MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella denitrificans OS217

Total Repeats: 83379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007954	CAA	2	6	28	33	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91791370
2	NC_007954	CAG	2	6	67	72	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791370
3	NC_007954	TCCG	2	8	86	93	0 %	25 %	25 %	50 %	91791370
4	NC_007954	ATGG	2	8	106	113	25 %	25 %	50 %	0 %	91791370
5	NC_007954	ATCA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	91791370
6	NC_007954	T	6	6	193	198	0 %	100 %	0 %	0 %	91791370
7	NC_007954	GTA	2	6	212	217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791370
8	NC_007954	GTC	2	6	248	253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791370
9	NC_007954	CCAG	2	8	270	277	25 %	0 %	25 %	50 %	91791370
10	NC_007954	ACA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91791370
11	NC_007954	ATC	2	6	374	379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791370
12	NC_007954	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791370
13	NC_007954	GGC	2	6	478	483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791370
14	NC_007954	ATT	2	6	495	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91791370
15	NC_007954	TGG	2	6	507	512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791370
16	NC_007954	TTA	2	6	535	540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91791370
17	NC_007954	ATT	2	6	559	564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91791370
18	NC_007954	AAT	2	6	568	573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91791370
19	NC_007954	GTG	2	6	586	591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791370
20	NC_007954	GAA	2	6	652	657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91791370
21	NC_007954	TTA	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91791370
22	NC_007954	CAA	2	6	717	722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91791370
23	NC_007954	AAG	2	6	734	739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91791370
24	NC_007954	TTC	2	6	742	747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91791370
25	NC_007954	TTA	2	6	763	768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91791370
26	NC_007954	ATC	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791370
27	NC_007954	ATC	2	6	784	789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791370
28	NC_007954	GATA	2	8	799	806	50 %	25 %	25 %	0 %	91791370
29	NC_007954	AGAT	2	8	831	838	50 %	25 %	25 %	0 %	91791370
30	NC_007954	TTGG	2	8	851	858	0 %	50 %	50 %	0 %	91791370
31	NC_007954	CCA	2	6	880	885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91791370
32	NC_007954	AG	3	6	927	932	50 %	0 %	50 %	0 %	91791370
33	NC_007954	TCG	2	6	965	970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791370
34	NC_007954	TAT	2	6	1150	1155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91791370
35	NC_007954	TGT	2	6	1175	1180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91791370
36	NC_007954	CAAGAC	2	12	1205	1216	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	91791370
37	NC_007954	TGG	2	6	1281	1286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791370
38	NC_007954	TGCA	2	8	1307	1314	25 %	25 %	25 %	25 %	91791370
39	NC_007954	GAA	2	6	1339	1344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91791370
40	NC_007954	AGA	2	6	1359	1364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91791370
41	NC_007954	TCT	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91791370
42	NC_007954	CGT	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791371
43	NC_007954	TTA	2	6	1873	1878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91791371
44	NC_007954	TTA	2	6	2033	2038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91791371
45	NC_007954	GAT	2	6	2045	2050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791371
46	NC_007954	CGC	2	6	2150	2155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791371
47	NC_007954	GTG	2	6	2180	2185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791371
48	NC_007954	GTC	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791371
49	NC_007954	CACT	2	8	2214	2221	25 %	25 %	0 %	50 %	91791371
50	NC_007954	TAA	2	6	2299	2304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91791371
51	NC_007954	AAG	3	9	2313	2321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91791371
52	NC_007954	TAA	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91791371
53	NC_007954	GAA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91791371
54	NC_007954	ATGT	2	8	2489	2496	25 %	50 %	25 %	0 %	91791371
55	NC_007954	AAG	2	6	2541	2546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007954	CTT	2	6	2559	2564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007954	ATTT	2	8	2743	2750	25 %	75 %	0 %	0 %	91791372
58	NC_007954	ATG	2	6	2804	2809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791372
59	NC_007954	TCA	2	6	2841	2846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791372
60	NC_007954	GCT	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791372
61	NC_007954	TTC	2	6	3120	3125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91791372
62	NC_007954	CATTT	2	10	3267	3276	20 %	60 %	0 %	20 %	91791372
63	NC_007954	AGTG	2	8	3357	3364	25 %	25 %	50 %	0 %	91791372
64	NC_007954	ACA	2	6	3486	3491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91791372
65	NC_007954	GAT	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791372
66	NC_007954	TAGC	2	8	3638	3645	25 %	25 %	25 %	25 %	91791372
67	NC_007954	CCT	2	6	3646	3651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91791372
68	NC_007954	AAT	2	6	3695	3700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91791372
69	NC_007954	GA	4	8	3704	3711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007954	TTC	2	6	3735	3740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91791373
71	NC_007954	TGA	2	6	3807	3812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791373
72	NC_007954	CAC	2	6	3826	3831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91791373
73	NC_007954	AGT	2	6	3843	3848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791373
74	NC_007954	GGCC	2	8	3873	3880	0 %	0 %	50 %	50 %	91791373
75	NC_007954	ATCACC	2	12	3892	3903	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	91791373
76	NC_007954	ATAC	2	8	3904	3911	50 %	25 %	0 %	25 %	91791373
77	NC_007954	TCAGTG	2	12	3919	3930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91791373
78	NC_007954	GAT	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791373
79	NC_007954	GAA	2	6	3970	3975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91791373
80	NC_007954	TTA	2	6	3995	4000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91791373
81	NC_007954	CGG	2	6	4017	4022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791373
82	NC_007954	GAT	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791373
83	NC_007954	GGT	2	6	4054	4059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791373
84	NC_007954	GGTGTG	2	12	4066	4077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791373
85	NC_007954	GTT	2	6	4081	4086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91791373
86	NC_007954	CA	3	6	4097	4102	50 %	0 %	0 %	50 %	91791373
87	NC_007954	TCG	2	6	4119	4124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791373
88	NC_007954	GGC	2	6	4126	4131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791373
89	NC_007954	GTG	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791373
90	NC_007954	TGAT	2	8	4328	4335	25 %	50 %	25 %	0 %	91791373
91	NC_007954	ACA	2	6	4343	4348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91791373
92	NC_007954	GGC	2	6	4372	4377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791373
93	NC_007954	CAA	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91791373
94	NC_007954	TAA	2	6	4527	4532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91791373
95	NC_007954	TGG	2	6	4548	4553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791373
96	NC_007954	TGA	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791373
97	NC_007954	AGC	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791373
98	NC_007954	TTG	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91791373
99	NC_007954	CCG	2	6	4893	4898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791373
100	NC_007954	GGT	2	6	4918	4923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791373
101	NC_007954	CTG	2	6	4997	5002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791373
102	NC_007954	TCT	2	6	5104	5109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91791373
103	NC_007954	AAG	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91791373
104	NC_007954	TGA	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791373
105	NC_007954	CAT	4	12	5193	5204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791373
106	NC_007954	TTC	2	6	5257	5262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91791373
107	NC_007954	TTATAT	2	12	5292	5303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91791373
108	NC_007954	AGCC	2	8	5363	5370	25 %	0 %	25 %	50 %	91791373
109	NC_007954	CTT	2	6	5757	5762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91791373
110	NC_007954	CT	3	6	5766	5771	0 %	50 %	0 %	50 %	91791373
111	NC_007954	ATGGT	2	10	5810	5819	20 %	40 %	40 %	0 %	91791373
112	NC_007954	GAA	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91791373
113	NC_007954	AAG	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91791373
114	NC_007954	GAT	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791373
115	NC_007954	CAC	2	6	6048	6053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91791373
116	NC_007954	T	6	6	6217	6222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007954	GTG	2	6	6268	6273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791374
118	NC_007954	CTGT	2	8	6291	6298	0 %	50 %	25 %	25 %	91791374
119	NC_007954	AAG	2	6	6309	6314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91791374
120	NC_007954	T	6	6	6328	6333	0 %	100 %	0 %	0 %	91791374
121	NC_007954	TGA	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791374
122	NC_007954	GTG	2	6	6411	6416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791374
123	NC_007954	CCA	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91791374
124	NC_007954	GCG	2	6	6432	6437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791374
125	NC_007954	CAT	2	6	6475	6480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791374
126	NC_007954	CAT	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791374
127	NC_007954	TGT	3	9	6614	6622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91791374
128	NC_007954	GTA	2	6	6641	6646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791374
129	NC_007954	TGT	2	6	6655	6660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91791374
130	NC_007954	TCT	2	6	6668	6673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91791374
131	NC_007954	TGG	2	6	6697	6702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791374
132	NC_007954	GCC	2	6	6719	6724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791374
133	NC_007954	ATG	2	6	6731	6736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791374
134	NC_007954	A	7	7	6754	6760	100 %	0 %	0 %	0 %	91791374
135	NC_007954	ATC	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791374
136	NC_007954	GCC	2	6	6983	6988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791374
137	NC_007954	GCT	2	6	7006	7011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791374
138	NC_007954	CTG	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791374
139	NC_007954	CAT	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791374
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142	NC_007954	CAT	2	6	7333	7338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791374
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145	NC_007954	GCT	2	6	7491	7496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791375
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259	NC_007954	ATA	2	6	14017	14022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91791378
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266	NC_007954	T	6	6	14332	14337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_007954	GTTT	2	8	21337	21344	0 %	75 %	25 %	0 %	162210779
401	NC_007954	ATG	2	6	21422	21427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162210779
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403	NC_007954	ACG	2	6	21603	21608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162210779
404	NC_007954	TCT	2	6	21660	21665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162210779
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433	NC_007954	TCT	2	6	22776	22781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162210779
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439	NC_007954	T	6	6	23222	23227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_007954	CAG	2	6	23286	23291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_007954	AAT	2	6	23294	23299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_007954	CAAT	2	8	25069	25076	50 %	25 %	0 %	25 %	91791386
473	NC_007954	GACA	2	8	25124	25131	50 %	0 %	25 %	25 %	91791386
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500	NC_007954	TGG	2	6	26346	26351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791387

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