATG	2	8	612366	612373	25 %	25 %	50 %	0 %	94990145
13021	NC_008022	A	6	6	612389	612394	100 %	0 %	0 %	0 %	94990145
13022	NC_008022	TTGG	2	8	612397	612404	0 %	50 %	50 %	0 %	94990145
13023	NC_008022	CGT	2	6	612412	612417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990145
13024	NC_008022	TTC	2	6	612424	612429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990145
13025	NC_008022	AGA	2	6	612549	612554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94990145
13026	NC_008022	A	6	6	612592	612597	100 %	0 %	0 %	0 %	94990145
13027	NC_008022	A	6	6	612602	612607	100 %	0 %	0 %	0 %	94990145
13028	NC_008022	AAC	2	6	612705	612710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94990146
13029	NC_008022	ATGAA	2	10	612773	612782	60 %	20 %	20 %	0 %	94990146
13030	NC_008022	GGT	2	6	612793	612798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94990146
13031	NC_008022	CAAT	2	8	612824	612831	50 %	25 %	0 %	25 %	94990146
13032	NC_008022	GGT	2	6	612832	612837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94990146
13033	NC_008022	ATT	2	6	612838	612843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990146
13034	NC_008022	ATA	2	6	612971	612976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990146
13035	NC_008022	TGA	2	6	612978	612983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990146
13036	NC_008022	TCG	2	6	612987	612992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990146
13037	NC_008022	A	6	6	613039	613044	100 %	0 %	0 %	0 %	94990146
13038	NC_008022	GTG	2	6	613048	613053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_008022	TAAG	2	8	613071	613078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_008022	TAT	2	6	613093	613098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_008022	TTTG	2	8	613099	613106	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_008022	TAC	2	6	613145	613150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_008022	TTA	2	6	613165	613170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_008022	TTG	2	6	613171	613176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_008022	T	6	6	613200	613205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_008022	GTT	2	6	613214	613219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_008022	AGA	2	6	613274	613279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_008022	TAA	2	6	613324	613329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990147
13049	NC_008022	ATT	2	6	613339	613344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990147
13050	NC_008022	ATTT	2	8	613371	613378	25 %	75 %	0 %	0 %	94990147
13051	NC_008022	T	6	6	613376	613381	0 %	100 %	0 %	0 %	94990147
13052	NC_008022	ATT	2	6	613399	613404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990147
13053	NC_008022	ATC	2	6	613440	613445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990147
13054	NC_008022	TTA	2	6	613481	613486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990147
13055	NC_008022	T	6	6	613553	613558	0 %	100 %	0 %	0 %	94990147
13056	NC_008022	AAG	2	6	613582	613587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_008022	TAC	2	6	613601	613606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_008022	AGAT	2	8	613614	613621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_008022	AAT	2	6	613643	613648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990148
13060	NC_008022	GGT	2	6	613656	613661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94990148
13061	NC_008022	GTT	2	6	613683	613688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990148
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13063	NC_008022	GCA	2	6	613725	613730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990148
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13065	NC_008022	TTG	2	6	613930	613935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990148
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13070	NC_008022	ATG	2	6	614323	614328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990148
13071	NC_008022	GCG	2	6	614370	614375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94990148
13072	NC_008022	AGA	3	9	614468	614476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94990148
13073	NC_008022	AC	3	6	614500	614505	50 %	0 %	0 %	50 %	94990148
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13077	NC_008022	TGC	2	6	614765	614770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990148
13078	NC_008022	TTG	2	6	614788	614793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990148
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13080	NC_008022	CTA	2	6	614840	614845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990148
13081	NC_008022	CTA	2	6	614878	614883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990148
13082	NC_008022	TTA	2	6	614946	614951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990149
13083	NC_008022	TGC	2	6	614963	614968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990149
13084	NC_008022	T	7	7	614980	614986	0 %	100 %	0 %	0 %	94990149
13085	NC_008022	A	6	6	615146	615151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_008022	CTTA	2	8	615196	615203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13087	NC_008022	CGACA	2	10	615210	615219	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13088	NC_008022	CAG	2	6	615267	615272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13091	NC_008022	ATA	2	6	615393	615398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990150
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13093	NC_008022	CGT	2	6	615476	615481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990150
13094	NC_008022	ATG	2	6	615528	615533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990150
13095	NC_008022	CTA	2	6	615542	615547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990150
13096	NC_008022	TGA	2	6	615580	615585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990150
13097	NC_008022	T	7	7	615710	615716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_008022	ATAGA	2	10	615718	615727	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_008022	CTT	2	6	615802	615807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_008022	AATT	2	8	615842	615849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_008022	GGA	2	6	615912	615917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527103358
13102	NC_008022	T	6	6	615927	615932	0 %	100 %	0 %	0 %	527103358
13103	NC_008022	AAG	2	6	615942	615947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527103358
13104	NC_008022	TGGT	2	8	616134	616141	0 %	50 %	50 %	0 %	527103358
13105	NC_008022	GAA	2	6	616184	616189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527103358
13106	NC_008022	GCT	2	6	616208	616213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527103358
13107	NC_008022	GTC	2	6	616263	616268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527103358
13108	NC_008022	GAA	2	6	616310	616315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527103358
13109	NC_008022	TTG	2	6	616350	616355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527103358
13110	NC_008022	ATT	2	6	616377	616382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527103358
13111	NC_008022	ATC	2	6	616413	616418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527103358
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13113	NC_008022	CGT	2	6	616562	616567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527103358
13114	NC_008022	TGA	2	6	616573	616578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527103358
13115	NC_008022	ATC	2	6	616670	616675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527103358
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13117	NC_008022	TGG	2	6	616774	616779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527103358
13118	NC_008022	GGAT	2	8	616808	616815	25 %	25 %	50 %	0 %	527103358
13119	NC_008022	ATA	2	6	617066	617071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_008022	TAG	2	6	617240	617245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990152
13121	NC_008022	CAG	2	6	617261	617266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990152
13122	NC_008022	CATTTG	2	12	617386	617397	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94990152
13123	NC_008022	TGA	2	6	617415	617420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990152
13124	NC_008022	TG	4	8	617436	617443	0 %	50 %	50 %	0 %	94990152
13125	NC_008022	A	6	6	617521	617526	100 %	0 %	0 %	0 %	94990152
13126	NC_008022	TAT	2	6	617595	617600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990152
13127	NC_008022	AGA	2	6	617637	617642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94990152
13128	NC_008022	ATCAT	2	10	617687	617696	40 %	40 %	0 %	20 %	94990152
13129	NC_008022	A	7	7	617795	617801	100 %	0 %	0 %	0 %	94990152
13130	NC_008022	AATG	2	8	617937	617944	50 %	25 %	25 %	0 %	94990152
13131	NC_008022	TAA	2	6	617961	617966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990152
13132	NC_008022	ATGC	2	8	618013	618020	25 %	25 %	25 %	25 %	94990152
13133	NC_008022	TTA	2	6	618134	618139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990152
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13135	NC_008022	GTT	2	6	618217	618222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990152
13136	NC_008022	GCT	2	6	618229	618234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990152
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13138	NC_008022	CGT	2	6	618574	618579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990152
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13144	NC_008022	AGA	2	6	618975	618980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94990152
13145	NC_008022	TTTTGC	2	12	619002	619013	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	94990152
13146	NC_008022	CCAA	2	8	619135	619142	50 %	0 %	0 %	50 %	94990152
13147	NC_008022	GGAC	2	8	619165	619172	25 %	0 %	50 %	25 %	94990152
13148	NC_008022	TTG	2	6	619208	619213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990152
13149	NC_008022	GCT	2	6	619282	619287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990152
13150	NC_008022	AGC	2	6	619293	619298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990152
13151	NC_008022	GTGAG	2	10	619376	619385	20 %	20 %	60 %	0 %	94990152
13152	NC_008022	TCA	2	6	619386	619391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990152
13153	NC_008022	CAG	2	6	619415	619420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990152
13154	NC_008022	GAA	2	6	619543	619548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94990152
13155	NC_008022	A	7	7	619616	619622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13156	NC_008022	T	7	7	619642	619648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13157	NC_008022	A	6	6	619664	619669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13158	NC_008022	GGA	2	6	619710	619715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94990153
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13160	NC_008022	TCT	2	6	619853	619858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990153
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13162	NC_008022	TG	4	8	619869	619876	0 %	50 %	50 %	0 %	94990153
13163	NC_008022	AC	3	6	619908	619913	50 %	0 %	0 %	50 %	94990153
13164	NC_008022	GAA	2	6	619943	619948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94990153
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13168	NC_008022	CTC	2	6	620045	620050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94990153
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13207	NC_008022	AGCAC	2	10	622351	622360	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13208	NC_008022	T	7	7	622369	622375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13209	NC_008022	TAT	2	6	622387	622392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13228	NC_008022	ATC	2	6	623314	623319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990157
13229	NC_008022	TAT	2	6	623356	623361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13230	NC_008022	AAT	2	6	623364	623369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13231	NC_008022	ATG	2	6	623391	623396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13232	NC_008022	TATAA	2	10	623436	623445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13233	NC_008022	AATT	2	8	623483	623490	50 %	50 %	0 %	0 %	94990158
13234	NC_008022	TGAA	2	8	623528	623535	50 %	25 %	25 %	0 %	94990158
13235	NC_008022	GCT	2	6	623545	623550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990158
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13237	NC_008022	GTTC	2	8	623664	623671	0 %	50 %	25 %	25 %	94990158
13238	NC_008022	T	6	6	623744	623749	0 %	100 %	0 %	0 %	94990158
13239	NC_008022	AGA	2	6	623775	623780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94990158
13240	NC_008022	AAT	2	6	623806	623811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990158
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13242	NC_008022	TA	3	6	623840	623845	50 %	50 %	0 %	0 %	94990158
13243	NC_008022	A	6	6	623853	623858	100 %	0 %	0 %	0 %	94990158
13244	NC_008022	AAG	2	6	623909	623914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94990158
13245	NC_008022	TTA	2	6	623918	623923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990158
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13247	NC_008022	AAT	2	6	624022	624027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94990158
13248	NC_008022	GTTATT	2	12	624043	624054	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	94990158
13249	NC_008022	ATT	2	6	624086	624091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990158
13250	NC_008022	TAT	2	6	624092	624097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990158
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13255	NC_008022	ATT	2	6	624297	624302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94990158
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13260	NC_008022	CGT	2	6	624622	624627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990158
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13303	NC_008022	ATCT	2	8	626396	626403	25 %	50 %	0 %	25 %	94990158
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13336	NC_008022	GCT	2	6	629034	629039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94990159
13337	NC_008022	TTAAT	2	10	629053	629062	40 %	60 %	0 %	0 %	94990159
13338	NC_008022	GTAT	2	8	629096	629103	25 %	50 %	25 %	0 %	94990159
13339	NC_008022	GCA	2	6	629168	629173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990159
13340	NC_008022	CGGTAT	2	12	629174	629185	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	94990159
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13344	NC_008022	A	8	8	629347	629354	100 %	0 %	0 %	0 %	94990159
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13347	NC_008022	AGTC	2	8	629554	629561	25 %	25 %	25 %	25 %	94990159
13348	NC_008022	GAC	2	6	629563	629568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990159
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13353	NC_008022	TCT	2	6	629781	629786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94990159
13354	NC_008022	A	7	7	629822	629828	100 %	0 %	0 %	0 %	94990159
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13356	NC_008022	TCA	2	6	629864	629869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94990159
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13358	NC_008022	A	7	7	629976	629982	100 %	0 %	0 %	0 %	94990159
13359	NC_008022	T	6	6	630018	630023	0 %	100 %	0 %	0 %	94990159
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13362	NC_008022	TGA	2	6	630137	630142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990159
13363	NC_008022	AGC	2	6	630181	630186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94990159
13364	NC_008022	A	6	6	630197	630202	100 %	0 %	0 %	0 %	94990159
13365	NC_008022	CAA	2	6	630210	630215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94990159
13366	NC_008022	CTCA	2	8	630240	630247	25 %	25 %	0 %	50 %	94990159
13367	NC_008022	GTT	2	6	630325	630330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13368	NC_008022	ATA	2	6	630356	630361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13369	NC_008022	AAT	3	9	630409	630417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13370	NC_008022	ATA	2	6	630423	630428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13371	NC_008022	TTA	2	6	630433	630438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13488	NC_008022	T	7	7	635336	635342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13489	NC_008022	A	6	6	635362	635367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13490	NC_008022	GAAAG	2	10	635369	635378	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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13494	NC_008022	CAA	2	6	635556	635561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94990165
13495	NC_008022	TTG	2	6	635582	635587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94990165
13496	NC_008022	ATG	2	6	635601	635606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990165
13497	NC_008022	T	6	6	635750	635755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13498	NC_008022	A	7	7	635821	635827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_008022	TCTA	2	8	635832	635839	25 %	50 %	0 %	25 %	94990166
13500	NC_008022	TGA	2	6	635856	635861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94990166

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